Entry information : GinCcP01
Entry ID 11110
Creation 2012-06-04 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2013-05-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2015-03-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GinCcP01
Name GinCcP01
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Glomeromycota Glomeromycetes Glomeraceae Glomus
Organism Glomus intraradices (Rhizophagus irregularis)    [TaxId: 4876 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GinCcP01
start..stop
S start..stop
AmacrCcP01 418 3e-146 21..384 17..369
ThybCcP01 412 3e-144 23..384 2..354
WmikCcP01 407 3e-142 74..380 42..350
MimpCcP01 405 4e-141 17..375 9..372
Literature and cross-references GinCcP01
DNA ref. JGI genome:   scaffold_20851 (3897..2336)
EST ref. GenBank:   GW116589.1 [5' end]   GW113999.1 [3' end]   GW098265.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. JGI gene:   347746
Protein sequence: GinCcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   392
PWM (Da):   %s   43307.68  
PI (pH):   %s   9.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSLRVLRAF STRANTTKFA ANATYPKIVL NTSVYFRSFA IPNLKRAYST EQTEQKTGGG SSGGDSSGGS SGMLWLGAAG LLGAGVGYYF YSTNNGGILE KTQVPIKPKT IDYQKIYNQI  ADILEDNDWD DGSNGPVFVR LAWHAAGTYD KVSKTGGSNG ATMRFSPESD HGANAGLKFA RDKLEPIKQK NPEISYSDLW SLAGVTAIQE MGGPTIPWIP GRKDADAATA CSPDGRLPDA  TKGPSHIRDI FYRMGFDDRE IVALVGAHAL GRCHPDRSGF DGPWTASPTM FTNNFFTELL GRKWVEKKWK GPKQYIDKET GELMMLPADM ALMQDKNFRP WVEKYAKDEE LFFKDFAAAF 
HKLLELCIPR TGEEKVYHFK KPMNHLKHPF VL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from 12 ESTs and genomic (5 introns).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTCGT TACGAGTTCT TCGCGCTTTT TCTACACGTG CTAACACAGC AAAGTTTGCC GCTAATGCAA CCTACCCTAA AACTGTTTTG AATACTTCAG TTTATTTTCG CTCCTTTGCA  ATTCCAAATT TGAAACGTGC TTATAGTACT GAACAAACAG AGCAAAAAAC TGGTGGTGGT AGCAGCGGTG GTGATAGCAG CGGTGGTAGC AGCGGTATGC TTTGGTTGGG AGCAGCTGGT  CTTTTAGGAG CAGGAGTGGG ATACTATTTT TACAGTACCA ACAATGGTGG TATTTTAGAA AAAACTCAAG TGCCTATAAA ACCAAAAACT ATTGATTATC AAAAAATTTA TAATCAAATA  GCTGATATTT TAGAAGATAA CGATTGGGAT GATGGTTCTA ATGGACCAGT TTTTGTTCGT CTTGCATGGC ATGCGGCCGG CACTTATGAT AAAGTATCTA AGACCGGTGG CAGTAATGGT  GCTACCATGA GATTTTCTCC CGAATCTGAT CATGGTGCTA ATGCAGGACT TAAGTTTGCT AGAGATAAAT TGGAACCTAT TAAACAAAAA AATCCAGAAA TATCTTATTC TGATTTATGG  AGTTTAGCTG GTGTTACCGC TATTCAGGAA ATGGTATAAA TTAATCTTAT GCGTATTTGC TTGAATTAGT ACTCGTATTG TGGGTTATTT ACAATTTACT TGTTATATAT TTTTTTAGGG  AGGTCCTACA ATTCCATGGA TTCCCGGACG GTAAGTTAAT CAATTTTAAG TCGGATATTA CTAATTTTAA TTGATAATGT AAATTCACGC GTAATGTTCG TATTATAATT ATTATAGTAA  GGATGCTGAC GCCGCAACAG CTTGTTCTCC TGATGGTCGT CTTCCCGATG CTACTAAAGG TCCATCTCAC ATTCGGGATA TTTTTTATCG AATGGGATTC GATGATCGGT AACTAATATA  CTCTTATACT TCTATTTATT CCAGCCATTT CAGTATAATT TATTCTCGTA AATTTGTTTA TGAATATTCA ACGCAGTGAA ATTGTAGCAC TTGTTGGGGC TCACGCTTTA GGTCGTTGTC  ATCCTGATCG AAGTGGTTTT GACGGTCCAT GGACTGCTAG TCCTACAATG TTTACAAATA ATTTCTTTAC CGAACTTTTG GGTAGAAAGT GGGTTGAAAA AAAATGGAAA GGTCCAAAAC  AATATATTGA CAAAGAGACT GGTGTGTAAT ATACAAGAAA CATTATTTTG CTACTTATTC ATTCGTTTAC TTACTTACTT ATTTGCTTTT ATAGGTGAAC TTATGATGCT TCCCGCTGAC  ATGGCATTGA TGCAGGTAAT TTATGTAAAT TTGGTTATTA TTAATGTAAT CTCAGTATTA ATTATGGTTA TTTTAATGAT TAGGATAAAA ATTTTAGACC ATGGGTAGAG AAATATGCTA  AAGATGAAGA ATTATTTTTC AAAGATTTCG CTGCTGCATT CCATAAGCTT TTAGAATTAG GTATACCAAG AACCGGAGAA GAAAAAGTTT ATCATTTTAA AAAACCGATG AATCATCTTA 
AACATCCGTT TGTTTTGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTCGT TACGAGTTCT TCGCGCTTTT TCTACACGTG CTAACACAAC AAAGTTTGCC GCTAATGCAA CCTACCCTAA AATTGTTTTG AATACTTCAG TTTATTTTCG CTCCTTTGCA  ATTCCAAATT TGAAACGTGC TTATAGTACT GAACAAACAG AGCAAAAAAC TGGTGGTGGT AGCAGCGGTG GTGATAGCAG CGGTGGTAGC AGCGGTATGC TTTGGTTGGG AGCAGCTGGT  CTTTTAGGAG CAGGAGTGGG ATACTATTTT TACAGTACCA ACAATGGTGG TATTTTAGAA AAAACTCAAG TGCCTATAAA ACCAAAAACT ATTGATTATC AAAAAATTTA TAATCAAATA  GCTGATATTT TAGAAGATAA CGATTGGGAT GATGGTTCTA ATGGACCAGT TTTTGTTCGT CTTGCATGGC ATGCGGCCGG CACTTATGAT AAAGTATCTA AGACCGGTGG CAGTAATGGT  GCTACCATGA GATTTTCTCC CGAATCTGAT CATGGTGCTA ATGCAGGACT TAAGTTTGCT AGAGATAAAT TGGAACCTAT TAAACAAAAA AATCCAGAAA TATCTTATTC TGATTTATGG  AGTTTAGCTG GTGTTACCGC TATTCAGGAA ATGGGAGGTC CTACAATTCC ATGGATTCCC GGACGTAAGG ATGCTGACGC CGCAACAGCT TGTTCTCCTG ATGGTCGTCT TCCCGATGCT  ACTAAAGGTC CATCTCACAT TCGGGATATT TTTTATCGAA TGGGATTCGA TGATCGTGAA ATTGTAGCAC TTGTTGGGGC TCACGCTTTA GGTCGTTGTC ATCCTGATCG AAGTGGTTTT  GACGGTCCAT GGACTGCTAG TCCTACAATG TTTACAAATA ATTTCTTTAC CGAACTTTTG GGTAGAAAGT GGGTTGAAAA AAAATGGAAA GGTCCAAAAC AATATATTGA CAAAGAGACT  GGTGAACTTA TGATGCTTCC CGCTGACATG GCATTGATGC AGGATAAAAA TTTTAGACCA TGGGTAGAGA AATATGCTAA AGATGAAGAA TTATTTTTCA AAGATTTCGC TGCTGCATTC 
CATAAGCTTT TAGAATTATG TATACCAAGA ACCGGAGAAG AAAAAGTTTA TCATTTTAAA AAACCGATGA ATCATCTTAA ACATCCGTTT GTTTTGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACATTCAATC TAGGAGTACT TTTTACCTTT GGATAACAAA TTCCACTTTA TTGTAAATAA AAAAGAAAAT GTCTTCGTTA CGAGTTCTTC GCGCTTTTTC TACACGTGCT AACACAACAA  AGTTTGCCGC TAATGCAACC TACCCTAAAA TTGTTTTGAA TACTTCAGTT TATTTTCGCT CCTTTGCAAT TCCAAATTTG AAACGTGCTT ATAGTACTGA ACAAACAGAG CAAAAAACTG  GTGGTGGTAG CAGCGGTGGT GATAGCAGCG GTGGTAGCAG CGGTATGCTT TGGTTGGGAG CAGCTGGTCT TTTAGGAGCA GGAGTGGGAT ACTATTTTTA CAGTACCAAC AATGGTGGTA  TTTTAGAAAA AACTCAAGTG CCTATAAAAC CAAAAACTAT TGATTATCAA AAAATTTATA ATCAAATAGC TGATATTTTA GAAGATAACG ATTGGGATGA TGGTTCTAAT GGACCAGTTT  TTGTTCGTCT TGCATGGCAT GCGGCCGGCA CTTATGATAA AGTATCTAAG ACCGGTGGCA GTAATGGTGC TACCATGAGA TTTTCTCCCG AATCTGATCA TGGTGCTAAT GCAGGACTTA  AGTTTGCTAG AGATAAATTG ACATTCAATC TAGGAGTACT TTTTACCTTT GGATAACAAA TTCCACTTTA TTGTAAATAA AAAAGAAAAT GTCTTCGTTA CGAGTTCTTC GCGCTTTTTC  TACACGTGCT AACACAACAA AGTTTGCCGC TAATGCAACC TACCCTAAAA TTGTTTTGAA TACTTCAGTT TATTTTCGCT CCTTTGCAAT TCCAAATTTG AAACGTGCTT ATAGTACTGA  ACAAACAGAG CAAAAAACTG GTGGTGGTAG CAGCGGTGGT GATAGCAGCG GTGGTAGCAG CGGTATGCTT TGGTTGGGAG CAGCTGGTCT TTTAGGAGCA GGAGTGGGAT ACTATTTTTA  CAGTACCAAC AATGGTGGTA TTTTAGAAAA AACTCAAGTG CCTATAAAAC CAAAAACTAT TGATTATCAA AAAATTTATA ATCAAATAGC TGATATTTTA GAAGATAACG ATTGGGATGA  TGGTTCTAAT GGACCAGTTT TTGTTCGTCT TGCATGGCAT GCGGCCGGCA CTTATGATAA AGTATCTAAG ACCGGTGGCA GTAATGGTGC TACCATGAGA TTTTCTCCCG AATCTGATCA  TGGTGCTAAT GCAGGACTTA AGTTTGCTAG AGATAAATTG ACATTCAATC TAGGAGTACT TTTTACCTTT GGATAACAAA TTCCACTTTA TTGTAAATAA AAAAGAAAAT GTCTTCGTTA  CGAGTTCTTC GCGCTTTTTC TACACGTGCT AACACAACAA AGTTTGCCGC TAATGCAACC TACCCTAAAA TTGTTTTGAA TACTTCAGTT TATTTTCGCT CCTTTGCAAT TCCAAATTTG  AAACGTGCTT ATAGTACTGA ACAAACAGAG CAAAAAACTG GTGGTGGTAG CAGCGGTGGT GATAGCAGCG GTGGTAGCAG CGGTATGCTT TGGTTGGGAG CAGCTGGTCT TTTAGGAGCA  GGAGTGGGAT ACTATTTTTA CAGTACCAAC AATGGTGGTA TTTTAGAAAA AACTCAAGTG CCTATAAAAC CAAAAACTAT TGATTATCAA AAAATTTATA ATCAAATAGC TGATATTTTA  GAAGATAACG ATTGGGATGA TGGTTCTAAT GGACCAGTTT TTGTTCGTCT TGCATGGCAT GCGGCCGGCA CTTATGATAA AGTATCTAAG ACCGGTGGCA GTAATGGTGC TACCATGAGA  TTTTCTCCCG AATCTGATCA TGGTGCTAAT GCAGGACTTA AGTTTGCTAG AGATAAATTG GAACCTATTA AACAAAAAAA TCCAGAAATA TCTTATTCTG ATTTATGGAG TTTAGCTGGT  GTTACCGCTA TTCAGGAAAT GGGAGGTCCT ACAATTCCAT GGATTCCCGG ACGTAAGGAT GCTGACGCCG CAACAGCTTG TTCTCCTGAT GGTCGTCTTC CCGATGCTAC TAAAGGTCCA  TCTCACATTC GGGATATTTT TTATCGAATG GGATTCGATG ATCGTGAAAT TGTAGCACTT GTTGGGGCTC ACGCTTTAGG TCGTTGTCAT CCTGATCGAA GTGGTTTTGA CGGTCCATGG  ACTGCTAGTC CTACAATGTT TACAAATAAT TTCTTTACCG AACTTTTGGG TAGAAAGTGG GTTGAAAAAA AATGGAAAGG TCCAAAACAA TATATTGACA AAGAGACTGG TGAACTTATG  ATGCTTCCCG CTGACATGGC ATTGATGCAG GATAAAAATT TTAGACCATG GGTAGAGAAA TATGCTAAAG ATGAAGAATT ATTTTTCAAA GATTTCGCTG CTGCATTCCA TAAGCTTTTA 
GAATTATGTA TACCAAGAAC CGGAGAAGAA AAAGTTTATC ATTTTAAAAA ACCGATGAAT CATCTTAAAC ATCCGTTTGT TTTGTAAATA ATTTTGTATT GCGTAAAAAA TATGT 

Retrieve as FASTA