Entry information : EcamPrx[P]42 ( EcC022949.20)
Entry ID 10456
Creation 2012-01-30 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-02-07 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EcamPrx[P]42 ( EcC022949.20)
Name (synonym) EcamPrx[P]42 ( EcC022949.20)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus camaldulensis    [TaxId: 34316 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EcamPrx[P]42
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]42 549 0 1..320 1..315
EgrPrx[P]46 529 0 4..320 1..313
EguPrx[P]42 520 0 1..320 1..315
EguPrx[P]46 511 0 4..320 1..313
Literature and cross-references EcamPrx[P]42 ( EcC022949.20)
Protein sequence: EcamPrx[P]42 ( EcC022949.20)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   315 (290)
PWM (Da):   %s   33202.78 (30636.5)  
PI (pH):   %s   8.73 (8.86) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-315
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MACESSSVNP AFLLLLRFLS GTASADLSST LYSxxxxxxx xxALHTIKCG MSSVVSSKAR MGVPLLRLCF HDCFINACHG LILLEYTANF TEKKNVSPNA NSIRVFEVID MIKSQLESTC  PRVVSYANTL VVTA*DSIVA LSGPNWIVSL GRRD*TSASQ SAAISNIPAP SLNLSDLISS FSNKGSTTKE MVALLGSYTI GQA*CLTFQA QLYNNQHRIY NITESKLSEL RRRQQPLSS* 
RHEPDVLRHC LFKNLQIQKD LLNSD*QLFS GGAIDFQGNA YSSNSATFMT DFSNAMVKMG NLNPLTGSSS QIRKNDGKVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (stops in frame). Incorrect prediction from Kazusa.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTGTG AGAGCTCTTC TGTCAACCCC GCCTTCTTAT TGTTACTCCG TTTCCTTAGC GGAACAGCCT CTGCTGACCT GTCCAGTACT TTATACTCCC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnGCCC TCCACACCAT TAAATGCGGC ATGAGCTCCG TGGTCTCGAG CAAGGCGCGC ATGGGTGTGC CGCTGCTCCG CCTTTGCTTC CACGATTGCT TCATCAATGC AAGTCTCTCT  GCTCTGAGTC TCCCCTCTCT TTCCGATTGA TTTTTACCTT TGTTTTTCTC TTTCGTTCAA GCTGCGTGCA AGCGTGCATG CATGATGCAT CTTCGTGCTT GTGCGTGTGA AGCATTCCAA  CCAACCACGT AGTCAAAAGA ATTATTAGAT TCGCGTCTAC ACAAGTTAGG TAGGAGGTTC ACATATTGAA TTAGCTGAGT CTGACACTTT TCTGGTATTT TGTGGTGCCA TGCATTTCCG  TGAGTTTATT ATATTATTAA TAGATTTTTT TTGTTATAAC AAAATAATTT TTTTGGTAAA TGAAAAAAAC TTTTTCATGA GTATCGTTAG TATATAGGCT GCCGGTGTAA AAATATTTTT  TTTACAAACG GGCTTATCCA CCCTTAATTT GGCTGTTAGT GAGGGGTTTG GAATCTTCAA ATCATGGATA AGAATGGTTA TGTAAAGTTT TCTTTAGACC GATAGTGCAC ACTTTAATTT  TCTTATATTA CAAAAACGAT GTTGTCGATC AGATGTATAT GTGATTAACT ACCTGGTTTA AATCCAATGA ACTCGATGAA TTGGATCACA TAAAGTCCTG AACGTTGGAG CTTAAAAATG  ATATTTTATG GTAAATTATC ATTTTTAATG AAATTTGTTA ATCAAATGGT ACTCTAAAAT CTTATTACGT CTTTGAACAA GCGAATCGCG CCTTGTGCAT GGCCTCACTA GTTTGCTTCC  ACACAAATTT AGAGTGTCAA TTTAAATAAA CCAATCAATT TAGTGTACCT ATTTTGTTAT CCTCTTCATC TTCTTTGTGC ATAATTTTAG AGTAGTCTAT ATCCTAGTGA GGGGTAAGTA  CATTAAAAGT ATCAAAAACT GTATACATCG CTCACTTTAA TACTAAAAAT TTTCGCCAGC TCACTTAAAC GTCAAATCGG AAAAAAAAAA AAAAAGTGAT TATCTAAGTG CCAACGACGA  GAAATTCCGG CCAAATTGAT TATATCTCAT TTATAATTAA AATTTTAATA TGACTTGACA AATTTTTTAA AAACCCCAGT CCATGTGGCA TTTTCACGTG GCATGCTTGG CACTGAAGTG  ATGGCTTTTT AATAAAAACT AGTTCTAAAG TGATCACTTT AAATAAAATT TAGCATTTAA ATGATCACTA TTTACAAATT TTGAACAACG TCATTTATGT GTTATATGCT GACTAGGCAC  GTTAGCGAGC CACGTAAGAC TGAGAAATTA ATAAAACATA ATCACGTCAG ATTTCCGGTA ACCCAAATCG GAATTGACAC TTAAAAGATT ATTATTATTT TTTTAAAGTT AGCACTTAAG  TGATCCAAAA AAACTTTTAA CACTAAAGTG AGTATCATAC ACAACTTTCA AACATGTCTC CATTTnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnCATTG TTCCTTCAGA GAAAAACGAA GCAAAGTCGA  AAGGCACGAG AAAAGTTGGA GAACTTCCTA TTTAGTGCCA CCCCGTCAAA ACTGGTGTCT CTAGGCGTTC ATGATGGGGA CGAAAAGGTG GAAAAGGATA GGGGAAAAAT TCAAAGTCCG  TACTCGATTT TCAGGAAAAA TTATAGCCTT TAACCCGTTT GCAACCATTG AATTTAATGG GCTCCAATCC CATCGATTTT CTATTTAGAA GGACTAATGT GTGGCGTAGA TGCCACGGGT  TGATTTTATT GGAGTACACC GCAAACTTCA CTGAGAAGAA GAATGTTAGC CCGAATGCCA ATTCTATACG GGTATTCGAG GTGATTGATA TGATCAAGTC CCAACTAGAG AGCACGTGCC  CCAGGGTCGT ATCCTATGCC AACACATTGG TTGTTACTGC ATGAGATTCC ATCGTTGCCT TAAGTGCACA TTTTCTTCTC AATTCTAGTG ATCAATTGTG AGGAGAAAAA AATCACATGA  TGTGTTCTCC ATGCTATATT AATACTAACA CATATGGATT TATTTTTTAC TTAATTTTTA GTTAGGTGGC CCAAATTGGA TAGTCTCACT TGGACGAAGA GACTAAACCA GCGCAAGCCA  AAGTGCTGCT ATTAGCAACA TTCCTGCCCC AAGTCTAAAC CTTAGCGACC TCATCTCTTC GTTTTCTAAC AAAGGCTCCA CCACCAAAGA AATGGTGGCA CTCTTAGGTC ATTGTCTTTT  TTTTTTTCAC CTATTAAAAA AGAATTTATA ATAATGCTCG ATCGATATAC AAAGAACAAT TTACAAAACA TTGTTTGATT GTTTGTTAAC AAGATCGTAC ACGATAGGTC AAGCCTGATG  CTTGACTTTC CAGGCCCAAC TTTACAATAA TCAACACCGC ATATACAACA TCACTGAAAG CAAACTGTCC GAGCTCCGTA GGCGACAACA ACCCCTCTCC TCTTGACGCC ACGAGCCCGA  CGTCCTTCGA CACTGCCTTT TCAAGAACTT GCAAATCCAA AAGGATCTTC TCAACTCGGA CTAGCAATTG TTCAGTGGCG GTGCCATAGA CTTTCAAGGG AATGCTTATA GCAGCAATTC 
GGCAACTTTC ATGACAGATT TTTCTAACGC TATGGTGAAG ATGGGTAACC TCAACCCGCT CACCGGCTCA AGCAGTCAAA TTAGGAAGAA CGATGGAAAG GTCAAC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTGTG AGAGCTCTTC TGTCAACCCC GCCTTCTTAT TGTTACTCCG TTTCCTTAGC GGAACAGCCT CTGCTGACCT GTCCAGTACT TTATACTCCC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnGCCC TCCACACCAT TAAATGCGGC ATGAGCTCCG TGGTCTCGAG CAAGGCGCGC ATGGGTGTGC CGCTGCTCCG CCTTTGCTTC CACGATTGCT TCATCAATGC ATGCCACGGG  TTGATTTTAT TGGAGTACAC CGCAAACTTC ACTGAGAAGA AGAATGTTAG CCCGAATGCC AATTCTATAC GGGTATTCGA GGTGATTGAT ATGATCAAGT CCCAACTAGA GAGCACGTGC  CCCAGGGTCG TATCCTATGC CAACACATTG GTTGTTACTG CATGAGATTC CATCGTTGCC TTAAGTGGCC CAAATTGGAT AGTCTCACTT GGACGAAGAG ACTAAACCAG CGCAAGCCAA  AGTGCTGCTA TTAGCAACAT TCCTGCCCCA AGTCTAAACC TTAGCGACCT CATCTCTTCG TTTTCTAACA AAGGCTCCAC CACCAAAGAA ATGGTGGCAC TCTTAGGATC GTACACGATA  GGTCAAGCCT GATGCTTGAC TTTCCAGGCC CAACTTTACA ATAATCAACA CCGCATATAC AACATCACTG AAAGCAAACT GTCCGAGCTC CGTAGGCGAC AACAACCCCT CTCCTCTTGA  CGCCACGAGC CCGACGTCCT TCGACACTGC CTTTTCAAGA ACTTGCAAAT CCAAAAGGAT CTTCTCAACT CGGACTAGCA ATTGTTCAGT GGCGGTGCCA TAGACTTTCA AGGGAATGCT  TATAGCAGCA ATTCGGCAAC TTTCATGACA GATTTTTCTA ACGCTATGGT GAAGATGGGT AACCTCAACC CGCTCACCGG CTCAAGCAGT CAAATTAGGA AGAACGATGG AAAGGTCAAC 

Retrieve as FASTA