Entry information : SpasCcP01
Entry ID 10772
Creation 2012-03-19 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-03-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-04-27 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: SpasCcP01
Name SpasCcP01
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP003]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saccharomycetes Spathaspora
Organism Spathaspora passalidarum (Candida sp)    [TaxId: 340170 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpasCcP01
start..stop
S start..stop
CalCcP02 462 7e-164 6..374 4..365
CduCcP01 458 2e-162 5..374 3..364
CtCcP01 432 2e-152 1..374 1..358
CtCcP02 431 6e-152 1..374 1..358
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 360808..361932 1125  
complement(join(360808..361932))


exon

Literature and cross-references SpasCcP01
DNA ref. JGI genome:   scaffold_5 (361932..360808)
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   61904
Protein sequence: SpasCcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   375
PWM (Da):   %s   42072.9  
PI (pH):   %s   9.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSAIALGPTI GRVTKRRIQF KSTRFSKYFL LGSAAATASL AYMYDDYKKK NSYNNNNNNN NNNNNNNKNI KRSGLMGLFG GSAVVNQATV PHGKGFDDYQ KVYNDIAQKI SEFPEYDENS  GFYAVLVRLG WHSSGTYNKD GNTGGSYRGT MIYAPEELDP ANNGLQNARD FLQEFLIKYP WISRGDLWTL ASVAGVQEAG GPKIPWGPGR VDDNSGKNVP PNGLLPDASQ DGKYVKNYFA  RLGFNEQESV ALLGAHVLGR CHPHNSGYKG PWGPSFNQFT NTFYNILLED WRVKKWDGPK QYEDVKSGEF MMLPTDIALK EEPNFLKYVK AYAADEELFF RDFSKAFSKL ISLGVTYPKG 
FKLWEFKTLD EQEE* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCTGCAA TTGCATTAGG TCCTACCATT GGTAGAGTCA CCAAACGTCG TATCCAATTC AAATCCACTA GATTCTCCAA GTACTTCTTG CTTGGGTCTG CTGCTGCCAC TGCCTCTTTG  GCTTACATGT ACGATGACTA CAAGAAGAAG AACAGTTACA ACAACAACAA CAACAACAAC AACAACAACA ATAACAACAA CAAGAACATA AAGAGAAGTG GATTGATGGG TCTCTTTGGT  GGTTCTGCCG TTGTCAATCA AGCCACCGTT CCTCACGGTA AAGGGTTTGA TGACTATCAA AAGGTTTACA ATGACATTGC TCAAAAGATC TCTGAATTCC CTGAATATGA TGAAAACTCT  GGTTTCTATG CTGTTTTAGT TAGATTGGGA TGGCACTCAT CTGGTACTTA CAACAAGGAC GGAAACACTG GTGGTTCATA CCGTGGTACT ATGATTTATG CTCCTGAAGA ATTGGATCCT  GCTAACAATG GTTTACAAAA TGCTCGTGAT TTCTTGCAAG AATTCTTAAT CAAATACCCA TGGATCTCCA GAGGTGATTT ATGGACTTTA GCCAGTGTTG CTGGTGTTCA AGAAGCTGGT  GGTCCAAAGA TTCCTTGGGG TCCAGGTAGA GTCGATGACA ATTCCGGTAA GAATGTTCCT CCAAACGGTT TATTACCAGA CGCTTCTCAA GATGGTAAGT ATGTCAAGAA CTACTTTGCC  CGTTTAGGTT TCAATGAACA AGAATCTGTT GCTTTATTAG GTGCCCACGT TTTAGGTAGA TGTCATCCAC ACAATTCCGG TTACAAGGGT CCATGGGGTC CATCATTCAA CCAATTCACC  AACACTTTCT ACAATATTTT GTTGGAAGAC TGGAGAGTTA AGAAGTGGGA TGGACCAAAG CAATACGAAG ATGTCAAGTC TGGTGAATTT ATGATGTTGC CAACTGATAT TGCCTTGAAG  GAAGAACCAA ACTTTTTAAA GTATGTCAAG GCTTATGCTG CCGATGAAGA ATTATTCTTT AGAGATTTCT CCAAGGCTTT CTCCAAGTTG ATCTCCTTAG GTGTCACTTA TCCAAAGGGA 
TTCAAGTTGT GGGAATTTAA GACATTAGAT GAACAAGAAG AGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCTGCAA TTGCATTAGG TCCTACCATT GGTAGAGTCA CCAAACGTCG TATCCAATTC AAATCCACTA GATTCTCCAA GTACTTCTTG CTTGGGTCTG CTGCTGCCAC TGCCTCTTTG  GCTTACATGT ACGATGACTA CAAGAAGAAG AACAGTTACA ACAACAACAA CAACAACAAC AACAACAACA ATAACAACAA CAAGAACATA AAGAGAAGTG GATTGATGGG TCTCTTTGGT  GGTTCTGCCG TTGTCAATCA AGCCACCGTT CCTCACGGTA AAGGGTTTGA TGACTATCAA AAGGTTTACA ATGACATTGC TCAAAAGATC TCTGAATTCC CTGAATATGA TGAAAACTCT  GGTTTCTATG CTGTTTTAGT TAGATTGGGA TGGCACTCAT CTGGTACTTA CAACAAGGAC GGAAACACTG GTGGTTCATA CCGTGGTACT ATGATTTATG CTCCTGAAGA ATTGGATCCT  GCTAACAATG GTTTACAAAA TGCTCGTGAT TTCTTGCAAG AATTCTTAAT CAAATACCCA TGGATCTCCA GAGGTGATTT ATGGACTTTA GCCAGTGTTG CTGGTGTTCA AGAAGCTGGT  GGTCCAAAGA TTCCTTGGGG TCCAGGTAGA GTCGATGACA ATTCCGGTAA GAATGTTCCT CCAAACGGTT TATTACCAGA CGCTTCTCAA GATGGTAAGT ATGTCAAGAA CTACTTTGCC  CGTTTAGGTT TCAATGAACA AGAATCTGTT GCTTTATTAG GTGCCCACGT TTTAGGTAGA TGTCATCCAC ACAATTCCGG TTACAAGGGT CCATGGGGTC CATCATTCAA CCAATTCACC  AACACTTTCT ACAATATTTT GTTGGAAGAC TGGAGAGTTA AGAAGTGGGA TGGACCAAAG CAATACGAAG ATGTCAAGTC TGGTGAATTT ATGATGTTGC CAACTGATAT TGCCTTGAAG  GAAGAACCAA ACTTTTTAAA GTATGTCAAG GCTTATGCTG CCGATGAAGA ATTATTCTTT AGAGATTTCT CCAAGGCTTT CTCCAAGTTG ATCTCCTTAG GTGTCACTTA TCCAAAGGGA 
TTCAAGTTGT GGGAATTTAA GACATTAGAT GAACAAGAAG AGTAA 

Retrieve as FASTA