Entry information : EglPrx[P]11
Entry ID 10834
Creation 2012-05-02 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-02-06 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-23 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EglPrx[P]11
Name EglPrx[P]11
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx046]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]11
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]11 358 9e-126 67..247 140..327
EgrPrx[P]11 122 1e-33 1..67 1..67
EgrPrx[P]06 334 3e-116 67..247 140..332
EgrPrx[P]06 116 3e-31 1..66 1..66
EglPrx[P]06 297 7e-102 67..247 145..307
EglPrx[P]06 100 2e-25 1..67 1..67
EcamPrx[P]11 259 2e-89 122..247 12..137
Literature and cross-references EglPrx[P]11
Protein sequence: EglPrx[P]11
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   244 (225)
PWM (Da):   %s   27244.54 (25177.4)  
PI (pH):   %s   7.93 (7.38) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-244
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTPSRLWQLL LSALALVSSC QVQHNANAAE TMDPPQKLQW LYYQNSCPDA EKYVRDQVEF YWKQDRVGGT SYPVPTGRRD GNSSSAKSVD LLPL*AIPWK AVPGYFKSKG LNVLFLATLR  xFIPDRLYDF NKTGEPDPSM DPTFLSQLRE QCPPNSxNLA YLNPDLGSSY SFGNSFYSRV RHHQAVLGIN QQIASNFDSS LIAWEYDVRF GDFQKMFGMS TIRMGNIKLL PEDQG*IRKN 
C*VVDGK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. PS are missing due to NNNN. Stops in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACACCAT CAAGGTTGTG GCAGTTGTTG CTATCGGCGC TCGCGTTGGT GAGCTCATGC CAGGTGCAGC ACAATGCCAA CGCGGCAGAG ACAATGGATC CGCCGCAGAA GCTGCAATGG  CTTTACTACC AGAACTCATG CCCTGACGCT GAGAAGTACG TGAGGGACCA GGTCGAGTTC TACTGGAAGC AGGACAGGGT CTATTTTTTT CCCCCTCTCT TGGACGATCT TGAAATCCGT  ATCGCTTCAA TATCAAGTTT CCATCACCTT TCTATGCACG TGATATCATT TCACCTAAGG GTTTAAACCT CTCGAACAGG GCTTTCTAAC GTACCACTCT TTTGTGTATA AAACTGGGGT  GCAATGCGTC AATTCTATTG GACGCGCCAG ATTCAGAATG CAGCGCTTCT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnCATGGTT CGCAGTTTTT CCCTTTTGGG CGTGAAAAAA nATCGTTTAG GCTGCTCCAC TAATAATTGA  CATGCTATTA GCTTGAGTTC TAGAGCGTTC GATATGGAGA AAAATTAGAA TTnnnnnnnn nnnnnnnnnT AACAGGTGGG AGGGACGTCG TACCCCGTTC CAACGGGGAG GAGGGACGGG  AATTCATCCT CCGCGAAGTC GGTGGnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTTTTCT TTTTCTTGTT CTTCTTCCAT TTTCTTCTTC  TTCATCTACT GCCATTGCnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnGGAAAAAA AAGAAAAAAG TAATAAAATT ATTTAAAAAT TAAAAGAAAA TGATTTGAAG TAGAAATTTT GAGCACGGTA  CTAAACGCAA TTCTATTATG TGAATTGAAA TTTTTTTATA GTTACCAAAC AGCTTAAAAT ACTTAGAAAT TGTTCCCGGG AACAnnnnnn nnnnnnnnnn nnnTCTTAGA GTGGGTCTTA  GACCCATATA TGACCCATTT AAATCATAAA TGGACCATAT ATGGATCACT TATTTTTTGA AGAAACAAGT TAAATGGATT TAAACATTTT CAACCAAAAC CTCACAATCT CCATCTTTCC  TCTTTAACTT TACGAAAATA TTTTTAAATA AAGATCGAAA TTATAATTAT TTTTTATACT TTAATTTTCT TTTTCTTTTT TTAATTTCCT TTTTTATTTC CTTCTTCCTC CTTCTTTAGC  CGGTGGCTGG CATGGTGACC GGCCAAGTGA GGCTCGAGCT CAATGGCCTT AGGCnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnG ACGATCAGCC ATAGAAGAAG AAAAACAAAA  AAGAAAAAAG AAAAGAGAAA AGGAAAATTA GAAATTATAT TCTTCnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnAAAAATAA TTAAAAATTC GATTTTCTAA  AATAATAAAT TCTTAAAAAA TATAAAAATT GTCCATTAAA TTTATAATTG ATAAAATTAT TTTAGCAATA CCATTTTTTA nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnATGG GTAAAAGAAT TTGCACTACA ATAAATCGGT CATAAACAGG TTAAATGGGT CGAATTGGGT CGGACCATTT ATGACCCGAC  CCACCCGTTT AACGGATCTA CTCCCATTGT AGGCCATCCC GTGGAAAGCG GTGCCCGGTT ACTTCAAATC AAAGGGTTTG AATGTGCTGT TCCTCGCTAC TCTACGCGGT ATCATCTGAC  CCTCACAAAT TTGACCGGGA CTTCATTATA TCACCTCAGA TCTTAACCAA TCCAAGCAAA TTGTTTAGTT TAGTGGATCG CGACGTCTTT TTTCGCTTTT AAGTTTTGTA AGTCGCTGCC  TAATTGTCAC GATACAAAGA ATTTTATCAT AAATAGAATT GTCGAGGAAC GTATTATGTC AATCTCAGAA TCATAGCCAA AATCCTAACT TGCCAAAACA ATTTAAATTT TTCCCGGGGG  GCATTCACTG GGCAAGACCA ATTGnnnnnn nnnnnTTCAT CCCGGACAGG TTGTACGATT TCAACAAAAC TGGCGAGCCA GACCCAAGCA TGGACCCAAC CTTCTTGTCC CAATTGAGGG  AGCAATGCCC TCCGAACTCA AnGAATCTAG CGTACCTCAA CCCTGACTTA GGCTCGAGCT ACAGCTTCGG CAATTCCTTC TACTCAAGGG TACGGCACCA CCAGGCGGTC CTCGGCATCA  ACCAGCAGAT CGCTAGCAAC TTCGACAGCT CCCTGATCGC TTGGGAGTAT GATGTCAGAT TCGGGGACTT CCAGAAGATG TTCGGCATGT CAACAATCCG GATGGGGAAC ATCAAGCTCC 
TACCGGAGGA TCAGGGGTAG ATTCGCAAGA ATTGCTGAGT CGTGGACGGG AAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACACCAT CAAGGTTGTG GCAGTTGTTG CTATCGGCGC TCGCGTTGGT GAGCTCATGC CAGGTGCAGC ACAATGCCAA CGCGGCAGAG ACAATGGATC CGCCGCAGAA GCTGCAATGG  CTTTACTACC AGAACTCATG CCCTGACGCT GAGAAGTACG TGAGGGACCA GGTCGAGTTC TACTGGAAGC AGGACAGGGT GGGAGGGACG TCGTACCCCG TTCCAACGGG GAGGAGGGAC  GGGAATTCAT CCTCCGCGAA GTCGGTGGAT CTACTCCCAT TGTAGGCCAT CCCGTGGAAA GCGGTGCCCG GTTACTTCAA ATCAAAGGGT TTGAATGTGC TGTTCCTCGC TACTCTACGC  GnnTTCATCC CGGACAGGTT GTACGATTTC AACAAAACTG GCGAGCCAGA CCCAAGCATG GACCCAACCT TCTTGTCCCA ATTGAGGGAG CAATGCCCTC CGAACTCAAn GAATCTAGCG  TACCTCAACC CTGACTTAGG CTCGAGCTAC AGCTTCGGCA ATTCCTTCTA CTCAAGGGTA CGGCACCACC AGGCGGTCCT CGGCATCAAC CAGCAGATCG CTAGCAACTT CGACAGCTCC  CTGATCGCTT GGGAGTATGA TGTCAGATTC GGGGACTTCC AGAAGATGTT CGGCATGTCA ACAATCCGGA TGGGGAACAT CAAGCTCCTA CCGGAGGATC AGGGGTAGAT TCGCAAGAAT 
TGCTGAGTCG TGGACGGGAA A 

Retrieve as FASTA