Entry information : EcamAPx09 ( EcC001245.40)
Entry ID 10236
Creation 2012-01-30 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-04-07 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-04-07 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EcamAPx09 ( EcC001245.40)
Name (synonym) EcamAPx09 ( EcC001245.40)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus camaldulensis    [TaxId: 34316 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EcamAPx09
start..stop
S start..stop
EgrAPx09 452 1e-162 1..287 1..287
EguAPx09 451 3e-162 1..287 1..287
EglAPx09 451 3e-162 1..287 1..287
LsaAPx02 397 6e-141 1..287 1..285
Literature and cross-references EcamAPx09 ( EcC001245.40)
Protein sequence: EcamAPx09 ( EcC001245.40)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   26736.84 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.95
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALPVVDTEY LKEIDKARRH LRALIAYKNC APIMLRLAWH DAGTYDARTK TGGPTGSIRN EEEYSHGANA GLKIALDFxx DVKSKCPRIT YADLYQLAGV VAVEVTGGPT IDFVPGRKDS  RVSPNEGRLP DANQxxxxxx xxxxxxxxxx xxxxxxxxxx xxxxxxxxxx xxxxGFTQEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKALLE DPAFRPYVEL YAKDEDAFFR DYVISHKKLS 
ELGFTPSSSG SKTVANGAVL AQGAVGVAVA AAVVILSYFY EVRKKMK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from kazusa (Parts of the sequence are missing due to NNNN in DNA).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCTGC CGGTGGTCGA CACGGAGTAC CTGAAGGAGA TCGACAAGGC CCGCCGCCAC CTCCGCGCGC TCATCGCCTA CAAGAACTGC GCTCCGATCA TGCTCCGGCT GGCGTAAATC  TCGCTTTGCC CCCGCCTCGA TTGGCGACGA CAGTTCTTTC TTCGATTCGA TTAGCTCGCC GGTTTCTGAC GTCCTGAGGT TTTCGCCGAT TCGGTCTTTG CAGGTGGCAC GACGCCGGGA  CCTACGACGC GAGAACGAAG ACCGGCGGCC CCACCGGCTC GATTCAGGAA CGAGGAGGAG TACTCCCACG GCGCCAATGC GGCTTGAAGA TCGCTCTTGA TTTTTnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnAAG AGTGTTGCAT ATAATTTACA  CGAGTCAACT TGTAGATATA CACGAGTCAA CTTGTAGATA TGTTATGTTT CTAATAGTTT CAACTATACA AGTGTAGGAA CCCATCATGG ATAAGGTCAT AGCTTTGATG AATAGACTTT  TTTGCAAATG GAGTTGAGAT ATAACTTCAA TCAGTATATT TACAATTGCT TTTATGTTGG ATACAGAGGA TGTGAAGTCC AAATGTCCGA GGATTACATA TGCAGATCTA TACCAGGTGA  AATGACTGTT TAAAGGATTC GTTCTTCTGT CTTACATATC ACAAGTTGGC TCCCCCAATA GGTGGACAAA ATCATTGTTG ATATAACAAG CTTAGTTTAT AAAAGACTTT GAATTCTTGC  CATTTAACTT TGATGTTTTC TGCCCTCCAG CATGCAACAT CTTCAAAACT AATATGCATG CGCGTGGTGA AGCCCTTAAT TGGCATAACC CAGAAATTCT TTATTTTGAG ATACTTTAGG  AACAAATCTT TATTTATCTT ATTTTTAGTC CTCTGAGAAT TTAGTTCTCA GTTGTTTATA GGAAATCTCC TCTGTCTAGT TCAACTGGTA ACGTCCTTGG TTGTTTAGTG GTTGAATAAT  GTTATATTAT AGCTGATCAA TTCTAGTGGT TACTATAAAT AATGGCTTAT CAATTTGCGA GTATTGATCA TTATGAGCGA ATTGCCTGTT TCAGCTAGCA GGAGTTGTCG CAGTAGAAGT  CACTGGAGGT CCCACAATTG ACTTTGTTCC TGGAAGAAAG GTACTCTGTT TTATCTGTAT GTGAGCAAGA TAATTCTTAC GAGTGCCTTA TTCATTAAGT TTTTTTCTAT CTGCAGGATT  CAAGAGTTTC TCCAAATGAA GGAAGACTTC CAGATGCTAA TCAAGGTTTT GTGTCAACTT TCCCTTTGTT GTGGCCTCCC TTCATTTCCC TCAATCCCTC CCTCCAAATA TTATGGCCCA  CTCTGCTTCT TATTGCTCCA GGCAAAAAGT TAAATAACTA TTTATTGTTT TCCTTATGGT TGCTGCCTGT TAATGTTGAA ATGTATGTCC ATCTCATCTG AATGTCAATT AGTAAATTTA  CAGAGGAATG ATTTGAATGA GATAAGAAGT GCATTGAAAC AAGGGTATCA GAGCTAACTG ACAGTCAGAT GTTGTCCATC CCATCTAAAT GTCAGTAAGT TTCCCGATTA AGAACCTCAC  ATGCAAAATG GGCACAGTGC CTATTTTGTA TGAGTCAGCT GTTGTGAAGT CACCACAAAG AATGAGTTGA GAGAGAAGTG CTGGGATTTG AACTCTTGAT CTGTCATCTG AAACAGTGCT  AGAATATCCA ACCTAAAAGT TTAAGCATTG ATGTGGAGAG AGGCAACATG TATGTAAGAA AACTTTAGCC ATCAGGTGAG AGAGACTATA TGTGTGTGAG ACACATTATG ACCATGTTTT  CAAGGGATGT TTGATTATCC TGAAAGACAA TATTACTACT CATGCGAACC CAGTTTGATA TTTCACATGA TATTTTACAT CTGCAGCTCA CTCTAGCTGA GTGAAAGGAG GCTCAAATGA  AAGGAGGCCT TCGACCGCAG CTTGGTTAAG CTTATCAATT TGTGATATTC ACGTTTAACA GTCCACTGCC TACCTATAAC TTATCATAGC TCTAAATCCA TCGGAGATTT TTCATGCATT  ATAATTCTTT TATTGGGGAC ATACATGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn ACTCAGGAAC CCCTTAAGTT TGATAATTCC  TATTTTGTGT AAGATTTCAT CTTTTCACCG GATGCATTTT CTACATTTCA GCTGGAGCAT TATAGAGCCA GATACTAATT GATCATTTTT GATACAGCGA GTTGTTGAAA GGGGAATCAG  AGGGGCTGCT GAAACTGCCA ACTGACAAGG CATTGCTGGA AGATCCTGCA TTTCGCCCTT ATGTTGAGTT GTATGCGAAG GTAAATAGGC TTTTCATGTG TTCTGGTGAC TCCATTGATA  AATCTATAAA ATTGAATTGC AGTTACATGG TTTCCTTTCG TAAATTTGTT TTTGATGAAA CTACCCCACC TGCACCACTA TCTCATTTCC TTATGCACAT GGTCTACAAC CCTCTGATGC  TGCTGTCCTT GGTTTTGCCA AGATTGAAAT AAGATGGAAA GTGTTTTTCA TGGAATTTAT GCTGTATAGG CTTGTGAATG CTAAAAAATA AGCATTCAGT CTGTTCCATC ACCATCTTCT  ACGTAGAGAC CAGGAATCTT CATAATGAGA TCGTGCATCA AATGTTGGGT AGATATATAC ATGTGTTGGG ATGGATATAT TATGTGGATC CCTGAAACCT CTAGGCTAGA GCATCATCTT  TGTGCTACTG GGAACACCTG ATTTGATATT TGAATTGGTT GTTGTTCCTG CAACTCTCTC ACGGTGGTTG GCATGACCTT GAAGAGAGAA ACGGACAATT TGATACTCTG CTTCTTTTTC  CCCTCGTTTT CTTTTGTCAT ATGCTCTTCT TTCCCTAATG TTGTCAAGCA TGTGGCAGGA TGAGGATGCA TTTTTCAGAG ATTATGTAAT CTCGCATAAG AAGCTCTCTG AACTGGGGTT  CACGCCAAGT TCTTCAGGCA GCAAGACAGT AGCGAATGGT GCTGTATTGG CACAAGGTGC TGTCGGAGTG GCAGTGGCTG CAGCCGTGGT GATCTTGAGC TACTTCTATG AAGTGCGCAA 
GAAAATGAAG TGA 

Retrieve as FASTA