Entry information : EglKat[P]08-1
Entry ID 11022
Creation 2012-05-16 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglKat[P]08-1
Name EglKat[P]08-1
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglKat[P]08-1
start..stop
S start..stop
EgrKat[P]08 548 0 1..321 1..449
EglKat[P]08-2 523 0 1..328 1..442
EguKat[P]08 508 0 1..312 1..418
EguKat[P]06 483 2e-172 1..292 1..402
Literature and cross-references EglKat[P]08-1
Protein sequence: EglKat[P]08-1
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324
PWM (Da):   %s   36426.64 Transmb domain:   %s   i20-42o
PI (pH):   %s   6.34
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASEVTSPLA SRQQSFRVKA YWSFLAFHPC TSFCCWCVAI SMCIGRNYSL TRADFLQAPG VQTPVTVRFS ILxGNFDLVG NNFPIFFICD GMKFPDMENW RILDFFFHHP ESLRLFTFLx  xxxxQELAGG SGN*SRGIQS QPCNSGFYDS IAAGNYPEWK LFVQILDPDH EDKFDFGPLD GAKTWPEDIL PLMPVGRLVL NRNIDNFFAE NEQLAFCPSI VVPGNTRKCA HHNNHPEGFT 
NFMHRDEEIN YFPSRYDPVC HGERYPIPPA KQTIIEKENN FKQLGERCQS *TGFR*EWFI CG*INALSNP RVTHEIRNLW TSYWSQVR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. Some PS is missing. Stops in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC AGTCGTCAGC AATCATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTGT ACATCATTCT GCTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTACTCGGTA AACTACTCTG AGTCAAGGCA TATTGGAGCT AAAAATATGC AGAGAAAACT AACCAAATTC ATCAAnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTTAGAG  TAACGCTAAA CGTGGAATAT GCTTATGGCA AACTATCATC TACATCATAG GTTCAATTCT TCTTGACGAT TATCACCTCA TGGAGAAACT TGCCAACTTT GATAGGGAGA GGATTCCATA  GCTTACCCGT GCCGATTTCC TTCAGGCACC GGGAGTTCAA ACACCTGTGA CTGTCCGTTT CTCCATCCTC Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nTGAGGGTCG TTTTGGTAGT AGACATGAAT GTGCAGTATG GACGGGCATG AGTATGATGC TCCCTGTGAT GAATCCTTTC ACGGGTGGCC TAAACTCGAC  CCATGCATAT GGCAGTTCTC TTGTCCACAT TGCATACATT TGTTTTGTTG CACTTTGCTA TGTGATCTTA CCTTTTCTGT CACTGCAGGG TAACTTTGAT CTGGTAGGAA ACAATTTCCC  TATCTTCTTT ATCTGCGATG GGATGAAATT CCCGGATATG GTnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnGG AGAACTGGAG GATCCTTGAC TTTTTCTTCC ACCATCCCGA  GAGCTTGCGC TTGTTCACCT TCCTCnnnnn nnnnnnnnnn CAAGAGCTTG CTGGAGGAAG TGGCAATTAG AGTCGGGGGA TCCAATCACA GCCATGCAAC TCAGGATTTT ATGATTCCAT  TGCTGCTGGA AACTATCCTG AATGGAAACT TTTCGTTCAG ATCCTCGATC CTGATCATGA AGACAAATTC GACTTTGGCC CACTTGATGG GGCTAAGACC TGGCCCGAGG ACATATTGCC  CCTAATGCCA GTTGGCCGCT TGGTCTTGAA TAGGAACATT GATAACTTCT TTGCTGAGAA TGAACAGCTT GCATTTTGCC CTTCAATTGT AGTTCCCGGC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnCCA ATACTCGTAA ATGCGCTCAT CACAACAATC ACCCTGAAGG TTTCACGAAT TTCATGCATA GGGATGAAGA GGTAAGAATC  GTCTTAGAAT ACTTCAGCAG CGATGCTCTG GGCAGCATCT CTTGTGGATT TTTTGTTGAT GTAACTAGAC ATCGTGCTTT CCTATAAGCA TGTAGGCGTT GTGATGCAAT CTGACATGTC  AATTGCGGAT CCTAAAGTGG CAGTGCGAAT GTCCTCCCTC CTTTTGAGGA AGAGTACTTT CTTAATTTTG CAAATGCACT ATGTACCTGA AACATACGTA CATGTTTACA TATGTAGGAA  ATGCCTGTCT GCTATTATGT AAAATGATTA TCTGTTGAGC AAATGCTTAA TTTCCCTGTT GCAGATAAAC TATTTTCCAT CAAGGTATGA TCCCGTTTGT CATGGAGAGA GGTATCCCAT  TCCACCTGCT nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnGAGAT TGATTGTCTT GAGGTGCTTT CATGGCGATG TCCATGGGAT AGACTCAGCT TGTCCTAGAT GATCAATTGA ATTGCAGTGA GTAGTGCGAC TGATGTATGT GTTTGGATTT  TGTTTACTTT TGTTGCTCCA AACAGACCAT CATTGAGAAA GAGAACAACT TCAAGCAGCT CGGAGAGAGA TGCCAATCAT AGACAGGTAT TCTTCAGTTG CGCAnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnGTCTGTC TCTGTTTTCG TTTTTCAGGT AAGAGTGGTT CATCTGCGGA TAGATCAATG CTTTATCTAA CCCACGTGTT ACTCATGAGA TCCGCAACCT 
CTGGACTTCA TACTGGTCTC AGGTGAGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC AGTCGTCAGC AATCATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTGT ACATCATTCT GCTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTACTCGCTT ACCCGTGCCG ATTTCCTTCA GGCACCGGGA GTTCAAACAC CTGTGACTGT CCGTTTCTCC ATCCTCAnnG GTAACTTTGA TCTGGTAGGA  AACAATTTCC CTATCTTCTT TATCTGCGAT GGGATGAAAT TCCCGGATAT GGAGAACTGG AGGATCCTTG ACTTTTTCTT CCACCATCCC GAGAGCTTGC GCTTGTTCAC CTTCCTCnnn  nnnnnnnnnn nnCAAGAGCT TGCTGGAGGA AGTGGCAATT AGAGTCGGGG GATCCAATCA CAGCCATGCA ACTCAGGATT TTATGATTCC ATTGCTGCTG GAAACTATCC TGAATGGAAA  CTTTTCGTTC AGATCCTCGA TCCTGATCAT GAAGACAAAT TCGACTTTGG CCCACTTGAT GGGGCTAAGA CCTGGCCCGA GGACATATTG CCCCTAATGC CAGTTGGCCG CTTGGTCTTG  AATAGGAACA TTGATAACTT CTTTGCTGAG AATGAACAGC TTGCATTTTG CCCTTCAATT GTAGTTCCCG GCAATACTCG TAAATGCGCT CATCACAACA ATCACCCTGA AGGTTTCACG  AATTTCATGC ATAGGGATGA AGAGATAAAC TATTTTCCAT CAAGGTATGA TCCCGTTTGT CATGGAGAGA GGTATCCCAT TCCACCTGCT AAACAGACCA TCATTGAGAA AGAGAACAAC  TTCAAGCAGC TCGGAGAGAG ATGCCAATCA TAGACAGGTT TCAGGTAAGA GTGGTTCATC TGCGGATAGA TCAATGCTTT ATCTAACCCA CGTGTTACTC ATGAGATCCG CAACCTCTGG 
ACTTCATACT GGTCTCAGGT GAGA 

Retrieve as FASTA