Entry information : NgrFRe03
Entry ID 11176
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NgrFRe03
Name NgrFRe03
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Heterolobosea Vahlkampfiidae Naegleria
Organism Naegleria gruberi    [TaxId: 5762 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NgrFRe03
start..stop
S start..stop
NgrFRe02 468 8e-156 201..857 3..624
NgrFRe01 368 2e-116 152..855 1..672
AeuRboh01_201684 109 8e-25 454..855 312..688
TvivFRe01 100 5e-22 435..835 441..834
Literature and cross-references NgrFRe03
DNA ref. GenBank:   NW_003163250.1 (176483..179056)
Protein sequence: NgrFRe03
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   857
PWM (Da):   %s   94827.89 Transmb domain:   %s   o346-368i407-429o439-461i478-500o510-532i539-561o571-593i
PI (pH):   %s   9.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDAWMVAKPQ SPVSDASDDI LQRNGGYNSA TGETHIKWTR FVKTGDSHDV IFTNAVMKTS WALHSTSTGM VRHTSTGKGP SLNFLSAGYA TGEYGVLPSQ PVVSDGGSSS SNSTCSLQTG  YSQSILTQWV NSADYPTANY KLVANYGTSD SLKLYWKVLT NPNDANVPII EFGLIATGIY GYASIGFNHG TNSGMDTADT MFGYVDSSGN PVILDTYMQG NLQAPTLDSS QDFISKNGGL  RSVSGNYELH LKWTRLVNTK DSLDHLFTNA QISISWAIAK TSTSMEYVHN YRGKNVMINF LQTATLAHLA APPGSELATC GSSTGNIKDG SISMNSLTKL ANSYRWHLIA TAFICGLLVI  GGFLLSVIGP RVNPNLFLDL ILYRRLTKQV NLKFIGIYIN TILDLTLGEA VVISCYWILV AIWFAFGYVN ATSAEAGKAF ASVCVFNFGL ILFPVTRYSV LQVLFGISFD RAIKYHRWLG  ILQWFFVTAH GIAMVVHYNA SGLYLVDVTS PTFPILGIIA WFFMTILWLM TFPVIRRKLW EVFLISHVIL SILIVILSII HGSGYINLLP YMALSILLYL FDVFLRVVFG FGIPTKIDSI  KYDEKSQVTT ITMRKPFLTF GSNPSMGHFI FLYIPAVSKY QHHPITVSSC KEIDGGMIKK KELEFTVHVK NFGSGWSKQV AKIAQEKAQS ANELICRVEG AYGSLSVPLL RYKTIVMFGG  GIGITPVHSI YSHLLEKNIQ DKTVYTCWSI PTTDMIQVFP QLLETNGNKN LKPNIFISKM KEENSQQTAF IHKGRANPKQ FLEQVKKEMK ERGELNAYVG VLVCGPEQLV TSVSNAIWDA 
NERNGIRFHL HKEVFTW 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGCAT GGATGGTTGC AAAGCCACAA TCACCAGTGA GTGATGCTTC CGATGATATC CTTCAAAGAA ATGGTGGATA CAACTCGGCC ACAGGTGAGA CACATATCAA GTGGACACGT  TTCGTTAAAA CAGGAGATTC CCACGATGTC ATTTTCACCA ATGCAGTCAT GAAAACTTCC TGGGCACTCC ACTCCACCAG TACTGGAATG GTTAGACATA CCAGCACTGG CAAAGGTCCA  AGTTTGAATT TCCTTTCAGC TGGTTATGCT ACTGGTGAGT ATGGAGTATT GCCAAGTCAA CCAGTAGTTT CGGATGGAGG TTCTAGTAGT AGTAATTCGA CCTGTTCACT TCAAACTGGA  TATTCACAAA GTATTTTAAC TCAGTGGGTC AACTCTGCTG ATTATCCTAC AGCTAATTAC AAGTTAGTTG CTAATTATGG AACTTCTGAT TCTTTGAAAT TGTATTGGAA AGTTTTAACA  AATCCAAATG ATGCAAATGT ACCAATTATT GAATTTGGAT TGATTGCCAC AGGAATTTAT GGCTATGCAT CAATTGGATT TAATCATGGA ACCAACTCTG GAATGGACAC TGCTGATACA  ATGTTTGGAT ATGTGGATTC AAGTGGAAAC CCAGTTATAT TAGACACATA CATGCAAGGT AATCTTCAAG CACCAACATT AGATTCATCT CAAGATTTCA TTTCCAAAAA TGGAGGATTA  AGATCTGTGA GTGGAAATTA TGAACTTCAT TTGAAATGGA CACGTTTGGT CAATACTAAG GATTCATTGG ATCACTTATT TACAAATGCA CAAATTTCAA TTTCTTGGGC TATAGCCAAA  ACATCTACAT CCATGGAATA TGTCCACAAT TACAGAGGCA AAAATGTCAT GATTAACTTT TTACAAACAG CTACTTTGGC ACACTTGGCA GCTCCTCCTG GCAGTGAATT GGCCACATGT  GGTTCTTCTA CTGGCAACAT TAAGGATGGA AGTATCTCAA TGAACTCATT GACCAAACTT GCCAATTCCT ACAGATGGCA TTTGATTGCT ACTGCATTCA TTTGTGGATT GTTGGTTATT  GGTGGATTCT TATTGAGTGT GATTGGACCA AGAGTGAATC CAAATCTATT CCTTGATTTG ATCTTGTACA GAAGATTGAC CAAACAAGTC AATTTGAAAT TTATTGGAAT TTACATTAAT  ACCATTTTAG ATTTAACTTT GGGTGAAGCT GTTGTAATTT CATGTTATTG GATTCTTGTG GCCATTTGGT TTGCATTTGG ATATGTGAAT GCAACATCAG CTGAAGCTGG AAAAGCATTT  GCTTCTGTTT GTGTTTTCAA TTTTGGATTA ATTTTATTTC CAGTCACGAG ATATTCAGTT TTACAAGTTT TATTTGGAAT TTCATTTGAT AGAGCAATTA AATATCACAG ATGGTTGGGT  ATTTTACAAT GGTTTTTTGT AACTGCTCAT GGAATTGCAA TGGTTGTTCA TTATAATGCA TCTGGATTAT ATTTAGTTGA TGTGACATCT CCAACATTTC CAATTTTGGG AATTATTGCA  TGGTTTTTCA TGACTATTCT TTGGTTAATG ACATTCCCAG TCATAAGAAG AAAGCTATGG GAGGTCTTTT TAATTTCACA TGTCATCTTG TCCATTTTAA TTGTCATTTT ATCAATTATT  CATGGTTCTG GATATATTAA TTTATTACCT TATATGGCAT TATCAATTTT ATTATATCTG TTTGATGTAT TTTTGAGAGT GGTATTTGGA TTTGGTATTC CAACCAAAAT TGATTCAATC  AAATATGATG AAAAGAGTCA AGTTACAACC ATTACAATGA GAAAACCATT CTTGACATTT GGCAGTAATC CTTCAATGGG ACATTTCATA TTCTTATACA TTCCTGCTGT TTCAAAATAT  CAACACCATC CAATCACAGT TAGTAGTTGT AAGGAAATTG ATGGTGGAAT GATTAAAAAG AAGGAATTAG AATTTACAGT TCATGTAAAG AATTTTGGAA GTGGATGGTC AAAACAAGTT  GCAAAAATTG CTCAAGAGAA GGCTCAATCA GCCAATGAAT TAATTTGTAG AGTTGAAGGT GCTTATGGAT CATTATCAGT TCCATTATTG AGATACAAGA CAATTGTCAT GTTTGGTGGT  GGAATTGGTA TTACACCAGT TCATTCAATT TATTCACACT TGTTGGAAAA GAATATTCAA GATAAGACTG TTTATACTTG TTGGTCAATT CCAACCACTG ATATGATTCA AGTATTTCCT  CAACTCTTGG AAACGAATGG AAATAAGAAT TTAAAACCAA ATATTTTCAT TTCCAAAATG AAAGAAGAAA ATTCACAACA AACAGCATTT ATTCATAAAG GAAGAGCCAA TCCAAAACAA  TTCTTGGAAC AAGTGAAAAA GGAAATGAAA GAAAGAGGAG AATTGAATGC ATATGTTGGT GTTTTAGTTT GTGGTCCAGA ACAATTGGTA ACTTCAGTTT CGAATGCCAT TTGGGATGCA 
AATGAAAGAA ATGGAATTAG ATTCCATCTC CATAAGGAAG TTTTTACGTG GTAG 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGCAT GGATGGTTGC AAAGCCACAA TCACCAGTGA GTGATGCTTC CGATGATATC CTTCAAAGAA ATGGTGGATA CAACTCGGCC ACAGGTGAGA CACATATCAA GTGGACACGT  TTCGTTAAAA CAGGAGATTC CCACGATGTC ATTTTCACCA ATGCAGTCAT GAAAACTTCC TGGGCACTCC ACTCCACCAG TACTGGAATG GTTAGACATA CCAGCACTGG CAAAGGTCCA  AGTTTGAATT TCCTTTCAGC TGGTTATGCT ACTGGTGAGT ATGGAGTATT GCCAAGTCAA CCAGTAGTTT CGGATGGAGG TTCTAGTAGT AGTAATTCGA CCTGTTCACT TCAAACTGGA  TATTCACAAA GTATTTTAAC TCAGTGGGTC AACTCTGCTG ATTATCCTAC AGCTAATTAC AAGTTAGTTG CTAATTATGG AACTTCTGAT TCTTTGAAAT TGTATTGGAA AGTTTTAACA  AATCCAAATG ATGCAAATGT ACCAATTATT GAATTTGGAT TGATTGCCAC AGGAATTTAT GGCTATGCAT CAATTGGATT TAATCATGGA ACCAACTCTG GAATGGACAC TGCTGATACA  ATGTTTGGAT ATGTGGATTC AAGTGGAAAC CCAGTTATAT TAGACACATA CATGCAAGGT AATCTTCAAG CACCAACATT AGATTCATCT CAAGATTTCA TTTCCAAAAA TGGAGGATTA  AGATCTGTGA GTGGAAATTA TGAACTTCAT TTGAAATGGA CACGTTTGGT CAATACTAAG GATTCATTGG ATCACTTATT TACAAATGCA CAAATTTCAA TTTCTTGGGC TATAGCCAAA  ACATCTACAT CCATGGAATA TGTCCACAAT TACAGAGGCA AAAATGTCAT GATTAACTTT TTACAAACAG CTACTTTGGC ACACTTGGCA GCTCCTCCTG GCAGTGAATT GGCCACATGT  GGTTCTTCTA CTGGCAACAT TAAGGATGGA AGTATCTCAA TGAACTCATT GACCAAACTT GCCAATTCCT ACAGATGGCA TTTGATTGCT ACTGCATTCA TTTGTGGATT GTTGGTTATT  GGTGGATTCT TATTGAGTGT GATTGGACCA AGAGTGAATC CAAATCTATT CCTTGATTTG ATCTTGTACA GAAGATTGAC CAAACAAGTC AATTTGAAAT TTATTGGAAT TTACATTAAT  ACCATTTTAG ATTTAACTTT GGGTGAAGCT GTTGTAATTT CATGTTATTG GATTCTTGTG GCCATTTGGT TTGCATTTGG ATATGTGAAT GCAACATCAG CTGAAGCTGG AAAAGCATTT  GCTTCTGTTT GTGTTTTCAA TTTTGGATTA ATTTTATTTC CAGTCACGAG ATATTCAGTT TTACAAGTTT TATTTGGAAT TTCATTTGAT AGAGCAATTA AATATCACAG ATGGTTGGGT  ATTTTACAAT GGTTTTTTGT AACTGCTCAT GGAATTGCAA TGGTTGTTCA TTATAATGCA TCTGGATTAT ATTTAGTTGA TGTGACATCT CCAACATTTC CAATTTTGGG AATTATTGCA  TGGTTTTTCA TGACTATTCT TTGGTTAATG ACATTCCCAG TCATAAGAAG AAAGCTATGG GAGGTCTTTT TAATTTCACA TGTCATCTTG TCCATTTTAA TTGTCATTTT ATCAATTATT  CATGGTTCTG GATATATTAA TTTATTACCT TATATGGCAT TATCAATTTT ATTATATCTG TTTGATGTAT TTTTGAGAGT GGTATTTGGA TTTGGTATTC CAACCAAAAT TGATTCAATC  AAATATGATG AAAAGAGTCA AGTTACAACC ATTACAATGA GAAAACCATT CTTGACATTT GGCAGTAATC CTTCAATGGG ACATTTCATA TTCTTATACA TTCCTGCTGT TTCAAAATAT  CAACACCATC CAATCACAGT TAGTAGTTGT AAGGAAATTG ATGGTGGAAT GATTAAAAAG AAGGAATTAG AATTTACAGT TCATGTAAAG AATTTTGGAA GTGGATGGTC AAAACAAGTT  GCAAAAATTG CTCAAGAGAA GGCTCAATCA GCCAATGAAT TAATTTGTAG AGTTGAAGGT GCTTATGGAT CATTATCAGT TCCATTATTG AGATACAAGA CAATTGTCAT GTTTGGTGGT  GGAATTGGTA TTACACCAGT TCATTCAATT TATTCACACT TGTTGGAAAA GAATATTCAA GATAAGACTG TTTATACTTG TTGGTCAATT CCAACCACTG ATATGATTCA AGTATTTCCT  CAACTCTTGG AAACGAATGG AAATAAGAAT TTAAAACCAA ATATTTTCAT TTCCAAAATG AAAGAAGAAA ATTCACAACA AACAGCATTT ATTCATAAAG GAAGAGCCAA TCCAAAACAA  TTCTTGGAAC AAGTGAAAAA GGAAATGAAA GAAAGAGGAG AATTGAATGC ATATGTTGGT GTTTTAGTTT GTGGTCCAGA ACAATTGGTA ACTTCAGTTT CGAATGCCAT TTGGGATGCA 
AATGAAAGAA ATGGAATTAG ATTCCATCTC CATAAGGAAG TTTTTACGTG GTAG 

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