Entry information : EglPrx[P]42
Entry ID 10864
Creation 2012-05-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-02-06 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglPrx[P]42
Name EglPrx[P]42
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]42
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]42 253 7e-86 1..135 52..208
EgrPrx[P]42 86 9e-21 132..171 280..319
EcamPrx[P]42 231 5e-77 1..135 56..213
EcamPrx[P]42 73 3e-16 132..167 285..320
EguPrx[P]42 222 2e-73 1..135 52..208
EguPrx[P]42 86 6e-21 132..171 280..319
EguPrx[P]46 221 4e-73 1..135 50..206
EguPrx[P]46 77 8e-18 132..167 278..313
Literature and cross-references EglPrx[P]42
Protein sequence: EglPrx[P]42
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   169
PWM (Da):   %s   18049.11  
PI (pH):   %s   9.66
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
SSKARMGVPL LRLCFHDCFI NAHGLILLEY TANFAKKKNV SPNANSIQVF EVIDMIKSQL ESTCPRVVSY ANTLVVTA*D SIVALSGPNW TVSLGRRDST GASQSAAFTV KEMAALLGSH 
TIGQA*CLTF RSATFMTDFS NAMVKMGNLN PLTGSSSQIR KNYGKVNSCS F 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. 5' and PS are missing due to NNNN. Stop in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCGAGCAAGG CGCGCATGGG TGTGCCGCTG CTCCGCCTTT GCTTCCACGA TTGCTTCATC AATGCAAGCC TCTCTnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTTTCCG ATTGATTTTT ACCTTTGTTT  TTCTCTTTAA TTCAAGCTGC GTGCAAGCGT GCATGCATGA TGCATCTTCG TGCTTGTGCG TGTGAAGCAT TCCAACCAAC CACGTTGTCA AAAGAATTAT TAGATTCGCG TCTACACAAG  TTAGGTAGGA GGTTCACATA TTGAATTnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnGGT GCCATGCATT TTTGTGAGTT TATTATATTA TTAATCGATT TTGTTTGTTA TAACAAAATA  TTTTTTTTGG TAAATGAAAA AAACTTnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnCG CTGCCGGTGT AAAAATGGTT TTTTACAAAC GGGCTTATCC ACCCTTAATT TGGCTGTTAG TGAGGGATTT  GGAATCTTCA AATCATGGAT AAGAATGGTT Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnTAT ATGTGATTAA  CTACCTGGTT TAAATCCAAT GAACTCGATG AATTGGATCA CGTAAAGTCC TGAACGTTGG AGCTTAAAAA TGATATTTTA TGGTAAATTA TCATTTTTAA TGAAATATGT TAATCAAATG  GTACTCTAAA ATCTTATTAG ATATTTGAAC AAGCGAATCG CGCCTTGTGC ATGGCCTCAC TAGTTTGCTT CCACACAAAT TTAGAGTGTC AATCTAAATA AACCAATCAA TTTAGTGTAC  CTACTTTGTT ATCCTCTTCA TCTTCTTTGT GCATAATTTT AGAGTAGTCT ATATCCTAAT GAGGGGTAAG TACATTAAAA GTACCAAAAG CTGTATACAG CGCTCACTTT AGTGCCAAAA  ATTTTCGCCG GCTCACTTAA ATGCCAAATC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnAAAT TGATTATGTC TCATTTATAA  TTAAAATTTT AATATGACTT GACAAATTTT TTAAAAACTC CAATCCATGT GGCATTTnnn nnnnnnnTGC TTGGCAATGA AGTGATGGCT TTTTAATAAC AACTAGTTCT AAAGTGATCA  CTTTAAACAA AATTTAGCAT TTAAATTATC ACTATTTACA AATTTTGAAC GACGTCGTTT ATGTGTTATA TGCTGACTAG GCACGTTGGC GAGCCACGTA GGACTGAGAA ATTAATAAAA  CACAATCACG TCGGATTTCT GGTAACCCAA ACCAGAAnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnCTTTTA ACACTAAAGT GAGTATTGTA  CACAACTTTT GACACTTTTA GTATATTTAT CCCTCCTAAT GGAGCTTTCT CCATCAAACA TGTCTCTATT TCAATCTCAA CATTCAAAGC CCGATCGGGC TTTTATGGAT GCATTGTTCC  TTCAGAGAAA ACACGAAGCA AAGTCGTAAG GCACGAGAAA AATTGGAGAA CTTCCTATTT AGTGTCACCC CGTCAAAACT GGTGTCTCTA GGCGTTCATG ATGGGGACAA AAAGGTGGAA  AAGGATAGGG GAAAAATTCA ATGTCCGTAC TCGATTTTCA GGAAAAATTA TAGCCTTTAA CCCGTTTGCA ACCATTGAAT TTAATGGACT CCAATCCCAT CGATTTTCTA TTTAGAAGGA  CTAATGTGTG GCGTAGATGA CACGGGTTGA TTTTATTGGA GTACACCGCA AACTTCGCTA AGAAGAAGAA TGTTAGCCCG AATGCCAATT CTATACAGGT ATTCGAGGTG ATTGATATGA  TCAAGTCCCA ACTAGAGAGC ACGTGCCCCA GGGTCGTATC CTATGCCAAC ACATTGGTTG TTACTGCATG AGATTCCATC GTTGCCTTAA GTGCACATTT TCTTCTCAAT TCTAGTGATC  AATTGTGAGG AGAAAAAAAT CACATGTTAT GTTCTCCATG CTATATTAAT ACTAACACAT ATGTATTTAT TTTTTACTTA ATTTTTAGTT AGGTGGCCCG AATTGGACAG TCTCACTTGG  AAGAAGAGAC TCAACCGGCG CAAGCCAAAG TGCTGCTTTC ACCGTCAAAG AAATGGCGGC ACTCTTAGGT CATnnnnnnn nnTTTTTTCA CCTATTAAAA AAGAATTTAT GATAATGCTC  GATCAATATA CTGAGAACAA TTTACAAAAC ATTGTTTGAT TGTTTGTTAA CAAAATCGCA CACGATAGGT CAAGCCTGAT GCTTGACTTT CCGGGnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnT CGGCAACTTT CATGACAGAT TTTTCTAACG CTATGGTGAA 
GATGGGAAAC CTCAACCCGC TCACCGGCTC AAGCAGTCAA ATTAGGAAGA ACTATGGAAA AGTCAACTCA TGTTCGTTC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCGAGCAAGG CGCGCATGGG TGTGCCGCTG CTCCGCCTTT GCTTCCACGA TTGCTTCATC AATGCACACG GGTTGATTTT ATTGGAGTAC ACCGCAAACT TCGCTAAGAA GAAGAATGTT  AGCCCGAATG CCAATTCTAT ACAGGTATTC GAGGTGATTG ATATGATCAA GTCCCAACTA GAGAGCACGT GCCCCAGGGT CGTATCCTAT GCCAACACAT TGGTTGTTAC TGCATGAGAT  TCCATCGTTG CCTTAAGTGG CCCGAATTGG ACAGTCTCAC TTGGAAGAAG AGACTCAACC GGCGCAAGCC AAAGTGCTGC TTTCACCGTC AAAGAAATGG CGGCACTCTT AGGTTCGCAC  ACGATAGGTC AAGCCTGATG CTTGACTTTC CGGTCGGCAA CTTTCATGAC AGATTTTTCT AACGCTATGG TGAAGATGGG AAACCTCAAC CCGCTCACCG GCTCAAGCAG TCAAATTAGG 
AAGAACTATG GAAAAGTCAA CTCATGTTCG TTC 

Retrieve as FASTA