| Entry information : |
| Entry ID |
5282 |
| Creation |
2007-04-17 (Marcel Zamocky) |
| Last sequence changes |
2010-12-03 (Myriam Duval (Scipio)) |
| Sequence status |
complete |
| Reviewer |
Marcel Zamocky |
| Last annotation changes |
2012-08-28 (Marcel Zamocky) |
| Peroxidase information |
| Name (synonym) |
HsKat01 (CatA_Human) |
| Class |
Catalase |
| Taxonomy |
Fungi/Metazoa; Metazoa; Bilateria; Deuterostomia  |
| Organism |
Homo sapiens (human)
[TaxId: 9606] |
| Cellular localisation |
N/D
|
| Tissue type |
N/D
|
| Inducer |
N/D
|
| Repressor |
N/D
|
| Best BLASTp hits |
| Perox |
score |
E-value |
HsKat01
start..stop |
S start..stop |
| GgoKat |
1096 |
0 |
1..527 |
1..527 |
| PtroKat01 |
1096 |
0 |
1..527 |
1..527 |
| PabeKat01 |
1088 |
0 |
1..527 |
1..527 |
| MnemKat01 |
1081 |
0 |
1..527 |
1..527 |
|
| Gene structure Fichier |
Exons +
| Exon | Start..End | Size |
Exon | Start..End | Size |
Exon | Start..End | Size |
Exon | Start..End | Size |
| N° 1 |
34460561..34460626 |
66 |
N° 2 |
34470739..34470910 |
172 |
N° 3 |
34472535..34472645 |
111 |
N° 4 |
34473624..34473754 |
131 |
| N° 5 |
34474637..34474741 |
105 |
N° 6 |
34475348..34475473 |
126 |
N° 7 |
34477558..34477749 |
192 |
N° 8 |
34478212..34478364 |
153 |
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N° 10 |
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131 |
N° 11 |
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108 |
N° 12 |
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84 |
| N° 13 |
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66 |
|
| join(34460561..34460626,34470739..34470910,34472535..34472645,34473624..34473754
,34474637..34474741,34475348..34475473,34477558..34477749,34478212..34478364,344
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5..34492980) |
|
| Literature and cross-references |
| Literature |
REFERENCE 1 Quan F., Korneluk R.G., Tropak M.B., Gravel R.A. Isolation and characterization of the human catalase gene. Nucleic Acids Res. 14:5321-5335(1986).
REFERENCE 2 Korneluk R.G., Quan F., Lewis W.H., Guise K.S., Willard H.F., Holmes M.T., Gravel R.A. Isolation of human fibroblast catalase cDNA clones. Sequence of clones derived from spliced and unspliced mRNA. J. Biol. Chem. 259:13819-13823(1984).; Ko T.P., Safo M.K.
REFERENCE 3 Musayev F.N., Di Salvo M.L., Wang C., Wu S.H., Abraham D.J. Structure of human erythrocyte catalase. Acta Crystallogr. D 56:241-245(2000).
REFERENCE 4 Putnam C.D., Arvai A.S., Bourne Y., Tainer J.A. Active and inhibited human catalase structures: ligand and NADPH binding and catalytic mechanism. J. Mol. Biol. 296:295-309(2000).
REFERENCE 5 Safo M.K., Musayev F.N., Wu S.H., Abraham D.J., Ko T.P. Structure of tetragonal crystals of human erythrocyte catalase. Acta Crystallogr. D 57:1-7(2001). |
| Protein ref. |
UniProtKB: A8K6C0 P04040 Q8TAK2 [Fragment] |
| DNA ref. |
GenBank: NC_000011.9 (34460561..34492980) |
| mRNA ref. |
GenBank: NM_001752.3 |
| Cluster/Prediction ref. |
UniGene: Hs.502302 |
| Protein sequence |
| Sequence length |
527 amino acids |
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
| .........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2 |
| MADSRDPASD QMQHWKEQRA AQKADVLTTG AGNPVGDKLN VITVGPRGPL LVQDVVFTDE MAHFDRERIP ERVVHAKGAG AFGYFEVTHD ITKYSKAKVF EHIGKKTPIA VRFSTVAGES
GSADTVRDPR GFAVKFYTED GNWDLVGNNT PIFFIRDPIL FPSFIHSQKR NPQTHLKDPD MVWDFWSLRP ESLHQVSFLF SDRGIPDGHR HMNGYGSHTF KLVNANGEAV YCKFHYKTDQ
GIKNLSVEDA ARLSQEDPDY GIRDLFNAIA TGKYPSWTFY IQVMTFNQAE TFPFNPFDLT KVWPHKDYPL IPVGKLVLNR NPVNYFAEVE QIAFDPSNMP PGIEASPDKM LQGRLFAYPD
THRHRLGPNY LHIPVNCPYR ARVANYQRDG PMCMQDNQGG APNYYPNSFG APEQQPSALE HSIQYSGEVR RFNTANDDNV TQVRAFYVNV LNEEQRKRLC ENIAGHLKDA QIFIQKKAVK
NFTEVHPDYG SHIQALLDKY NAEKPKNAIH TFVQSGSHLA AREKANL
|
Retrieve as FASTA |
|
| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 11, 12 introns) and 14 mRNA and 567 ESTs. |
DNA +
Send to BLAST
|
| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCTGACAGCCGGGATCCCGCCAGCGACCAGATGCAGCACTGGAAGGAGCAGCGGGCCGCGCAGGTACACTCTGTGCTCCCCGAGCGGGCCCGAAGGTCCGTTTAGAAAGCGGGGGCG
TCGGCAAGTAAAGGCCCGGCTTCCCCCGGGGCGGCGCTTGGAGGGACTGTACCGCGGCTCACTGGGCAGGGGGGATCCCCTTCGGTGCAGACGGACTTTTACATTCGCCGAAGCAGGGGA
GGGGGGTCCGGGTAGTGGGGCGCGGGACTGCAGGCTTTGTTGTCCGCGACAGGCTCGGGTGGTTGCTTCAGAATTTTGCACTTTTGCCAACTGGGACAGAGGTCGCAGCTTGAGGACAGA
TTGAGGGCTCATGGGGAAAGAGGCAGAGAGCTGCAGCTGCAAGGAAGTCAGTGAGGGGAGAAGTGGAACCAGGCTCTAATGGTGCCCTTCTTGAAATACTGTTTACACGCTTTCATAGTT
GTGGGGTCCCAGCAGGGCAGGGATTGTGTTTTACAATCTTGAGGTCTCCAGCACCAGTCACAGTGACTGGTACGTACTATGCACATTATTAAACGACTAAATAAAAGAACTTTTACATTC
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GGGGCAAGGTGTACAAATTCCAGTGCGGCAAGAACAACACCCTTGAGAAGCTGAGAGTCTAGTCTGGGAGACGAGACACATAAACAGATGATTACACTCCAGCGTGGTGAGGGCTCTAAT
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GGCCTGTGCCCACGGCTGCAGAGTCTCAGAGGGCATCTATGAGGAGGTTGGATTAGATGAGACCACATCTGGTCTGAGTCTACTGTTGGCAGATTGGCCCAGGGAGTCTAAAGGTCTTGC
CCTGTTCCCTGGCTGCTGGTTAATGGTAGACAGAGGACTGCAGCCCTGTTTTCCCTATTCTGCCTAGTGCTCTTGCTCAAAACTCAGGTTCGTGAACTGGGGTATTAATGCTAAGTGCTC
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TGGCCTCCCAAAGTACCGAGATTACAGGTGTAATATTTTCATTTTTAAAGGACTCCCCTTTATTCTGAGACTAGCTGCCTTCTTCCTTGTTTGGGAGAATCATGAACTGTTGAAGTCCCT
GCTGTTGATTTACCTTACATAGTTGCCCATGTGAGAAATGGCTGACTCCAAAACACATCTATAGTTGGGAGGCTCTTAATTGAAATACAGCCATCCCCTTTGTCCATGACATCTCAGGGC
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ACAGAGGGAGACCCTGTCTTAAAAATTAAAAATAAATAAAGCTGCTATAAAAATTCTTACATAAGTCTTTTTGTGCACAGGTGGTTTTATTTCTCTTAGGAAATACCTAGGAGTAGATTT
ATTGGGTCATAAGGTAAGTGAATGTGTTATGAGAAACTGCTGAGCCTTTTTCCAAAGTGGTTGTACCATTTTATACTTCATCAGCAGTGTATGGGAGTTCCAGTTGCTCCACATCCTACC
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TGACCATTGGTATATATTCCTTTGAAGTATATGTTCAAATTTTCTGTCTTTTTAAAAATTGAATTGCTTTTAAATTATTAATTCATAGCCCATATTTTAAGTTCAATCATGTGGAATCAT
GTGTAGGCTAAGTGTTATAATAATAAATCTCAACATGTATCATGGTATAAACATATTAGAAATTTATGGCCGGGTGCAGTGACTCACACCTATAATCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTG
GGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAAACTAGCCTGACCAATATGGAGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTGCTT
GGGAGGCTGAGGCAGGATAATCACTTGAACCCTGGAGGCGGAGGTTGCAGTAAGCCGAGATCCTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAGAAAAAA
AAAGAAATGTATTCCTTTCCTACATGAATGGCCCAAAGTGGTTTGAGGTTGAAGGAGGTGGGTGGGTGCTCTGCTTCCCACAGTTATTGAGGGCACCAGGCTGAAGGAAGCTCCCCCTTG
GTCAAACATGGCTTTTATGGGCGTCACTGTCCAGCACAGAAGGCTCAAGAGCGTGGAGAAGGGTATATGAGTGTGGGAAGGTTTAGGGTCCAGGGTCACTGCCACTTACATTCTGTTGGC
TAGAACTCTGTTACAGGCCACACCTGGGGTAGTCTACCCCCTGTCCAGGAAGCTGACTCTACTATATTATCCAAAGCGTACATTTCATATTTGGTGAAAATCTGTCCAGCCATTTTCTTG
TGATGCGGCAATGGACATGCAACATAATTTCTTTTTAAAGAATATGTCATTTTTACTTTCTGACATTAAGATATTCTGTTAGAAAATTATGACAGTAACAGATGGTATTAAAAAAAAATC
TCCCCTTGCTTGGTAAATGCTTTTATCTAAGTGGGCAGCTTTGTGCTAATATGATGTCTTCCACTTCCCAATTAGTTGTGATGCTTTACTGATCTAGGAGAGCTTTATGGTTTGGGACTA
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TTTTTTTTTTTAAGTGCAGCTTGCTGCCAGTGCTCTTTTCTTGGGGGTAAATGGGAAATGTTAATAAGTAGCCTCTGATCCCTTTAAAATGGGAGAATTTGAACATTTCAAACCTTACCT
TTTTATACAGTTCTCTTATTACCTGGGAGAGAGGTTAAGTCTTAGACTATCCATTTCTGTCAGTGAGTTGCCTATGCATTATAGCCTGTGAGGGTCTATATTTTTTTAGGGTAATCCTGG
TAATAACTGCATTGATGTTACACTGCTAACATTTGGGATGGAGAAGGGGTGACTGAGTGACTTAACCCTTGGTCCACATGTGCTTTCATTTCTCCTGAAATATACCTAGGTATGGAATCG
CTAAGTCATTATGTGCAGTGGGAGAGACTATGGGAGATGGGACAGAAATTTTTAAGGTTTCATTTCTTTTTTTTAGCTTTTGCATGGTGGGTAGGTCTATGCAAACCTACCCCCAAAGTC
TGAGGAAGCTGAGAGGCCAAAGAAAGAGGCTGACAAATCAAGTTTCTCAGAAAGAAATGTTTAGTAGGGACTTAGGACCAGAAACCATGTCTGTGTCTTGCGTGTTGGCGAGACAAGATG
GTGGATCCCATACCATTACCCCTCAGACCCAGGGCTTAATACCATAGGGAAGGGCGATTCAGAAGGGAGGTATGGCATGACTGAAGTATGATAATGTCAAGGTTGTTTGACCTCAGGGCA
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TGTTGAATAAATGGAGAATGTTAGGCAGTTATTTGCTAGAAAACGCTAGGCACATTCTTTATCACAGAATGAAAAGACGTCATTATGACTCCTCTGGGACTGATGGGCAATTTGCATTAA
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GTTTTTAGCCAAGCTAATTTCTGTGGCAGTTTTCATAACAAGTGTGTCTAAAGGTGTTTGATCAGAATTTATAAATTAAAATATTTCTCTCATTTTTTGGAGGGGCGATGCAGGGAGAGG
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CCAAGATGGGCGGATTTCTTGAGGTCAGGAGTTTGAGATCATCAGCCTGGCCAACATGATGGAACCCTGTCTTTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGGTCGCCTGTAA
TCCCAACTACTTGGGAGGCTGAGACGGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGCTGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAATAGAGCGAGACTCCATC
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TGAGCTTCTTGGTATCTTTTCTCATACTTGTACCTTTTATGGGATGTCCCCCCCTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTTTCGCTGCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCACGATCTCAGC
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TTAAAAAGCTCCTCAGGTGATTTTAGTGCATTGCCAAGGTTGAAAACCAAGGCTTTAGGTTTAAACTAAAGGTGAAATTGCTCTTTTTCTGGTTCATTTTCTACTTTAGAAAGTAGAAAT
TTTTTTTCTGGTTCATTTTCTACTTTAAATTAAAAATAAACCTACAGAGGGTAACACGTATTAGCACGTCACAGAGGGTCACACGTATTAGCAACATATGTATCTTCAAAAGAGTGATGT
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GAGGGTCTTGTTTATTAGTTTTGCAAATTGCACGGTCTCCTTTATTCAATATCTTTTTTCAAACAGCTCACAGATCTTTTGTGGTTTTGTAAGTGCCTACTCCCCACCGTATTGCCTTCT
AGAGAAGAGGCAGGAATTTATTTTAATGTACAGGACAGACATGCATGGGGAGTAAAACTACAGACTCCACTCTAGGTGTGTGGAAATACTAAAAATAGTGCTTTTCTCTGTGTGTGAAGT
TGGTCTGTTGAGTTTTGTCATAGACAGCGTTGAGTTCCTCTCCCAGGTGGAGGTGGCGTAGCTTTGCGTCACTTACGTGTCTCTCCTGATTTCCAGTGACCCGGGGAAGACACTGCAGAG
GCAGTTGTCTGTGGTCAAAAGTATTCTCTGACCATGGAACTAGATGAAGCTATGAGCTTCCAGGATCATGTGGGGCTAGAAGAATGCCGCTCTAACCCTAGAGGAGGGACAGCTGAGTGT
CTTCTGATGTAACTGAAATTGGAGAATCAGGTGGATTAAAATTAATTATTTATTACAGTAAAATAACCTATCCCATTTCAGAGACATTTGCTATCTTTAAAACATTAATACTATAATCCA
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AGATGGTATAAACATTGCAAAGCTATGTACCCGTGACAGTGTAAATGAAAGGTTTGATTGTGCTAACTCTCCTGCACTTTCTTTCTGTGTTCCTGTAGAAAGCTGATGTCCTGACCACTG
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CTGAGAGAGTTGTGCATGCTAAAGGAGCAGGTAAGTGCTGTGTTTATTTGCTGTAAAAAGATTGTTTCACAGCACCTGGGTCAAGTGTTATTTCCCAAAGGATTGGAAGACCTTTAACAC
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TTCTCCAGTGGTTTGTGTGTATTTTTCCATCTTGACTTGTTTAGTTTATTGCTTGCTTTGTATCATCGTTGCTAAGTGTTGAAAAGATTCTTTCTCTTATGTTTTCATCTCCTCTTCTCT
CTGTTCTTCACTTTCTCTCATAGGTCCTACCTGTACTTCAGGCCCCTCTGAGACCCTGTGTCCTTGGGCCAACCTTGACGACTTCTAGCCTCACTCACCTCCTTCTCTTGGCTCCAGCTA
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ACCATCATTTTCTCTTGTCACCCAGGTGCCTGTTGAGGACCTGAATGTCTGAGTAATGGTCTCATGGTAAGGATTTCTGTGTCTTTCTCGTTAGGGGCCTTTGGCTACTTTGAGGTCACA
CATGACATTACCAAATACTCCAAGGCAAAGGTATTTGAGCATATTGGAAAGAAGACTCCCATCGCAGTTCGGTTCTCCACTGTTGGTAAGTTGGTTTATTGGCGTGATTGGTATGGCTTA
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TAGGAAGTTACTTGTATTTCTGTTTGTTGAGGTCTTAGGAAATCACACTTACACAGAGGCTACCTCTGCAATTCTGTGACATTTGGAAAGAGCTTTCCTAAAAGTGGTTGCCTCTAACAG
AAGAATAGAGTGGAAATCTTATTTAATAACTATGCCTACAGCTGACCTTTATTGAGAATTAATTCTGTGCCAACTGTGGTTAGGTGCTTTACAGATATAATCTCTGATTTGTAGATCTAC
TTTGCAGAGTGGGATTCTTTTTATTTTTGAGAGGCTAAGTGATGTTTCTCACGTTACAGAGATAGTATTAGATCTATCATACTATATTTCAACATACCTAGTGCTTCACTAGTTCCGTTT
CTGTGTCAGTCTCTGCATTTTAAAAATACTGTGGAATGTAAAAATAAATGAAATTAAGAACTAAGAACCAATATTTTAACTCATTTTCTTAATGTTAACCTCATCATTTTGACAACTCAC
TTATTCTGTTTGTCACTACTTTAAGCCTCATAATTATTTTCTTCCCTTATTTTAATTAAAAGTTCAATTACCTGTTTGAACAAAGTTATCTTATTATGGTAAATGAATGACATTGTCAGC
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AGTGGATTAGAAAGGATGGATCCAGGTGCTTCTTTATGTCTCCAGGCTTCTTGGATGCAAAGTGCTGTGGCTTATGCTTCCTGTTTCCATTTGAATATTGTAGCTGGAGAATCGGGTTCA
GCTGACACAGTTCGGGACCCTCGTGGGTTTGCAGTGAAATTTTACACAGAAGATGGTAACTGGGATCTCGTTGGAAATAACACCCCCATTTTCTTCATCAGGGATCCCATATTGGTAGGT
AATAGAGTATTTTGCACTCAACAAATGTTTGTTGACTTAAATTGATTTCAAATAGGTTGGCATTTGAGGAGAAGCCGTGGGAAAGGCAGAAAGAAAAGAATGCGAGTTGTCTGGACTACT
TTTTTCAACACATTTTTCTGTATTTAATAAGATAAAGTAAGAACAGTTACCATTGGTCTTAGATTTGTCATTTTAAGACAGATTGACTTAATGGGAAGTGAGTTTAGTTTTCCTTGCAGA
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GGGAGAAGGCAAATCTGTGA |
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ATGGCTGACAGCCGGGATCCCGCCAGCGACCAGATGCAGCACTGGAAGGAGCAGCGGGCCGCGCAGAAAGCTGATGTCCTGACCACTGGAGCTGGTAACCCAGTAGGAGACAAACTTAAT
GTTATTACAGTAGGGCCCCGTGGGCCCCTTCTTGTTCAGGATGTGGTTTTCACTGATGAAATGGCTCATTTTGACCGAGAGAGAATTCCTGAGAGAGTTGTGCATGCTAAAGGAGCAGGG
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ATCCAGGTCATGACATTTAATCAGGCAGAAACTTTTCCATTTAATCCATTCGATCTCACCAAGGTTTGGCCTCACAAGGACTACCCTCTCATCCCAGTTGGTAAACTGGTCTTAAACCGG
AATCCAGTTAATTACTTTGCTGAGGTTGAACAGATAGCCTTCGACCCAAGCAACATGCCACCTGGCATTGAGGCCAGTCCTGACAAAATGCTTCAGGGCCGCCTTTTTGCCTATCCTGAC
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GCTCCAAATTACTACCCCAACAGCTTTGGTGCTCCGGAACAACAGCCTTCTGCCCTGGAGCACAGCATCCAATATTCTGGAGAAGTGCGGAGATTCAACACTGCCAATGATGATAACGTT
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GCAAGGGAGAAGGCAAATCTGTGA |
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