Entry information : TvivFRe01
Entry ID 11178
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: TvivFRe01
Name TvivFRe01
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Trypanosomatidae Trypanosoma
Organism Trypanosoma vivax    [TaxId: 5699 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value TvivFRe01
start..stop
S start..stop
LbraFRe01 304 4e-89 283..745 267..750
LinfFRe01 291 3e-85 285..751 173..660
LinfFRe01 50 0.000002 171..244 8..81
AeuRboh01_201684 129 4e-31 524..850 370..690
NgrFRe01 120 2e-28 447..844 267..666
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1317766..1320318 2553  
complement(join(1317766..1320318))


exon

Literature and cross-references TvivFRe01
Protein ref. UniProtKB:   G0UAY4
DNA ref. GenBank:   HE573027.1 (1317766..1320318)
Protein sequence: TvivFRe01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   850
PWM (Da):   %s   94762.42 Transmb domain:   %s   o10-32i90-112o139-161i168-190o226-248i261-283o354-373i390-412o438-460i473-495o524-546i553-575o
PI (pH):   %s   9.03
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MRKILGCPLL LPAAACGYPF PVLIALLMHL LYFCCRVSKY GICSAFLKTL RFKSNTHTRL GSAAYSFKFK QIMSSATLIL QQHAKSPLKL AGVVAISGLV GVGVSLSGLL CWSKVGMFVN  VQPHQKGCVG YDLPAFTGLL LFTALSLPSI SLLYLGVSSL LCLQASLFIF IVSTALGLAF VLTGVSALLL WNEMSWCSDV FVAGILDTKE QCLSEVGKGL HNTIAITAFF VLVPVGIVLL  FQVFLRALGT NRWHLLRKWQ WVFLFPTSTL FSVIFATLLL TFFGVLSLIL PNSWAAFSSS GILDNARKLV TRNYTRCRVE RSSYTCPEVP WSWFQTRNWA WSDALVLKSY PSNVIFYLYA  FILLITTATV RLSHRGRTSL RRRCRMIPNF TYGEICFILL TVSMLSLFFF YWMHDHNYKC RYTDVSKETV PVEKWARSLG QLATAFLSLC IASATRHSVL HSILGTSWDS SIWVHKLLGY  GTLFATAAHA GVWYVRYYQV EAFPRGVFSV PAVYPPVFED DFTVPLVTLA SFFAFVSIGV FALPPIRRKC YEVFYYAHIV AFYTLVPAVL WHAAAAWEYL LPGLTVWLVD WLLRMHRRGL  AVEIVYATTS GSTVSLCFRR TAVNVVCGQY FFVNVPELSL FQWHPFSLSS EDGQNCTMHI KSMGDGTWTD RLLHLVEKRG GSFSLFIEGP YGQSHHFTDY KRVVLVAGGI GVTPCASIFN  NLHQRLLEGK VGPTITLLWT LRDARIIPML SYVWDNGRLH ERAVFSGADA SACASVELFL TDDCFSSDNL GDVSVSHGRV DLRSKLPELL AGEHARDVLV FSCGPRGLVQ AARNVAISLG 
ANFHEENFLM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 11, no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCGTAAAA TCCTGGGGTG TCCCTTGCTG CTCCCAGCAG CAGCATGCGG GTACCCATTT CCGGTGTTAA TTGCGTTGTT GATGCACTTG CTTTATTTTT GCTGTCGCGT ATCCAAATAT  GGTATATGTT CTGCTTTTCT TAAGACTCTA CGTTTTAAAT CAAATACACA CACTCGCCTC GGAAGTGCTG CTTACAGCTT TAAGTTTAAA CAGATCATGA GCAGTGCTAC TCTCATTTTG  CAACAACATG CCAAAAGTCC ATTGAAGTTA GCAGGTGTTG TTGCTATTTC AGGTTTGGTT GGAGTAGGTG TATCGCTCTC TGGACTCCTC TGTTGGTCCA AAGTTGGCAT GTTCGTAAAT  GTTCAACCTC ACCAAAAAGG ATGTGTTGGC TACGACTTAC CGGCCTTCAC CGGTCTACTT CTCTTTACGG CCCTGTCACT GCCAAGCATC TCTTTGCTTT ACCTTGGAGT GAGCTCTTTG  TTGTGTTTGC AAGCAAGTCT CTTCATTTTT ATTGTAAGCA CTGCTCTAGG TCTTGCTTTC GTTCTCACTG GAGTTTCAGC ACTTCTATTA TGGAACGAGA TGTCATGGTG CTCCGACGTC  TTTGTTGCAG GCATTTTGGA CACCAAAGAG CAGTGTCTAT CGGAAGTTGG GAAGGGGCTC CACAACACAA TAGCGATAAC TGCATTCTTT GTTCTTGTCC CAGTCGGCAT TGTATTACTT  TTTCAAGTCT TTCTGCGCGC ACTGGGAACC AATCGCTGGC ATTTGCTACG AAAGTGGCAA TGGGTTTTCT TGTTTCCGAC CTCGACGTTG TTCTCAGTGA TTTTTGCCAC ACTCCTTCTG  ACCTTTTTTG GAGTTCTATC ATTGATTCTT CCAAATTCAT GGGCAGCATT CTCTTCTTCA GGTATCTTGG ACAATGCACG TAAACTCGTT ACGCGCAATT ATACACGATG CCGTGTGGAA  AGAAGCTCAT ACACTTGCCC AGAAGTGCCA TGGTCCTGGT TCCAGACGCG AAACTGGGCA TGGAGTGATG CCTTAGTATT GAAATCATAT CCAAGTAATG TAATTTTTTA CCTGTATGCA  TTTATTCTCT TGATCACTAC CGCAACCGTT CGCCTCTCTC ACCGCGGCCG CACCTCTTTG AGACGGAGAT GTCGTATGAT TCCAAACTTT ACTTATGGTG AAATTTGCTT TATACTTCTG  ACCGTGTCAA TGCTTTCGCT GTTTTTTTTC TACTGGATGC ACGACCACAA CTATAAATGC CGCTACACTG ATGTGTCAAA AGAAACGGTG CCAGTGGAAA AATGGGCCCG TTCACTAGGC  CAGCTTGCTA CCGCATTTCT CTCACTTTGC ATTGCCTCTG CAACCCGGCA CTCTGTCCTG CATTCTATAC TGGGCACCTC ATGGGACTCG TCAATCTGGG TGCATAAACT CCTAGGGTAT  GGCACGCTGT TTGCAACAGC AGCACACGCG GGTGTATGGT ATGTGCGATA CTACCAAGTT GAGGCTTTTC CACGCGGTGT TTTTTCTGTT CCTGCAGTGT ACCCCCCTGT ATTCGAGGAT  GACTTCACGG TGCCACTAGT CACTTTAGCA TCCTTTTTCG CATTCGTTTC CATTGGCGTA TTCGCGCTTC CACCTATAAG ACGCAAGTGC TACGAAGTGT TCTACTACGC TCACATTGTG  GCTTTCTACA CGCTTGTTCC TGCTGTTTTG TGGCACGCAG CAGCAGCGTG GGAGTACCTA CTTCCTGGGC TCACTGTGTG GCTGGTGGAC TGGCTGTTGC GCATGCACCG TCGCGGGTTA  GCAGTAGAGA TTGTGTATGC TACCACCAGT GGATCTACTG TGTCATTGTG CTTCCGACGG ACCGCTGTCA ATGTGGTCTG TGGTCAGTAT TTTTTCGTCA ATGTTCCTGA ACTTTCGTTG  TTTCAATGGC ATCCATTCAG TCTGAGCAGT GAAGACGGAC AGAATTGTAC AATGCACATT AAGTCAATGG GTGATGGTAC ATGGACTGAT CGTTTACTAC ATTTAGTAGA AAAACGTGGT  GGTAGCTTTT CTTTGTTTAT TGAAGGCCCA TATGGACAGT CACATCACTT CACCGACTAT AAACGCGTTG TTCTCGTCGC CGGGGGCATT GGTGTAACGC CGTGTGCTTC TATATTCAAC  AATCTTCACC AGCGACTGCT CGAAGGCAAG GTGGGACCCA CCATAACGCT ACTGTGGACT TTGCGTGATG CGAGGATTAT ACCTATGCTC TCATACGTAT GGGACAACGG CAGGTTACAT  GAAAGGGCAG TGTTCAGCGG AGCAGATGCA TCTGCATGCG CATCGGTTGA ACTGTTCCTC ACCGATGACT GTTTTTCAAG TGACAATTTA GGTGATGTCT CAGTTTCCCA TGGCCGCGTA  GACTTGAGAT CAAAGCTGCC TGAACTGCTG GCCGGCGAGC ATGCGCGCGA TGTGTTGGTG TTTTCATGTG GCCCTCGTGG ATTGGTGCAG GCTGCTCGGA ATGTTGCCAT TTCCCTGGGT 
GCCAATTTCC ACGAGGAAAA CTTTTTAATG TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCGTAAAA TCCTGGGGTG TCCCTTGCTG CTCCCAGCAG CAGCATGCGG GTACCCATTT CCGGTGTTAA TTGCGTTGTT GATGCACTTG CTTTATTTTT GCTGTCGCGT ATCCAAATAT  GGTATATGTT CTGCTTTTCT TAAGACTCTA CGTTTTAAAT CAAATACACA CACTCGCCTC GGAAGTGCTG CTTACAGCTT TAAGTTTAAA CAGATCATGA GCAGTGCTAC TCTCATTTTG  CAACAACATG CCAAAAGTCC ATTGAAGTTA GCAGGTGTTG TTGCTATTTC AGGTTTGGTT GGAGTAGGTG TATCGCTCTC TGGACTCCTC TGTTGGTCCA AAGTTGGCAT GTTCGTAAAT  GTTCAACCTC ACCAAAAAGG ATGTGTTGGC TACGACTTAC CGGCCTTCAC CGGTCTACTT CTCTTTACGG CCCTGTCACT GCCAAGCATC TCTTTGCTTT ACCTTGGAGT GAGCTCTTTG  TTGTGTTTGC AAGCAAGTCT CTTCATTTTT ATTGTAAGCA CTGCTCTAGG TCTTGCTTTC GTTCTCACTG GAGTTTCAGC ACTTCTATTA TGGAACGAGA TGTCATGGTG CTCCGACGTC  TTTGTTGCAG GCATTTTGGA CACCAAAGAG CAGTGTCTAT CGGAAGTTGG GAAGGGGCTC CACAACACAA TAGCGATAAC TGCATTCTTT GTTCTTGTCC CAGTCGGCAT TGTATTACTT  TTTCAAGTCT TTCTGCGCGC ACTGGGAACC AATCGCTGGC ATTTGCTACG AAAGTGGCAA TGGGTTTTCT TGTTTCCGAC CTCGACGTTG TTCTCAGTGA TTTTTGCCAC ACTCCTTCTG  ACCTTTTTTG GAGTTCTATC ATTGATTCTT CCAAATTCAT GGGCAGCATT CTCTTCTTCA GGTATCTTGG ACAATGCACG TAAACTCGTT ACGCGCAATT ATACACGATG CCGTGTGGAA  AGAAGCTCAT ACACTTGCCC AGAAGTGCCA TGGTCCTGGT TCCAGACGCG AAACTGGGCA TGGAGTGATG CCTTAGTATT GAAATCATAT CCAAGTAATG TAATTTTTTA CCTGTATGCA  TTTATTCTCT TGATCACTAC CGCAACCGTT CGCCTCTCTC ACCGCGGCCG CACCTCTTTG AGACGGAGAT GTCGTATGAT TCCAAACTTT ACTTATGGTG AAATTTGCTT TATACTTCTG  ACCGTGTCAA TGCTTTCGCT GTTTTTTTTC TACTGGATGC ACGACCACAA CTATAAATGC CGCTACACTG ATGTGTCAAA AGAAACGGTG CCAGTGGAAA AATGGGCCCG TTCACTAGGC  CAGCTTGCTA CCGCATTTCT CTCACTTTGC ATTGCCTCTG CAACCCGGCA CTCTGTCCTG CATTCTATAC TGGGCACCTC ATGGGACTCG TCAATCTGGG TGCATAAACT CCTAGGGTAT  GGCACGCTGT TTGCAACAGC AGCACACGCG GGTGTATGGT ATGTGCGATA CTACCAAGTT GAGGCTTTTC CACGCGGTGT TTTTTCTGTT CCTGCAGTGT ACCCCCCTGT ATTCGAGGAT  GACTTCACGG TGCCACTAGT CACTTTAGCA TCCTTTTTCG CATTCGTTTC CATTGGCGTA TTCGCGCTTC CACCTATAAG ACGCAAGTGC TACGAAGTGT TCTACTACGC TCACATTGTG  GCTTTCTACA CGCTTGTTCC TGCTGTTTTG TGGCACGCAG CAGCAGCGTG GGAGTACCTA CTTCCTGGGC TCACTGTGTG GCTGGTGGAC TGGCTGTTGC GCATGCACCG TCGCGGGTTA  GCAGTAGAGA TTGTGTATGC TACCACCAGT GGATCTACTG TGTCATTGTG CTTCCGACGG ACCGCTGTCA ATGTGGTCTG TGGTCAGTAT TTTTTCGTCA ATGTTCCTGA ACTTTCGTTG  TTTCAATGGC ATCCATTCAG TCTGAGCAGT GAAGACGGAC AGAATTGTAC AATGCACATT AAGTCAATGG GTGATGGTAC ATGGACTGAT CGTTTACTAC ATTTAGTAGA AAAACGTGGT  GGTAGCTTTT CTTTGTTTAT TGAAGGCCCA TATGGACAGT CACATCACTT CACCGACTAT AAACGCGTTG TTCTCGTCGC CGGGGGCATT GGTGTAACGC CGTGTGCTTC TATATTCAAC  AATCTTCACC AGCGACTGCT CGAAGGCAAG GTGGGACCCA CCATAACGCT ACTGTGGACT TTGCGTGATG CGAGGATTAT ACCTATGCTC TCATACGTAT GGGACAACGG CAGGTTACAT  GAAAGGGCAG TGTTCAGCGG AGCAGATGCA TCTGCATGCG CATCGGTTGA ACTGTTCCTC ACCGATGACT GTTTTTCAAG TGACAATTTA GGTGATGTCT CAGTTTCCCA TGGCCGCGTA  GACTTGAGAT CAAAGCTGCC TGAACTGCTG GCCGGCGAGC ATGCGCGCGA TGTGTTGGTG TTTTCATGTG GCCCTCGTGG ATTGGTGCAG GCTGCTCGGA ATGTTGCCAT TTCCCTGGGT 
GCCAATTTCC ACGAGGAAAA CTTTTTAATG TAG 

Retrieve as FASTA