Entry information : EglPrx[P]139
Entry ID 10959
Creation 2012-05-15 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-02-07 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglPrx[P]139
Name EglPrx[P]139
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx005]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglPrx[P]139
start..stop
S start..stop
EguPrx[P]139 365 3e-130 1..214 1..233
EgrPrx[P]139 347 4e-122 1..215 24..299
SaPrx31 190 6e-61 11..215 34..270
EglPrx179 177 1e-57 123..215 14..114
Literature and cross-references EglPrx[P]139
Protein sequence: EglPrx[P]139
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   215
PWM (Da):   %s   23208.69  
PI (pH):   %s   8.62
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
VQGRGTRVES YSGSCPRAEA IIRSTIQAHF RSDPIVAPGL FFFFFNPSPP PMHFHDRFIQ GCDGSVLING PNAEKTAPPN HLLKGYELIN DAKTQLEAAC PSVVSCADIL ALPARNSVAL 
LFNASIDPSF VSQLRSLCPQ NGDGTRRVAL DTGSPSRFDA SFFANLRSGR GVLESDQKLW TFNMEFAKSM VKMSNIGVKT GTNGEIRKIC SAINA 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from NGS. 5' and 3' end are missing due to NNNN.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGCAAGGAC GAGGTACGAG AGTAGAGTCC TACTCAGGTT CGTGTCCGCG TGCCGAGGCC ATTATTAGGT CAACGATTCA AGCCCATTTC CGGTCCGATC CCATTGTGGC TCCTGGGCTG  TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG Gnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnGTGTGG GAGTTGAAAC CCACTCCTGA AATGAAATCG  TCCCCACCCC AATCCCCCAT GAGAAAGTGG GGATTTGAAC CCCTCACCTC CCCCTATGCA CTTTCATGAT CGCTTCATCC AGGGATGTGA CGGTTCGGTT CTCATCAATG GGCCCAACGC  TGAGAAAACG GCGCCTCCGA ACCATTTGCT GAAAGGATAT GAATTGATCA ATGACGCGAA GACCCAGCTC GAAGCTGCGT GTCCTAGTGT CGTTTCATGT GCTGATATTC TTGCTCTTCC  AGCCCGTAAT TCCGTTGCTC TGTTATTTAA TAATTTCATT CACTTCCATG CAAATCTTGG GCGAGGTCCA TGATATATGT GAGGGTTCTG GACTGGACGT GGATTCCTTA ATTTTCCGAT  AGATATAGTG ATGCCCTTGA TGCAAGGCCT AATAAACTTT GGTAGCAACA CTGAAGTTTA GCAAGACAGA AGTTAGGCCA TGAAGACTAA GGACACGAAT GATGTAGATT GATAACGTGA  GGAGGTGTAG ATGAACCAAT AACCATTAGG TAGTCGTTTT TTCCACTCTC TATTTCTAGA CTTTTAAATC TACCTGTTTA GGCTTCATGA CTTTTGGGTT GAATTTCTGC TATGACTTAC  CATCAGGTTG AAAACACTAT TGGAGAGTTA GGGTGCGTTT GTTTGCGTTT CTGTTTAAAA ATTGTTCCAG GGAACAGAAA TAGAAAAAAA TGTTTCTGTT CCTGGGAACA ATTTCTGAAC  AAAAAAACGC GTTTGGTAAA CTTGTTCCGG GTTTTTCTTA TTTTTCCTTT TTTTCTTTTT TCTTTTTCCT TTTTTCTTTT TTCTTCTTTT GGCCGGTCGT CGGCCTCAGC CATGGCCGGC  GACCGGCCGA CGAGnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnTGGGCGA GGCCGCCGGC CCTCGTCAGC  CGGTCGCCGG CCATGGCCGA GGCCGGCGAC CGGCGAAAGA AAAAAGAAAG AAAATAAGAA GAAAAAGAAG AAAAATTTCA AAAGTGTTTC TGATTTGTGT TTCTTGTTTC TGTTTCTTTT  TTGTTCCTGG GAACAAAAGA ACAAAAAAAA CAGAAAAAGT GTTTAAAAAC AAAAAAAAGA AATACAAACA AACGCAGCAT TATACTTTCG AGAAGTCAGT GCGACTGCAG GTGCTGTCAC  AATCACTTGC CTCATGGTCT GTCCATTGCT GTTATATTGT ATTGATAAAG ACAGAGATGC CATTGGGCAG AGATGCCATT GAGCGTAAAA ATCTCTTGGT CGTGGGTACA TTTTTCTATT  TCTTCACGAA AATATTTTTA ATATCTTAAC TTTTGGATTC ACCTGTGTCA GGTTGCAAAT CTCGTTGGCT TTGTGATTGG ACCATCTGGT ATCAGTTGGT TAATTGCTCG ATTCCTTCAT  AAAGAAGGTA TATCCCAATG TTGCCACCTT TGCAAGAGCT AAACATGCAT TGTCTGTAAA GATTGACTTT CTATTTTGGT GATAGTGCAT CATTAACCAT GTTACTCGAT ACATCTCCTA  AGATTGATGC TCCAGTGCTC ATTAAATTTC AGCTCCATTT TTATCATCTA GAAATATGGT CTCAAAGACA ATCGATGCAG TCCTTGTGTG GCTTTCTAGA TAAGAATGAC CCACCTTAGG  GAGCACAGTA CGGTGTTAAT TTTTTGTTTT TTTTTAGGAT TGTTCCTTTT AAACTTTCAG GCTGATATGG ATCAAGTCTT TGAATAAGAT AGATTGTTGA TGTTATCAAA AGATTTCTTA  TGTGAAACTT TTGAAGCCTG CTGGTTGATA GCATAGGATA AATGGTGCAA GTTGTGCCTT TGTCAAATAA GACATTCTTC AACCTGCCAG CCTCTCCAAG CTGTCCGCAT GAAATGCAAA  AGATTTAGGC AAAAGCTTTC TGCATGAGAT ACACAAGTTT AAGGCCAGTT GGACCATTAC ATATGTACTA GCTATCATTA TTTCAGTTTT CCTCTCTATT GGCAATTGAA ACTGTAACTA  GAGTCTGGGA GGAGATGGAT GGATGCTGCT CTAGTGGGCA AGCGGAGATC GTCAGCCGCT TCTGATATCG CAGAGCTCTA TTAGCATCTA AGAGATTCTG CCAAATTTGT CCTTTCATGT  CACTACATAT AGCATTTATT GGGGATTCTT GTTTCCTTCT TATTCCCTCA ATTTTGGAGC TCCAGGCATT GATAGAGCAT CCATCTTGCA GTGCAGCTCA TGTTTCATAT CCAGGATGCC  AAACGGAAAG GACGGTGAAT CAGACACCAT GATTTGAAAG GGTTGTACTC AGTTGCACCA CTGCACAGTA GGATTATTTA GCAATCGACC ACGGAGAAGA GCATTGATGA AATTTCTGGA  CATACTGACC TTGGCATCAG AGTTAACCTG GAAAGGCATT CCATTACTCC TCCCGGCACT CGGTGGTAGA GTCAGATTTG TTAGCCCTGT ATGGACTGGT AACTCTTCAG TGCTCGTGAA  AGGTGGTGCT GCTGAGAACT ATTTTTGTAT AACGTTGTTT TGTCCTAGTC AATTGGTTGT GATGTAACAA ATAGTTATCT ATGGAATATA AATTAATCAG ATACAGATGC ACATGAAAAT  GATATCAGTC AGGTTGCTCT TTCAACATTT TTGAAATATC GAAATGAACG GGTAATAAGG CCATTTTTCT TTGTCGAAGT ATTAAGGCCA CTTATGAAGA ATAGGAGTGT CTTTGATTTA  TAATCCCTGT ACATTTACTT CAAATGTGCA TTATTTTTAC TCTTTTCGTG TCTACTATAA ATTGGACAAG ACATACTTAA ATCCTTCGTA GAGATAATAT CTGAAAGAAT AATACCTCAA  GTGTTAATAC TTGGCACGGA TGGATATATA ATTGCCAAAA ATTTTAGAAT GTACACTTAA GTGTCACCnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nACGCTTCCA TCGATCCTTC CTTTGTTTCT  CAACTCCGGT CTCTGTGTCC ACAAAACGGT GATGGCACGA GGCGTGTTGC CCTCGACACC GGCAGCCCTA GTCGTTTCGA TGCATCCTTC TTTGCAAACT TGAGGAGCGG AAGGGGAGTT  TTGGAGTCTG ATCAGAAGCT ATGGACCGAn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnAC TTCAACATGG AGTTTGCTAA ATCGATGGTG 
AAGATGAGTA ACATTGGCGT GAAGACAGGG ACCAATGGTG AAATTAGGAA AATATGCTCT GCCATTAATG CATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGCAAGGAC GAGGTACGAG AGTAGAGTCC TACTCAGGTT CGTGTCCGCG TGCCGAGGCC ATTATTAGGT CAACGATTCA AGCCCATTTC CGGTCCGATC CCATTGTGGC TCCTGGGCTG  TTTTTTTTTT TTTTTAACCC CTCACCTCCC CCTATGCACT TTCATGATCG CTTCATCCAG GGATGTGACG GTTCGGTTCT CATCAATGGG CCCAACGCTG AGAAAACGGC GCCTCCGAAC  CATTTGCTGA AAGGATATGA ATTGATCAAT GACGCGAAGA CCCAGCTCGA AGCTGCGTGT CCTAGTGTCG TTTCATGTGC TGATATTCTT GCTCTTCCAG CCCGTAATTC CGTTGCTCTG  TTATTTAATG CTTCCATCGA TCCTTCCTTT GTTTCTCAAC TCCGGTCTCT GTGTCCACAA AACGGTGATG GCACGAGGCG TGTTGCCCTC GACACCGGCA GCCCTAGTCG TTTCGATGCA  TCCTTCTTTG CAAACTTGAG GAGCGGAAGG GGAGTTTTGG AGTCTGATCA GAAGCTATGG ACCTTCAACA TGGAGTTTGC TAAATCGATG GTGAAGATGA GTAACATTGG CGTGAAGACA 
GGGACCAATG GTGAAATTAG GAAAATATGC TCTGCCATTA ATGCATGA 

Retrieve as FASTA