Entry information : CposLDS02_silveira
Entry ID 10754
Creation 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-03-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CposLDS02_silveira
Name CposLDS02_silveira
Class Linoleate diol synthase (PGHS like)    [Orthogroup: LDS001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Eurotiomycetes Coccidioides
Organism Coccidioides posadasii    [TaxId: 199306 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CposLDS02_silveira
start..stop
S start..stop
CimLDS02 2129 0 1..1045 1..1044
AteLDS05 1256 0 12..1045 17..1036
AclLDS02 1199 0 16..1044 18..1045
AorLDS05 1153 0 9..918 13..927
Literature and cross-references CposLDS02_silveira
DNA ref. GenBank:   ABAI02000104.1 (38235..34326)
Protein sequence: CposLDS02_silveira
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1045
PWM (Da):   %s   116962.19  
PI (pH):   %s   7.11
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDLRKSDKDT QSGLANVLSG TMADIFSQTG RIGSDIQVIR EGAETMAAGG IIDDRQYTIE HIIQLAASLP NGSKLRDKLT DQFITTLWNN LEHPPLSYLG DQFKYRSADG SNNNIMYPHL  GASGSHYARS VVPQRPKMTN LPDPELIFET LMKRNGPSKD HPTKISSMLF HFATIIIHDI FRTDELDISR LKNSSYLDLG PLYGHDEEQQ KSVRQFKDGL LKNDAFAEER VLGQPPGVCA  LLVAFNRFHN YVVGELATIN ERGRFTMPVE GSPNYEKALL KRDNDLFQTG RLVTCGLYIN VILNDYLRAI LNLNDNDKDS DWKLDPRLAV GVFDATGVPR GVGNQVSAEF NVIYRFHPAV  SNNDEAWANQ FFKDVFGNDK DPAKISVNEF RLGIWNWMRK LDKDPAKREF GGLKRQSNGM FKDSDLVKLL QESTEAVAGS FGARNVPAVM KVVEMLGIEQ GRQWGLATLN EFRAFFKLKR  HEKFLDVNSD PSIAETLESL YGHPDDIELY TGVHVEEAKK PFMPGSGLCP GFTISTAILY DAVALVRGDR FYTIDYSPES LTSFGFSVAN SSFDVAKGGV MYRLLMRAFP SWYRPNSVYA  LFPFTTPEKN REVFTKHGSV NQYSFDRPSL TMPPIPISTW KGVVDVLNDQ ARFKVPWGPH TFEMTKHDYM LSGDSKANAE QREFVSKCLF EPKKGLEEVR KFYEAVTLNF LRKHGRKAGN  TYQVDAVREI GNLVHANFAG HFFQIPLQSA SGGPDSFTEQ ELYDSLAHLF AYVFLDVDPA KSFERSVVGA RDSARLGKVV SQAVAAVQAG GFFFFKHLEH AKPEILSEYG ARLVERLSRG  RKSVDEVTWT IIPTAAASVA TQAQGANKYV QWAQMFDLYM SDKYYSHWKT IEKLSRSDAP EDFEKLKRYA LEGLRLATPA YGVLRVAATN GTIQDGNRTV SYKPGDVIFT NFMTAGADPS 
RFPDPEAIKL DRPEEDYIHH GWGPHTCLGR PFVTTAAASM LRVFGRLDNV RRAPGPPGEM KSKVEGGVFK VFLTPDGGDW NAFPC 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTTGC GCAAGAGCGA CAAAGACACT CAGTCTGGCT TGGCCAACGT GCTGAGCGGC ACGATGGCTG ACATTTTCAG CCAGACCGGG CGTATTGGAT CCGACATTCA GGTTATCAGG  GAGGGCGCTG AGACGATGGC CGCTGGTGGT ATTATCGACG ATCGCCAGTA TACTGTAAGC AACCACTCGC TACTTAGATG TGAGCAGCCG ATAAACGGCC TTTCTTATCA TATAGATCGA  GCACATCATT CAGCTAGCGG CGTCTCTCCC TAACGGATCG AAGCTCCGGG ATAAACTTAC GGATCAGTTT ATCACCACAT TGTGGAACAA CCTGGAGCAT CCACCGCTAT CTTACCTGGG  TGACCAGTTC AAATACCGTA GTGCCGATGG TTCAAACAAT GTACGTTCGC ACCCTCCTGT CCACTAGGTC AAGCTTCAGT TCTGACTGCA CCTAGAACAT AATGTATCCC CATCTTGGGG  CTTCAGGAAG TCACTATGCG AGAAGCGTAG TCCCACAGCG GCCCAAGATG ACCAATCTTC CTGATCCGGA ACTTATTTTT GAGAGTATGT TGCATGAAAT TTGTCAGTAT AGAATGAATG  GCACTTACTC TGAATAGCTT TGATGAAGCG TAACGGCCCC TCAAAGGACC ACCCAACCAA GATATCGAGC ATGTTGTTCC ATTTCGCAAC GATAATTATC CACGGTAGGT GTCTCTGCCT  CACTCATTAA CTGTGAATTC AGTGTTAATT TCCATAGACA TTTTTCGCAC TGATGAATTG GACATCAGCC GCTTGAAGAA CTCCTCGTAT CTCGATCTTG GTCCGCTCTA CGGACACGAT  GAGGAGCAGC AGAAAAGTGT CCGACAGTTC AAGGACGGCT TGCTCAAGAA CGACGCATTT GCTGAAGAGC GAGTGCTGGG CCAACCCCCA GGAGTGTGCG CCTTGCTAGT CGCTTTCAAT  CGCTTCCACA ACTACGTTGT TGGAGAGTTG GCGACCATCA ACGAGCGGGG ACGTTTCACC ATGCCTGTGG AAGGTAGTCC AAACTATGAA AAAGCCTTGC TTAAGCGGGA TAACGATTTG  TTTCAAACCG GACGACTGTG AGTGTTCAGG ATCCACTGTC CTTTGGTATC CATAGGCTCA TCAAATGGTG GATAGGGTAA CATGTGGTCT CTATATCAAC GTGATTCTCA ATGACTATCT  GAGGGCAATT CTGAACTTGA ACGACAACGA CAAAGACTCA GACTGGAAGT TGGATCCACG TCTGGCCGTG GGCGTTTTTG ATGCAACCGG TGTGCCCAGG GGAGTCGGTA ATCAAGTGAG  CGCCGAGTTT AACGTCATCT ACCGCTTCCA CCCTGCAGTA AGTAATAACG ACGAAGCTTG GGCCAATCAA TTCTTCAAAG ACGTATTTGG TAACGATAAG GATCCAGGTG AGTAATCTTG  CAAAAGTTGC TCGTCCTCTC CTGCGAGCAA TACTAACTAT CGTGAAATTC GTAAAGCCAA AATCAGTGTG AATGAGTTCC GCCTAGGGAT TTGGAATTGG ATGAGAAAGC TGGACAAAGA  CCCTGCGAAG CGGGAGTTCG GAGGCCTGAA GCGTCAGTCC AATGGAATGT TTAAGGACAG CGATCTCGTG AAGCTTCTTC AGGAAAGCAC AGAAGCCGTC GCTGGTAGGT TCGCAGCTCA  ACATCGAGGG GAACTGGAGC TGACGTAAAA CGTCGAATAG GTTCTTTTGG TGCTCGCAAT GTACCAGCCG TTATGAAGGT GGTCGAAATG CTTGGAATCG AACAGGGACG GCAATGGGGG  CTTGCGACCC TCAACGAATT CAGAGCATTT TTCAAGCTGA AGCGACACGA GAAATTCTGT GAGTAAACCC CGGTCAAGGG AAGCATAGAC TTTCTGCTTA ACCATTCAAC CAGTGGACGT  AAACTCGGAT CCATCCATCG CCGAGACCTG TAAGTTTTCG CGTCCTACAC AGCATACTTG AGTATTAATT GCAAGTTTAG TGGAATCATT GTACGGCCAC CCAGATGACA TCGAGTTATA  CACCGGAGTC CACGTCGAGG AAGCCAAGAA GCCTTTCATG CCTGGATCTG GCCTTTGCCC TGGCTTCACC ATTTCGACTG CGATTTTATA CGATGCAGTA GCATTGGTGA GGGGCGACCG  ATTTTATACG ATCGACTATA GCCCGGAGAG CCTCACAAGT TTTGGGTAAG TGATGCCACA TTCTCACCAC GAAAGATGGG CTAATTCGTT CTGCAGCTTC AGTGTTGCAA ACTCATCGTT  TGATGTTGCC AAAGGCGGAG TCATGTATAG GCTTCTCATG CGCGCATTTC CGAGCTGGTA CCGTCCGAAT TCGGTGTATG CACTCTTCCC GTTCACGACA CCGGAGAAGA ACCGTGAAGT  TTTCACGAAA CATGGTTCTG TGAATCAATA TAGCTTTGAC AGGCCCTCTC TGACTATGCC TCCGATACCC ATCTCCACGT GGAAAGGAGT GGTTGACGTT CTCAACGACC AAGCAAGGTT  TAAGGTCCCT TGTGAGTTTG AACCGAGTTG GGCTTGCTTG ACGGTAAAGC TGATTTTTGC ACAGGGGGAC CACACACTTT CGAGATGACG AAACACGACT ACATGCTTAG TGGTGACTCG  AAAGCCAACG CCGAGCAGAG GGAGTTCGTG TCAAAATGCT TATTTGAACC CAAGAAAGGC TTGGAAGAAG TCCGGAAATT TTATGAGGCT GTTACTCTGA ATTTCCTCCG TAAACACGGC  CGAAAGGCAG GGAACACCTA TCAGGTGGAT GCTGTGCGCG AGTCAGTCCT CCTTTTACCC AGAGGCAATG ATGCTTTACG CTAACATAGC CAGGATTGGA AACCTCGTGC ATGCAAACTT  CGCCGGGCAT TTCTTTCAGA TTCCGTTGCA AAGTGCTAGC GGCGGGCCAG ACAGCTTCAC AGAGCAAGAG CTCTATGATT CCTTGGCACA CTTGTTCGCG TACGTTTTCC TGGATGTTGA  CCCGGCGAAG TCATTCGAGC GAAGCGTGGT TGGGGCTAGG GACTCGGCGC GGCTTGGAAA GGTGGTTTCG CAGGCTGTTG CCGCAGTTCA AGCTGGCGGC TTCTTTTTCT TCAAGCATTT  AGAACACGCT AAACCCGAGA TCCTTAGCGA GTATGGGGCC CGCTTGGTGG AGCGACTGTC CAGAGGGCGA AAGTCCGTCG ATGAGGTGAC ATGGACAATC ATCCCAACAG CAGCTGCATC  AGTTGCAACG CAGGCGCAAG GAGTATGTTA TAACCCGGAT CCTTTTAAGG GTATAGGCTA ACAAATACGT CCAGTGGGCC CAAATGTTTG ACTTGTACAT GTCTGACAAA TACTACTCGC  ACTGGAAGAC GATCGAAAAG CTCTCGCGCT CCGACGCGCC TGAGGATTTC GAAAAGCTGA AGAGATACGC TTTAGAAGGG TAACTCCATA CTACACAGCT CCCAATGCTT TTTGATACAC  AATGCCAACC AGCGCACTTT CTTATAGGCT CCGACTTGCG ACCCCCGCCT ATGGCGTTCT CCGGGTAGCC GCCACGAACG GAACAATCCA AGATGGAAAC CGCACTGTAT CATATAAGCC  AGGAGACGTG ATATTCACGA ATTTCATGAC TGCCGGGGCC GATCCATCAA GATTCCCAGA CCCCGAAGCC ATCAAACTCG ACCGCCCTGA AGAGGATTAT ATCCACCACG GGTGGGGCCC  GCATACCTGC CTTGGACGAC CCTTCGTAAC GACAGCGGCT GCCAGCATGT TAAGGGTATT TGGTAGGTTG GACAACGTGC GGAGGGCACC TGGGCCACCT GGGGAGATGA AGAGTAAAGT 
GGAGGGAGGA GTATTCAAGG TCTTCTTGAC CCCTGACGGC GGAGACTGGA ACGCTTTCCC TTGCAGTAAG TTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTTGC GCAAGAGCGA CAAAGACACT CAGTCTGGCT TGGCCAACGT GCTGAGCGGC ACGATGGCTG ACATTTTCAG CCAGACCGGG CGTATTGGAT CCGACATTCA GGTTATCAGG  GAGGGCGCTG AGACGATGGC CGCTGGTGGT ATTATCGACG ATCGCCAGTA TACTATCGAG CACATCATTC AGCTAGCGGC GTCTCTCCCT AACGGATCGA AGCTCCGGGA TAAACTTACG  GATCAGTTTA TCACCACATT GTGGAACAAC CTGGAGCATC CACCGCTATC TTACCTGGGT GACCAGTTCA AATACCGTAG TGCCGATGGT TCAAACAATA ACATAATGTA TCCCCATCTT  GGGGCTTCAG GAAGTCACTA TGCGAGAAGC GTAGTCCCAC AGCGGCCCAA GATGACCAAT CTTCCTGATC CGGAACTTAT TTTTGAGACT TTGATGAAGC GTAACGGCCC CTCAAAGGAC  CACCCAACCA AGATATCGAG CATGTTGTTC CATTTCGCAA CGATAATTAT CCACGACATT TTTCGCACTG ATGAATTGGA CATCAGCCGC TTGAAGAACT CCTCGTATCT CGATCTTGGT  CCGCTCTACG GACACGATGA GGAGCAGCAG AAAAGTGTCC GACAGTTCAA GGACGGCTTG CTCAAGAACG ACGCATTTGC TGAAGAGCGA GTGCTGGGCC AACCCCCAGG AGTGTGCGCC  TTGCTAGTCG CTTTCAATCG CTTCCACAAC TACGTTGTTG GAGAGTTGGC GACCATCAAC GAGCGGGGAC GTTTCACCAT GCCTGTGGAA GGTAGTCCAA ACTATGAAAA AGCCTTGCTT  AAGCGGGATA ACGATTTGTT TCAAACCGGA CGACTGGTAA CATGTGGTCT CTATATCAAC GTGATTCTCA ATGACTATCT GAGGGCAATT CTGAACTTGA ACGACAACGA CAAAGACTCA  GACTGGAAGT TGGATCCACG TCTGGCCGTG GGCGTTTTTG ATGCAACCGG TGTGCCCAGG GGAGTCGGTA ATCAAGTGAG CGCCGAGTTT AACGTCATCT ACCGCTTCCA CCCTGCAGTA  AGTAATAACG ACGAAGCTTG GGCCAATCAA TTCTTCAAAG ACGTATTTGG TAACGATAAG GATCCAGCCA AAATCAGTGT GAATGAGTTC CGCCTAGGGA TTTGGAATTG GATGAGAAAG  CTGGACAAAG ACCCTGCGAA GCGGGAGTTC GGAGGCCTGA AGCGTCAGTC CAATGGAATG TTTAAGGACA GCGATCTCGT GAAGCTTCTT CAGGAAAGCA CAGAAGCCGT CGCTGGTTCT  TTTGGTGCTC GCAATGTACC AGCCGTTATG AAGGTGGTCG AAATGCTTGG AATCGAACAG GGACGGCAAT GGGGGCTTGC GACCCTCAAC GAATTCAGAG CATTTTTCAA GCTGAAGCGA  CACGAGAAAT TCTTGGACGT AAACTCGGAT CCATCCATCG CCGAGACCTT GGAATCATTG TACGGCCACC CAGATGACAT CGAGTTATAC ACCGGAGTCC ACGTCGAGGA AGCCAAGAAG  CCTTTCATGC CTGGATCTGG CCTTTGCCCT GGCTTCACCA TTTCGACTGC GATTTTATAC GATGCAGTAG CATTGGTGAG GGGCGACCGA TTTTATACGA TCGACTATAG CCCGGAGAGC  CTCACAAGTT TTGGCTTCAG TGTTGCAAAC TCATCGTTTG ATGTTGCCAA AGGCGGAGTC ATGTATAGGC TTCTCATGCG CGCATTTCCG AGCTGGTACC GTCCGAATTC GGTGTATGCA  CTCTTCCCGT TCACGACACC GGAGAAGAAC CGTGAAGTTT TCACGAAACA TGGTTCTGTG AATCAATATA GCTTTGACAG GCCCTCTCTG ACTATGCCTC CGATACCCAT CTCCACGTGG  AAAGGAGTGG TTGACGTTCT CAACGACCAA GCAAGGTTTA AGGTCCCTTG GGGACCACAC ACTTTCGAGA TGACGAAACA CGACTACATG CTTAGTGGTG ACTCGAAAGC CAACGCCGAG  CAGAGGGAGT TCGTGTCAAA ATGCTTATTT GAACCCAAGA AAGGCTTGGA AGAAGTCCGG AAATTTTATG AGGCTGTTAC TCTGAATTTC CTCCGTAAAC ACGGCCGAAA GGCAGGGAAC  ACCTATCAGG TGGATGCTGT GCGCGAGATT GGAAACCTCG TGCATGCAAA CTTCGCCGGG CATTTCTTTC AGATTCCGTT GCAAAGTGCT AGCGGCGGGC CAGACAGCTT CACAGAGCAA  GAGCTCTATG ATTCCTTGGC ACACTTGTTC GCGTACGTTT TCCTGGATGT TGACCCGGCG AAGTCATTCG AGCGAAGCGT GGTTGGGGCT AGGGACTCGG CGCGGCTTGG AAAGGTGGTT  TCGCAGGCTG TTGCCGCAGT TCAAGCTGGC GGCTTCTTTT TCTTCAAGCA TTTAGAACAC GCTAAACCCG AGATCCTTAG CGAGTATGGG GCCCGCTTGG TGGAGCGACT GTCCAGAGGG  CGAAAGTCCG TCGATGAGGT GACATGGACA ATCATCCCAA CAGCAGCTGC ATCAGTTGCA ACGCAGGCGC AAGGAGCTAA CAAATACGTC CAGTGGGCCC AAATGTTTGA CTTGTACATG  TCTGACAAAT ACTACTCGCA CTGGAAGACG ATCGAAAAGC TCTCGCGCTC CGACGCGCCT GAGGATTTCG AAAAGCTGAA GAGATACGCT TTAGAAGGGC TCCGACTTGC GACCCCCGCC  TATGGCGTTC TCCGGGTAGC CGCCACGAAC GGAACAATCC AAGATGGAAA CCGCACTGTA TCATATAAGC CAGGAGACGT GATATTCACG AATTTCATGA CTGCCGGGGC CGATCCATCA  AGATTCCCAG ACCCCGAAGC CATCAAACTC GACCGCCCTG AAGAGGATTA TATCCACCAC GGGTGGGGCC CGCATACCTG CCTTGGACGA CCCTTCGTAA CGACAGCGGC TGCCAGCATG  TTAAGGGTAT TTGGTAGGTT GGACAACGTG CGGAGGGCAC CTGGGCCACC TGGGGAGATG AAGAGTAAAG TGGAGGGAGG AGTATTCAAG GTCTTCTTGA CCCCTGACGG CGGAGACTGG 
AACGCTTTCC CTTGC 

Retrieve as FASTA