Entry information : NgrFRe02
Entry ID 11175
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NgrFRe02
Name NgrFRe02
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Heterolobosea Vahlkampfiidae Naegleria
Organism Naegleria gruberi    [TaxId: 5762 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NgrFRe02
start..stop
S start..stop
NgrFRe03 463 6e-154 3..624 201..857
NgrFRe01 363 1e-117 22..624 71..674
TvivFRe01 107 1e-24 157..616 381..844
BdeNOx02 102 3e-23 208..622 83..541
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 224758..226632 1875  
join(224758..226632)


exon

Literature and cross-references NgrFRe02
DNA ref. GenBank:   NW_003163322.1 (224758..226632)
Protein sequence: NgrFRe02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   624
PWM (Da):   %s   70008.52 Transmb domain:   %s   i119-141o178-200i220-242o257-279i286-308o318-335i342-364o
PI (pH):   %s   9.78
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MMMFRYTGSI DIKDMYLATN SRSAPIQDTI DNLIFKDGGV SGSDLHVIFR RYLNTGDSSR DKIIRNETMR FSYAYSLSSN DFQSYHDKTG KFTTNLLLIA TNSSSGGTTT GTTNNLYNFH  LIVTGIMFVI VLSLGIVFTF IPVLVKPNLL TDLILYRRFC KVSTNKYLGG MINSLADLTI GEVLIVSSYW LILAAWAVYG GISASSFPAG RAFAYVNVWN FSLILFPLSR YSVLLALFGI  SFERAIKFHK WLGRSTHFFV TVHFLAMLIE NAMINNAAYL WSMSTINYPL LGFISWILLS ILVMGTFEPI RRKLWELFYG SHIILAVLVI GLSIAHGRGW ITLLPYMAAS ILLYLIDLLF  RWVFGFGIPT KVVGISYNED CSVTTVTFQK RFLTFLNIGG KPGKGSFIFV YLPSVSPFEY HPFTVSSYKE LDKKGTYEFT CHVKNHHGKG YGNKLANLAK SNPDVSRLFA RVEGAFGNLS  IPIQHYQTVI LISGGIGITF VHSLLDGLVQ RGEDKSKKIH LWWSFRHPSM LDLFPTIKNN SSIEKELFLT GKDTEMGSHS HSDIKMSRMD VKQLLEKVKS NTNDSYVGVF VCGPTQLIST 
VQNAIFDVNG GGTRFHLHKE VFEF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATGATGT TTAGATATAC TGGATCAATT GATATCAAAG ATATGTACTT GGCTACAAAT TCACGATCAG CTCCTATTCA AGATACTATT GACAATTTGA TTTTCAAAGA TGGTGGAGTG  AGTGGAAGTG ATCTTCATGT GATTTTCAGA AGATACTTGA ATACTGGAGA TAGTTCAAGA GACAAAATTA TTAGAAACGA AACTATGAGG TTCAGTTATG CCTACTCTTT ATCTTCCAAT  GATTTCCAAT CATATCACGA TAAGACTGGA AAGTTCACGA CCAATTTGCT CTTGATTGCT ACAAATTCAT CAAGTGGAGG CACCACAACA GGCACTACAA ATAATCTCTA TAATTTCCAT  CTGATTGTTA CGGGAATCAT GTTTGTGATT GTACTTTCAT TGGGCATTGT CTTTACATTT ATTCCAGTTT TGGTTAAACC AAATCTACTG ACAGATTTGA TTTTATATAG AAGATTTTGC  AAAGTTTCGA CAAACAAATA CTTGGGAGGA ATGATTAATT CATTGGCTGA CTTGACCATT GGAGAAGTTT TAATCGTGTC ATCATATTGG CTCATTCTAG CTGCTTGGGC AGTTTATGGA  GGTATTTCGG CAAGCTCATT CCCAGCTGGA AGAGCTTTTG CTTATGTGAA TGTTTGGAAT TTTAGTTTGA TACTATTCCC TTTGAGTAGA TATTCAGTTT TACTTGCCCT GTTCGGTATT  TCATTTGAGA GAGCTATCAA ATTCCACAAA TGGTTGGGAA GATCAACTCA CTTCTTTGTT ACTGTTCACT TCCTTGCCAT GTTGATTGAA AATGCAATGA TCAATAATGC TGCCTATTTG  TGGTCAATGT CAACAATTAA TTATCCTCTC TTGGGTTTTA TTTCTTGGAT TTTATTGAGT ATTCTAGTGA TGGGAACTTT TGAGCCAATT AGAAGAAAGT TGTGGGAACT TTTCTATGGT  TCACATATTA TTCTTGCTGT TCTAGTGATT GGATTATCCA TTGCACACGG TAGAGGATGG ATTACATTAC TCCCTTATAT GGCTGCAAGT ATTCTCTTGT ATTTGATTGA TTTGCTATTC  AGATGGGTAT TTGGCTTTGG AATTCCAACA AAGGTTGTTG GTATTAGTTA TAATGAGGAT TGTAGTGTAA CAACCGTTAC TTTCCAGAAG AGATTTTTGA CCTTCCTTAA TATTGGAGGA  AAACCTGGAA AGGGTTCATT TATTTTTGTT TATTTGCCTT CAGTTTCTCC TTTCGAATAT CATCCATTTA CTGTGAGTAG TTACAAGGAA TTGGATAAGA AGGGAACCTA TGAATTTACA  TGCCATGTCA AGAATCATCA TGGTAAGGGT TATGGAAACA AGTTGGCCAA TCTTGCCAAA TCCAATCCAG ATGTTAGTCG TCTATTTGCC AGAGTTGAGG GAGCATTTGG AAATCTCTCC  ATTCCTATTC AACATTATCA AACCGTCATC TTAATTAGTG GTGGTATTGG TATTACATTT GTTCATTCAC TCCTCGATGG TCTAGTTCAG AGAGGAGAAG ACAAGTCAAA GAAGATTCAC  TTGTGGTGGT CATTCAGACA TCCCTCAATG TTGGATTTAT TCCCAACGAT TAAGAATAAT TCATCTATCG AAAAGGAACT TTTCCTCACT GGAAAGGACA CTGAGATGGG TTCTCATTCT  CACAGTGACA TTAAAATGTC AAGAATGGAC GTTAAACAAT TACTGGAAAA GGTGAAGAGT AATACCAATG ATTCCTATGT TGGAGTATTC GTCTGTGGAC CAACTCAATT AATTTCCACT 
GTACAAAATG CAATTTTCGA TGTGAATGGT GGAGGTACTA GATTCCATCT CCACAAGGAA GTATTTGAAT TTTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGATGATGT TTAGATATAC TGGATCAATT GATATCAAAG ATATGTACTT GGCTACAAAT TCACGATCAG CTCCTATTCA AGATACTATT GACAATTTGA TTTTCAAAGA TGGTGGAGTG  AGTGGAAGTG ATCTTCATGT GATTTTCAGA AGATACTTGA ATACTGGAGA TAGTTCAAGA GACAAAATTA TTAGAAACGA AACTATGAGG TTCAGTTATG CCTACTCTTT ATCTTCCAAT  GATTTCCAAT CATATCACGA TAAGACTGGA AAGTTCACGA CCAATTTGCT CTTGATTGCT ACAAATTCAT CAAGTGGAGG CACCACAACA GGCACTACAA ATAATCTCTA TAATTTCCAT  CTGATTGTTA CGGGAATCAT GTTTGTGATT GTACTTTCAT TGGGCATTGT CTTTACATTT ATTCCAGTTT TGGTTAAACC AAATCTACTG ACAGATTTGA TTTTATATAG AAGATTTTGC  AAAGTTTCGA CAAACAAATA CTTGGGAGGA ATGATTAATT CATTGGCTGA CTTGACCATT GGAGAAGTTT TAATCGTGTC ATCATATTGG CTCATTCTAG CTGCTTGGGC AGTTTATGGA  GGTATTTCGG CAAGCTCATT CCCAGCTGGA AGAGCTTTTG CTTATGTGAA TGTTTGGAAT TTTAGTTTGA TACTATTCCC TTTGAGTAGA TATTCAGTTT TACTTGCCCT GTTCGGTATT  TCATTTGAGA GAGCTATCAA ATTCCACAAA TGGTTGGGAA GATCAACTCA CTTCTTTGTT ACTGTTCACT TCCTTGCCAT GTTGATTGAA AATGCAATGA TCAATAATGC TGCCTATTTG  TGGTCAATGT CAACAATTAA TTATCCTCTC TTGGGTTTTA TTTCTTGGAT TTTATTGAGT ATTCTAGTGA TGGGAACTTT TGAGCCAATT AGAAGAAAGT TGTGGGAACT TTTCTATGGT  TCACATATTA TTCTTGCTGT TCTAGTGATT GGATTATCCA TTGCACACGG TAGAGGATGG ATTACATTAC TCCCTTATAT GGCTGCAAGT ATTCTCTTGT ATTTGATTGA TTTGCTATTC  AGATGGGTAT TTGGCTTTGG AATTCCAACA AAGGTTGTTG GTATTAGTTA TAATGAGGAT TGTAGTGTAA CAACCGTTAC TTTCCAGAAG AGATTTTTGA CCTTCCTTAA TATTGGAGGA  AAACCTGGAA AGGGTTCATT TATTTTTGTT TATTTGCCTT CAGTTTCTCC TTTCGAATAT CATCCATTTA CTGTGAGTAG TTACAAGGAA TTGGATAAGA AGGGAACCTA TGAATTTACA  TGCCATGTCA AGAATCATCA TGGTAAGGGT TATGGAAACA AGTTGGCCAA TCTTGCCAAA TCCAATCCAG ATGTTAGTCG TCTATTTGCC AGAGTTGAGG GAGCATTTGG AAATCTCTCC  ATTCCTATTC AACATTATCA AACCGTCATC TTAATTAGTG GTGGTATTGG TATTACATTT GTTCATTCAC TCCTCGATGG TCTAGTTCAG AGAGGAGAAG ACAAGTCAAA GAAGATTCAC  TTGTGGTGGT CATTCAGACA TCCCTCAATG TTGGATTTAT TCCCAACGAT TAAGAATAAT TCATCTATCG AAAAGGAACT TTTCCTCACT GGAAAGGACA CTGAGATGGG TTCTCATTCT  CACAGTGACA TTAAAATGTC AAGAATGGAC GTTAAACAAT TACTGGAAAA GGTGAAGAGT AATACCAATG ATTCCTATGT TGGAGTATTC GTCTGTGGAC CAACTCAATT AATTTCCACT 
GTACAAAATG CAATTTTCGA TGTGAATGGT GGAGGTACTA GATTCCATCT CCACAAGGAA GTATTTGAAT TTTAA 

Retrieve as FASTA