Entry information : CposLDS01_silveira
Entry ID 10753
Creation 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CposLDS01_silveira
Name CposLDS01_silveira
Class Linoleate diol synthase (PGHS like)    [Orthogroup: LDS001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Eurotiomycetes Coccidioides
Organism Coccidioides posadasii    [TaxId: 199306 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CposLDS01_silveira
start..stop
S start..stop
CimLDS01 2224 0 1..1080 1..1080
AorLDS01 1385 0 10..1076 8..1075
AfumLDS01 1384 0 15..1080 13..1079
AniLDS01 1384 0 11..1080 9..1079
Literature and cross-references CposLDS01_silveira
DNA ref. GenBank:   ABAI02000078.1 (183608..180032)
Protein sequence: CposLDS01_silveira
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1080
PWM (Da):   %s   121456.64  
PI (pH):   %s   6.47
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVLDSLSRRG VLDDLAKYFP HFGGIANGSL WPITPDSGHH SPSQGPTGGL LQDLGSLDVK DVGTVLELLK NTASGAPVED KRYIMERVIQ LASSLPSTSH NRTTITNTLL AQLWNDLSHP  PVSYLGRDVI YRQADGSYNN IYWPQIGKAG SNYARSVQPK SIQPASRPDP GLLFDGLLAR QQFKEHPNKL SSVLFYLAAL IIHDLFRTDP RDSSRNMTSS YLDLSPLYGC NQEEQNQVRT  FKDGKLRPDC FSERRIFGFP PGVGVLLIMF NRFHNYVVQN LAAINENNRF RKPDESDADA CAKYDNDLFQ TGRLITCGLY INIILKDYVR NILNINQTDS DWSLDPRSDV KELLSHKPVQ  EAGGNMVAAE FNLVYRWHSC LSDRDDRWMQ EIFEKALDGK DLDTIGMPEF LGKIRKLQSS IPDDPMLRPF ANLERQSNGS YDDNDLVKIL TESIEDCAGS FGARHVPKVL RSVEILGILQ  ARSWNLSSLN EFRKYFNLAP HTSFEDINSD PEVVEQLRHF YGHPDNVELY PGIVVEEGKP RIVPGSGLCA SYTISRTVLS DAVALVRGDR FYTVDYTPQN LTNWGYNEAN YDMTVNNGHI  FHKLILRAFP RHFKPDSVYA HFPFVIPSEN KKILSDLGLA EKYSWERPGA VPHPTVILSH GACNAILHNK EDFKITWGEK VKHLMARNSI PYGADFMLSG DEQVHEDSRQ MMQKALYIED  WCGQVRAFYE RITLELLHSK SHRISGVSQV DIVRDVANLA AIHFSSNIFL LPLKTEGLPH GVFTDTELYR SMALILNYIF YDVDPTQSFK LRERSRSDSQ KLGELVMLNV QAISKTGFIG  SIIDKLHGNE ALANYGVHMI RRLLATQMPI DELVWTHILP TAGGMVANQA QLFSQCLDFY LSEQGSRHWP EIRRLAGLNT KEADDLLLRY FLEGARIRST VALYRDVSKD CKVKDHGKEV  NLHAGQRVIC NLMSACKDPE VFPEPDEVDL TRDLNSYIHL GVGPHECLGK GMVQIGLTTM LKVVGRLDNL RRAPGPQGQL HSIPGPGGIP LYMSEDESEV SPFPATMKVL WDGELPPLPQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (6 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCTGG ATTCATTATC CCGCCGAGGT GTGCTTGACG ACCTTGCGAA GTATTTCCCC CATTTCGGCG GGATTGCCAA CGGCTCCCTC TGGCCGATAA CTCCTGATTC GGGACACCAC  TCGCCGTCCC AGGGGCCTAC GGGTGGGCTG CTGCAGGACC TTGGGAGTTT GGATGTCAAG GATGTCGGGA CGGTCCTGGA GCTTCTTAAG AATACCGCCA GTGGTGCGCC TGTCGAGGAC  AAGCGTTATA TTATGGAAAG AGTCATACAG GTACGTTAGG AGGATGGACT ACTGTCGGGC ACAATTCTAA ACTCCGTTAT AGCTGGCTTC GTCGCTACCC AGTACATCCC ACAACCGTAC  TACTATCACA AATACTCTGC TGGCTCAGCT TTGGAATGAC CTGAGTCACC CACCGGTCTC GTAAGTTTTC TGATGATAAG AACTTTGAAG GCCGCTAGCT GACATTGATG TAGGTATTTA  GGTCGCGATG TTATTTATCG ACAGGCGGAT GGCTCATATA ATGTATGTTT ATTCGCACCC GGGGTGATTG TGCGCACTGC TGTGCTAATG GAAAACTGGA CAGAATATCT ATTGGCCTCA  AATTGGAAAG GCGGGATCCA ATTATGCAAG GAGTGTGCAG CCGAAATCGA TACAGCCAGC CTCGCGCCCA GATCCAGGTC TCCTGTTCGA CGGCCTTCTC GCAAGACAAC AGTTCAAAGA  GCACCCAAAC AAATTATCGA GTGTGCTCTT TTATCTTGCA GCTCTTATCA TTCATGGTAT GTTTCCCAGC ACTGTCGAAA TGAGAATATT CGATCTAACA AGTAACTAGA CCTTTTCCGA  ACGGACCCAA GGGATAGTTC TCGCAACATG ACGTCTTCAT ACCTGGACTT ATCGCCGTTG TACGGCTGCA ACCAGGAAGA GCAAAATCAA GTTAGAACGT TTAAAGATGG GAAGCTCCGG  CCGGACTGCT TTTCTGAAAG GCGTATTTTC GGGTTCCCTC CTGGTGTTGG TGTTCTGCTT ATTATGTTCA ATCGTTTCCA CAACTATGTT GTCCAAAATC TCGCAGCGAT TAATGAAAAT  AACCGGTTCC GAAAACCCGA TGAGAGTGAT GCAGATGCCT GTGCGAAGTA CGACAACGAT CTCTTCCAAA CTGGACGCCT AATCACCTGC GGCCTTTACA TAAACATTAT CCTGAAAGAC  TATGTTAGGA ACATTCTCAA TATCAATCAG ACAGATAGTG ACTGGAGCCT CGACCCTCGT TCGGATGTGA AAGAACTTTT GAGCCACAAA CCTGTTCAGG AGGCCGGTGG AAACATGGTG  GCTGCGGAAT TCAACCTGGT TTACCGATGG CATTCTTGCC TTTCTGATAG AGATGATCGT TGGATGCAGG AAATCTTCGA GAAAGCTTTG GATGGAAAAG ACCTAGACAC TATTGGTATG  CCAGAATTCC TAGGGAAAAT CAGGAAACTA CAGAGTTCTA TTCCTGATGA CCCTATGTTA CGGCCGTTTG CAAATCTTGA GCGGCAGTCA AACGGGTCGT ATGATGACAA CGATCTGGTT  AAAATCCTCA CGGAGAGCAT TGAAGATTGC GCCGGCTCTT TTGGAGCGAG ACATGTGCCC AAAGTTTTGC GATCTGTGGA GATATTGGGC ATTCTCCAGG CTCGCTCGTG GAACCTGTCG  AGCCTCAATG AGTTCCGGAA GTATTTCAAC CTCGCCCCTC ATACCTCGTT TGAAGATATC AACTCAGATC CCGAGGTTGT GGAACAATTG AGGCACTTTT ATGGTCATCC CGACAATGTC  GAGTTGTACC CTGGTATCGT CGTCGAGGAA GGAAAACCCC GTATAGTTCC GGGAAGCGGT CTATGTGCCA GCTATACCAT ATCCCGCACA GTCCTCTCCG ATGCGGTGGC ACTAGTGAGA  GGCGATAGAT TTTATACTGT TGACTATACA CCACAGAATC TTACAAACTG GGGATATAAC GAAGCAAACT ACGATATGAC GGTTAACAAT GGCCACATAT TCCACAAGCT TATCCTCCGC  GCCTTTCCCC GACATTTCAA GCCCGATTCG GTTTACGCCC ATTTCCCATT TGTTATACCC TCTGAGAACA AGAAGATACT GAGCGACTTG GGCTTGGCTG AAAAATACTC TTGGGAAAGA  CCTGGTGCTG TGCCTCATCC CACTGTGATC CTTTCTCATG GCGCCTGCAA CGCGATACTG CACAATAAGG AAGATTTCAA GATCACTTGG GGCGAAAAAG TCAAGCATCT AATGGCGCGA  AATTCTATTC CGTACGGTGC TGACTTTATG CTGTCTGGAG ATGAGCAGGT GCACGAGGAC TCACGCCAAA TGATGCAAAA AGCGTTATAC ATAGAGGACT GGTGCGGGCA GGTTAGGGCT  TTCTACGAAC GAATAACCCT AGAACTGCTT CATTCAAAGT CACATCGAAT TTCTGGAGTT AGTCAGGTTG ATATCGTTCG TGATGTTGCC AATCTGGCCG CAATTCACTT TAGTTCGAAC  ATCTTTCTGC TTCCTCTTAA GACAGAAGGG CTGCCACATG GAGTTTTCAC AGACACAGAG CTTTACAGAA GCATGGCCCT GATTTTGAAT TACATATTTT ACGACGTCGA CCCAACGCAA  AGTTTCAAGC TCCGAGAGCG TTCTCGAAGC GATTCTCAGA AACTCGGAGA GCTTGTAATG TTGAATGTTC AAGCTATCTC GAAGACTGGC TTTATTGGGA GTATTATTGA CAAACTGCAC  GGAAACGAAG CTCTCGCAAA TTATGGGGTT CATATGATAC GGCGCTTGCT AGCAACACAG ATGCCTATTG ATGAGCTTGT CTGGACACAT ATCCTTCCCA CCGCTGGAGG CATGGTGGCA  AATCAAGCGC AACTGTTTTC TCAGTGCCTT GATTTCTACC TCTCGGAGCA AGGATCAAGA CACTGGCCGG AAATTCGTCG ACTGGCTGGC TTGAATACCA AGGAGGCTGA TGATCTTCTC  CTGAGATAGT AAGTTATTGT TCGCCATGGG CTTGCTATGT TTATGTGCTA ACAACTGGAC AGCTTTTTGG AGGGAGCTCG GATACGATCC ACTGTAGCTC TGTATCGCGA TGTTTCCAAA  GATTGCAAGG TTAAAGATCA CGGCAAAGAG GTAAATTTGC ATGCCGGACA ACGAGTCATT TGCAATTTGG TGAGCTTCTC CAGAACTACC CCGGGAGATG GGTAGTAAAA ATGTCTAACA  GGTACAACAG ATGTCTGCAT GCAAGGATCC CGAGGTTTTC CCTGAGCCCG ATGAGGTTGA CCTCACTCGC GATCTAAATT CGTACATTCA CCTTGGCGTC GGTCCTCATG AGTGTTTGGG  CAAGGGCATG GTTCAAATAG GCCTTACAAC CATGCTTAAG GTTGTGGGGA GACTTGACAA CCTGCGCCGG GCACCCGGAC CCCAGGGACA GCTGCATAGC ATTCCTGGAC CAGGCGGAAT 
CCCGCTTTAC ATGTCGGAAG ATGAGAGCGA GGTTTCTCCT TTCCCGGCTA CGATGAAGGT GCTGTGGGAC GGGGAGCTGC CGCCTCTTCC ACAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGCTGG ATTCATTATC CCGCCGAGGT GTGCTTGACG ACCTTGCGAA GTATTTCCCC CATTTCGGCG GGATTGCCAA CGGCTCCCTC TGGCCGATAA CTCCTGATTC GGGACACCAC  TCGCCGTCCC AGGGGCCTAC GGGTGGGCTG CTGCAGGACC TTGGGAGTTT GGATGTCAAG GATGTCGGGA CGGTCCTGGA GCTTCTTAAG AATACCGCCA GTGGTGCGCC TGTCGAGGAC  AAGCGTTATA TTATGGAAAG AGTCATACAG CTGGCTTCGT CGCTACCCAG TACATCCCAC AACCGTACTA CTATCACAAA TACTCTGCTG GCTCAGCTTT GGAATGACCT GAGTCACCCA  CCGGTCTCGT ATTTAGGTCG CGATGTTATT TATCGACAGG CGGATGGCTC ATATAATAAT ATCTATTGGC CTCAAATTGG AAAGGCGGGA TCCAATTATG CAAGGAGTGT GCAGCCGAAA  TCGATACAGC CAGCCTCGCG CCCAGATCCA GGTCTCCTGT TCGACGGCCT TCTCGCAAGA CAACAGTTCA AAGAGCACCC AAACAAATTA TCGAGTGTGC TCTTTTATCT TGCAGCTCTT  ATCATTCATG ACCTTTTCCG AACGGACCCA AGGGATAGTT CTCGCAACAT GACGTCTTCA TACCTGGACT TATCGCCGTT GTACGGCTGC AACCAGGAAG AGCAAAATCA AGTTAGAACG  TTTAAAGATG GGAAGCTCCG GCCGGACTGC TTTTCTGAAA GGCGTATTTT CGGGTTCCCT CCTGGTGTTG GTGTTCTGCT TATTATGTTC AATCGTTTCC ACAACTATGT TGTCCAAAAT  CTCGCAGCGA TTAATGAAAA TAACCGGTTC CGAAAACCCG ATGAGAGTGA TGCAGATGCC TGTGCGAAGT ACGACAACGA TCTCTTCCAA ACTGGACGCC TAATCACCTG CGGCCTTTAC  ATAAACATTA TCCTGAAAGA CTATGTTAGG AACATTCTCA ATATCAATCA GACAGATAGT GACTGGAGCC TCGACCCTCG TTCGGATGTG AAAGAACTTT TGAGCCACAA ACCTGTTCAG  GAGGCCGGTG GAAACATGGT GGCTGCGGAA TTCAACCTGG TTTACCGATG GCATTCTTGC CTTTCTGATA GAGATGATCG TTGGATGCAG GAAATCTTCG AGAAAGCTTT GGATGGAAAA  GACCTAGACA CTATTGGTAT GCCAGAATTC CTAGGGAAAA TCAGGAAACT ACAGAGTTCT ATTCCTGATG ACCCTATGTT ACGGCCGTTT GCAAATCTTG AGCGGCAGTC AAACGGGTCG  TATGATGACA ACGATCTGGT TAAAATCCTC ACGGAGAGCA TTGAAGATTG CGCCGGCTCT TTTGGAGCGA GACATGTGCC CAAAGTTTTG CGATCTGTGG AGATATTGGG CATTCTCCAG  GCTCGCTCGT GGAACCTGTC GAGCCTCAAT GAGTTCCGGA AGTATTTCAA CCTCGCCCCT CATACCTCGT TTGAAGATAT CAACTCAGAT CCCGAGGTTG TGGAACAATT GAGGCACTTT  TATGGTCATC CCGACAATGT CGAGTTGTAC CCTGGTATCG TCGTCGAGGA AGGAAAACCC CGTATAGTTC CGGGAAGCGG TCTATGTGCC AGCTATACCA TATCCCGCAC AGTCCTCTCC  GATGCGGTGG CACTAGTGAG AGGCGATAGA TTTTATACTG TTGACTATAC ACCACAGAAT CTTACAAACT GGGGATATAA CGAAGCAAAC TACGATATGA CGGTTAACAA TGGCCACATA  TTCCACAAGC TTATCCTCCG CGCCTTTCCC CGACATTTCA AGCCCGATTC GGTTTACGCC CATTTCCCAT TTGTTATACC CTCTGAGAAC AAGAAGATAC TGAGCGACTT GGGCTTGGCT  GAAAAATACT CTTGGGAAAG ACCTGGTGCT GTGCCTCATC CCACTGTGAT CCTTTCTCAT GGCGCCTGCA ACGCGATACT GCACAATAAG GAAGATTTCA AGATCACTTG GGGCGAAAAA  GTCAAGCATC TAATGGCGCG AAATTCTATT CCGTACGGTG CTGACTTTAT GCTGTCTGGA GATGAGCAGG TGCACGAGGA CTCACGCCAA ATGATGCAAA AAGCGTTATA CATAGAGGAC  TGGTGCGGGC AGGTTAGGGC TTTCTACGAA CGAATAACCC TAGAACTGCT TCATTCAAAG TCACATCGAA TTTCTGGAGT TAGTCAGGTT GATATCGTTC GTGATGTTGC CAATCTGGCC  GCAATTCACT TTAGTTCGAA CATCTTTCTG CTTCCTCTTA AGACAGAAGG GCTGCCACAT GGAGTTTTCA CAGACACAGA GCTTTACAGA AGCATGGCCC TGATTTTGAA TTACATATTT  TACGACGTCG ACCCAACGCA AAGTTTCAAG CTCCGAGAGC GTTCTCGAAG CGATTCTCAG AAACTCGGAG AGCTTGTAAT GTTGAATGTT CAAGCTATCT CGAAGACTGG CTTTATTGGG  AGTATTATTG ACAAACTGCA CGGAAACGAA GCTCTCGCAA ATTATGGGGT TCATATGATA CGGCGCTTGC TAGCAACACA GATGCCTATT GATGAGCTTG TCTGGACACA TATCCTTCCC  ACCGCTGGAG GCATGGTGGC AAATCAAGCG CAACTGTTTT CTCAGTGCCT TGATTTCTAC CTCTCGGAGC AAGGATCAAG ACACTGGCCG GAAATTCGTC GACTGGCTGG CTTGAATACC  AAGGAGGCTG ATGATCTTCT CCTGAGATAC TTTTTGGAGG GAGCTCGGAT ACGATCCACT GTAGCTCTGT ATCGCGATGT TTCCAAAGAT TGCAAGGTTA AAGATCACGG CAAAGAGGTA  AATTTGCATG CCGGACAACG AGTCATTTGC AATTTGATGT CTGCATGCAA GGATCCCGAG GTTTTCCCTG AGCCCGATGA GGTTGACCTC ACTCGCGATC TAAATTCGTA CATTCACCTT  GGCGTCGGTC CTCATGAGTG TTTGGGCAAG GGCATGGTTC AAATAGGCCT TACAACCATG CTTAAGGTTG TGGGGAGACT TGACAACCTG CGCCGGGCAC CCGGACCCCA GGGACAGCTG  CATAGCATTC CTGGACCAGG CGGAATCCCG CTTTACATGT CGGAAGATGA GAGCGAGGTT TCTCCTTTCC CGGCTACGAT GAAGGTGCTG TGGGACGGGG AGCTGCCGCC TCTTCCACAG 
TGA 

Retrieve as FASTA