Entry information : BdotCP
Entry ID 10116
Creation 2012-01-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-01-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-10-15 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: BdotCP
Name BdotCP
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Dothideomycetes Botryosphaeriaceae Botryosphaeria
Organism Botryosphaeria dothidea    [TaxId: 55169 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BdotCP
start..stop
S start..stop
CparCP01 1074 0 1..733 1..750
AmonCP01 1074 0 7..733 5..749
MEspCP01_NRRL54901 1049 0 1..732 1..749
MacrCP01 1044 0 7..733 6..724
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1934..4135 2202  
complement(join(1934..4135))


exon

Literature and cross-references BdotCP
DNA ref. JGI genome:   NODE_338_length_9542_cov_61.286629 (4135..1934)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   8656
Protein sequence: BdotCP
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   733
PWM (Da):   %s   80765.59  
PI (pH):   %s   6.15
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGSIDACPAH GVAGQGTRPR DFWPDQLKLN ILRQNQPANN PLGPDFDYTK AFQKLDYFAL KDDLKKLMTD SQDWWPADFG HYGGLFIRMS WHAAGTYRVY DGRGGGGEGQ QRFAPLNSWP  DNGNLDKARR LLWPIKQKYG NAISWADLLL LAGNVAMEDM GFKTFGFGAG RPDTWESDES VYWGSEKDMF PAGNKERYDG NKDIKTRNLE EPLGATHHGL IYVNPVGPDF NPDPVAAARD  IKTTFGRMAM NNEETVALIA GGHAFGKTHG AASDGDNLEA GPEGAPIHLQ GLGWNSKHKS GKAGDAITSG LEVTWTTTPT KWSNGYLTSL FKNEWELTKS PGGAWQWVAK NAEETVPDAF  DKNKKHRPTM LTTDLSLRFD SEYEPIARRF YEHPEELAEA YSRAWFKLLH RDMGPKVRYL GPEVPKEDLI WQDPVPPVDH PLVDANDVAS LKKEILATGL DVSTLAFTAW SSASSFRNSD  KRGGANGARI RLDPMRNWEV NNPQQTSSVL KALEGVQQKF NGSASGGKKI SLADLIVLAG AAAVEKAAKD AGVNITVPFT PGRTDASQEQ TEVDSIAYLE PKVDGFRNYG KSTSRVRSEA  LLIDRANLLT LTPPELTVLI GGLRSLNANY DKSDKGVLTK TPGKLTNDFF VNLLDMNTAW KPIDSEHEVF EGVDRKTGAK KWTATRIDLI FGSHAELRAV SEEYASAGVN DKFVKDFVAA 
WDKVMTLDRF DVK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTAGTA TTGACGCTTG TCCCGCACAC GGCGTTGCTG GTCAGGGCAC TCGCCCCCGC GACTTTTGGC CCGACCAGCT GAAGCTCAAT ATTCTGCGCC AGAACCAGCC CGCCAACAAC  CCGCTGGGCC CCGATTTCGA CTACACCAAG GCTTTCCAGA AGCTCGACTA CTTCGCGCTC AAGGATGACC TCAAGAAGCT GATGACCGAC AGCCAGGACT GGTGGCCCGC AGATTTTGGC  CACTACGGCG GTCTTTTCAT TCGCATGTCC TGGCACGCCG CCGGTACCTA CCGCGTCTAC GATGGCCGAG GTGGTGGTGG CGAGGGTCAG CAGAGATTCG CTCCGCTGAA CAGCTGGCCC  GATAACGGCA ACCTCGACAA GGCCCGTCGG CTGCTGTGGC CGATCAAGCA AAAGTACGGC AACGCCATCT CGTGGGCCGA TCTCCTGCTG CTGGCCGGCA ACGTCGCCAT GGAGGATATG  GGCTTCAAGA CTTTCGGATT CGGTGCTGGT CGCCCGGATA CATGGGAGTC GGACGAGTCG GTCTACTGGG GGTCGGAGAA GGACATGTTC CCCGCAGGGA ACAAGGAGCG CTACGATGGT  AACAAGGATA TCAAGACGCG CAACCTTGAA GAGCCATTGG GCGCCACCCA CCACGGTCTG ATCTACGTCA ACCCCGTGGG TCCCGATTTC AACCCTGACC CCGTCGCTGC GGCCCGGGAT  ATTAAGACTA CCTTCGGCCG CATGGCAATG AACAACGAGG AGACCGTTGC TCTGATCGCT GGTGGCCACG CTTTCGGCAA GACTCACGGT GCCGCTTCCG ACGGCGATAA CCTCGAGGCC  GGCCCTGAGG GTGCTCCCAT CCACCTGCAG GGTCTGGGAT GGAACAGCAA GCACAAGTCT GGAAAGGCTG GCGATGCTAT CACCAGCGGT CTGGAGGTTA CGTGGACAAC AACACCCACC  AAGTGGAGCA ACGGTTACCT CACGAGTCTG TTCAAGAACG AGTGGGAACT TACCAAGAGC CCCGGTGGTG CGTGGCAGTG GGTTGCGAAG AACGCCGAGG AGACCGTCCC CGACGCTTTC  GACAAGAACA AGAAGCACAG GCCCACTATG TTGACGACCG ATCTGTCCCT CCGCTTCGAT TCCGAGTACG AGCCGATTGC CCGCCGTTTC TACGAGCACC CGGAGGAGCT TGCCGAGGCC  TACTCTCGTG CATGGTTCAA GCTGTTGCAT CGTGATATGG GTCCCAAGGT CCGCTACCTT GGACCTGAGG TGCCAAAGGA GGACCTGATC TGGCAGGACC CCGTCCCTCC GGTTGACCAC  CCGCTGGTTG ACGCCAATGA CGTCGCTTCT CTGAAGAAGG AGATTCTCGC CACCGGCCTC GACGTCTCCA CCCTCGCCTT CACTGCCTGG TCGTCAGCAT CTTCCTTCCG CAACAGCGAC  AAGCGTGGTG GTGCCAATGG TGCCCGTATC AGGCTCGACC CCATGCGCAA CTGGGAGGTC AACAACCCCC AGCAGACCTC CTCCGTCCTC AAGGCCCTCG AGGGTGTGCA GCAGAAGTTC  AACGGCTCCG CATCTGGGGG CAAGAAGATC TCGCTTGCCG ACCTCATTGT TCTCGCCGGT GCTGCCGCCG TCGAGAAGGC TGCCAAGGAT GCCGGCGTGA ACATCACCGT TCCGTTCACC  CCTGGCCGCA CCGACGCATC GCAGGAGCAG ACCGAGGTTG ACTCGATCGC CTACCTCGAG CCCAAGGTTG ACGGATTCCG CAACTACGGC AAGTCGACCT CGCGCGTCCG CTCCGAGGCT  CTCCTCATTG ACCGCGCCAA CCTGCTCACC CTCACCCCGC CCGAACTAAC CGTCCTCATC GGCGGTCTCC GCTCCCTGAA CGCCAACTAC GACAAGTCCG ACAAGGGTGT GTTGACCAAG  ACTCCCGGCA AGTTGACCAA CGACTTCTTC GTCAATCTCC TCGACATGAA CACCGCCTGG AAGCCGATCG ACTCCGAGCA CGAGGTCTTC GAAGGCGTCG ACCGCAAGAC CGGCGCCAAG  AAGTGGACCG CCACCCGTAT CGACCTCATC TTCGGCTCGC ACGCCGAGCT GCGCGCCGTT TCCGAGGAGT ACGCCAGCGC CGGCGTCAAC GACAAGTTCG TCAAGGACTT TGTTGCCGCC 
TGGGACAAGG TCATGACGCT GGACCGCTTC GACGTTAAGT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTAGTA TTGACGCTTG TCCCGCACAC GGCGTTGCTG GTCAGGGCAC TCGCCCCCGC GACTTTTGGC CCGACCAGCT GAAGCTCAAT ATTCTGCGCC AGAACCAGCC CGCCAACAAC  CCGCTGGGCC CCGATTTCGA CTACACCAAG GCTTTCCAGA AGCTCGACTA CTTCGCGCTC AAGGATGACC TCAAGAAGCT GATGACCGAC AGCCAGGACT GGTGGCCCGC AGATTTTGGC  CACTACGGCG GTCTTTTCAT TCGCATGTCC TGGCACGCCG CCGGTACCTA CCGCGTCTAC GATGGCCGAG GTGGTGGTGG CGAGGGTCAG CAGAGATTCG CTCCGCTGAA CAGCTGGCCC  GATAACGGCA ACCTCGACAA GGCCCGTCGG CTGCTGTGGC CGATCAAGCA AAAGTACGGC AACGCCATCT CGTGGGCCGA TCTCCTGCTG CTGGCCGGCA ACGTCGCCAT GGAGGATATG  GGCTTCAAGA CTTTCGGATT CGGTGCTGGT CGCCCGGATA CATGGGAGTC GGACGAGTCG GTCTACTGGG GGTCGGAGAA GGACATGTTC CCCGCAGGGA ACAAGGAGCG CTACGATGGT  AACAAGGATA TCAAGACGCG CAACCTTGAA GAGCCATTGG GCGCCACCCA CCACGGTCTG ATCTACGTCA ACCCCGTGGG TCCCGATTTC AACCCTGACC CCGTCGCTGC GGCCCGGGAT  ATTAAGACTA CCTTCGGCCG CATGGCAATG AACAACGAGG AGACCGTTGC TCTGATCGCT GGTGGCCACG CTTTCGGCAA GACTCACGGT GCCGCTTCCG ACGGCGATAA CCTCGAGGCC  GGCCCTGAGG GTGCTCCCAT CCACCTGCAG GGTCTGGGAT GGAACAGCAA GCACAAGTCT GGAAAGGCTG GCGATGCTAT CACCAGCGGT CTGGAGGTTA CGTGGACAAC AACACCCACC  AAGTGGAGCA ACGGTTACCT CACGAGTCTG TTCAAGAACG AGTGGGAACT TACCAAGAGC CCCGGTGGTG CGTGGCAGTG GGTTGCGAAG AACGCCGAGG AGACCGTCCC CGACGCTTTC  GACAAGAACA AGAAGCACAG GCCCACTATG TTGACGACCG ATCTGTCCCT CCGCTTCGAT TCCGAGTACG AGCCGATTGC CCGCCGTTTC TACGAGCACC CGGAGGAGCT TGCCGAGGCC  TACTCTCGTG CATGGTTCAA GCTGTTGCAT CGTGATATGG GTCCCAAGGT CCGCTACCTT GGACCTGAGG TGCCAAAGGA GGACCTGATC TGGCAGGACC CCGTCCCTCC GGTTGACCAC  CCGCTGGTTG ACGCCAATGA CGTCGCTTCT CTGAAGAAGG AGATTCTCGC CACCGGCCTC GACGTCTCCA CCCTCGCCTT CACTGCCTGG TCGTCAGCAT CTTCCTTCCG CAACAGCGAC  AAGCGTGGTG GTGCCAATGG TGCCCGTATC AGGCTCGACC CCATGCGCAA CTGGGAGGTC AACAACCCCC AGCAGACCTC CTCCGTCCTC AAGGCCCTCG AGGGTGTGCA GCAGAAGTTC  AACGGCTCCG CATCTGGGGG CAAGAAGATC TCGCTTGCCG ACCTCATTGT TCTCGCCGGT GCTGCCGCCG TCGAGAAGGC TGCCAAGGAT GCCGGCGTGA ACATCACCGT TCCGTTCACC  CCTGGCCGCA CCGACGCATC GCAGGAGCAG ACCGAGGTTG ACTCGATCGC CTACCTCGAG CCCAAGGTTG ACGGATTCCG CAACTACGGC AAGTCGACCT CGCGCGTCCG CTCCGAGGCT  CTCCTCATTG ACCGCGCCAA CCTGCTCACC CTCACCCCGC CCGAACTAAC CGTCCTCATC GGCGGTCTCC GCTCCCTGAA CGCCAACTAC GACAAGTCCG ACAAGGGTGT GTTGACCAAG  ACTCCCGGCA AGTTGACCAA CGACTTCTTC GTCAATCTCC TCGACATGAA CACCGCCTGG AAGCCGATCG ACTCCGAGCA CGAGGTCTTC GAAGGCGTCG ACCGCAAGAC CGGCGCCAAG  AAGTGGACCG CCACCCGTAT CGACCTCATC TTCGGCTCGC ACGCCGAGCT GCGCGCCGTT TCCGAGGAGT ACGCCAGCGC CGGCGTCAAC GACAAGTTCG TCAAGGACTT TGTTGCCGCC 
TGGGACAAGG TCATGACGCT GGACCGCTTC GACGTTAAGT AG 

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