Entry information : EglGPx03
Entry ID 11069
Creation 2012-05-22 (Qiang Li)
Last sequence changes 2014-01-20 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EglGPx03
Name EglGPx03
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: Gpx2001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglGPx03
start..stop
S start..stop
EgrGPx03 389 2e-139 1..218 1..238
EguGPx03 380 4e-136 1..218 1..238
GhGPx01 321 7e-113 24..218 36..230
VvGPx01 318 1e-111 3..218 27..237
Literature and cross-references EglGPx03
Protein sequence: EglGPx03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   223
PWM (Da):   %s   24361.48  
PI (pH):   %s   9.84
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASAPFSPFP TSLWSPAALR VPSSVRSSLG SCNSAFLVNG LSSSSLQSSS RLSFSSRSSG VYARAATEKT LYDFSVKDID RNDVSLSKFK GKVLLIVNVA SKGLTTSNYK ELSHVYEKYK 
TQGFEILAFP CNQFGGQEPG SNPEIKQFAC TRFKAEFPIF DKVDVNGPGT APVYQFLKSS AGGFLGELVK WNFEKFLVDK NGKVVERYPP TTSPFQIEVR FLS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from NGS.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTCGG CCCCTTTTTC GGnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnCC CTTTCCGACC TCCCTTTGGT CGCCGGCCGC TCTTCGCGTG  CCGTCATCGG TTCGATCCTC GCTCGGTTCG TGTAATTCGG CTTTTCTCGT TAATGGGTTG TCGTCGTCGT CCCTTCAGAG TTCGTCGCGG CTCAGCTTCA GTTCTCGCTC GTCGGGTGTT  TATGCTAGAG CTGCCACTGA GAAGACCCTC TACGATTTCA GCGTGAAGGT ATCGAATTTC TCTTCTGGGT GTAGCTGAAA TTGGTATTTG GAGAGATCTT CTTTTTTGGG TCGTCAGGGA  ACTTTGTAAT TCACTTAGAT ACGCTGTTTT TATGTATTTA TTTATCTTCG GTAGAATCAA GCAATTCTGA TGGCTTGCCC AAGCTACTTT GGAAATTAGA AAAAAAATAT ATCTTAATTG  TCTCAGCCGC CACACTGTTT TTTGCATCTT CTCTGTTTTA TTGTTACTTT TGGATGACGA GGAAGCACAT TTTAGCTACT TAACATTGGT GCTTCCAATT TGGACTAAAA GAAATCAAGC  TGGAGTTGAG GTCGCTTATT TGCTCTTTGT TCATGAATTG AACTAATTTG CAAATTCTCC ACGGTATGCA AATCCTTAGA ATTAAGATTC ATGCTGTTGT GGCTAAAAAT TCTTCGTTGT  TTTGGCACCT GCTATGTTTC GGTAATTTAT GTGGACATTA TTATACTATT CATTTTTCGG TTTACATACT GAATTTTGGG TAAAGCTGCT TTATTCATGA TAATTGCTAA TTGCTGCACA  CATTTTTCTT CATGGTTCAG GACATTGATA GGAATGATGT TTCATTGAGC AAATTCAAGG GAAAAGTCTT ATTAATTGTG AACGTAGCTT CGAAATGGTA ATTGCTTTAT CTCCTTCAGT  TGTCTGATTT AATTTATCAG ATTCACAGTC TCATTGAAGA ATTTTCTTGT GATTCAGTGG TTTAACGACA TCAAACTACA AGGAGCTCTC GCACGTATAT GAGAAGTACA AGACTCAAGG  TGAGATGAGA TTGTGGGGAG AGTTATAGAA TTCCTTAAAA GCTTCTCCTG TTTGAAGTTA GACTACTATC TTTGAGCTAG GAGGGATCAT TAATTTTTAA ATATAGTAGA TGAAATCATG  ATTCAGCAAA GGATGTGAAT CACCTTATTA TATCAGTGTC TTTTTCCAAT CATCGGAAAT GTTCAAGTTC TCAAGACCAT CTAATTAGGA GCTGAATTTC CCTTAACAAC AAGTCACGTC  GATCATTATG CTTCTCACTT ATAGTTTTTT TAATGATATG GGCTCCAACC AAAATTTAAT CTTCTCAAGC AAGCTTTGTT TAGTTTGCCC TGTGGTACTG GGTCTTACAC AGATTGCTAA  AGGGATTGTC CAATGGTCTT TGCTGCGGTT GAGTGTAACA GTGTGCTAGA AATCAGTTGT CCTTTATTTT TCCGTGGGAC TTTTATCAGT GTTTTTTCCA GTCCATTTTC AGGTGTTATA  CAGTTAGAGA TGCTTCCTTT GTGTGTGTGT GTACGAGGGA GAGAGAGAGA GAGAGTAGTA TATCCTGGAT GGATGGATGA ATGGATGGGG TGATAGGGGT AGAGAAAGAG AGATGTACCT  CCACTGATGA AAAGGAAGGG TTCTTTGTTT GGATGCAAGG AGAGAGACAT AGAGAGGGAG AGGCCTATTG CCTCTACCGC AAGGGTGGGA TGGCTGTTTC TTTGCTGGGA TGGAAACAGT  GGGAGACCTC CACTGATGAA AGGAAAGGAG TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TGGTGGGGGG GGGGGGGGGG AGCTATATAT TTTGCTATAT CCAAGAGACA GGAAGAGATC CACTTCTTAA  TTGCCTCTAC TGGAAGGGTG GGATGGCTGT TTCTTTGCTG GGATGGAAAG AGTGGGAGAC CTCTTTCCTC TGATCTAATG TATAGCTTGA ATCTTCTATG CAGATTTGGA TTTGGTTAGT  CCTCTTTCTA TATCTTTAAA ATTGATAAGA AACACCTTGG GCTGTCCATG TTACAGGTTT TGAAATTCTG GCTTTTCCTT GTAATCAATT TGGTGGCCAG GAGCCTGGTT CAAATCCTGA  GATTAAACAA TTTGCTTGTA CAAGGTTTAA AGCAGAGTTT CCGATTTTTG ATAAGGTTTG ACTTCCACAC ATACATTCTT TCCTCTATTT TAAGTGATGG CTGGAATGAA CAACTGAGCT  CAAGTCTGTT GGAAACAGGT TGATGTTAAT GGACCAGGTA CAGCTCCTGT GTATCAGTTT CTGAAATCGA GTGCAGGAGG TTTTTTGGGT GAACTGGTCA AGTGGAACTT TGAGAAGTTT 
CTGGTTGACA AAAATGGCAA AGTTGTGGAG AGATATCCTC CAACAACGTC TCCTTTTCAA ATAGAGGTAC GTTTTTTAAG C 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCTCGG CCCCTTTTTC GCCCTTTCCG ACCTCCCTTT GGTCGCCGGC CGCTCTTCGC GTGCCGTCAT CGGTTCGATC CTCGCTCGGT TCGTGTAATT CGGCTTTTCT CGTTAATGGG  TTGTCGTCGT CGTCCCTTCA GAGTTCGTCG CGGCTCAGCT TCAGTTCTCG CTCGTCGGGT GTTTATGCTA GAGCTGCCAC TGAGAAGACC CTCTACGATT TCAGCGTGAA GGACATTGAT  AGGAATGATG TTTCATTGAG CAAATTCAAG GGAAAAGTCT TATTAATTGT GAACGTAGCT TCGAAAGGTT TAACGACATC AAACTACAAG GAGCTCTCGC ACGTATATGA GAAGTACAAG  ACTCAAGGTT TTGAAATTCT GGCTTTTCCT TGTAATCAAT TTGGTGGCCA GGAGCCTGGT TCAAATCCTG AGATTAAACA ATTTGCTTGT ACAAGGTTTA AAGCAGAGTT TCCGATTTTT  GATAAGGTTG ATGTTAATGG ACCAGGTACA GCTCCTGTGT ATCAGTTTCT GAAATCGAGT GCAGGAGGTT TTTTGGGTGA ACTGGTCAAG TGGAACTTTG AGAAGTTTCT GGTTGACAAA 
AATGGCAAAG TTGTGGAGAG ATATCCTCCA ACAACGTCTC CTTTTCAAAT AGAGGTACGT TTTTTAAGC 

Retrieve as FASTA