Entry information : EglKat[P]06
Entry ID 11024
Creation 2012-05-16 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglKat[P]06
Name EglKat[P]06
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglKat[P]06
start..stop
S start..stop
EgrKat[P]06 731 0 1..407 1..402
EgrKat[P]08 691 0 1..407 1..400
EguKat[P]06 617 0 1..407 1..382
EglKat[P]08-2 584 0 1..407 1..389
Literature and cross-references EglKat[P]06
Protein sequence: EglKat[P]06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   405
PWM (Da):   %s   45073.39 Transmb domain:   %s   i21-43o
PI (pH):   %s   9.06
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASEVTSPLA RRQR*FRVKA YWSFLAFHPY TSFYCWCVAI SMCIGRNYSS AVHARGACAK GFFEVTHDIS HLTRADFLQA PGVQTPVTVR FSILIHVRSG PESLRDPRGS HVNFYTSGEG  RFDLVGDNFP IFFICDGMKF PDMVRALRPN PKSRVQENWR ILDFFFHHPK SLRSFTFLFD DIGSAQDYRH MQGSGVHTYT LINKARKAHH VKFHRKPTCG SRxxxxxxxL AGGRGN*SRG  IQSQPCNFGF YDSIAAGNYP EWKLFVQILD PDHENKFDFG PLDGAKTWPE DMLPLMPVGR LVLNRNIDNF FAENEQLAFL PFNCSSILIL GGTVLDQNII NSHPPPPPxL FPPxTRKCAH 
HNSHPEGFAN FMHRDEEINY FPSRYDPVRH GERYPIPPAM LTGKHEK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from NGS. 3' and PS are missing due to NNNN. Stop in frame.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC CGTCGCCAGC GATAATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTAT ACATCATTCT ACTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTACTCGGTG AACTACTCTG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT AAAAATATGC AGAGAGACGC AATAGAACCT AATTTTAGAG TAATGCTAAA TGTGGAATAT  GCTTATGGCA AACTATCATC TACGTCACAG GTCCAATTCT TCTTGACGAA TATCACCTTG TGGAGAAACT TGCCAACTTT GATAGGGAGA GGATTCCATA GAGTGCTGTC CATGCCAGGG  GAGCCTGTGC AAAGGGATTC TTTGAGGTCA CTCATGACAT TTCTCACCTT ACCCGTGCTG ATTTCCTTCA GGCACCAGGA GTTCAAACAC CTGTGACTGT CCGTTTCTCC ATCCTCATCC  ACGTAAGGAG CGGCCCTGAA AGCCTGAGGG ACCCCCGGGG TTCTCATGTG AACTTCTACA CGAGTGGTGA GGGTCGTTCT GGTAGTAGAC ATGAATGGGC AGCATGGACG GGCACGAGTA  TGATGCTCCC TGTGATGAAT CCTTTCACAG GTGGCCTAAA CTCGACCGAT GCATATGGCA GTTCTCTTGT CCACATTGCA TATATTTGTT TTGTTGTACT TTGCTATGTG ATCTTACCTT  TTCTGTTACT GCAGGGTAAC TTTGATCTGG TAGGAGACAA TTTCCCTATC TTCTTTATCT GCGATGGGAT GAAATTCCCG GATATGGTTC GTGCACTTAG ACCAAACCCC AAATCCCGCG  TCCAGGAGAA CTGGAGGATC CTTGACTTTT TCTTCCACCA TCCCAAGAGC TTGCGCTCGT TCACCTTCCT CTTTGATGAT ATTGGTAGTG CACAAGATTA CAGGCACATG CAGGGCTCTG  GAGTTCACAC CTACACTTTG ATCAACAAGG CCAGAAAAGC GCATCATGTG AAGTTTCACC GGAAACCAAC TTGCGGGTCA AGAGnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnCTTGCT GGAGGAAGAG  GCAATTAGAG TCGGGGAATC CAATCACAGC CATGCAACTT TGGATTTTAT GATTCCATTG CTGCTGGAAA CTATCCTGAA TGGAAACTTT TCGTTCAGAT CCTCGATCCT GATCATGAAA  ACAAATTCGA CTTTGGCCCA CTTGATGGGG CTAAGACCTG GCCCGAGGAC ATGTTGCCCC TAATGCCAGT TGGCCGCTTG GTCTTGAATA GGAACATTGA TAACTTCTTT GCTGAGAACG  AACAGCTTGC ATTTTTGCCC TTCAATTGTA GTTCCAGGCG TCTACGATTC TGATGATAAG CTACTCCAAA CTCGTCATCT CATATTCTGA TACTCGGAGG CACCGTCTTG GACCAAAATA  TCATCAACTC CCACCCCCCC CCCCCCCCnn TCCTTTTCCC CCCCAAnACT CGTAAATGCG CTCACCACAA CAGTCACCCT GAAGGTTTCG CGAATTTCAT GCATAGGGAT GAAGAGGTAA  GAATCGTCTT AGAATACTTC AGCAGCGATG CTCTGGGCAG CATCTCTTGT GGATTTTGTT TTGATGGAAC TAGACATCGT GCTTTCCTAT AAGCATTGTA GGCGTTGTGA TGCAATCTGA  CATGTCAATT GCGGATCCTA AAGTGGCAGT GCGAATGTCC TCCCTCTTTT TGAGGATTTC CCTGTTGCAG ATAAACTATT TTCCATCAAG GTATGATCCC GTTCGTCATG GAGAGAGGTA 
TCCCATTCCA CCTGCTATGC TGACTGGAAA GCATGAAAAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC CGTCGCCAGC GATAATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTAT ACATCATTCT ACTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTACTCGAGT GCTGTCCATG CCAGGGGAGC CTGTGCAAAG GGATTCTTTG AGGTCACTCA TGACATTTCT CACCTTACCC GTGCTGATTT CCTTCAGGCA  CCAGGAGTTC AAACACCTGT GACTGTCCGT TTCTCCATCC TCATCCACGT AAGGAGCGGC CCTGAAAGCC TGAGGGACCC CCGGGGTTCT CATGTGAACT TCTACACGAG TGGTGAGGGT  CGTTTTGATC TGGTAGGAGA CAATTTCCCT ATCTTCTTTA TCTGCGATGG GATGAAATTC CCGGATATGG TTCGTGCACT TAGACCAAAC CCCAAATCCC GCGTCCAGGA GAACTGGAGG  ATCCTTGACT TTTTCTTCCA CCATCCCAAG AGCTTGCGCT CGTTCACCTT CCTCTTTGAT GATATTGGTA GTGCACAAGA TTACAGGCAC ATGCAGGGCT CTGGAGTTCA CACCTACACT  TTGATCAACA AGGCCAGAAA AGCGCATCAT GTGAAGTTTC ACCGGAAACC AACTTGCGGG TCAAGAGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnCTT GCTGGAGGAA GAGGCAATTA GAGTCGGGGA  ATCCAATCAC AGCCATGCAA CTTTGGATTT TATGATTCCA TTGCTGCTGG AAACTATCCT GAATGGAAAC TTTTCGTTCA GATCCTCGAT CCTGATCATG AAAACAAATT CGACTTTGGC  CCACTTGATG GGGCTAAGAC CTGGCCCGAG GACATGTTGC CCCTAATGCC AGTTGGCCGC TTGGTCTTGA ATAGGAACAT TGATAACTTC TTTGCTGAGA ACGAACAGCT TGCATTTTTG  CCCTTCAATT GTAGTTCCAT TCTGATACTC GGAGGCACCG TCTTGGACCA AAATATCATC AACTCCCACC CCCCCCCCCC CCCnnTCCTT TTCCCCCCCA AnACTCGTAA ATGCGCTCAC  CACAACAGTC ACCCTGAAGG TTTCGCGAAT TTCATGCATA GGGATGAAGA GATAAACTAT TTTCCATCAA GGTATGATCC CGTTCGTCAT GGAGAGAGGT ATCCCATTCC ACCTGCTATG 
CTGACTGGAA AGCATGAAAA G 

Retrieve as FASTA