Entry information : EglPrx[P]06
Entry ID 10829
Creation 2012-05-02 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-05-02 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglPrx[P]06
Name EglPrx[P]06
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx046]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]06
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]06 559 0 1..307 1..332
EgrPrx[P]11 523 0 1..307 1..327
EguPrx12 382 5e-134 1..307 1..334
EgrPrx12 382 9e-134 1..307 1..334
Literature and cross-references EglPrx[P]06
Protein sequence: EglPrx[P]06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   304 (285)
PWM (Da):   %s   33426.92 (31389.8)  
PI (pH):   %s   5.78 (5.39) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-304
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTPSRLWQLL LAALAVVSSC *VxxNANAAA TMEPPQKLQW LYYQNSCPDA EKYVRDQVEF YSKQDRTLAL KFIRLLYSDC FVTLLRIKLG CNxSILLDGP IQNAALLGLP MEMIDKVKEV  LEQHCPGDVS CDIINLAAKD AVVLVGGTSY PIPTGRRDEN SSSAKLVDLL PLQAVPWKAE PSYFKSKGLN VLVTSCSFIP DRLYDFNKTG EPDPSMDPTF LLNPDLGSSY SFGNSFYSRV 
RHHQAVLGIN QQIASNFDSS LIAWEYDVRF GDFQKMFGMS TIRMGNIKLL PEDQG*IRKN C*VVDGK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from NGS. PS are missing due to NNNN. Stops in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACACCAT CAAGATTGTG GCAGTTGTTG CTAGCGGCGC TCGCGGTGGT GAGCTCATGC TAGGTGCAnn ACAATGCCAA CGCGGCAGCG ACAATGGAAC CGCCGCAGAA GCTGCAGTGG  CTTTACTACC AGAACTCATG CCCTGACGCT GAGAAGTACG TGAGGGACCA GGTCGAGTTC TACTCGAAGC AGGACAGGAC CCTTGCTCTC AAGTTCATCC GACTGCTCTA CTCCGACTGC  TTCGTCACCn nnnnnnnnnn nnnnnTTTTT TCCCCTCTCT TGGACGATCT TGAAATCTGT ATCACTTCAA TATCAAGTTT CCATCACCTT TCTATGCACG TCATATCCTA ACGGTTTAAA  CCTGTCGAAC TGGGCTTTCT AACGCTTGCT CAAAAnnnnA AAAGAAAAAG AACTGGGCTT TCTAACGTAC CACTCTTTTG CGTATAAAAC TCGGGTGCAA TGMGTCAATT CTATTGGACG  GGCCTATTCA GAATGCAGCG CTTCTAGGGC TTCCTATGGA GATGATTGAC AAGGTCAAGG AAGTCCTGGA ACAGCATTGT CCCGGGGACG TCTCTTGCAY GACATAATCA ACCTCGCTGC  TAAAGATGCT GTTGTCTTGG TATGCAACAT GGTTCGCAGT TTTTCCCTTT TGGGCTTGAA AAAAGATCGT TTAGGCTGCT CCACTAATAA TTGACATTGT GCGTTTGGTT CAGCATTTTC  AAGGGGCTTT CAGCCCTGAA AGCCTCTTGG GGAAATGCTA GACCGTTTGG TTCAATTTTT TTGCTAGCTT TCAACTTTCA ACTTACCTTC AAAATGTTAA AGGCCCAAAG CTAGTAGAGA  CTAGCTTTTG GGCTTTTAGC ATTAAGCGGA ATGTTAAAAT TATTTTTTAT CTTCCAAAAC TACTCTCACT AATTTTTCAT ATTTTCGATT TTGTnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnTGGTTT GACGAAGGGT TTAGTTTAAT TTTCAAAAAT AAAAATAAAA GTATATATAA TTATATACCC ATCAAAGCTC ATTGGGAAAG TTTTCTTTAC CAAACGCACA TTCAACTCAA  AGACCATTTG CAAAAAAAAT TTACCAAACA CAATTGCATT TCTCCAAGTA AATTTGGGCT TTCAGCATTT ACATTGAACT CAAAACCTAT TGCAAATGCT GAACCAAACG nnnnnnnnnn  nnACTTGAGT TTTAGAGCGT TTGATATGGA GAAAAATTAG AATTACTAAT GCAATAATGA TGTTGTAACA AGTGGGAGGG ACGTCGTACC CCATTCCAAC GGGGAGGAGG GACGAGAATT  CATCCTCCGC GAAGTTGGTG GACCTCCCAT TTATGCCCTG TTTGGTAACG GGTTAAATAG TAAAAAAATT TATTCTTTTG TTCTGGGGAG TAGTTTTGGA ACAGAATCGT GTTTAGTAAA  ATTTTTGTTn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn AAAAAGAAAA AGTTGATTCT TCTTTCCAAG AACAATTCTA GAATTAAGTT  CATATTTTCC TTTTTATTTT CTTTTTCTTT GTTCTTCTTC CATTTTCTTC TTCTTCATCT ATTGCCACCG CCGCCAnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnAG CTAACGCCCA TTAGGGTACC TAGGGTGGTG CTCTAGTCAT GGAAGAAAGA ACCTGTGGGC  TTCCCCTGCC ATTCnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nGAATAGGAA AGAAAAAAAA GAAGGAAAAA  GTAAAAAAGT AATAACATTA TTTAAAAATT AAAAGAAAAT GATTTGGAGT AGGAATTTTG AGTACAGTAC CAAACACAAT TTTATTTCGG GAATTGAAAT TTTGGACAGT TACCAAACAA  CTTAAAATAC TTAAAAAnnn nnnnnnnnnn CAGAATAAAA GAGAATCAAT TCTGATAAGA AATTGTTTCT GAGAACAGAA GCATTACCAA ACGCACCCTT AGAGTGGGTC TTAGACCTAT  ATATGACCCA TTTAAATTAT AAATTGGTCA TATATGGATC ACTTATTTTT TGAAGAAACT AGTTAAATGG ATTTAAAAAT TAAAGACTTA AGATAAATTG GTTTTAATTT TTAAATGGGT  CTTAAACGGG TTGGACTTAG AACCCATTTT CAACCAAAAC CTCACAATCT CCATCTTCCC TCTTTAACTT TATGAAATTA TTTTTAAACA AAGATCAAAA TTATAATTAT TTTTTATATT  TTAATTTTCT TTTTTCTTTC CTTCTTCCTC TTTCTTTAGC TGATGGCCAG CATGGCAATT GGCCAAGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnAAG GCTTGCCTGT GGCTGGTAGC CAGCTGTCGT CATGGTCGAT GACCGGCCAT AGAAGAAGAA  AAACAAAAAA CAAAAAACAA AAGGAAAATT AAAAATTATA TTCTTAAAAA ATATAAAAAT TGTCCATTAA ATTTATATTG GATAAAATTA TTTTAGCAAT RCCATTTAAA AAAATGATAA  GAAATAATTT TTCTTAAGTT TAGTTAAATG GGTCAGATAT GGGTTAGGTC GGGnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnC ACCAATTTAA CGGATCTACT TCCATTGCAG GCCGTCCCGT GGAAAGCGGA GCCCAGTTAC TTCAAATCAA AGGGTTTGAA TGTGCTAGTC Cnnnnnnnnn  nnnnnGGTGT CATTTGACCC TCACAAATTT GACCGGGACC TCATTATATC ACCTTAGATC TTAACCAATC CAGGCAAATC GTTTAGTTTA GYGGATCGCA ACGTCTTTTT TTGCTTTTAA  GTTTTGTAAG TCRCTRCCTA ATTGTCACGA TACAAAGAAT TTTATCAGAT ATAGTATTGT CGAGGATATA ATCTGAGCCC CAATACTCAC TATGATCTCC TCCCAGTGCA CAAAATGGCA  ATGCTCACGT ATTATGTCAA TCTCAGAATC ATAGCCAAAA TCCTAACTTG CCGAAnnnnn nnnnnnnnnn nnACCAGTTG CAGCTTCATC CCGGACAGGT TGTACGATTT CAACAAAACT  GGCGAGCCAG ACCCAAGCAT GGACCCAACC TTCTTGnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnACCTCAAC CCTGACTTAG GCTCGAGCTA CAGCTTCGGC  AATTCCTTCT ACTCAAGGGT ACGGCACCAC CAGGCGGTCC TCGGCATCAA CCAGCAGATC GCTAGCAACT TCGACAGCTC CCTGATCGCT TGGGAGTATG ATGTCAGATT CGGGGACTTC 
CAGAAGATGT TCGGCATGTC AACAATCCGG ATGGGGAACA TCAAGCTCCT ACCGGAGGAT CAGGGGTAGA TTCGCAAGAA TTGCTGAGTC GTGGACGGGA AATAA 

Retrieve as FASTA