Entry information : LbraFRe01
Entry ID 11177
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LbraFRe01
Name LbraFRe01
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Trypanosomatidae Leishmania
Organism Leishmania braziliensis    [TaxId: 5660 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LbraFRe01
start..stop
S start..stop
LinfFRe01 1347 0 97..1085 1..984
TvivFRe01 315 5e-93 267..750 283..745
BdeNOx03 124 9e-30 421..766 95..453
NgrFRe01 113 8e-26 418..760 256..583
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 568711..571968 3258  
join((568711..571968))


exon

Literature and cross-references LbraFRe01
Protein ref. UniProtKB:   A4HIA6
DNA ref. GenBank:   NC_009322.2 (568711..571968)
Protein sequence: LbraFRe01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1085
PWM (Da):   %s   119495.83 Transmb domain:   %s   i12-34o60-82i103-125o155-177i257-274o332-349i369-391o426-448i460-482o507-529i542-564o
PI (pH):   %s   7.78
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MHITPLTLTA QLCYLIGGTV ICVFFTIFGY LVWRAQGYYQ LTPPGEKRRA GFTPNGIAGI TAFFTFAGLA VVLLIETTVF YVRYAFHPSH KGRYWAMHRC AAVIFQAAVG SLYVATGVAL  LVKWGGNSAQ CAFIFCLGID RYPSLSLTRG ENFNILLSVI IFFVLVPAGL VLLCRAFSTV MLQLAERVVR KRGSASEGAD AQVFNSTPGQ PTGEETSSSG SSGGAKASVA TETNPMGKPV  SMRPFHAEPR VKQVCRLIGV LIGILVYAIV SFWLPNDSRR FNANYIAAFA RNSIARDRRT NSTTVPDMPY AWFRTGQIRC SDDLTLKLFP GNVFFYAYLL ATAIIIFVLR QTQRGRYWVQ  RRIPLCACFT YGEAAFVVAT TLLSVMFFIY WLRDHNYKQT WSVTAKESVQ IEAPERWGRG LGQLAILFLS LLLLPVGRQS IVVSVLGVSR DGMLWFHRAV GYAMLAATVG HVVAFYVSYA  SFGYLMQNLN TVANRVCKKG VFDDYSVLVA TWTTWFLLIA MGIFGLSFIR RRYYELFYYT HLAATYMTLP AMVFHASAGW MYLLPGMTIF LADQLVRLWQ RTAVVRIVHA RVISEDTTEL  AFSVPGRWDM QRVHPGQYVL VCVPELTALQ WHPFTLINLV DEESVAVKSS KVSAAGTVFY VHVKSMGPKT WTGRLYDLVS RGEEITMAVE GPCGTPVDYR HYDDIVLVAG GIGATPCVSI  LGSLMRQFDA LGHSGARPRV SVIWCTRSAR HVNAVANMLQ LPVRCGNVVR QPWTRPALVG KIDACAALED LNTNVKMTAK ITQSVSTLEQ DEPLNEEVGV MDEAVRASGD TEQHFSFDVY  VTLKTELQHF STEAAHQFEQ CSSKLSDRLT AKLYTELDDG LYTCVDAIEN ARTVSYSSSL QKQKTAAVTE AEPHVTADDA GQEGEEMVFS SESVCNEREC SEGPGADVHE ESSEGASPCI  AGNKEQEVVT RAASAVDGES VVVPSEFSQW SPRSVMESGN QLDGGDSSND SECGRVAIQV YSGRPDVDRL IREALNKPRP GVGKPSRLDK ARTMLFVCGP NALVRQVISS GVQIGVAVHK 
EEFLF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 30, no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCACATTA CTCCCCTGAC ACTCACGGCG CAGCTGTGCT ACCTGATTGG TGGCACTGTG ATTTGCGTTT TCTTCACTAT CTTTGGCTAT CTGGTGTGGC GTGCTCAGGG GTATTACCAA  CTAACCCCTC CAGGGGAGAA ACGCCGCGCC GGGTTTACGC CAAACGGTAT CGCCGGCATC ACGGCGTTCT TCACCTTCGC TGGTCTCGCT GTGGTGCTTC TAATCGAGAC GACCGTCTTC  TACGTGCGCT ACGCCTTCCA CCCATCCCAC AAGGGCCGAT ACTGGGCGAT GCATCGGTGC GCCGCTGTAA TCTTTCAGGC TGCTGTGGGT AGCCTCTACG TCGCAACTGG TGTGGCGCTC  CTCGTCAAAT GGGGTGGCAA TTCCGCACAG TGCGCTTTCA TCTTTTGCTT GGGAATCGAC CGGTATCCGT CCCTCTCCCT AACGCGGGGC GAAAACTTCA ACATTCTTCT CTCCGTGATC  ATCTTCTTCG TCCTGGTGCC GGCAGGGCTG GTGTTGCTGT GCCGCGCCTT CTCTACTGTC ATGCTGCAGT TGGCCGAGAG GGTGGTGCGC AAGCGCGGCT CGGCGAGCGA GGGAGCCGAC  GCGCAGGTGT TCAACAGCAC ACCGGGACAG CCCACTGGTG AAGAGACGTC TTCGTCCGGA AGCAGTGGCG GTGCGAAGGC CTCGGTGGCG ACAGAGACAA ACCCAATGGG GAAGCCGGTG  AGCATGCGGC CATTTCACGC GGAGCCGAGG GTGAAGCAAG TGTGCCGCCT TATCGGCGTG CTGATCGGTA TCCTGGTGTA CGCTATCGTC TCCTTCTGGC TGCCGAACGA CTCGCGTCGC  TTCAACGCCA ACTACATTGC CGCCTTTGCG CGCAACAGCA TCGCGCGTGA CCGTCGTACT AATAGCACGA CTGTACCCGA TATGCCATAC GCATGGTTCC GCACTGGTCA GATTCGTTGC  TCTGATGACC TGACGCTAAA GCTGTTTCCC GGCAACGTCT TCTTCTATGC GTACCTGTTG GCGACGGCGA TCATTATATT TGTGCTGCGG CAGACGCAGC GCGGGCGGTA CTGGGTGCAG  CGCCGCATCC CACTGTGCGC GTGCTTCACA TATGGCGAGG CCGCCTTCGT TGTCGCCACG ACGCTGCTCT CGGTCATGTT CTTCATCTAC TGGCTTCGCG ACCACAACTA CAAGCAAACC  TGGAGTGTGA CAGCGAAGGA GAGTGTACAG ATTGAGGCGC CGGAGCGATG GGGCCGCGGA CTGGGGCAGC TGGCCATTCT CTTCCTTTCA CTGCTGCTGT TGCCGGTGGG TCGTCAGTCG  ATTGTCGTCA GCGTGCTTGG TGTGTCGCGG GATGGCATGC TGTGGTTCCA TCGTGCGGTC GGCTACGCCA TGCTGGCAGC TACGGTCGGT CACGTTGTGG CCTTCTACGT GTCCTACGCC  AGTTTCGGCT ATCTCATGCA AAACTTGAAC ACCGTTGCCA ATCGCGTCTG CAAGAAGGGG GTTTTCGACG ACTATAGTGT TTTAGTGGCG ACGTGGACGA CGTGGTTCCT GCTGATTGCC  ATGGGCATCT TCGGCCTAAG CTTCATACGC CGTCGCTACT ACGAGCTGTT CTACTATACA CACCTTGCCG CGACGTACAT GACGCTGCCC GCCATGGTTT TCCACGCCTC TGCTGGCTGG  ATGTACCTGC TCCCCGGCAT GACGATATTC CTGGCTGACC AGCTGGTGCG TCTGTGGCAG CGGACCGCCG TGGTGCGCAT TGTGCACGCG CGCGTGATCA GCGAGGACAC GACGGAGCTT  GCCTTCTCTG TGCCCGGGCG GTGGGACATG CAGCGCGTAC ACCCAGGGCA GTATGTGCTG GTGTGCGTAC CGGAGCTGAC GGCTTTGCAG TGGCACCCCT TCACGCTCAT CAACCTCGTG  GACGAGGAGT CGGTGGCCGT CAAAAGCTCG AAGGTGAGTG CGGCGGGGAC TGTGTTCTAT GTGCACGTCA AATCCATGGG GCCAAAGACG TGGACAGGGC GACTGTACGA CCTGGTGAGC  CGTGGCGAGG AGATCACGAT GGCTGTGGAG GGGCCGTGCG GGACGCCGGT AGACTACCGC CACTATGACG ATATTGTTCT GGTTGCCGGT GGCATCGGCG CGACTCCGTG CGTATCGATC  CTCGGGTCGC TGATGCGCCA GTTCGACGCT CTCGGTCACA GTGGCGCGAG GCCGCGTGTG AGCGTCATTT GGTGTACTCG CTCTGCTCGT CACGTGAACG CTGTAGCGAA CATGCTGCAG  CTGCCGGTGC GATGTGGCAA CGTGGTTCGT CAACCTTGGA CCCGGCCGGC GTTGGTGGGG AAGATCGACG CGTGTGCGGC ACTCGAAGAC CTGAATACGA ATGTGAAGAT GACTGCCAAG  ATCACCCAGT CTGTCAGCAC TTTGGAGCAG GACGAGCCGT TGAACGAGGA AGTGGGTGTG ATGGACGAGG CTGTCCGAGC TAGTGGCGAC ACAGAACAGC ACTTTTCCTT CGACGTGTAT  GTTACTCTGA AGACGGAGCT GCAGCATTTT TCCACCGAAG CCGCTCATCA ATTCGAGCAG TGCTCATCAA AATTGAGTGA TCGTTTGACA GCAAAGCTGT ATACAGAGTT GGATGATGGC  CTGTACACTT GCGTGGATGC CATTGAGAAC GCCCGGACTG TTTCGTACAG TTCTTCTCTG CAGAAGCAGA AGACAGCGGC GGTGACGGAG GCCGAGCCAC ACGTCACAGC CGATGATGCG  GGCCAAGAGG GGGAAGAGAT GGTGTTCTCC TCTGAGTCTG TGTGCAATGA AAGAGAATGT TCTGAGGGTC CCGGCGCCGA TGTCCATGAA GAGAGCAGCG AAGGCGCTTC GCCTTGCATT  GCCGGCAATA AGGAACAGGA AGTGGTGACT CGCGCCGCAT CTGCGGTGGA TGGGGAGAGC GTGGTGGTGC CGAGCGAATT CTCCCAGTGG TCACCGAGGT CTGTTATGGA GTCGGGCAAT  CAACTGGATG GCGGCGACAG CAGCAACGAC AGCGAATGCG GACGTGTGGC GATACAGGTG TACTCAGGAC GCCCCGATGT TGATCGCCTC ATCCGCGAAG CACTCAACAA GCCTCGACCT  GGCGTCGGGA AGCCCTCGAG GCTGGACAAG GCCCGCACGA TGTTATTTGT GTGTGGTCCG AACGCGCTCG TTCGCCAGGT CATTTCCTCA GGGGTGCAGA TCGGTGTGGC TGTACACAAG 
GAAGAATTTC TTTTCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCACATTA CTCCCCTGAC ACTCACGGCG CAGCTGTGCT ACCTGATTGG TGGCACTGTG ATTTGCGTTT TCTTCACTAT CTTTGGCTAT CTGGTGTGGC GTGCTCAGGG GTATTACCAA  CTAACCCCTC CAGGGGAGAA ACGCCGCGCC GGGTTTACGC CAAACGGTAT CGCCGGCATC ACGGCGTTCT TCACCTTCGC TGGTCTCGCT GTGGTGCTTC TAATCGAGAC GACCGTCTTC  TACGTGCGCT ACGCCTTCCA CCCATCCCAC AAGGGCCGAT ACTGGGCGAT GCATCGGTGC GCCGCTGTAA TCTTTCAGGC TGCTGTGGGT AGCCTCTACG TCGCAACTGG TGTGGCGCTC  CTCGTCAAAT GGGGTGGCAA TTCCGCACAG TGCGCTTTCA TCTTTTGCTT GGGAATCGAC CGGTATCCGT CCCTCTCCCT AACGCGGGGC GAAAACTTCA ACATTCTTCT CTCCGTGATC  ATCTTCTTCG TCCTGGTGCC GGCAGGGCTG GTGTTGCTGT GCCGCGCCTT CTCTACTGTC ATGCTGCAGT TGGCCGAGAG GGTGGTGCGC AAGCGCGGCT CGGCGAGCGA GGGAGCCGAC  GCGCAGGTGT TCAACAGCAC ACCGGGACAG CCCACTGGTG AAGAGACGTC TTCGTCCGGA AGCAGTGGCG GTGCGAAGGC CTCGGTGGCG ACAGAGACAA ACCCAATGGG GAAGCCGGTG  AGCATGCGGC CATTTCACGC GGAGCCGAGG GTGAAGCAAG TGTGCCGCCT TATCGGCGTG CTGATCGGTA TCCTGGTGTA CGCTATCGTC TCCTTCTGGC TGCCGAACGA CTCGCGTCGC  TTCAACGCCA ACTACATTGC CGCCTTTGCG CGCAACAGCA TCGCGCGTGA CCGTCGTACT AATAGCACGA CTGTACCCGA TATGCCATAC GCATGGTTCC GCACTGGTCA GATTCGTTGC  TCTGATGACC TGACGCTAAA GCTGTTTCCC GGCAACGTCT TCTTCTATGC GTACCTGTTG GCGACGGCGA TCATTATATT TGTGCTGCGG CAGACGCAGC GCGGGCGGTA CTGGGTGCAG  CGCCGCATCC CACTGTGCGC GTGCTTCACA TATGGCGAGG CCGCCTTCGT TGTCGCCACG ACGCTGCTCT CGGTCATGTT CTTCATCTAC TGGCTTCGCG ACCACAACTA CAAGCAAACC  TGGAGTGTGA CAGCGAAGGA GAGTGTACAG ATTGAGGCGC CGGAGCGATG GGGCCGCGGA CTGGGGCAGC TGGCCATTCT CTTCCTTTCA CTGCTGCTGT TGCCGGTGGG TCGTCAGTCG  ATTGTCGTCA GCGTGCTTGG TGTGTCGCGG GATGGCATGC TGTGGTTCCA TCGTGCGGTC GGCTACGCCA TGCTGGCAGC TACGGTCGGT CACGTTGTGG CCTTCTACGT GTCCTACGCC  AGTTTCGGCT ATCTCATGCA AAACTTGAAC ACCGTTGCCA ATCGCGTCTG CAAGAAGGGG GTTTTCGACG ACTATAGTGT TTTAGTGGCG ACGTGGACGA CGTGGTTCCT GCTGATTGCC  ATGGGCATCT TCGGCCTAAG CTTCATACGC CGTCGCTACT ACGAGCTGTT CTACTATACA CACCTTGCCG CGACGTACAT GACGCTGCCC GCCATGGTTT TCCACGCCTC TGCTGGCTGG  ATGTACCTGC TCCCCGGCAT GACGATATTC CTGGCTGACC AGCTGGTGCG TCTGTGGCAG CGGACCGCCG TGGTGCGCAT TGTGCACGCG CGCGTGATCA GCGAGGACAC GACGGAGCTT  GCCTTCTCTG TGCCCGGGCG GTGGGACATG CAGCGCGTAC ACCCAGGGCA GTATGTGCTG GTGTGCGTAC CGGAGCTGAC GGCTTTGCAG TGGCACCCCT TCACGCTCAT CAACCTCGTG  GACGAGGAGT CGGTGGCCGT CAAAAGCTCG AAGGTGAGTG CGGCGGGGAC TGTGTTCTAT GTGCACGTCA AATCCATGGG GCCAAAGACG TGGACAGGGC GACTGTACGA CCTGGTGAGC  CGTGGCGAGG AGATCACGAT GGCTGTGGAG GGGCCGTGCG GGACGCCGGT AGACTACCGC CACTATGACG ATATTGTTCT GGTTGCCGGT GGCATCGGCG CGACTCCGTG CGTATCGATC  CTCGGGTCGC TGATGCGCCA GTTCGACGCT CTCGGTCACA GTGGCGCGAG GCCGCGTGTG AGCGTCATTT GGTGTACTCG CTCTGCTCGT CACGTGAACG CTGTAGCGAA CATGCTGCAG  CTGCCGGTGC GATGTGGCAA CGTGGTTCGT CAACCTTGGA CCCGGCCGGC GTTGGTGGGG AAGATCGACG CGTGTGCGGC ACTCGAAGAC CTGAATACGA ATGTGAAGAT GACTGCCAAG  ATCACCCAGT CTGTCAGCAC TTTGGAGCAG GACGAGCCGT TGAACGAGGA AGTGGGTGTG ATGGACGAGG CTGTCCGAGC TAGTGGCGAC ACAGAACAGC ACTTTTCCTT CGACGTGTAT  GTTACTCTGA AGACGGAGCT GCAGCATTTT TCCACCGAAG CCGCTCATCA ATTCGAGCAG TGCTCATCAA AATTGAGTGA TCGTTTGACA GCAAAGCTGT ATACAGAGTT GGATGATGGC  CTGTACACTT GCGTGGATGC CATTGAGAAC GCCCGGACTG TTTCGTACAG TTCTTCTCTG CAGAAGCAGA AGACAGCGGC GGTGACGGAG GCCGAGCCAC ACGTCACAGC CGATGATGCG  GGCCAAGAGG GGGAAGAGAT GGTGTTCTCC TCTGAGTCTG TGTGCAATGA AAGAGAATGT TCTGAGGGTC CCGGCGCCGA TGTCCATGAA GAGAGCAGCG AAGGCGCTTC GCCTTGCATT  GCCGGCAATA AGGAACAGGA AGTGGTGACT CGCGCCGCAT CTGCGGTGGA TGGGGAGAGC GTGGTGGTGC CGAGCGAATT CTCCCAGTGG TCACCGAGGT CTGTTATGGA GTCGGGCAAT  CAACTGGATG GCGGCGACAG CAGCAACGAC AGCGAATGCG GACGTGTGGC GATACAGGTG TACTCAGGAC GCCCCGATGT TGATCGCCTC ATCCGCGAAG CACTCAACAA GCCTCGACCT  GGCGTCGGGA AGCCCTCGAG GCTGGACAAG GCCCGCACGA TGTTATTTGT GTGTGGTCCG AACGCGCTCG TTCGCCAGGT CATTTCCTCA GGGGTGCAGA TCGGTGTGGC TGTACACAAG 
GAAGAATTTC TTTTCTAG 

Retrieve as FASTA