Entry information : MlpCcP02 (Mella-CCP2)
Entry ID 10722
Creation 2012-03-08 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-07-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: MlpCcP02 (Mella-CCP2)
Name (synonym) MlpCcP02 (Mella-CCP2)
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Basidiomycota Melampsoraceae Melampsora
Organism Melampsora laricis-populina    [TaxId: 203908 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MlpCcP02
start..stop
S start..stop
CqueCcP02 597 0 4..375 1..371
PgrCcP02 546 0 50..375 60..382
PUtriCcP02 545 0 51..375 62..383
HrufCcP01 426 9e-150 47..375 39..368
Literature and cross-references MlpCcP02 (Mella-CCP2)
EST ref. GenBank:   GR807813.1 [5' end]   GR807535.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   49879
Protein sequence: MlpCcP02 (Mella-CCP2)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   377
PWM (Da):   %s   41557.68  
PI (pH):   %s   8.14
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSLLLRPTR TLPKSTRYPL SIPAVFNSRS APLSTASTQP DPSFPPPPPP KSSNTFFYGG AIGITALGLA YYAYAKDSDS QAEVQSRYTA VKSANKNLDY QAIYNDIAEV LDNNDYDDGS  YAPVLVRLAW HASGTYDKES KTGGSNGATM RFAPESGHGA NAGLGAARDL LEPIYKKYAA KGLTYSDLWT LAGVVAIQEI GGPKILWRPG RQDGVGPQNC TPDGRLPDGD KDQDHIRKIF  YRMGFNDQEI VALSGAHALG RCHPDRSGFS GPWTFSPTTF TNDYYKLLFE EKWQPKKWSG PTQYEDTKTK SLMMLTTDMS LVMDKSFRAW AKKYATDEQA FFHDFSRAFS KLIELGVPEK 
NFGGKQPFEL KNLDEA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (4 introns). Genomic DNA contains undetermined residues.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTCAC TCCTCCTGCG TCCTACTCGT ACCTTGCCCA AGTCCACTAG ATATCCTCTT TCGATCCCTG CTGTCTTCAA TTCTCGTTCA GCTCCACTTT CTACTGCTTC AACTCAACCC  GATCCATCCT TCCCACCACC CCCGCCACCC AAATCTTCAA ACACGTTTTT CTATGGAGGC GCTATCGGAA TCACAGCTCT CGGATTAGCT TACTATGCCT ACGCCAAGGA CTCTGACTCT  CAAGCTGAAG TTCAGTCCCG TTACACGGCT GTCAAATCTG CGAATAAGAA CCTCGATTAT CAAGCTATCT ACAACGATAT TGCCGAAGTA CTTGACAATA ATGATTATGA CGATGGTTCT  TACGCTCCAG TCCTTGTTCG ACTCGCTTGG CATGCATCTG GAACCTACGA CAAGGAGTCC AAGACTGGTG GTAGTAATGG AGCTACTATG CGCTTTGCTC CCGAGAGTGG CCATGGCGCG  AATGCAGGTC TGGGCGCTGC GCGAGATCTG CTTGAACCGA TTTACAAGAA GTATGCCGCC AAAGGGCTCA CTTATTCAGA TCTTTGGACC CTCGCCGGTG TTGTAGCAAT CCAAGAAATT  GGTGGACCAA AGATCTTATG GCGTCCAGGA CGTCAAGATG GCGTTGGACC TCAGAATTGT ACACCCGATG GGCGTTTGCC TGATGGTGAC AAAGATCAAG ATCACATCCG TAAGATATTC  TATCGGATGG GCTTCAATGA CCAGGAAATC GTCGCGCTCT CTGGTGCGCA TGCTTTAGGC AGATGCCATC CCGATCGTTC AGGTTTCTCG GGTCCTTGGA CATTCTCACC CACGACCTTC  ACAAACGATT ACTACAAATT ATTATTCGAA GAAAAATGGC AGCCAAAGAA ATGGTCAGGA CCGACTCAAT ATGAGGATAC CAAGACAAAA AGTTTGATGA TGTTGACAAC AGATATGAGC  TTGGTGATGG ATAAGAGTTT TCGCGCTTGG GCTAAAAAAT ATGCAACAGA TGAACAGGCA TTCTTTCACG ACTTCAGTCG TGCTTTTTCA AAGCTAATTG AGTTGGGTGT CCCAGAGAAA 
AATTTTGGTG GCAAGCAACC CTTTGAATTG AAAAACTTAG ATGAAGCTTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATTGATCCA AAATGAAAGT TGTGTGAGAT ATTCATCGCT TTTGTAAACA ACTGTAGCGA GCGAGCCGAA GCGAAAGGCA TACACTGCGA CTCAGACCAG TGCCAGTGGA TGGATCGACT  TACAAAATAA AAAGACAAAC TCAACTGATT TGCTTGATTG GATCTTTCCA CTTGAACCAT CAATTCACAA GATACACATA GACTGTACCC ATTCCTTCAA CTTTCTCAAT CGATCATGTC  TTCACTCCTC CTGCGTCCTA CTCGTACCTT GCCCAAGTCC ACTAGATATC CTCTTTCGAT CCCTGCTGTC TTCAATTCTC GTTCAGCTCC ACTTTCTACT GCTTCAACTC AACCCGATCC  ATCCTTCCCA CCACCCCCGC CACCCAAATC TTCAAACACG TTTTTCTATG GAGGCGCTAT CGGAATCACA GCTCTCGGAT TAGCTTACTA TGCCTACGCC AAGGACTCTG ACTCTCAAGC  TGAAGTTCAG TCCCGTTACA CGGCTGTCAA ATCTGCGAAT AAGAACCTCG ATTATCAAGC TATCTACAAC GATATTGCCG AAGTACTTGA CAATAATGAT TATGACGATG GTTCTTACGC  TCCAGTCCTT GTTCGACTCG CTTGGCATGC ATCTGGAACC TACGACAAGG AGTCCAAGAC TGGTGGTAGT AATGGAGCTA CTATGCGCTT TGCTCCCGAG AGTGGCCATG GCGCGAATGC  AGGTCTGGGC GCTGCGCGAG ATCTGCTTGA ACCGATTTAC AAGAAGTATG CCGCCAAAGG GCTCACTTAT TCAGATCTTT GGACCCTCGC CGGTGTTGTA GCAATCCAAG AAATTGGTGG  ACCAAAGATC TTATGGCGTC CAGGACGTCA AGATGGCGTT GGACCTCAGA ATTGTACACC CGATGGGCGT TTGCCTGATG GTGACAAAGA TCAAGATCAC ATCCGTAAGA TATTCTATCG  GATGGGCTTC AATGACCAGG AAATCGTCGC GCTCTCTGGT GCGCATGCTT TAGGCAGATG CCATCCCGAT CGTTCAGGTT TCTCGGGTCC TTGGACATTC TCACCCACGA CCTTCACAAA  CGATTACTAC AAATTATTAT TCGAAGAAAA ATGGCAGCCA AAGAAATGGT CAGGACCGAC TCAATATGAG GATACCAAGA CAAAAAGTTT GATGATGTTG ACAACAGATA TGAGCTTGGT  GATGGATAAG AGTTTTCGCG CTTGGGCTAA AAAATATGCA ACAGATGAAC AGGCATTCTT TCACGACTTC AGTCGTGCTT TTTCAAAGCT AATTGAGTTG GGTGTCCCAG AGAAAAATTT  TGGTGGCAAG CAACCCTTTG AATTGAAAAA CTTAGATGAA GCTTGACCAA ACACATCAAC AGCGTTACAA ATTGAGGCTA CGAGCCATGC TACATAACCA CTCTTACCAA CGTAGTTTGA  TGTATAAAAA TTGATGTATA ACACCTGATG GTTCCGGTCG TGTTGTGATT AAAATCATCT GTTGAAGTTT TCCTTGTGCT TGATTACATG GCTGGATTGA GTAGTCTCAC AGCTTTATTC 
TCAATATGAT CCATGTTTGC TCAGATGTAA AAGAATGATG TTTTTACAC 

Retrieve as FASTA