Entry information : LsalCP[P]04
Entry ID 10146
Creation 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LsalCP[P]04
Name LsalCP[P]04
Class Catalase peroxidase     [Orthogroup: CP001]*
Taxonomy Eukaryota Metazoa Arthropoda Maxillopoda Caligidae Lepeophtheirus
Organism Lepeophtheirus salmonis    [TaxId: 72036 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LsalCP[P]04
start..stop
S start..stop
MedeBAC3506CP01 805 0 6..656 5..710
AmeCP01_QYMF 791 0 7..656 6..729
AflaCP01 791 0 5..657 35..752
CphCP01_DSM266 781 0 6..657 5..732
Literature and cross-references LsalCP[P]04
DNA ref. GenBank:   ADND02009317.1 (17460..15306)
Protein sequence: LsalCP[P]04
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   657
PWM (Da):   %s   72504.3  
PI (pH):   %s   4.64
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTNATSKCPV LNHSTHSSGS VANQHWWPEQ LNLKMLNQNS SLINPMKSDF DYKKEFKKLN FQALKQDLHN LMTDSQDWWP ADYGHYGPLF VRMAWHSAGT YRTYDGRGGA STGSQRFSPL  NSWPDNGNLD KARRLLWPIK QKHGQKISWA DLMILAGNVA MESMGLETKG FGGGRADIWE PEEDIYWGSE TQWLDDERYS GERELESPLG AVQMGLIYVN PEGPNGNPDP LKSAFDIRDT  FARMGMDDYE TVALIAGGHT FGKGHGAGPE NSVGSEPEGA PLEQMGLGWV NAHGSGKGSD TTTAGFEGAW TINPTQWDMG YFDxxGYEWE QVKSPMGVTQ WAPTSSSNAQ QPKAAHDASS  TEPLMMLTSD IAIKTDPIYV NIAKNFHQNP QEFATAYAQA WFKLTHRDMG PKSRYLGEEV PSEDLIWQDP LPQNTVQLTE QDKVLSALNE IKSNSNTTVS LADLIVLGGS VAIEQVSGIT  VPFTPGRTDA SAEKTDAESF EVLEPKYDGF RNFKDTQDTR STESLLVDKA QLLTLTAPEM TVLIGGLRCI NINTEATNHG VLTNNQGALS NDFFKNILDI NIEWKSVDKS QEIFNGYDRE 
SGKVKWTGSR ADLVFGSNSI LRSLSEVYAS DDANQKFIAD FVLAWTKVMN LDRFDVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAACG CTACAAGTAA ATGTCCGGTT CTTAACCACA GCACACACAG CTCTGGCAGT GTGGCTAACC AACATTGGTG GCCGGAACAA CTCAATTTAA AAATGCTTAA TCAAAATTCT  TCTTTAATTA ACCCAATGAA AAGTGATTTT GATTATAAAA AGGAATTTAA AAAACTTAAT TTCCAAGCGC TAAAACAAGA TTTACACAAC CTCATGACGG ACTCTCAAGA TTGGTGGCCT  GCAGATTATG GGCATTATGG TCCTTTGTTT GTTCGCATGG CTTGGCACAG TGCGGGAACG TATCGTACTT ACGATGGTCG AGGCGGTGCC TCTACTGGAT CTCAACGTTT TTCCCCGTTA  AATAGCTGGC CTGACAATGG CAATCTAGAT AAAGCAAGAC GCTTACTATG GCCTATAAAA CAAAAGCACG GGCAAAAAAT CTCTTGGGCT GACTTAATGA TTCTTGCCGG TAATGTGGCC  ATGGAATCCA TGGGGCTTGA AACTAAAGGC TTTGGTGGTG GTAGAGCCGA TATCTGGGAA CCCGAAGAAG ATATATATTG GGGTTCAGAA ACACAGTGGT TAGACGACGA ACGCTATAGC  GGAGAGCGCG AACTAGAATC TCCTTTGGGT GCAGTTCAAA TGGGCTTAAT TTACGTCAAC CCTGAGGGAC CTAATGGCAA TCCGGATCCA TTGAAATCGG CATTTGATAT TCGCGATACA  TTTGCCAGAA TGGGAATGGA CGATTATGAA ACGGTTGCAC TTATTGCTGG CGGGCACACA TTTGGAAAAG GGCATGGCGC GGGGCCTGAG AATAGCGTAG GCTCAGAACC AGAGGGTGCA  CCGTTAGAAC AAATGGGTTT AGGCTGGGTA AATGCACACG GCTCAGGCAA AGGTAGTGAT ACCACAACTG CCGGCTTTGA AGGCGCATGG ACTATTAACC CAACACAATG GGATATGGGG  TATTTTGATG TTTATTGGTT ATGAATGGGA GCAAGTAAAA AGCCCCATGG GGGTAACACA ATGGGCACCT ACTTCAAGCT CTAATGCGCA ACAACCTAAA GCGGCACATG ACGCATCCAG  CACCGAGCCT TTAATGATGC TAACAAGCGA TATCGCCATC AAAACTGACC CAATATACGT AAATATTGCT AAAAACTTCC ACCAAAACCC ACAAGAGTTT GCAACAGCCT ATGCGCAAGC  ATGGTTTAAG CTCACACATC GAGATATGGG ACCCAAAAGT CGGTATCTAG GTGAAGAAGT ACCGTCAGAA GACTTAATCT GGCAAGACCC TCTTCCACAA AATACTGTGC AGTTAACCGA  ACAAGATATC AAGGCGCTAA AAACATCTAT TTTAAAAGCG GGCTTATCCA CAAGTGAATT AGTCGCAACG GCATGGGCAT CCGCATCAAC ATTTCGTGGC TCTGATTATC GTGGCGGAGC  AAATGGCGCT CGTATTGCAT TAGCCCCACA AAAAGACTGG GCGGTTAATA ATCCTCAACA GTTATCCAAA GTGCTCTCTG CACTAAATGA AATTAAGTCG AACTCTAACA CTACAGTTTC  TCTTGCGGAT TTAATTGTGC TTGGTGGCTC GGTAGCTATT GAACAAGTAA GTGGGATTAC CGTCCCTTTT ACTCCTGGAC GTACAGACGC ATCCGCAGAG AAAACCGACG CAGAATCGTT  TGAAGTACTT GAGCCTAAAT ACGACGGTTT CCGCAATTTC AAAGACACAC AAGACACGCG CTCAACCGAG TCGTTGCTTG TCGATAAAGC GCAATTATTG ACACTGACTG CACCAGAAAT  GACTGTACTA ATTGGTGGGC TTCGCTGTAT AAACATTAAT ACAGAGGCAA CAAATCACGG TGTGCTAACA AATAATCAAG GTGCGCTTTC TAATGATTTC TTTAAAAATA TCTTGGATAT  AAATATTGAA TGGAAATCGG TTGATAAATC ACAAGAAATA TTTAACGGTT ACGACCGGGA GTCGGGTAAG GTGAAGTGGA CAGGCAGTCG TGCAGACCTA GTCTTTGGTT CTAACTCTAT 
TCTACGTTCA TTATCCGAAG TGTATGCATC TGACGACGCT AATCAAAAGT TTATTGCTGA TTTTGTGCTT GCGTGGACCA AGGTAATGAA TTTAGATCGC TTTGACGTAA ATTAA 

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