Entry information : EglPrx100
Entry ID 10921
Creation 2012-05-04 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-03-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-03-13 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EglPrx100
Name EglPrx100
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx016]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx100
start..stop
S start..stop
EgrPrx100 655 0 1..324 1..324
EguPrx100 645 0 1..324 1..324
EcamPrx100 616 0 1..324 1..317
CclPrx116 466 3e-167 11..311 8..308
Literature and cross-references EglPrx100
Protein sequence: EglPrx100
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (301)
PWM (Da):   %s   34587.13 (32149.0)  
PI (pH):   %s   4.92 (5.03) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDLELSRVLA LLAYCCLMGT GNAQLRFGFY GQTCPSAEPI VRSVVRNAVI SNPTMAAVLL RLHFHDCxxx GCDGSILIEN GRSAERNAFG HQGVGGFEVI EEAKKHLEVT CPGVVSCADI  VALAARDAVA MANGPDYEVP TGRRDGRVSN VSLAEDMPDV GNSIQQLKSK FFQKGLxEKD LVLLSAAHTI GTTACFFMTD RLYNFMPGGG SDPSINPDFL PELKSMCPQN GDVNVRMPID 
HGSEQTFDDQ ILRNIRSGWA VLESDAKLND DPVTRSVIES YxGLFNPIFG PSFEADFVES MVKMGQIGVK TRVKWRDQAG LQIF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from NGS. GEIR is missing but present in another frame
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCTAG AGCTCTCACG GGTTCTTGCA CTRCTCGCTT ATTGTTGCTT GATGGGAACG GGTAATGCGC AGCTCAGATT CGGTTTCTAC GGCCAAACCT GCCCTTCTGC CGAGCCCATC  GTGAGATCCG TCGTTCGAAA TGCGGTCATC TCCAACCCCA CCATGGCCGC CGTCTTGCTT CGCCTTCACT TCCATGACTG CTTnnnnnnn nnnnCTCTCT CGCTCAATAT GCTCTGCTTT  CCTCATATCA TGACTAGTAA TGCTTCAAAA GTTGAAAGAT TCTTGATAGA TAAATGCTCT TGAATAAGAC CCTTTTATCT AGGAATGAGA CTGTTAAGGT CGATCTTGTG ATTTTGATGC  TATGTATCTT TTAGGGATGT GATGGTTCAA TTCTTATAGA GAACGGGCGA AGTGCGGAGA GGAATGCGTT CGGGCACCAA GGGGTGGGCG GATTTGAGGT GATCGAGGAA GCCAAGAAGC  ACCTCGAGGT CACTTGCCCC GGTGTCGTCT CGTGCGCCGA CATTGTTGCC TTAGCGGCTA GAGATGCTGT CGCAATGGTT CGCCTCTCTT TTATTTGTGT TCTCTTGATT TGCACATATA  TATTAGTTGT CTGTTTAGGA TGATCATATA TGGATGTACC ATGAGTCAAT TATCTAGCAT GCCTAGGATG GATTTTTCGT GTACTCGTGA ATCAGTATCA TGATTGAATA TGAATTCCGA  ATAGAATGAT GCGYGAAATT AGTACAATGG CCGGATAATT GTTACAAACT GAATTTATGA AGTGACATGA CAAATTGACA ACACACTTAT ATTAATGTGT GTGAAGGCAA ATGGGCCTGA  TTATGAGGTT CCGACGGGGC GCCGGGATGG GAGGGTGTCA AATGTGTCGC TGGCCGAGGA CATGCCGGAC GTCGGCAACT CCATCCAACA GCTCAAGTCC AAGTTCTTCC AGAAAGGCCT  CWCCGAAAAG GACCTCGTCC TCCTAAGCGG TACAGCCCCT CTCTCTCTCT CTACCnnnnn nnnnnnnnnn nTACCCATGC TGATATGATG AGCTGATGTT GGTTTGGAAG CCTAAAAAAC  ATGAAAAAGG TGTCATCAAT CGTCATGTTG GAGCATCAAA ATTAGAATTT CGTTTGGCTG GTTTTAGGTG GGTAAGAAAC AGATTATTCT ACTCACATTC TCAACTRCAT ACAATGACAC  ATCCTTCAAC GATGACTCTT TGTAATTAGG CTTGTAATCC AATTTCACAA TTCTTAAAAT CGTCCAAGAC TACAAGGATT GGGAAAAATT ACGAAAAATG TTAGGAATAT RTTGTACAAA  TACCAAATCA ATCATAAACT TTTCAATTTG GTCAATTTAA TCRTAAACCT TTTAAGCATA TGTCAATATT CCATCCAAAT TTGGCTAGAT CTTATTGATA TAGACGCCAA AGGTCCTACG  TGACACAGTT GACGCTAACA TGTACAATTA TTTTGCATTT TTAATTTTTT TTCTTTTTTT TTTCTTTTCT TTTCTTTTTG TTTCTTTCTC TTTCTTACGG CCTCGnnnnn nnnnnnnnnn  nnAATCCAAA ACACTGCAAA AATCATCTAT GTTAGTGCCA GTTGTGGCAT ATAAGGCAAA TGTCATTTAT RTTAGTAATT TCCAACCAAA ATTGGCCGGA ATGACTAAAT TAACAAATTG  TCCAAAGGTT TATTACTATG TTGACTAAAT TGAAAAGTTT AAGACTAGAT TGACATCCAC ATATTTTTTG GTAATTATCT TATAGTAAAT TAATATTAGA GATGAGCGGT TTTAAGCTCC  ATACAAGTTC CACTTGAAAC CTAGAATTTG GAACATATCC ATTTAAATAG ATTTCTCATT TTCTAGAACT TAAAATCTAT CATGGGGACT TTGGAACCTA GAACCCATCT TATCAYAGAT  TCTAAAGTTA GTTCCAAGAT CTACATAAGT TTCACCTTTA TTATTAATAG GATAATTGCA ATAAATTATC ACTTTTAATA ATCGTCAATT GTTGCCACAA TCTATCAATC ATAATTTATA  TTTGGATACA CGAAAAATAT GAAATATTAT AAAGTAAATG TTTTAATCAT AAAATAGAAG CTCAGACTAG TGATCCCAGA TTATACATTC ATAATCAAAT GCCATAGAAT ACTACAAGAT  CGTGCAAAAA CATAGCCAAG AAAAACATAG AAATTCATTT TGGATTCCAA GTTTTGGGTT TTGGGTTTTG GGTTTAAGGT TCAAAGTTTC ATTAACCTAG AATTTAGGAC CTACTCATCG  AAACATAATT TTCAATTTTT GAAACCTGAA ACTACCCTGC ATACCTTGAA ATCTAGAACT TAACATGTTn nTACCATTGG TTCAGTTCTT AGATTTTAGG TTCTACCCCA AAACCATATC  TATCCCTAAT TGATATAATG GCCGTGTTAT GTGGTCTCTC TTGCTTCCAT ATATCATCAA AAATTTCTTT CCTTAAGCTA AGYATGTACT TAYAACTTCA TTTTTTTTAA ATATAAATAT  TTTTAATATA ATTTTAAAAG TTCATATAGT GTTATATGTG AATATTTTTT TAGGTATTCG GTATTAAATA TCGAATCCTA AAGAATAAAG AGATAGTAAC AATGGCAAYG GCTTGAACTC  CACATTGATT TCTCCTGAAC CATGAACCAA CTTGAGATTA TTCAAGTAAA CCTAAGCTGA CTTCGTTTAT TGAATGAAAC AGGGTCGCTT GTTTTAAGTG TCTAATAGGA CTGATTAATT  AAGAAAACAA ATTTGTGAAT CTCTGATATT CACTTCCAAT TTTCATGTTG CAGCCGCGCA TACCATCGGA ACCACnGCAT GCTTCTTCAT GACGGACCGT CTGTACAACT TCATGCCCGG  CGGCGGATCG GACCCTTCGA TCAACCCCGA CTTCTTGCCG GAGCTAAAGT CAATGTGCCC GCAGAACGGC GACGTGAATG TGCGGATGCC AATCGATCAC GGCAGCGAGC AGACATTCGA  CGACCAGATC CTCCGGAACA TCAGGAGYGG ATGGGCCGTT TTGGAGTCGG ACGCGAAGCT AAATGACGAC CCGGTGACGC GGAGCGTGAT CGAATCTTAC RTGGGTCTCT TCAACCCGAT 
CTTCGGGCCT TCCTTCGAAG CGGATTTCGT CGAATCAATG GTAAAAATGG GTCAGATCGG TGTCAAGACG AGGGTCAAAT GGAGAGATCA GGCGGGTTTG CAGATCTTTT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCTAG AGCTCTCACG GGTTCTTGCA CTCCTCGCTT ATTGTTGCTT GATGGGAACG GGTAATGCGC AGCTCAGATT CGGTTTCTAC GGCCAAACCT GCCCTTCTGC CGAGCCCATC  GTGAGATCCG TCGTTCGAAA TGCGGTCATC TCCAACCCCA CCATGGCCGC CGTCTTGCTT CGCCTTCACT TCCATGACTG CTTnnnnnnn nnGGATGTGA TGGTTCAATT CTTATAGAGA  ACGGGCGAAG TGCGGAGAGG AATGCGTTCG GGCACCAAGG GGTGGGCGGA TTTGAGGTGA TCGAGGAAGC CAAGAAGCAC CTCGAGGTCA CTTGCCCCGG TGTCGTCTCG TGCGCCGACA  TTGTTGCCTT AGCGGCTAGA GATGCTGTCG CAATGGCAAA TGGGCCTGAT TATGAGGTTC CGACGGGGCG CCGGGATGGG AGGGTGTCAA ATGTGTCGCT GGCCGAGGAC ATGCCGGACG  TCGGCAACTC CATCCAACAG CTCAAGTCCA AGTTCTTCCA GAAAGGCCTC CCCGAAAAGG ACCTCGTCCT CCTAAGCGCC GCGCATACCA TCGGAACCAC CGCATGCTTC TTCATGACGG  ACCGTCTGTA CAACTTCATG CCCGGCGGCG GATCGGACCC TTCGATCAAC CCCGACTTCT TGCCGGAGCT AAAGTCAATG TGCCCGCAGA ACGGCGACGT GAATGTGCGG ATGCCAATCG  ATCACGGCAG CGAGCAGACA TTCGACGACC AGATCCTCCG GAACATCAGG AGCGGATGGG CCGTTTTGGA GTCGGACGCG AAGCTAAATG ACGACCCGGT GACGCGGAGC GTGATCGAAT  CTTACCTGGG TCTCTTCAAC CCGATCTTCG GGCCTTCCTT CGAAGCGGAT TTCGTCGAAT CAATGGTAAA AATGGGTCAG ATCGGTGTCA AGACGAGGGT CAAATGGAGA GATCAGGCGG 
GTTTGCAGAT CTTTTAA 

Retrieve as FASTA