Entry information : EglPrx[P]30
Entry ID 10853
Creation 2012-05-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-02-06 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglPrx[P]30
Name EglPrx[P]30
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx012]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]30
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]30 649 0 1..323 1..325
EgrPrx[P]27 521 0 1..323 1..320
EguPrx[P]27 504 0 1..323 1..320
EguPrx[P]30 483 4e-175 76..323 1..250
Literature and cross-references EglPrx[P]30
Protein sequence: EglPrx[P]30
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (299)
PWM (Da):   %s   35222.83 (32758.6)  
PI (pH):   %s   7.36 (6.65) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPVRFNRVH AFLC*LFATT AFAITPHAEL TPAFYDSLCT QASPAIKWVV EAAIQEEPRT GASLLRLHFH DCFVNECDAS ILLDSTPSFA SEKFAIPNNN SVRGFEVIDR IKAAVDEACG  GPVVSCADSL AVAA*DCRSG GPWWKVRLRR KDSTVASKDK AQASLPSPFS NISNITKSFI NQSLDINNLV VLSGAHTPGY ARCTIFRGRI YSDTNIEPTF AQSLRLFCPP LPSNESDPRL 
TALDQTSAVF DTLYYKNLLQ QEGLLHSDQA LLNNPLAAEL VKSYSEEGER FQRDSTKSMV KVINIKPLTG ERGQVQRDCR RAN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. Stops in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCAG TTAGATTCAA TCGTGTCCAT GCATTTCTCT GTTAACTCTT TGCGACCACA GCTTTCGCCA TTACACCCCA TGCCGAGCTC ACACCTGCTT TCTACGACTC GCTTTGTACT  CAAGCTTCAC CAGCCATCAA ATGGGTGGTC GAGGCCGCTA TCCAAGAAGA GCCACGCACG GGTGCTTCTT TACTCCGTCT GCACTTCCAC GACTGCTTTG TCAATGTACT AAGATGTCTA  TGGGCAGAAG AACAGCACAA GTGCCATAAC TTGGCACGCC GGGACACTTA AGTGCCATAA CTTCCAAACG GTACACTTAA GTGCCACTTT TTTTTTCGAG TGGGACACTT AAGTGCCACC  TCCGGCGACC CTTGCCGGAA ATCCTACGTG GCAATATTTT ATTATTATTT TTTGCCTACG TGGCTCGCCG GAGCTCCAAA TCAGCATAAA AATTAACAAA AAAAATTTTT AAAAAAGAAG  ATnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn GCGAGGGCTC  AGCCCTCAGC CGCCCGTTCG ACCTCCCCCA CCCTTTTTTT TTTAATTTTT CATTTTCTTA ATTTTTTAAA AATTTTAAAT TTTTCTTAAT TTTTTAAAAA TTTTAAATTT TTCTTAATTT  TTTAAATTTT TTGAATACTT TATAATTTAA TTAATTTTTA TATTACAAAA CGACGCCGTT TTGGACTAAA CTCGCCGGAA AATTGCCACG TCAGCCATTT GGCCGACCAT TTTAAAGTTA  TGGCACTTAA GTGTCCCGGC GTGCCAAGTT ATGGCACTCC AGGTGCATGC TTATTGAGTT TCGGGATAAT TGATAATGCA GGAATGCGAC GCTTCAATTC TTTTGGACTC TACGCCTTCC  TTTGCCAGCG AGAAGTTTGC CATTCCTAAT AACAATTCAG TTAGAGGATT CGAAGTAATC GACCGGATCA AGGCAGCAGT TGATGAAGCT TGTGGAGGCC CTGTGGTCTC CTGTGCAGAC  AGCTTGGCCG TTGCTGCCTG AGACTGTCGT AGCGTGAACA AGAGACATCA AATATGTTGG AAAAATTTGT TAATATTCCA ATGCGGCCAG GAGGACCATG GTGGAAGGTT CGGCTCAGAA  GAAAAGACTC AACCGTGGCA AGCAAGGACA AGGCTCAAGC GTCTCTTCCT TCGCCTTTTA GCAATATCTC TAACATAACC AAGTCCTTCA TAAATCAAAG CCTCGACATT AATAACTTGG  TCGTCCTGTC CGGTGCACAC ACACCAGGAT ATGCACGGTG CACAATATTC AGGGGAAGGA TCTACAGTGA CACAAACATT GAGCCAACCT TTGCACAAAG CCTTCGGTTG TTTTGCCCGC  CCCTTCCAAG CAACGAATCC GACCCTAGGC TCACTGCTTT GGATCAAACT TCTGCTGTCT TTGATACTTT GTACTATAAA AACTTGTTAC AGCAAGAAGG GCTTCTCCAT TCCGATCAGG  CGCTTCTCAA CAATCCCCTA GCTGCCGAGC TGGTCAAGTC TTACAGCGAA GAAGGCGAGA GGTTTCAGAG AGATTCCACG AAATCCATGG TTAAGGTGAT AAATATAAAG CCTTTGACTG 
GTGAACGTGG CCAAGTTCAA CGCGACTGTA GACGAGCGAA C 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCAG TTAGATTCAA TCGTGTCCAT GCATTTCTCT GTTAACTCTT TGCGACCACA GCTTTCGCCA TTACACCCCA TGCCGAGCTC ACACCTGCTT TCTACGACTC GCTTTGTACT  CAAGCTTCAC CAGCCATCAA ATGGGTGGTC GAGGCCGCTA TCCAAGAAGA GCCACGCACG GGTGCTTCTT TACTCCGTCT GCACTTCCAC GACTGCTTTG TCAATGAATG CGACGCTTCA  ATTCTTTTGG ACTCTACGCC TTCCTTTGCC AGCGAGAAGT TTGCCATTCC TAATAACAAT TCAGTTAGAG GATTCGAAGT AATCGACCGG ATCAAGGCAG CAGTTGATGA AGCTTGTGGA  GGCCCTGTGG TCTCCTGTGC AGACAGCTTG GCCGTTGCTG CCTGAGACTG TCGTAGCGGA GGACCATGGT GGAAGGTTCG GCTCAGAAGA AAAGACTCAA CCGTGGCAAG CAAGGACAAG  GCTCAAGCGT CTCTTCCTTC GCCTTTTAGC AATATCTCTA ACATAACCAA GTCCTTCATA AATCAAAGCC TCGACATTAA TAACTTGGTC GTCCTGTCCG GTGCACACAC ACCAGGATAT  GCACGGTGCA CAATATTCAG GGGAAGGATC TACAGTGACA CAAACATTGA GCCAACCTTT GCACAAAGCC TTCGGTTGTT TTGCCCGCCC CTTCCAAGCA ACGAATCCGA CCCTAGGCTC  ACTGCTTTGG ATCAAACTTC TGCTGTCTTT GATACTTTGT ACTATAAAAA CTTGTTACAG CAAGAAGGGC TTCTCCATTC CGATCAGGCG CTTCTCAACA ATCCCCTAGC TGCCGAGCTG  GTCAAGTCTT ACAGCGAAGA AGGCGAGAGG TTTCAGAGAG ATTCCACGAA ATCCATGGTT AAGGTGATAA ATATAAAGCC TTTGACTGGT GAACGTGGCC AAGTTCAACG CGACTGTAGA 
CGAGCGAAC 

Retrieve as FASTA