Entry information : ArubFRe02
Entry ID 10768
Creation 2012-03-16 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-04-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2012-04-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ArubFRe02
Name ArubFRe02
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saccharomycetes Ascoideaceae Ascoidea
Organism Ascoidea rubescens    [TaxId: 54195 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ArubFRe02
start..stop
S start..stop
ArubFRe01 167 7e-45 27..543 272..739
PcFRe01 130 4e-32 19..329 294..629
UmFRe01 118 1e-28 24..350 135..476
MgrFRe01 101 1e-22 12..340 198..552
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 573256..574896 1641  
complement(join(573256..574896))


exon

Literature and cross-references ArubFRe02
DNA ref. JGI genome:   scaffold_1 (574896..573256)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   83429
Protein sequence: ArubFRe02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   547
PWM (Da):   %s   63470.87 Transmb domain:   %s   o23-45i66-85o100-122i129-148o
PI (pH):   %s   9.53
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MFDYKFNNNS QLFGPKVFQV TRFLADRAGI LAFAHLPLLI LLAGRNNLTI LLTGLPYKSL IMYHKWTSRM MFLNSTFHGI LYSLIEIKKG SYLKSFKTDY FFWGVFSTIV CGILMFQSLH  FFRNHYYEIF LYGHILFAGI FFLFIYYHCK RLGWHGYIHL SVLFWASDRV IRIINIIRFG FPIAKIRYLS DDTFKVTIKR RKNWKPFPGC YIFIYFLKGK NFYQSHPFSI IDSILNPNEI  TIYIKIKEGI TFEIGEMLKK SINNNKEINI RVAVEGPYGH GPNFKNYNNI LLIAGGNGIP GPLYDAINMI KKDGYKNLRY IKLIWVVKNF ESIKFIYPEL LRLIGIDNNN NQNKKINTNR  MKNLVDIEIY MTRVSNEPIF SNTETSDKNG SLKSFKKLDS LMNELNTSKF ELNDDFGNNS SSNLAAMDIT DESNLITNSN SNSNINLVDL DSLLNNDVYE INEDNFKPEN LNQYKILKKI 
GQYVTINYGK RPNFEEIILQ NFKYTKGSIC IVTCGNSSMC DSLRNIVAEN VSKCSYQVDF FEELQVW 

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Remarks Complete sequence from genomic (no intron). Seq is shorter => control the prediction
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTTGACT ATAAATTTAA TAATAATAGC CAACTTTTTG GTCCAAAGGT TTTCCAAGTT ACAAGATTTC TAGCTGATAG AGCAGGGATA TTAGCTTTTG CTCATTTGCC TTTATTAATA  CTATTAGCTG GTCGTAATAA TTTAACCATT TTATTGACTG GATTACCTTA CAAATCATTA ATTATGTATC ATAAATGGAC ATCAAGGATG ATGTTTTTGA ATTCAACATT TCATGGAATC  TTATACTCAT TAATTGAAAT AAAAAAGGGT TCATACTTGA AAAGCTTTAA AACTGATTAC TTTTTTTGGG GAGTCTTTTC AACAATAGTT TGTGGGATTT TAATGTTTCA GTCATTACAT  TTTTTCAGAA ACCATTATTA TGAAATTTTT CTTTATGGGC ATATATTATT TGCAGGAATT TTTTTTCTAT TTATTTATTA TCATTGCAAA AGACTTGGAT GGCATGGATA TATTCATCTT  TCAGTATTAT TTTGGGCATC AGATCGAGTT ATTAGAATTA TAAATATAAT TAGATTTGGT TTTCCAATTG CTAAAATAAG ATATCTTAGT GATGACACAT TTAAAGTTAC AATAAAAAGA  CGAAAAAACT GGAAACCATT TCCTGGTTGT TATATTTTCA TTTATTTCTT GAAGGGCAAA AATTTTTATC AATCACATCC ATTTTCAATT ATTGATTCAA TACTAAATCC CAATGAAATT  ACAATTTATA TCAAAATTAA AGAGGGAATC ACATTCGAAA TAGGAGAGAT GTTGAAAAAA AGTATAAATA ATAATAAAGA AATCAATATA AGAGTAGCAG TTGAAGGGCC ATATGGACAT  GGCCCAAATT TCAAAAATTA TAACAATATA TTATTAATTG CAGGTGGTAA TGGTATACCT GGTCCACTAT ATGATGCTAT AAATATGATT AAAAAAGATG GGTATAAAAA TTTAAGATAT  ATTAAATTAA TTTGGGTGGT TAAAAATTTT GAATCAATCA AGTTTATTTA CCCAGAGTTA TTGAGACTTA TTGGCATTGA TAATAATAAT AATCAAAATA AAAAAATAAA TACAAATAGA  ATGAAGAATT TAGTTGATAT TGAAATTTAT ATGACTAGAG TCTCAAATGA ACCAATATTT TCAAATACTG AAACAAGTGA TAAAAATGGA AGTTTGAAAA GTTTTAAAAA ATTGGATTCA  TTAATGAATG AACTGAATAC CTCAAAATTT GAATTAAACG ATGATTTTGG TAATAATAGT AGTAGTAATT TGGCAGCAAT GGATATTACC GATGAATCCA ATTTAATAAC AAACTCCAAT  TCCAATTCCA ATATCAATCT AGTGGATCTT GATTCGTTAC TAAATAATGA TGTCTATGAG ATTAATGAGG ACAATTTTAA ACCAGAAAAC TTGAATCAAT ATAAAATACT CAAGAAAATT  GGACAATATG TGACAATAAA CTATGGAAAA CGACCCAACT TTGAGGAGAT TATACTCCAA AACTTCAAGT ATACAAAAGG ATCTATTTGT ATAGTTACTT GTGGCAACTC TTCGATGTGT 
GATTCATTAA GAAACATTGT TGCAGAGAAT GTCAGTAAAT GTAGCTACCA AGTTGACTTT TTTGAAGAGT TACAAGTTTG G 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTTTGACT ATAAATTTAA TAATAATAGC CAACTTTTTG GTCCAAAGGT TTTCCAAGTT ACAAGATTTC TAGCTGATAG AGCAGGGATA TTAGCTTTTG CTCATTTGCC TTTATTAATA  CTATTAGCTG GTCGTAATAA TTTAACCATT TTATTGACTG GATTACCTTA CAAATCATTA ATTATGTATC ATAAATGGAC ATCAAGGATG ATGTTTTTGA ATTCAACATT TCATGGAATC  TTATACTCAT TAATTGAAAT AAAAAAGGGT TCATACTTGA AAAGCTTTAA AACTGATTAC TTTTTTTGGG GAGTCTTTTC AACAATAGTT TGTGGGATTT TAATGTTTCA GTCATTACAT  TTTTTCAGAA ACCATTATTA TGAAATTTTT CTTTATGGGC ATATATTATT TGCAGGAATT TTTTTTCTAT TTATTTATTA TCATTGCAAA AGACTTGGAT GGCATGGATA TATTCATCTT  TCAGTATTAT TTTGGGCATC AGATCGAGTT ATTAGAATTA TAAATATAAT TAGATTTGGT TTTCCAATTG CTAAAATAAG ATATCTTAGT GATGACACAT TTAAAGTTAC AATAAAAAGA  CGAAAAAACT GGAAACCATT TCCTGGTTGT TATATTTTCA TTTATTTCTT GAAGGGCAAA AATTTTTATC AATCACATCC ATTTTCAATT ATTGATTCAA TACTAAATCC CAATGAAATT  ACAATTTATA TCAAAATTAA AGAGGGAATC ACATTCGAAA TAGGAGAGAT GTTGAAAAAA AGTATAAATA ATAATAAAGA AATCAATATA AGAGTAGCAG TTGAAGGGCC ATATGGACAT  GGCCCAAATT TCAAAAATTA TAACAATATA TTATTAATTG CAGGTGGTAA TGGTATACCT GGTCCACTAT ATGATGCTAT AAATATGATT AAAAAAGATG GGTATAAAAA TTTAAGATAT  ATTAAATTAA TTTGGGTGGT TAAAAATTTT GAATCAATCA AGTTTATTTA CCCAGAGTTA TTGAGACTTA TTGGCATTGA TAATAATAAT AATCAAAATA AAAAAATAAA TACAAATAGA  ATGAAGAATT TAGTTGATAT TGAAATTTAT ATGACTAGAG TCTCAAATGA ACCAATATTT TCAAATACTG AAACAAGTGA TAAAAATGGA AGTTTGAAAA GTTTTAAAAA ATTGGATTCA  TTAATGAATG AACTGAATAC CTCAAAATTT GAATTAAACG ATGATTTTGG TAATAATAGT AGTAGTAATT TGGCAGCAAT GGATATTACC GATGAATCCA ATTTAATAAC AAACTCCAAT  TCCAATTCCA ATATCAATCT AGTGGATCTT GATTCGTTAC TAAATAATGA TGTCTATGAG ATTAATGAGG ACAATTTTAA ACCAGAAAAC TTGAATCAAT ATAAAATACT CAAGAAAATT  GGACAATATG TGACAATAAA CTATGGAAAA CGACCCAACT TTGAGGAGAT TATACTCCAA AACTTCAAGT ATACAAAAGG ATCTATTTGT ATAGTTACTT GTGGCAACTC TTCGATGTGT 
GATTCATTAA GAAACATTGT TGCAGAGAAT GTCAGTAAAT GTAGCTACCA AGTTGACTTT TTTGAAGAGT TACAAGTTTG G 

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