Entry information : NgrPxDo02
Entry ID 11093
Creation 2012-05-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-05-30 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-05-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NgrPxDo02
Name NgrPxDo02
Class Short peroxidockerin    [Orthogroup: PxDo001]
Taxonomy Eukaryota Heterolobosea Vahlkampfiidae Naegleria
Organism Naegleria gruberi    [TaxId: 5762 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NgrPxDo02
start..stop
S start..stop
NgrPxDo01 590 0 11..559 51..598
RbaPxDo02 290 1e-88 36..545 194..683
RbaPxDo01 277 2e-84 45..544 192..670
BmaPxDo01 273 5e-84 45..544 25..502
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 226701..228383 1683  
complement(join(226701..228383))


exon

Literature and cross-references NgrPxDo02
DNA ref. GenBank:   GG738885.1 (228383..226701)
Protein sequence: NgrPxDo02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   560 (536)
PWM (Da):   %s   63152.88 (60417.4) Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   9.74 (9.76) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-560
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNNKLTLSLF VVLLLLQCMV YVLSREISLK DLKKLTKPVK QSCYTYDGVG VNKKHPTWGS TGEPFPRLTK AAYTDGIKVP PRQKYSAREI SNVFCKQEKC DDSNKYGLSS MFYAFAQFID  HDIDSIGTGI NTESFPIPIP PGDRFTTPTM PFTRANFASE KQIFIGQPLN QVNQITGYLD CSQIYGSDPI KGRALRLLKG GLLKYDEKFG LEFLPSAFPH TNGLFFSGGR NQSIVAGDDR  VTEALPITSI QTLFLREHNR LARLLAKRFN VCKSDAKSPK YDEWLYQTAR AINCAQIQSI TYKEYVPALI GKSHSFNPKK VKFNPDVQVT PSTEFATVAY RFGHSLVSCF LKRIDENGIE  KERVEFKDAF NGFNRFKNSK EELDLILRGL CKHAQQNLDE KVADGLRDFL FGPNVRFDLA AFNLQRSRDC GIASFNDLRS QLGLKKLTAT EISNSNSELK QKLVQYYGEE LSDLDPWLGI 
LMEPKSRDSM LGKLGTKIVK DQFLKLIKGD PCFYTHRKES WVKQLRKSIE RVTLSDIIVA NTGIKRGDKA LGSSAFKSKN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (No intron). Strain="NEG-M".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACAACA AGTTGACCCT TTCTCTTTTT GTTGTCCTGT TGCTACTTCA GTGCATGGTC TACGTTTTGT CAAGAGAAAT TTCACTCAAA GATCTCAAAA AGTTGACCAA GCCAGTAAAA  CAATCTTGTT ATACCTATGA TGGAGTTGGA GTGAATAAGA AGCACCCAAC TTGGGGTTCA ACTGGCGAGC CATTCCCAAG ACTTACCAAA GCTGCTTACA CTGATGGTAT TAAAGTCCCA  CCAAGACAAA AGTACTCTGC CAGAGAAATC AGTAATGTAT TCTGTAAACA AGAAAAGTGT GACGATTCTA ACAAGTATGG TTTGAGTTCA ATGTTTTATG CCTTTGCCCA ATTCATTGAT  CACGATATTG ATTCAATTGG AACTGGTATC AATACTGAAT CATTCCCAAT TCCAATTCCA CCTGGAGATA GATTTACCAC TCCAACTATG CCATTCACTA GAGCCAATTT TGCAAGTGAG  AAACAAATTT TCATTGGTCA ACCATTGAAT CAAGTCAATC AAATTACTGG TTACTTGGAT TGTTCACAAA TTTACGGAAG TGATCCAATT AAGGGAAGAG CATTGAGATT ACTCAAAGGA  GGTCTTTTAA AATATGATGA AAAGTTTGGT TTAGAGTTCC TTCCTTCTGC ATTCCCTCAT ACTAATGGAT TATTCTTCTC TGGTGGCAGA AACCAAAGTA TCGTAGCAGG TGATGATAGA  GTAACTGAGG CATTGCCTAT CACCTCAATT CAAACCTTAT TCTTGAGAGA GCACAACAGA TTGGCCAGAC TTCTTGCAAA GAGATTCAAT GTCTGTAAAT CTGATGCAAA GAGTCCAAAA  TATGATGAAT GGTTATATCA AACAGCTAGA GCCATCAATT GTGCACAAAT TCAATCCATC ACTTATAAGG AATATGTTCC AGCATTGATT GGTAAATCTC ATTCTTTTAA TCCAAAAAAG  GTCAAATTCA ATCCAGATGT TCAAGTGACA CCAAGTACAG AATTCGCTAC TGTTGCCTAT CGTTTTGGTC ACTCTCTTGT TTCATGTTTC TTGAAGAGAA TTGACGAAAA TGGTATTGAG  AAAGAAAGAG TTGAATTTAA GGATGCTTTT AATGGTTTCA ATCGTTTCAA GAATAGTAAG GAAGAATTGG ATCTTATTTT GAGAGGTTTG TGTAAACATG CTCAACAAAA TCTTGATGAA  AAGGTTGCTG ATGGTTTAAG AGATTTCTTG TTTGGACCTA ATGTCAGATT TGATTTGGCT GCCTTCAATT TGCAAAGATC TCGTGATTGT GGTATTGCCT CATTCAATGA TTTGAGAAGT  CAACTTGGAC TCAAGAAATT GACAGCCACT GAAATTTCCA ATTCCAATTC TGAACTCAAG CAAAAACTAG TTCAATACTA TGGTGAAGAA TTGAGCGATT TGGATCCTTG GCTCGGTATT  TTGATGGAAC CAAAATCCAG AGATTCAATG TTGGGTAAAT TAGGAACCAA GATTGTTAAG GATCAATTCT TAAAGTTGAT TAAGGGTGAT CCATGTTTCT ACACTCACAG AAAGGAATCT  TGGGTTAAAC AACTCAGAAA GTCCATTGAG AGAGTTACTC TTTCTGACAT TATTGTTGCC AATACTGGAA TTAAGAGAGG AGATAAGGCT CTCGGATCTT CTGCATTCAA ATCAAAGAAT 
TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAACAACA AGTTGACCCT TTCTCTTTTT GTTGTCCTGT TGCTACTTCA GTGCATGGTC TACGTTTTGT CAAGAGAAAT TTCACTCAAA GATCTCAAAA AGTTGACCAA GCCAGTAAAA  CAATCTTGTT ATACCTATGA TGGAGTTGGA GTGAATAAGA AGCACCCAAC TTGGGGTTCA ACTGGCGAGC CATTCCCAAG ACTTACCAAA GCTGCTTACA CTGATGGTAT TAAAGTCCCA  CCAAGACAAA AGTACTCTGC CAGAGAAATC AGTAATGTAT TCTGTAAACA AGAAAAGTGT GACGATTCTA ACAAGTATGG TTTGAGTTCA ATGTTTTATG CCTTTGCCCA ATTCATTGAT  CACGATATTG ATTCAATTGG AACTGGTATC AATACTGAAT CATTCCCAAT TCCAATTCCA CCTGGAGATA GATTTACCAC TCCAACTATG CCATTCACTA GAGCCAATTT TGCAAGTGAG  AAACAAATTT TCATTGGTCA ACCATTGAAT CAAGTCAATC AAATTACTGG TTACTTGGAT TGTTCACAAA TTTACGGAAG TGATCCAATT AAGGGAAGAG CATTGAGATT ACTCAAAGGA  GGTCTTTTAA AATATGATGA AAAGTTTGGT TTAGAGTTCC TTCCTTCTGC ATTCCCTCAT ACTAATGGAT TATTCTTCTC TGGTGGCAGA AACCAAAGTA TCGTAGCAGG TGATGATAGA  GTAACTGAGG CATTGCCTAT CACCTCAATT CAAACCTTAT TCTTGAGAGA GCACAACAGA TTGGCCAGAC TTCTTGCAAA GAGATTCAAT GTCTGTAAAT CTGATGCAAA GAGTCCAAAA  TATGATGAAT GGTTATATCA AACAGCTAGA GCCATCAATT GTGCACAAAT TCAATCCATC ACTTATAAGG AATATGTTCC AGCATTGATT GGTAAATCTC ATTCTTTTAA TCCAAAAAAG  GTCAAATTCA ATCCAGATGT TCAAGTGACA CCAAGTACAG AATTCGCTAC TGTTGCCTAT CGTTTTGGTC ACTCTCTTGT TTCATGTTTC TTGAAGAGAA TTGACGAAAA TGGTATTGAG  AAAGAAAGAG TTGAATTTAA GGATGCTTTT AATGGTTTCA ATCGTTTCAA GAATAGTAAG GAAGAATTGG ATCTTATTTT GAGAGGTTTG TGTAAACATG CTCAACAAAA TCTTGATGAA  AAGGTTGCTG ATGGTTTAAG AGATTTCTTG TTTGGACCTA ATGTCAGATT TGATTTGGCT GCCTTCAATT TGCAAAGATC TCGTGATTGT GGTATTGCCT CATTCAATGA TTTGAGAAGT  CAACTTGGAC TCAAGAAATT GACAGCCACT GAAATTTCCA ATTCCAATTC TGAACTCAAG CAAAAACTAG TTCAATACTA TGGTGAAGAA TTGAGCGATT TGGATCCTTG GCTCGGTATT  TTGATGGAAC CAAAATCCAG AGATTCAATG TTGGGTAAAT TAGGAACCAA GATTGTTAAG GATCAATTCT TAAAGTTGAT TAAGGGTGAT CCATGTTTCT ACACTCACAG AAAGGAATCT  TGGGTTAAAC AACTCAGAAA GTCCATTGAG AGAGTTACTC TTTCTGACAT TATTGTTGCC AATACTGGAA TTAAGAGAGG AGATAAGGCT CTCGGATCTT CTGCATTCAA ATCAAAGAAT 
TAA 

Retrieve as FASTA