Entry information : NtetCP01_2509 (NtetKatG1)
Entry ID 10074
Creation 2012-01-04 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2012-01-05 (Marcel Zamocky)
Sequence status complete
Reviewer Catherine Mathe
Last annotation changes 2012-05-24 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: NtetCP01_2509 (NtetKatG1)
Name (synonym) NtetCP01_2509 (NtetKatG1)
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Sordariomycetes Sordariaceae Neurospora
Organism Neurospora tetrasperma    [TaxId: 40127 ]
Cellular localisation Peroxisomal
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtetCP01_2509
start..stop
S start..stop
NcCP01 1543 0 1..753 1..753
NdisCP 1488 0 1..753 1..753
SmaCP01 1443 0 1..753 1..753
PanCP01 1190 0 1..753 1..755
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 519155..521416 2262  
join(519155..521416)


exon

Literature and cross-references NtetCP01_2509 (NtetKatG1)
Literature Ellison C.E., Stajich J.E., Jacobson D.J., Natvig D.O., Lapidus A., Foster B., Aerts A., Riley R., Lindquist E.A., Grigoriev I.V., Taylor J.W. (2011) Massive Changes in Genome Architecture Accompany the Transition to Self-Fertility in the Filamentous Fungus Neurospora tetrasperma. Genetics 189:55-69
Protein ref. GenBank:   EGZ68861.1 UniProtKB:   G4UXA4
DNA ref. JGI genome:   scaffold_6 (519155..521416)
Protein sequence: NtetCP01_2509 (NtetKatG1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   753
PWM (Da):   %s   83193.67  
PI (pH):   %s   6.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSECPVRKSN VGGGGTRNHD WWPAQLRLNI LRQHTPVSNP LDKDFDYAAA FKSLDYEGLK KDLTKLMTDS QDWWPADFGH YGGLFIRMAW HSAGTYRVTD GRGGGGEGQQ RFAPLNSWPD  NVSLDKARRL LWPIKQKYGN KISWSDLLLL TGNVALESMG FKTFGFAGGR PDTWEADESV YWGAESTWLG NEDRYSEGQE GHEGHGVVQG DESKKQHTDI HNRDLQSPLA SSHMGLIYVN  PEGPDGIPDP VASAKDIRVT FGRMAMNDEE TVALIAGGHS FGKTHGAGPT HHVGKEPEAA PIEHQGLGWA NSFGQGKGPD TITSGLEVTW TPTPTKWGMG YLEYLYKFDW EPTKSPAGAN  QWVAKNAEPT IPDAYDPNKK KLPTMLTTDI ALRMDPAYDK ICRDYLANPD KFADAFARAW FKLLHRDMGP RTRWIGPEVP SEILPWEDYI PPVDYQIIDD NDIAALKKEI MATGVAPKKL  IFVAWSSASS FRGSDKRGGA NGARIRLAPQ NEWKVNDPST LREVLAALES VQQKFNDSSS GKKVSLADLI VLGGVAALEQ ASGLVVPFTP GRNDATQEQT DVHSFTHLEP HADGFRSYGK  GTKRVRTEQF LIDRASLLTL SAPELTALIG GLRVLEANYD GSSYGVLTKT PGKLTNDFFV NLLDTNTAWK AADNEGEVFI GYDRKTHDKK WTATRADLIF GAHAELRALA EVYAAVDGEE 
KFKRDFVAAW HKVMNLDRFD LKQEGRGQNA PKL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron). Strain="FGSC 2509".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCCGAGT GCCCCGTCCG CAAGTCCAAC GTCGGCGGTG GTGGCACCAG GAACCACGAC TGGTGGCCCG CCCAGCTTAG GCTCAACATC CTCCGCCAAC ATACCCCCGT CTCCAACCCC  CTCGACAAAG ACTTCGACTA TGCCGCTGCT TTCAAGAGCC TCGACTACGA AGGCCTCAAG AAGGACCTCA CTAAACTCAT GACCGACTCG CAAGACTGGT GGCCTGCTGA TTTCGGCCAC  TATGGCGGTC TCTTCATCCG CATGGCATGG CACAGCGCCG GTACCTACCG TGTCACGGAT GGCCGTGGAG GCGGTGGTGA GGGTCAGCAG CGTTTTGCTC CCCTCAACAG CTGGCCCGAC  AACGTCTCTC TCGACAAGGC CCGTCGTCTC CTGTGGCCCA TCAAGCAAAA ATACGGCAAC AAGATCTCAT GGTCCGACTT GCTCCTTCTG ACCGGTAACG TGGCTCTCGA GTCCATGGGC  TTCAAGACCT TTGGCTTTGC CGGTGGCCGT CCCGACACTT GGGAGGCTGA CGAGTCTGTA TACTGGGGTG CCGAGTCCAC ATGGCTGGGC AACGAGGACC GCTACTCGGA GGGTCAGGAA  GGCCACGAAG GACATGGTGT CGTCCAAGGT GACGAGTCCA AGAAACAGCA CACGGACATC CACAACCGTG ATCTGCAAAG CCCCCTTGCC TCCTCCCATA TGGGCCTTAT CTACGTCAAC  CCCGAAGGTC CTGACGGTAT TCCCGACCCC GTTGCCTCAG CCAAGGATAT CCGTGTCACC TTTGGCCGCA TGGCTATGAA CGACGAGGAG ACTGTCGCTC TGATTGCGGG TGGTCACTCC  TTTGGCAAGA CTCACGGTGC CGGTCCCACT CACCACGTCG GCAAGGAGCC CGAGGCTGCT CCTATCGAGC ACCAAGGTCT CGGCTGGGCG AACAGCTTTG GCCAGGGCAA GGGTCCCGAC  ACCATCACCA GTGGTCTTGA AGTCACTTGG ACACCAACTC CTACCAAGTG GGGCATGGGC TACCTGGAAT ACCTCTACAA GTTTGACTGG GAGCCGACAA AGAGCCCTGC TGGTGCCAAC  CAGTGGGTGG CCAAGAACGC CGAGCCCACC ATCCCAGATG CCTACGACCC CAACAAGAAA AAGCTCCCGA CCATGTTGAC GACCGATATT GCCCTGCGCA TGGATCCCGC TTATGACAAG  ATCTGCCGCG ATTACCTTGC GAACCCAGAC AAGTTCGCCG ATGCTTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAGCTTC TTCATCGTGA CATGGGCCCG CGTACTCGCT GGATCGGTCC CGAGGTCCCA  TCTGAGATCC TACCTTGGGA AGACTACATT CCTCCCGTAG ACTACCAGAT CATTGACGAT AACGACATCG CGGCCTTGAA GAAGGAGATT ATGGCCACCG GTGTCGCTCC AAAGAAGCTG  ATCTTCGTTG CCTGGTCCTC GGCTTCCTCT TTCCGTGGCT CTGACAAGCG CGGTGGTGCC AATGGTGCCC GTATCCGTCT CGCTCCTCAA AACGAGTGGA AGGTCAACGA CCCTTCCACG  CTCCGCGAGG TCCTTGCTGC GCTCGAGTCT GTGCAGCAAA AGTTCAACGA CAGTTCGAGC GGCAAGAAGG TCTCCTTGGC TGATCTCATC GTCCTTGGTG GTGTCGCCGC CCTTGAGCAA  GCTTCTGGCT TGGTGGTCCC TTTCACCCCA GGCCGCAACG ACGCCACTCA GGAGCAGACC GATGTGCATT CTTTCACTCA CCTCGAGCCC CACGCCGACG GCTTCCGCAG CTATGGTAAG  GGTACCAAGC GCGTACGCAC CGAGCAGTTT CTCATTGACC GTGCCTCGCT GCTCACTCTC TCTGCGCCCG AGCTTACTGC CCTCATTGGC GGTCTCCGTG TGCTAGAGGC CAACTATGAT  GGCTCATCCT ACGGTGTGTT GACCAAAACA CCCGGCAAGC TTACCAACGA CTTCTTTGTC AACCTGTTGG ACACCAACAC GGCATGGAAG GCGGCGGATA ATGAGGGCGA GGTCTTCATT  GGCTATGACC GCAAGACACA CGATAAAAAG TGGACTGCGA CAAGGGCCGA TCTCATCTTC GGAGCGCATG CTGAGCTTCG CGCGCTTGCG GAGGTGTATG CCGCGGTGGA TGGCGAGGAG 
AAGTTCAAGC GCGACTTTGT GGCGGCTTGG CACAAGGTCA TGAACCTTGA TCGGTTCGAT CTCAAGCAGG AGGGACGGGG CCAGAATGCC CCCAAGCTTT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCCGAGT GCCCCGTCCG CAAGTCCAAC GTCGGCGGTG GTGGCACCAG GAACCACGAC TGGTGGCCCG CCCAGCTTAG GCTCAACATC CTCCGCCAAC ATACCCCCGT CTCCAACCCC  CTCGACAAAG ACTTCGACTA TGCCGCTGCT TTCAAGAGCC TCGACTACGA AGGCCTCAAG AAGGACCTCA CTAAACTCAT GACCGACTCG CAAGACTGGT GGCCTGCTGA TTTCGGCCAC  TATGGCGGTC TCTTCATCCG CATGGCATGG CACAGCGCCG GTACCTACCG TGTCACGGAT GGCCGTGGAG GCGGTGGTGA GGGTCAGCAG CGTTTTGCTC CCCTCAACAG CTGGCCCGAC  AACGTCTCTC TCGACAAGGC CCGTCGTCTC CTGTGGCCCA TCAAGCAAAA ATACGGCAAC AAGATCTCAT GGTCCGACTT GCTCCTTCTG ACCGGTAACG TGGCTCTCGA GTCCATGGGC  TTCAAGACCT TTGGCTTTGC CGGTGGCCGT CCCGACACTT GGGAGGCTGA CGAGTCTGTA TACTGGGGTG CCGAGTCCAC ATGGCTGGGC AACGAGGACC GCTACTCGGA GGGTCAGGAA  GGCCACGAAG GACATGGTGT CGTCCAAGGT GACGAGTCCA AGAAACAGCA CACGGACATC CACAACCGTG ATCTGCAAAG CCCCCTTGCC TCCTCCCATA TGGGCCTTAT CTACGTCAAC  CCCGAAGGTC CTGACGGTAT TCCCGACCCC GTTGCCTCAG CCAAGGATAT CCGTGTCACC TTTGGCCGCA TGGCTATGAA CGACGAGGAG ACTGTCGCTC TGATTGCGGG TGGTCACTCC  TTTGGCAAGA CTCACGGTGC CGGTCCCACT CACCACGTCG GCAAGGAGCC CGAGGCTGCT CCTATCGAGC ACCAAGGTCT CGGCTGGGCG AACAGCTTTG GCCAGGGCAA GGGTCCCGAC  ACCATCACCA GTGGTCTTGA AGTCACTTGG ACACCAACTC CTACCAAGTG GGGCATGGGC TACCTGGAAT ACCTCTACAA GTTTGACTGG GAGCCGACAA AGAGCCCTGC TGGTGCCAAC  CAGTGGGTGG CCAAGAACGC CGAGCCCACC ATCCCAGATG CCTACGACCC CAACAAGAAA AAGCTCCCGA CCATGTTGAC GACCGATATT GCCCTGCGCA TGGATCCCGC TTATGACAAG  ATCTGCCGCG ATTACCTTGC GAACCCAGAC AAGTTCGCCG ATGCTTTTGC CCGCGCTTGG TTCAAGCTTC TTCATCGTGA CATGGGCCCG CGTACTCGCT GGATCGGTCC CGAGGTCCCA  TCTGAGATCC TACCTTGGGA AGACTACATT CCTCCCGTAG ACTACCAGAT CATTGACGAT AACGACATCG CGGCCTTGAA GAAGGAGATT ATGGCCACCG GTGTCGCTCC AAAGAAGCTG  ATCTTCGTTG CCTGGTCCTC GGCTTCCTCT TTCCGTGGCT CTGACAAGCG CGGTGGTGCC AATGGTGCCC GTATCCGTCT CGCTCCTCAA AACGAGTGGA AGGTCAACGA CCCTTCCACG  CTCCGCGAGG TCCTTGCTGC GCTCGAGTCT GTGCAGCAAA AGTTCAACGA CAGTTCGAGC GGCAAGAAGG TCTCCTTGGC TGATCTCATC GTCCTTGGTG GTGTCGCCGC CCTTGAGCAA  GCTTCTGGCT TGGTGGTCCC TTTCACCCCA GGCCGCAACG ACGCCACTCA GGAGCAGACC GATGTGCATT CTTTCACTCA CCTCGAGCCC CACGCCGACG GCTTCCGCAG CTATGGTAAG  GGTACCAAGC GCGTACGCAC CGAGCAGTTT CTCATTGACC GTGCCTCGCT GCTCACTCTC TCTGCGCCCG AGCTTACTGC CCTCATTGGC GGTCTCCGTG TGCTAGAGGC CAACTATGAT  GGCTCATCCT ACGGTGTGTT GACCAAAACA CCCGGCAAGC TTACCAACGA CTTCTTTGTC AACCTGTTGG ACACCAACAC GGCATGGAAG GCGGCGGATA ATGAGGGCGA GGTCTTCATT  GGCTATGACC GCAAGACACA CGATAAAAAG TGGACTGCGA CAAGGGCCGA TCTCATCTTC GGAGCGCATG CTGAGCTTCG CGCGCTTGCG GAGGTGTATG CCGCGGTGGA TGGCGAGGAG 
AAGTTCAAGC GCGACTTTGT GGCGGCTTGG CACAAGGTCA TGAACCTTGA TCGGTTCGAT CTCAAGCAGG AGGGACGGGG CCAGAATGCC CCCAAGCTTT AG 

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