Entry information : EglGPx02
Entry ID 11071
Creation 2012-05-22 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-04-08 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-04-08 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EglGPx02
Name EglGPx02
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus globulus    [TaxId: 34317 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EglGPx02
start..stop
S start..stop
EgrGPx02 236 2e-80 1..196 7..202
EglGPx01 234 1e-79 1..196 7..202
EguGPx01 233 8e-79 1..196 7..202
EgrGPx01 224 2e-75 1..190 7..196
Literature and cross-references EglGPx02
Protein sequence: EglGPx02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   196 (176)
PWM (Da):   %s   14516.57 (12258.4)  
PI (pH):   %s   9.47 (9.54) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-196
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
PSFFPFLFAL LALSVYLFNA HRPASRxxxx xxxxxxxxxx xxMQDIRGND VSLSEYSGKV LLIVNVASKx xxxxxxxxxx xxxxxxxxxx xxxxxxxxxx QFAGQEPGSN EEIQETVCTM 
FKAEFPxxxx xxxxxxxxxP LYKFLKSQKG GIFGDGIKWN FTKFLVNREG KVVERYAPxx xxxxLQKDIQ NLLGSS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from NGS. 5' and parts are missing due to NNNN.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCAGCTTCT TCCCATTCCT CTTCGCGCTT CTAGCTCTCT CCGTCTACTT GTTCAACGCG CATCGACCGG CGTCTCGnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnCT GTTCTGTCTG CTCTTGGGTT GGAGAGGGGA GAGGTTTTAG AGGCTGCGCT  ATGTGCAAGA TTGGAACTTT AGCTnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnGT TGTAAAAGTT TATTTGATGT AGATTCCCTT TTCATGGTTT TTATAGTTAG AGATATTTAT GAGTGTAGAT  GTCAATTATC TGATGCATAT GCAGGACATT CGTGGAAATG ATGTAAGTTT GAGCGAGTAC TCTGGGAAGG TTCTTCTGAT TGTCAACGTT GCTTCAAAAT GGTnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnTCATGAA ATGGTTTAGT AGTTGACTAG TTGGTCCTGT TGTATGTCGC TATGTGTTTG  ACTGCATGCA GAACACTTGC ATGTCCAATC TTGAACCTGT TATCACTnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn TCCCAGTAAC AGTCAACTCC TTGAACTTAT ATCATCTGCT TTGATACTTA  TGATATCTAA TATAGCGCAC ACATGTTTGC AGTGGTCTCA CCCAATCAAA TTACAAGGAA TTGAACAnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnC AGTTTGCAGG  ACAAGAGCCA GGGAGTAATG AAGAGATTCA AGAGACTGTA TGCACTATGT TCAAGGCTGA ATTCCCTATn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnCCCACTCT ACAAGTTTTT AAAATCTCAG  AAAGGAGGGA TATTTGGAGA TGGCATCAAA TGGAACTTTA CAAAGTTTCT GGTGAACAGA GAAGGGAAAG TTGTGGAGAG ATATGCTCCC Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn 
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTTTTGGGT TTTCCTGCAG AAAGATATCC AAAATCTGTT GGGATCGTCT TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCAGCTTCT TCCCATTCCT CTTCGCGCTT CTAGCTCTCT CCGTCTACTT GTTCAACGCG CATCGACCGG CGTCTCGnAT GCAGGACATT CGTGGAAATG ATGTAAGTTT GAGCGAGTAC  TCTGGGAAGG TTCTTCTGAT TGTCAACGTT GCTTCAAAAC AGTTTGCAGG ACAAGAGCCA GGGAGTAATG AAGAGATTCA AGAGACTGTA TGCACTATGT TCAAGGCTGA ATTCCCTCCA  CTCTACAAGT TTTTAAAATC TCAGAAAGGA GGGATATTTG GAGATGGCAT CAAATGGAAC TTTACAAAGT TTCTGGTGAA CAGAGAAGGG AAAGTTGTGG AGAGATATGC TCCCCTGCAG 
AAAGATATCC AAAATCTGTT GGGATCGTCT TGA 

Retrieve as FASTA