Entry information : NgrFRe01
Entry ID 11174
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NgrFRe01
Name NgrFRe01
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Heterolobosea Vahlkampfiidae Naegleria
Organism Naegleria gruberi    [TaxId: 5762 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NgrFRe01
start..stop
S start..stop
NgrFRe02 361 2e-116 71..674 22..624
NgrFRe03 355 8e-112 1..672 152..855
AeuRboh01_201684 131 3e-32 219..674 254..690
TvivFRe01 120 1e-28 267..666 447..844
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 113000..115024 2025  
join(113000..115024)


exon

Literature and cross-references NgrFRe01
DNA ref. GenBank:   NW_003163277.1 (113000..115024)
Protein sequence: NgrFRe01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   674
PWM (Da):   %s   75798.61 Transmb domain:   %s   o166-188i231-253o263-285i297-319o334-353i360-382o392-414i441-463o526-548i
PI (pH):   %s   9.52
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNIYWKFHNK VTGLLQDDDL IEIAIVAKTK GWLAIGLDFN KTGMTQADCY IGFYDQTNSR PVLYDFWLPG KSIPKNDSLF LGQDDILQLT GSLKDGTTTL KFLRKIDTGD IHADHPIRNR  TIGVSYAFNI NTIDVTQKHT THGDFFINFV TQKGALNLAP APLIQFHIIA TASVAILMAA IGLSYTFISM KEKNRVISLV FHTKFTGLIK NPILGSIFNP ILELTIGEIT LILFHLMLTA  VWFCFGFFNS TSANVGKGFA YAIIINLTAT ILPITRYSAF VFVFGISFER AVKYHKWVAR LTLLIATIHG ILMTVHLADN GSLGNILTAS ANDYILFGLI AWIAMVIMTI FALEPIRRKF  WELFKVIHII LAPVVLVMSS IHAKGWERTL PVLGIAMGLL VIDHLLRIIF GYIMPTKVIK MEYEEKTGIT TMVFEKPTIS MWYMESLGMG KFVYVYIPGV SFFQSHPFTI SSYSKLDSSI  EFTCHVKNLG RGWTKKLADF AMKRKYSAAS IFARVEGPYG KLSVDLNTYS TVVLIAGGIG VTPINAIYNE ITSNKVNASK QNIYVLWTMK DEHMIQLFPN LTQPSSQVKQ SFYITGENHK 
QVNESDTSYQ YHYNMRPNFG KFFHMVSETV GSDNSVAVVV CGPTQMNVDV YNAARRVGRE ERVNFHVHRE TFEL 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Strain="NEG-M".
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATATCT ATTGGAAGTT CCATAATAAG GTTACAGGCT TGCTTCAAGA TGACGATCTT ATTGAAATTG CAATTGTTGC CAAGACAAAG GGTTGGTTGG CTATTGGTTT GGATTTTAAC  AAGACTGGTA TGACACAAGC TGATTGTTAC ATTGGTTTTT ATGATCAGAC AAATTCAAGA CCAGTTCTCT ATGATTTTTG GTTACCTGGA AAGTCAATTC CAAAGAATGA TTCACTTTTT  TTAGGTCAAG ATGACATTTT ACAATTGACT GGTTCATTAA AAGATGGAAC CACTACTTTG AAATTCTTGA GAAAGATTGA TACTGGTGAT ATTCATGCTG ATCACCCAAT TAGAAATAGA  ACTATTGGTG TTAGTTATGC TTTCAATATT AACACAATTG ATGTCACTCA GAAACACACT ACTCATGGCG ATTTTTTCAT TAATTTCGTC ACACAAAAAG GTGCATTGAA TTTGGCACCT  GCTCCATTGA TTCAATTCCA CATTATTGCA ACTGCATCTG TTGCCATTTT GATGGCTGCT ATTGGTTTGT CTTATACTTT CATTTCAATG AAGGAGAAGA ATCGTGTAAT TAGTTTAGTT  TTCCACACCA AGTTTACAGG TTTGATCAAG AACCCAATTC TCGGTTCCAT TTTCAATCCA ATTTTGGAGT TGACCATTGG TGAAATTACT CTCATCTTGT TCCATCTCAT GCTTACTGCT  GTGTGGTTCT GTTTTGGATT TTTCAACAGT ACTTCAGCAA ACGTTGGTAA AGGATTTGCC TATGCCATTA TTATCAATTT GACTGCTACC ATCTTGCCAA TTACTAGATA TTCTGCATTT  GTCTTTGTTT TTGGTATTTC ATTTGAAAGA GCTGTCAAGT ATCACAAATG GGTTGCTAGA TTAACTCTTC TTATTGCTAC TATTCACGGT ATTTTGATGA CTGTTCACTT GGCAGACAAT  GGAAGTCTTG GTAACATTCT TACTGCATCA GCAAATGATT ACATCTTATT TGGATTAATT GCTTGGATTG CCATGGTCAT TATGACTATC TTTGCTTTGG AACCAATTCG TAGAAAGTTC  TGGGAATTGT TCAAGGTAAT TCACATTATT CTTGCCCCAG TTGTCCTCGT CATGTCTTCA ATCCACGCCA AAGGTTGGGA AAGAACTCTC CCAGTTCTTG GTATTGCCAT GGGTTTATTA  GTTATTGATC ATTTGCTCAG AATTATCTTT GGTTATATCA TGCCAACTAA GGTTATCAAG ATGGAATATG AGGAAAAGAC TGGAATTACT ACAATGGTAT TTGAAAAGCC AACTATTAGT  ATGTGGTATA TGGAAAGTTT GGGAATGGGC AAGTTTGTCT ATGTCTACAT TCCAGGTGTT AGTTTCTTCC AATCTCATCC ATTCACTATC AGTAGTTATT CTAAATTAGA TAGTTCTATT  GAATTCACAT GTCATGTTAA GAATTTAGGA AGGGGTTGGA CAAAGAAATT GGCAGATTTT GCCATGAAGA GAAAATACTC TGCTGCCTCA ATCTTTGCCA GAGTTGAAGG TCCATACGGT  AAATTATCAG TTGATTTGAA TACCTATTCT ACTGTTGTAT TGATTGCTGG TGGTATTGGT GTTACTCCAA TTAATGCAAT CTACAATGAA ATTACAAGTA ATAAGGTTAA TGCTTCCAAG  CAAAATATCT ATGTTTTGTG GACCATGAAG GATGAACACA TGATACAATT ATTCCCTAAT TTGACTCAAC CATCTTCTCA AGTCAAACAA AGCTTTTATA TTACTGGTGA AAATCATAAG  CAAGTTAACG AATCAGATAC CAGCTATCAA TATCATTACA ATATGAGACC AAACTTTGGT AAATTCTTCC ACATGGTTTC TGAAACTGTT GGATCAGATA ATAGTGTTGC TGTAGTTGTT 
TGTGGACCAA CTCAAATGAA TGTTGATGTT TATAATGCTG CAAGAAGAGT TGGAAGGGAA GAGAGAGTTA ATTTCCATGT TCACAGAGAA ACCTTTGAAT TGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATATCT ATTGGAAGTT CCATAATAAG GTTACAGGCT TGCTTCAAGA TGACGATCTT ATTGAAATTG CAATTGTTGC CAAGACAAAG GGTTGGTTGG CTATTGGTTT GGATTTTAAC  AAGACTGGTA TGACACAAGC TGATTGTTAC ATTGGTTTTT ATGATCAGAC AAATTCAAGA CCAGTTCTCT ATGATTTTTG GTTACCTGGA AAGTCAATTC CAAAGAATGA TTCACTTTTT  TTAGGTCAAG ATGACATTTT ACAATTGACT GGTTCATTAA AAGATGGAAC CACTACTTTG AAATTCTTGA GAAAGATTGA TACTGGTGAT ATTCATGCTG ATCACCCAAT TAGAAATAGA  ACTATTGGTG TTAGTTATGC TTTCAATATT AACACAATTG ATGTCACTCA GAAACACACT ACTCATGGCG ATTTTTTCAT TAATTTCGTC ACACAAAAAG GTGCATTGAA TTTGGCACCT  GCTCCATTGA TTCAATTCCA CATTATTGCA ACTGCATCTG TTGCCATTTT GATGGCTGCT ATTGGTTTGT CTTATACTTT CATTTCAATG AAGGAGAAGA ATCGTGTAAT TAGTTTAGTT  TTCCACACCA AGTTTACAGG TTTGATCAAG AACCCAATTC TCGGTTCCAT TTTCAATCCA ATTTTGGAGT TGACCATTGG TGAAATTACT CTCATCTTGT TCCATCTCAT GCTTACTGCT  GTGTGGTTCT GTTTTGGATT TTTCAACAGT ACTTCAGCAA ACGTTGGTAA AGGATTTGCC TATGCCATTA TTATCAATTT GACTGCTACC ATCTTGCCAA TTACTAGATA TTCTGCATTT  GTCTTTGTTT TTGGTATTTC ATTTGAAAGA GCTGTCAAGT ATCACAAATG GGTTGCTAGA TTAACTCTTC TTATTGCTAC TATTCACGGT ATTTTGATGA CTGTTCACTT GGCAGACAAT  GGAAGTCTTG GTAACATTCT TACTGCATCA GCAAATGATT ACATCTTATT TGGATTAATT GCTTGGATTG CCATGGTCAT TATGACTATC TTTGCTTTGG AACCAATTCG TAGAAAGTTC  TGGGAATTGT TCAAGGTAAT TCACATTATT CTTGCCCCAG TTGTCCTCGT CATGTCTTCA ATCCACGCCA AAGGTTGGGA AAGAACTCTC CCAGTTCTTG GTATTGCCAT GGGTTTATTA  GTTATTGATC ATTTGCTCAG AATTATCTTT GGTTATATCA TGCCAACTAA GGTTATCAAG ATGGAATATG AGGAAAAGAC TGGAATTACT ACAATGGTAT TTGAAAAGCC AACTATTAGT  ATGTGGTATA TGGAAAGTTT GGGAATGGGC AAGTTTGTCT ATGTCTACAT TCCAGGTGTT AGTTTCTTCC AATCTCATCC ATTCACTATC AGTAGTTATT CTAAATTAGA TAGTTCTATT  GAATTCACAT GTCATGTTAA GAATTTAGGA AGGGGTTGGA CAAAGAAATT GGCAGATTTT GCCATGAAGA GAAAATACTC TGCTGCCTCA ATCTTTGCCA GAGTTGAAGG TCCATACGGT  AAATTATCAG TTGATTTGAA TACCTATTCT ACTGTTGTAT TGATTGCTGG TGGTATTGGT GTTACTCCAA TTAATGCAAT CTACAATGAA ATTACAAGTA ATAAGGTTAA TGCTTCCAAG  CAAAATATCT ATGTTTTGTG GACCATGAAG GATGAACACA TGATACAATT ATTCCCTAAT TTGACTCAAC CATCTTCTCA AGTCAAACAA AGCTTTTATA TTACTGGTGA AAATCATAAG  CAAGTTAACG AATCAGATAC CAGCTATCAA TATCATTACA ATATGAGACC AAACTTTGGT AAATTCTTCC ACATGGTTTC TGAAACTGTT GGATCAGATA ATAGTGTTGC TGTAGTTGTT 
TGTGGACCAA CTCAAATGAA TGTTGATGTT TATAATGCTG CAAGAAGAGT TGGAAGGGAA GAGAGAGTTA ATTTCCATGT TCACAGAGAA ACCTTTGAAT TGTAA 

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