Entry information : LinfFRe01
Entry ID 11179
Creation 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-06-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LinfFRe01
Name LinfFRe01
Class Ferric Reductase    [Orthogroup: FRe001]
Taxonomy Eukaryota Trypanosomatidae Leishmania
Organism Leishmania infantum    [TaxId: 5671 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LinfFRe01
start..stop
S start..stop
LbraFRe01 1394 0 1..984 97..1085
TvivFRe01 327 2e-98 173..660 285..751
TvivFRe01 50 0.000003 8..81 171..244
BdeNOx03 114 2e-26 325..678 95..461
ClitRboh01 103 8e-23 325..628 232..525
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 563861..566815 2955  
join(563861..566815)


exon

Literature and cross-references LinfFRe01
DNA ref. GenBank:   NC_009414.2 (563861..566815)
Protein sequence: LinfFRe01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   984
PWM (Da):   %s   107670.98 Transmb domain:   %s   i7-29o59-81i161-178o233-255i275-297o330-352i364-386o411-433i446-468o
PI (pH):   %s   8.15
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MHRYASVILQ AALGILYVAT GVTLLVEWGG NPAQCAFIFC LGVDKYPEAP RTRGEDFNVT LSVITFFVLV PAGLVLLYRV FTTVMLQRTA KVVRERDAAS VAAGAQASSS ASGQSTGEEM  PSPGRGRGAI AAVATEANPM AKSERMWPFQ ARSRVKQVCR LVGVLIGILV CAILSFWLPN DSRRFNSHRI ASFARNGISR ERRTTNMTVP EMPDAWLRTG QIRFSDDLTL KLFPGNVFFY  AYLLTTAIVV LVLRLTQRGR YWVQRRIPLC ACFTYGEAAF VAATALLSVM FFIYWLHDHN YKQTWTVTAN ESAQIEAPER WARGLGQLAI LFLSLLLLPV SRQSVVVSVL GVSRDGMLWF  HRAVGYAMLA ATVGHIVAFY VSYASFGYLM QNLNTVTNRV CKKGVYDDYT VLVVTWTTWF LLISMGIFAF NLVRRRHYEL FYYTHLAATY MTLPAMVFHA SAGWMYLLPG MTVFLSDQLV  RLWQRSAVVR VVRARVIGDD TTELAFSVPG RRDMRHVHPG QYVLVCVPEL TALQWHPFTL INVVDEESAA VGSSKASTTG TVFYVHVKSM GPKTWTGRLY DLVNRGEEIT MAVEGPCGTP  VDYRHYDNIV LVAGGIGATP CVSILGSLLR QCHALGHSGA SPRVDFIWST RSARHVKAVA DMLQLPMRCG DVVRQPATRS ALKKIDTCAA PDDITKDARL NTEIIQPADS LEQDEPLNDE  LSAVNEVVRI ADDAAQKVFI DVYVTRKTEL RHFSNGDACL GEQCPSKALL SARKGFVELD GKPLSCAGAI ENAQNAVDSA SPWKQKAAAA MTPGLHGKAD DAEEAEEMVF SNEPMGSESE  GFDSASADGC EDGIEGASES TAHKKERKTV VDTASATDQE GALVSNGLSK WSSSSVMKSG ERLHDNSDSS GSGCVAVKVH LGRPDVDRLI REALKQPGSG VHKSSRLDRA RTLLFVCGPN 
SLVRQVTSSG AQLGVAVHKE EFLF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 30, no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCACCGGT ATGCCTCCGT GATCCTTCAG GCAGCTCTGG GTATCCTCTA CGTGGCGACT GGTGTGACGC TCCTCGTCGA GTGGGGCGGC AATCCTGCAC AGTGCGCTTT CATCTTCTGC  TTGGGAGTCG ACAAGTACCC GGAGGCGCCT CGAACGCGCG GTGAGGACTT CAATGTTACT CTCTCCGTGA TCACCTTCTT CGTCCTGGTG CCTGCAGGGC TGGTGCTGCT GTACCGCGTC  TTCACTACTG TCATGCTGCA GCGGACCGCG AAGGTGGTGC GCGAGCGTGA CGCGGCGAGC GTGGCAGCCG GCGCGCAAGC GTCCAGCAGC GCCTCCGGCC AGTCCACCGG CGAAGAGATG  CCCTCGCCGG GAAGGGGTCG TGGTGCGATT GCTGCGGTCG CGACGGAGGC GAACCCAATG GCGAAGTCGG AGCGCATGTG GCCATTTCAG GCGAGATCGA GGGTGAAGCA GGTGTGCCGC  CTTGTCGGCG TGCTGATTGG CATCCTGGTG TGCGCCATTC TCTCCTTCTG GCTGCCAAAT GACTCGCGCC GCTTCAACTC CCACCGTATC GCCTCCTTCG CTCGCAATGG CATCTCGCGG  GAGAGACGCA CTACTAACAT GACTGTGCCG GAGATGCCGG ACGCGTGGCT CCGCACCGGC CAGATCCGCT TCTCTGATGA CCTGACGCTG AAGCTGTTCC CGGGCAACGT CTTCTTCTAC  GCGTACCTGC TGACGACGGC GATCGTTGTG TTGGTGCTGC GGCTGACGCA GCGCGGGCGG TACTGGGTGC AGCGCCGCAT TCCGCTGTGC GCGTGCTTCA CATATGGCGA GGCCGCTTTT  GTCGCCGCCA CGGCGCTGCT GTCGGTCATG TTCTTCATCT ACTGGCTGCA CGACCACAAC TACAAGCAGA CCTGGACTGT GACAGCGAAT GAGAGTGCAC AGATTGAGGC GCCGGAGCGG  TGGGCCCGCG GGCTGGGCCA GCTGGCCATC CTGTTCCTTT CGCTGCTGTT GCTGCCGGTG AGCCGTCAGT CGGTGGTGGT CAGCGTGCTT GGTGTGTCGC GGGATGGCAT GTTGTGGTTC  CACCGCGCTG TCGGCTACGC CATGCTGGCG GCCACGGTCG GCCACATCGT GGCCTTCTAT GTGTCCTACG CCAGTTTTGG GTATCTCATG CAGAACCTGA ACACCGTCAC CAATCGCGTG  TGCAAGAAGG GTGTTTACGA CGACTACACC GTTTTGGTCG TGACGTGGAC AACGTGGTTC CTGCTGATCT CCATGGGCAT CTTCGCCTTC AATCTGGTGC GCCGCCGCCA CTACGAGCTG  TTCTACTACA CGCACCTCGC CGCGACGTAC ATGACGCTAC CCGCCATGGT CTTCCACGCC TCTGCTGGCT GGATGTACCT GCTCCCCGGC ATGACGGTGT TCCTGTCTGA CCAGCTGGTG  CGTCTGTGGC AGCGGTCCGC CGTGGTGCGC GTCGTGCGCG CGCGCGTGAT CGGCGACGAC ACGACGGAGC TGGCCTTCTC TGTGCCCGGG CGACGGGACA TGCGGCACGT GCACCCGGGG  CAGTACGTGC TGGTGTGCGT GCCGGAGCTG ACGGCGCTGC AGTGGCACCC CTTCACTCTG ATCAACGTCG TGGACGAGGA GTCGGCTGCC GTCGGAAGCT CGAAGGCGAG CACGACGGGG  ACCGTGTTCT ACGTGCACGT CAAGTCGATG GGGCCGAAGA CGTGGACGGG GCGGCTGTAC GACCTAGTGA ACCGCGGCGA AGAGATCACG ATGGCTGTGG AGGGGCCTTG TGGGACGCCG  GTGGACTACC GCCACTATGA CAACATTGTT CTGGTTGCCG GTGGCATCGG CGCGACGCCG TGCGTATCGA TCCTCGGGTC GCTGCTGCGC CAGTGCCACG CTCTCGGCCA CAGTGGCGCT  AGCCCACGTG TGGATTTCAT TTGGTCTACT CGCTCTGCGC GTCACGTGAA GGCTGTAGCA GACATGCTGC AGCTGCCGAT GCGGTGTGGC GACGTGGTTC GTCAGCCTGC AACCCGTTCG  GCGTTGAAGA AGATCGACAC GTGTGCGGCC CCCGACGACA TCACCAAAGA TGCCAGACTG AATACCGAGA TCATCCAGCC CGCCGACTCC CTGGAGCAGG ACGAGCCGCT AAATGATGAA  CTCAGTGCGG TGAACGAGGT CGTCCGCATT GCTGACGACG CAGCGCAAAA AGTTTTCATC GACGTCTACG TCACTCGTAA GACGGAGCTG CGGCATTTTT CCAACGGAGA TGCGTGCCTG  GGCGAGCAGT GCCCATCAAA GGCCCTCCTC TCGGCAAGGA AAGGCTTTGT GGAGCTGGAT GGCAAACCGC TTAGTTGCGC GGGTGCCATT GAGAATGCCC AAAATGCTGT GGACAGCGCC  TCTCCTTGGA AGCAGAAGGC AGCGGCGGCG ATGACGCCCG GGCTGCATGG CAAGGCTGAC GATGCGGAAG AAGCGGAGGA GATGGTGTTC TCCAATGAGC CTATGGGCAG TGAAAGCGAA  GGCTTTGATT CGGCGAGCGC CGATGGCTGT GAGGATGGCA TCGAAGGCGC TTCCGAGTCG ACTGCGCATA AAAAGGAGCG GAAAACTGTT GTCGACACTG CATCTGCTAC GGATCAGGAA  GGTGCCTTGG TGTCAAATGG TCTTTCCAAG TGGTCGTCGA GCTCTGTTAT GAAGTCGGGC GAGCGCCTGC ATGACAACAG CGACAGCAGC GGCAGCGGGT GTGTGGCGGT GAAGGTGCAC  CTGGGGCGCC CCGATGTCGA TCGCCTCATC CGCGAGGCAC TCAAGCAGCC TGGATCTGGC GTCCATAAAT CCTCGAGACT GGACAGGGCC CGCACGTTGT TGTTTGTGTG CGGTCCGAAC 
TCGCTCGTTC GCCAGGTCAC GTCCTCAGGG GCGCAGCTCG GTGTGGCGGT GCACAAGGAA GAATTCCTCT TCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGCACCGGT ATGCCTCCGT GATCCTTCAG GCAGCTCTGG GTATCCTCTA CGTGGCGACT GGTGTGACGC TCCTCGTCGA GTGGGGCGGC AATCCTGCAC AGTGCGCTTT CATCTTCTGC  TTGGGAGTCG ACAAGTACCC GGAGGCGCCT CGAACGCGCG GTGAGGACTT CAATGTTACT CTCTCCGTGA TCACCTTCTT CGTCCTGGTG CCTGCAGGGC TGGTGCTGCT GTACCGCGTC  TTCACTACTG TCATGCTGCA GCGGACCGCG AAGGTGGTGC GCGAGCGTGA CGCGGCGAGC GTGGCAGCCG GCGCGCAAGC GTCCAGCAGC GCCTCCGGCC AGTCCACCGG CGAAGAGATG  CCCTCGCCGG GAAGGGGTCG TGGTGCGATT GCTGCGGTCG CGACGGAGGC GAACCCAATG GCGAAGTCGG AGCGCATGTG GCCATTTCAG GCGAGATCGA GGGTGAAGCA GGTGTGCCGC  CTTGTCGGCG TGCTGATTGG CATCCTGGTG TGCGCCATTC TCTCCTTCTG GCTGCCAAAT GACTCGCGCC GCTTCAACTC CCACCGTATC GCCTCCTTCG CTCGCAATGG CATCTCGCGG  GAGAGACGCA CTACTAACAT GACTGTGCCG GAGATGCCGG ACGCGTGGCT CCGCACCGGC CAGATCCGCT TCTCTGATGA CCTGACGCTG AAGCTGTTCC CGGGCAACGT CTTCTTCTAC  GCGTACCTGC TGACGACGGC GATCGTTGTG TTGGTGCTGC GGCTGACGCA GCGCGGGCGG TACTGGGTGC AGCGCCGCAT TCCGCTGTGC GCGTGCTTCA CATATGGCGA GGCCGCTTTT  GTCGCCGCCA CGGCGCTGCT GTCGGTCATG TTCTTCATCT ACTGGCTGCA CGACCACAAC TACAAGCAGA CCTGGACTGT GACAGCGAAT GAGAGTGCAC AGATTGAGGC GCCGGAGCGG  TGGGCCCGCG GGCTGGGCCA GCTGGCCATC CTGTTCCTTT CGCTGCTGTT GCTGCCGGTG AGCCGTCAGT CGGTGGTGGT CAGCGTGCTT GGTGTGTCGC GGGATGGCAT GTTGTGGTTC  CACCGCGCTG TCGGCTACGC CATGCTGGCG GCCACGGTCG GCCACATCGT GGCCTTCTAT GTGTCCTACG CCAGTTTTGG GTATCTCATG CAGAACCTGA ACACCGTCAC CAATCGCGTG  TGCAAGAAGG GTGTTTACGA CGACTACACC GTTTTGGTCG TGACGTGGAC AACGTGGTTC CTGCTGATCT CCATGGGCAT CTTCGCCTTC AATCTGGTGC GCCGCCGCCA CTACGAGCTG  TTCTACTACA CGCACCTCGC CGCGACGTAC ATGACGCTAC CCGCCATGGT CTTCCACGCC TCTGCTGGCT GGATGTACCT GCTCCCCGGC ATGACGGTGT TCCTGTCTGA CCAGCTGGTG  CGTCTGTGGC AGCGGTCCGC CGTGGTGCGC GTCGTGCGCG CGCGCGTGAT CGGCGACGAC ACGACGGAGC TGGCCTTCTC TGTGCCCGGG CGACGGGACA TGCGGCACGT GCACCCGGGG  CAGTACGTGC TGGTGTGCGT GCCGGAGCTG ACGGCGCTGC AGTGGCACCC CTTCACTCTG ATCAACGTCG TGGACGAGGA GTCGGCTGCC GTCGGAAGCT CGAAGGCGAG CACGACGGGG  ACCGTGTTCT ACGTGCACGT CAAGTCGATG GGGCCGAAGA CGTGGACGGG GCGGCTGTAC GACCTAGTGA ACCGCGGCGA AGAGATCACG ATGGCTGTGG AGGGGCCTTG TGGGACGCCG  GTGGACTACC GCCACTATGA CAACATTGTT CTGGTTGCCG GTGGCATCGG CGCGACGCCG TGCGTATCGA TCCTCGGGTC GCTGCTGCGC CAGTGCCACG CTCTCGGCCA CAGTGGCGCT  AGCCCACGTG TGGATTTCAT TTGGTCTACT CGCTCTGCGC GTCACGTGAA GGCTGTAGCA GACATGCTGC AGCTGCCGAT GCGGTGTGGC GACGTGGTTC GTCAGCCTGC AACCCGTTCG  GCGTTGAAGA AGATCGACAC GTGTGCGGCC CCCGACGACA TCACCAAAGA TGCCAGACTG AATACCGAGA TCATCCAGCC CGCCGACTCC CTGGAGCAGG ACGAGCCGCT AAATGATGAA  CTCAGTGCGG TGAACGAGGT CGTCCGCATT GCTGACGACG CAGCGCAAAA AGTTTTCATC GACGTCTACG TCACTCGTAA GACGGAGCTG CGGCATTTTT CCAACGGAGA TGCGTGCCTG  GGCGAGCAGT GCCCATCAAA GGCCCTCCTC TCGGCAAGGA AAGGCTTTGT GGAGCTGGAT GGCAAACCGC TTAGTTGCGC GGGTGCCATT GAGAATGCCC AAAATGCTGT GGACAGCGCC  TCTCCTTGGA AGCAGAAGGC AGCGGCGGCG ATGACGCCCG GGCTGCATGG CAAGGCTGAC GATGCGGAAG AAGCGGAGGA GATGGTGTTC TCCAATGAGC CTATGGGCAG TGAAAGCGAA  GGCTTTGATT CGGCGAGCGC CGATGGCTGT GAGGATGGCA TCGAAGGCGC TTCCGAGTCG ACTGCGCATA AAAAGGAGCG GAAAACTGTT GTCGACACTG CATCTGCTAC GGATCAGGAA  GGTGCCTTGG TGTCAAATGG TCTTTCCAAG TGGTCGTCGA GCTCTGTTAT GAAGTCGGGC GAGCGCCTGC ATGACAACAG CGACAGCAGC GGCAGCGGGT GTGTGGCGGT GAAGGTGCAC  CTGGGGCGCC CCGATGTCGA TCGCCTCATC CGCGAGGCAC TCAAGCAGCC TGGATCTGGC GTCCATAAAT CCTCGAGACT GGACAGGGCC CGCACGTTGT TGTTTGTGTG CGGTCCGAAC 
TCGCTCGTTC GCCAGGTCAC GTCCTCAGGG GCGCAGCTCG GTGTGGCGGT GCACAAGGAA GAATTCCTCT TCTAG 

Retrieve as FASTA