Entry information : EglPrx[P]47
Entry ID 10870
Creation 2012-05-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-05-03 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-21 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglPrx[P]47
Name EglPrx[P]47
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx266]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]47
start..stop
S start..stop
EgrPrx[P]47 642 0 1..322 1..323
EguPrx[P]47 589 0 1..322 1..323
EcamPrx[P]47 452 1e-161 1..322 1..316
EglPrx48 411 2e-145 20..313 22..319
Literature and cross-references EglPrx[P]47
Protein sequence: EglPrx[P]47
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (0)
PWM (Da):   %s   34611.65 (0.0)  
PI (pH):   %s   8.92 (0.00) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-19
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKMITIFLGF VFLLPRGLGN LKVGFYHSTC PRAESIVHQV VQxRFQADQS ITAALLCMHF HECFVRGCDA SILIDSTDSN PMKKSAAPNL TVRGFEIIDE AKKNIEASCP SMVSCADIAT  LATRYAVFFA GGPNYDVATG RRDGIISARD EVNLPGPTFS VSQAQRAFAA KGFTLTEMVI LLGGHTIEIA HYRPYPRFMG TGAPDRSMDP SLIMKLKVTC GASSSSDPTV SLDQSTPSIV 
DNKFYSEILx KRGILQIDQE LTVDKSSMAI VAKFGLDANG FRQSFANAMV KMSNVGVLTG NAG*IRKNCR VFQLARVLRQ LG 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from NGS (stop in frame).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGATGA TAACTATCTT TCTCGGGTTC GTTTTTCTTC TTCCTCGGGG TTTGGGCAAT CTGAAGGTCG GCTTCTACCA CTCTACTTGC CCGCGAGCTG AGTCCATCGT CCATCAGGTC  GTGCAGAKTC GATTCCAAGC CGACCAATCC ATCACGGCCG CCTTGCTCTG CATGCATTTC CACGAATGTT TCGTTAGAGT AAGTTTCGTG CATGTGTGTT TGGACACGTG CTCTCGATGC  TAGGATGTAA ACGTATAAAC ATCATATCAT AAAATTGATT TATCTATCAT TGTAACGAAA TGTGAATAAA TTCTTAAATA GGTCAGTCAT TTTTAAATGT TTAGTGAAAG TCTCTACATC  AATCATTTTT GTGTCTTCAA GCATACGTTA GTCAAAGATG ATTAGAATCC ATGTGYAATT TATAGATAGT TTATGGGTTC TATAGAGTAT ATGTCTCAGT TTGGATAATA AAAAAAAATT  GGCATGAAAG GATATTTAAG TGCCAAAAGT TAGGAAAGTG ACACTTAAGT ACCAAAATTG AATCAATTAA GTGCCAACGG CGAGAAAATT TGACTAAAAT GCTGACATGG CAATTTTTTG  GCAAGACAAG TGCAAAACGA CGACGTTTTG CACGCTGATG TGGTTAGGCA AATGTAAAAA CAACTTCGTT TTGTTACTGA TGTGGCTAAA TAAATAATAT AAAAATTCnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnGATCA ATTGGCAATG AGGGCCTACG AGCCCTTGCC TAGATCCGAC GAGGGTCGCT AGCCCTTGCT CAGCTGGGCC  AAGAGCCGTC GCTTGCTGGG GGGCCAAGGC CAnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnCCGCAA CAACGGGGAG GGGGCGGTGA CAAGGGTTGT GCCTTAGCCG  TTGTTCATCA TCTTCTTCTT CTTCTTCTTC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnTCT TTGATGAGTC ACATAAATGA GCAAAATTAA TTAAAAATTG CCATGTATGA  TTTTCGGCGA GGTTTGTCGG AAGTGACATT CGAGTGTCCC ATTTAAAAAA AAAAAGTAGT ACTTAAGTGT CACTTTCCTA ATTTTTTGTA CTTAAGTGTC TCATAGTGCC AAATTTTGGC  GCTTGTGGTG TTCTTTTGTT TTGTATAGAG TATTTGCCTC CATTTGAATA CATATTTGTG GAAATTAGAG ATTGCATGGA TACTGTGATA TATGTGTAGT ATATGTGCAA TTTCGAGAGA  TATGGATAAT CAAYAGAATT ATTATAATTA ACTCTAATAT AGGAAATTCT CCAAAGAAAT CCCTAATTAT CTCTAACAAA TAGTAAATGT AGTCTAGCCA ATCATTTGAT GAAAGAKCAC  GGTATTAACG TGCCATGATT CTTCCTATCA CGATGTCCAC TAATTTACTC CTACTTCCTT CGTCTCATTT AGGGTTGTGA CGCATCCATA CTCATAGACT CTACCGACAG CAATCCAATG  AAGAAATCCG CCGCCCCGAA CCTAACTGTG CGAGGCTTCG AAATCATTGA CGAAGCCAAG AAGAACATCG AAGCCTCATG CCCTTCGATG GTCTCCTGTG CCGACATCGC AACTTTGGCA  ACACGGTACG CGGTCTTCTT TGCAGGAGGG CCTAACTATG ATGTCGCGAC GGGAAGGCGA GATGGCATCA TCTCGGCCCG CGACGAAGTT AACTTGCCAG GACCGACATT CTCGGTGTCT  CAGGCTCAAC GAGCCTTCGC AGCAAAAGGA TTCACTCTTA CCGAAATGGT CATTCTCTTG GGTGGACACA CCATTGAAAT CGCTCACTAC TAGACCATAT CCCAGATTTA TGGGTACCGG  CGCTCCGGAC CGATCCATGG ACCCAAGCTT GATCATGAAG CTCAAGGTCA CCTGTGGTGC TTCATCAAGT AGCGACCCGA CCGTGTCCTT GGACCAGAGC ACACCGTCCA TCGTCGATAA  CAAGTTCTAT AGCGAGATTC TTGYGAAGAG AGGGATATTG CAAATTGATC AGGAGCTCAC TGTTGAYAAA TCGAGCATGG CAATCGTCGC TAAGTTCGGG TTGGACGCAA ATGGATTTAG  GCAGAGTTTT GCAAACGCGA TGGTGAAGAT GAGCAATGTC GGAGTTCTAA CAGGAAATGC TGGATAGATT AGGAAAAACT GTAGGGTTTT CCAACTAGCT AGAGTGCTCC GCCAGTTAGG 
ATAA 

Retrieve as FASTA