Entry information : ArubFRe01
Entry ID 10767
Creation 2012-03-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2015-12-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ArubFRe01
Name ArubFRe01
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saccharomycetes Ascoideaceae Ascoidea
Organism Ascoidea rubescens    [TaxId: 54195 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ArubFRe01
start..stop
S start..stop
PcFRe01 158 9e-41 194..743 230..753
ArubFRe02 153 7e-40 272..739 27..543
UmFRe02 115 5e-27 226..571 207..555
UmFRe01 107 2e-24 269..563 135..434
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 501539..503770 2232  
complement(join(501539..503770))


exon

Literature and cross-references ArubFRe01
DNA ref. JGI genome:   scaffold_3 (503770..501539)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   74746
Protein sequence: ArubFRe01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   743 (721)
PWM (Da):   %s   85836.7 (83339.3) Transmb domain:   %s   i7-26o159-181i231-253o268-290i311-330o345-364i384-406o (o137-159i209-231o246-268i289-308o323-342i362-384o)
PI (pH):   %s   8.58 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-743
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MRLPFRLLFA AFLLSLLAIS HSLVVVDSTL ASACIYYLKT YDWGCGSHGN GMSAYKCRCA NVNWLGSVAN CIYSESNSTA AIDHALTHVA TRCKQKAGYD YSLDDMKSFY LNATLFLRDP  IEAIDTFNLV TDPVNVNQSE FDFYDQSFKD FSFSVQRSQW FGWGLVFYWA AVLAVSSLFN LNKRYLNIKF LNSNYLKKFL ILPLIVNKNN SNSFLFTKVL RNAKIPSIVN FCILFVFAIQ  VIISCCVGYD LQLPNAFIND RWHMNMTLIS YRTDLMSISL FPLIFFFGIR NNPFIPLTGL SFSTFNLYHK FIAYIMVILA FIHAIIWTVY SVRNGGYQAW FSDTYFQYGV AAMIISSILL  FQSLRYFKDH IYEIFLLLHK ILNVFFIVVM YFHINTLGWL GWIWSMVAIW CFDRFVRIVK ICLSGGIQTV DLYRFDDNVI KMSIKKPKFF KYYQGSYSYI YFLSNSYWFY SFQSHPFSLV  SSPIEDKGNL IIYFKAKNGI TKSILKLLND LKANEPLKLK IIIEGPYGNS TGIRKKAIEN KKFVGIVGGL GVTAVYPSFV EVLKNRDSNS LEDKFNEKSL HSNNNNNNNN NSTDTSTVSS  SKNDDINTYN HDDYYDNSYT DKFYWIINDL NNLNWFHKDL DWLVSKNCFV NVIYTGSKDI KFEELVNIPT NEIHYKITRK YSRPDLNEIV EKNIFESVED NKEISILACG PEPFNNSVRY 
SIKNNITPEV SVKVNYHEEN FGW 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGACTGC CATTTCGTTT ACTTTTTGCT GCTTTTTTGC TCAGTCTCCT AGCAATTTCT CACTCTTTGG TTGTTGTCGA CTCAACTTTG GCTTCGGCCT GTATCTACTA TCTCAAGACC  TATGATTGGG GTTGTGGCTC TCATGGCAAT GGCATGAGTG CCTACAAGTG TCGTTGTGCT AATGTCAACT GGTTAGGCTC TGTCGCAAAT TGCATCTACT CAGAATCAAA TTCAACTGCA  GCCATTGACC ATGCTTTGAC CCATGTTGCT ACTCGTTGCA AACAGAAAGC TGGCTATGAT TACTCCTTGG ACGATATGAA GTCCTTTTAT CTAAACGCTA CGCTTTTTCT TAGAGACCCA  ATTGAAGCAA TTGACACTTT CAATTTGGTT ACTGATCCAG TCAACGTCAA CCAGTCTGAA TTTGATTTCT ACGATCAAAG TTTCAAAGAC TTTAGCTTTT CTGTTCAAAG ATCCCAGTGG  TTTGGCTGGG GTTTAGTCTT CTACTGGGCT GCTGTTTTAG CTGTATCTTC TTTATTCAAT TTAAACAAAA GATATTTAAA CATCAAGTTT TTAAACTCAA ACTATTTGAA AAAATTTCTT  ATACTACCTC TAATTGTCAA CAAAAACAAT TCAAATTCCT TTCTCTTTAC AAAAGTATTG AGAAATGCAA AGATTCCCTC CATTGTAAAT TTTTGTATTC TATTTGTTTT CGCAATCCAA  GTGATCATCT CCTGTTGTGT TGGTTATGAC TTGCAATTAC CAAATGCTTT CATTAATGAC AGATGGCACA TGAATATGAC TTTAATTAGT TACAGAACTG ATTTAATGTC AATTTCTCTA  TTTCCTTTAA TTTTCTTTTT TGGTATTAGA AACAATCCTT TCATTCCTCT AACTGGTCTA TCCTTTTCAA CTTTTAATTT GTACCATAAA TTCATTGCTT ACATCATGGT GATTCTAGCA  TTTATTCACG CAATTATTTG GACCGTTTAT AGCGTTAGAA ATGGCGGTTA TCAAGCCTGG TTTTCTGACA CCTATTTCCA ATATGGTGTT GCTGCAATGA TTATTAGTTC CATCTTACTA  TTCCAAAGTT TGAGATACTT TAAAGATCAC ATTTATGAAA TCTTTTTGTT GTTACATAAA ATTTTAAATG TCTTTTTCAT TGTCGTAATG TATTTTCATA TCAATACGCT AGGATGGTTG  GGATGGATTT GGTCGATGGT GGCCATTTGG TGTTTTGATA GGTTTGTTCG AATCGTTAAA ATTTGTTTAT CTGGTGGAAT TCAAACAGTT GATTTGTATA GATTTGATGA TAATGTTATT  AAAATGTCAA TTAAAAAACC CAAGTTCTTC AAATACTACC AAGGTTCATA CAGCTATATC TATTTTCTTT CAAACTCATA TTGGTTCTAT TCTTTTCAAT CCCATCCATT TTCACTAGTT  TCGTCTCCAA TTGAAGACAA GGGTAATTTG ATCATCTACT TTAAAGCTAA AAATGGTATA ACCAAATCCA TTTTGAAATT ACTCAACGAC TTGAAAGCAA ACGAACCATT GAAATTGAAA  ATCATTATTG AAGGACCATA TGGCAATTCA ACTGGTATCA GAAAAAAGGC AATTGAGAAT AAAAAATTCG TTGGAATTGT TGGTGGTTTG GGCGTTACTG CAGTTTATCC GTCATTTGTT  GAGGTTTTGA AAAATAGAGA TTCAAATTCA TTAGAAGATA AATTCAATGA AAAATCTCTT CATAGCAACA ACAACAACAA CAACAACAAC AATTCAACAG ATACTTCAAC AGTTAGTTCA  AGCAAAAATG ATGATATTAA TACTTATAAT CATGACGATT ATTACGATAA TTCATATACA GACAAGTTCT ATTGGATAAT CAATGATTTA AATAACTTGA ACTGGTTCCA TAAAGATTTA  GACTGGTTGG TATCCAAAAA CTGTTTTGTT AATGTTATAT ACACTGGAAG TAAAGATATA AAATTCGAAG AATTGGTCAA TATTCCAACT AACGAAATTC ATTACAAAAT CACTAGAAAA  TATTCTCGTC CAGATTTGAA TGAAATTGTC GAGAAAAATA TTTTTGAATC TGTTGAAGAT AACAAGGAAA TTTCAATTCT TGCATGTGGA CCAGAACCAT TTAATAATTC AGTGAGATAT 
TCGATTAAGA ATAATATTAC ACCTGAAGTT AGTGTAAAAG TCAACTATCA TGAAGAGAAT TTCGGTTGGT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGACTGC CATTTCGTTT ACTTTTTGCT GCTTTTTTGC TCAGTCTCCT AGCAATTTCT CACTCTTTGG TTGTTGTCGA CTCAACTTTG GCTTCGGCCT GTATCTACTA TCTCAAGACC  TATGATTGGG GTTGTGGCTC TCATGGCAAT GGCATGAGTG CCTACAAGTG TCGTTGTGCT AATGTCAACT GGTTAGGCTC TGTCGCAAAT TGCATCTACT CAGAATCAAA TTCAACTGCA  GCCATTGACC ATGCTTTGAC CCATGTTGCT ACTCGTTGCA AACAGAAAGC TGGCTATGAT TACTCCTTGG ACGATATGAA GTCCTTTTAT CTAAACGCTA CGCTTTTTCT TAGAGACCCA  ATTGAAGCAA TTGACACTTT CAATTTGGTT ACTGATCCAG TCAACGTCAA CCAGTCTGAA TTTGATTTCT ACGATCAAAG TTTCAAAGAC TTTAGCTTTT CTGTTCAAAG ATCCCAGTGG  TTTGGCTGGG GTTTAGTCTT CTACTGGGCT GCTGTTTTAG CTGTATCTTC TTTATTCAAT TTAAACAAAA GATATTTAAA CATCAAGTTT TTAAACTCAA ACTATTTGAA AAAATTTCTT  ATACTACCTC TAATTGTCAA CAAAAACAAT TCAAATTCCT TTCTCTTTAC AAAAGTATTG AGAAATGCAA AGATTCCCTC CATTGTAAAT TTTTGTATTC TATTTGTTTT CGCAATCCAA  GTGATCATCT CCTGTTGTGT TGGTTATGAC TTGCAATTAC CAAATGCTTT CATTAATGAC AGATGGCACA TGAATATGAC TTTAATTAGT TACAGAACTG ATTTAATGTC AATTTCTCTA  TTTCCTTTAA TTTTCTTTTT TGGTATTAGA AACAATCCTT TCATTCCTCT AACTGGTCTA TCCTTTTCAA CTTTTAATTT GTACCATAAA TTCATTGCTT ACATCATGGT GATTCTAGCA  TTTATTCACG CAATTATTTG GACCGTTTAT AGCGTTAGAA ATGGCGGTTA TCAAGCCTGG TTTTCTGACA CCTATTTCCA ATATGGTGTT GCTGCAATGA TTATTAGTTC CATCTTACTA  TTCCAAAGTT TGAGATACTT TAAAGATCAC ATTTATGAAA TCTTTTTGTT GTTACATAAA ATTTTAAATG TCTTTTTCAT TGTCGTAATG TATTTTCATA TCAATACGCT AGGATGGTTG  GGATGGATTT GGTCGATGGT GGCCATTTGG TGTTTTGATA GGTTTGTTCG AATCGTTAAA ATTTGTTTAT CTGGTGGAAT TCAAACAGTT GATTTGTATA GATTTGATGA TAATGTTATT  AAAATGTCAA TTAAAAAACC CAAGTTCTTC AAATACTACC AAGGTTCATA CAGCTATATC TATTTTCTTT CAAACTCATA TTGGTTCTAT TCTTTTCAAT CCCATCCATT TTCACTAGTT  TCGTCTCCAA TTGAAGACAA GGGTAATTTG ATCATCTACT TTAAAGCTAA AAATGGTATA ACCAAATCCA TTTTGAAATT ACTCAACGAC TTGAAAGCAA ACGAACCATT GAAATTGAAA  ATCATTATTG AAGGACCATA TGGCAATTCA ACTGGTATCA GAAAAAAGGC AATTGAGAAT AAAAAATTCG TTGGAATTGT TGGTGGTTTG GGCGTTACTG CAGTTTATCC GTCATTTGTT  GAGGTTTTGA AAAATAGAGA TTCAAATTCA TTAGAAGATA AATTCAATGA AAAATCTCTT CATAGCAACA ACAACAACAA CAACAACAAC AATTCAACAG ATACTTCAAC AGTTAGTTCA  AGCAAAAATG ATGATATTAA TACTTATAAT CATGACGATT ATTACGATAA TTCATATACA GACAAGTTCT ATTGGATAAT CAATGATTTA AATAACTTGA ACTGGTTCCA TAAAGATTTA  GACTGGTTGG TATCCAAAAA CTGTTTTGTT AATGTTATAT ACACTGGAAG TAAAGATATA AAATTCGAAG AATTGGTCAA TATTCCAACT AACGAAATTC ATTACAAAAT CACTAGAAAA  TATTCTCGTC CAGATTTGAA TGAAATTGTC GAGAAAAATA TTTTTGAATC TGTTGAAGAT AACAAGGAAA TTTCAATTCT TGCATGTGGA CCAGAACCAT TTAATAATTC AGTGAGATAT 
TCGATTAAGA ATAATATTAC ACCTGAAGTT AGTGTAAAAG TCAACTATCA TGAAGAGAAT TTCGGTTGGT AG 

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