Entry information : UhorCP
Entry ID 11199
Creation 2012-07-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-07-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-07-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: UhorCP
Name UhorCP
Class Catalase peroxidase    [Orthogroup: CP001]
Taxonomy Eukaryota Fungi Basidiomycota Ustilaginomycetes Ustilaginaceae Ustilago
Organism Ustilago hordei    [TaxId: 120017 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value UhorCP
start..stop
S start..stop
SreCP01 1287 0 4..745 3..745
UmCP01 1271 0 4..745 3..749
CthedisCP1 1075 0 4..735 3..720
CtheCP01 1069 0 4..735 3..720
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 9108..11345 2238  
complement(join(9108..11345))


exon

Literature and cross-references UhorCP
DNA ref. GenBank:   CAGI01000163.1 (11345..9108)
Protein sequence: UhorCP
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   745
PWM (Da):   %s   82199.26  
PI (pH):   %s   6.25
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGAECPVAHA GNIDRKRVPA AGFGTKNSDW WPNELRLNIL RQHQANSDPF RAHFDYAAAF NSLDYDALKK DLHNLMTDSQ DWWPADYGHY GGFFIRLAWH AAGTYRVQDG RGGGGEGQQR  FAPLNSWPDN GNLDKGRRLL WPLKQKYGNK ISWADLLLLS GNVALESMGF KTFGFAGGRA DTWEADESTY WGGETTWLGN DVRYEQSNPK DLKNRNLDGA LAASHMGLIY VNPEGPNGLP  DPAAAANDIR TTFGRMAMND YETVALIAGG HTFGKTHGAG DPGLVGPEPN AAPIEAQGLG WASKYKSGKG PHAITSGTEV IWTSKPTEWT NLYLEYLFKF DWELTKSPAG ANQWVAKDSD  AIIPEPFDPT KKRRPTMLTT DLSLRYDPEY EKISRHFLNN FDEFADAFAR AWFKLLHRDM GPRSRWLGPE IPKETLIWED PVPPVKHALV DNRDLAGLKQ AILAAGVEPT KLLNVAWSSA  ASYRDSDKRG GANGARVRLA PLKDWEVNNP AEVAEVIKAL EGVQQHFNSS SQGGKQISIA DLIVLGGNAA LEKASGLAVP FTPGRTDALQ EETESETFQW LRPTADGFRN YGQSSEHVRA  EQYLVDKANL LTLTPPELTV LIGGLRALGM NWDGSSHGVL THRRGQLTND FFVNLLDMST EWKVADGGKA ELFDGVDRKS GQNKWTATRA DLIFGAQAEL RALAEHYAQP DNGEKFAKDF 
VAAWNKVMNL DRFDVKTNKI GLAKF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGAGCAG AGTGCCCAGT TGCTCACGCC GGCAACATCG ACCGCAAGCG TGTCCCCGCT GCCGGCTTCG GTACCAAGAA CAGCGATTGG TGGCCTAACG AGCTCAGGCT CAACATCCTT  CGCCAGCACC AGGCCAACTC GGATCCTTTC CGCGCCCATT TCGATTACGC TGCCGCCTTC AACAGCCTCG ACTATGACGC CCTCAAGAAG GATCTCCACA ACTTGATGAC CGACTCCCAG  GACTGGTGGC CAGCCGACTA TGGCCACTAC GGCGGTTTCT TCATCCGTCT CGCATGGCAC GCCGCCGGCA CCTATCGTGT TCAGGACGGC CGTGGCGGTG GAGGTGAGGG TCAGCAGCGA  TTCGCTCCTC TCAACTCCTG GCCAGACAAC GGTAACCTCG ACAAGGGACG TCGTCTCTTG TGGCCCCTCA AGCAGAAGTA CGGTAACAAG ATCTCTTGGG CCGACCTCTT GCTTCTCTCC  GGCAACGTTG CGCTCGAGTC GATGGGATTC AAGACTTTCG GTTTCGCCGG TGGTCGCGCA GACACCTGGG AGGCCGACGA GTCCACTTAC TGGGGTGGCG AGACCACCTG GCTCGGCAAC  GATGTTCGTT ACGAGCAGAG CAACCCCAAG GACCTCAAGA ACCGTAACCT TGACGGTGCC CTTGCTGCCT CGCACATGGG TCTCATCTAC GTCAACCCTG AGGGTCCCAA CGGCCTGCCT  GACCCGGCCG CCGCTGCCAA CGACATCCGA ACCACGTTCG GCCGTATGGC GATGAACGAT TACGAGACCG TTGCTCTTAT CGCTGGTGGT CACACTTTCG GTAAGACCCA CGGTGCTGGT  GACCCTGGCC TTGTCGGTCC CGAGCCCAAC GCTGCTCCTA TCGAGGCTCA GGGTCTCGGA TGGGCTAGCA AGTACAAGTC TGGTAAGGGC CCTCACGCCA TCACTTCGGG CACCGAGGTC  ATTTGGACCA GCAAGCCTAC CGAGTGGACC AACCTCTATC TCGAGTACCT CTTCAAGTTC GACTGGGAGC TCACCAAGTC GCCCGCTGGT GCCAACCAGT GGGTTGCCAA GGACTCAGAT  GCCATCATCC CCGAACCCTT CGACCCTACC AAGAAGCGCC GCCCAACCAT GCTGACCACG GATCTGTCGC TTCGCTATGA CCCCGAGTAC GAGAAGATCT CGCGTCACTT TCTCAACAAC  TTTGACGAGT TTGCTGATGC CTTTGCTCGT GCTTGGTTCA AGCTTCTTCA CCGTGACATG GGTCCTCGTT CTCGATGGCT CGGTCCCGAG ATCCCCAAGG AGACGCTTAT CTGGGAGGAC  CCCGTTCCGC CTGTCAAGCA CGCTCTCGTT GACAACCGCG ACCTTGCTGG TTTGAAGCAG GCCATTCTTG CCGCCGGTGT CGAGCCCACC AAGTTGCTCA ACGTTGCTTG GTCTTCGGCT  GCCAGCTACC GTGACTCGGA CAAGCGTGGT GGCGCCAATG GTGCCCGCGT CCGTCTTGCT CCCTTGAAGG ACTGGGAGGT CAACAACCCT GCTGAGGTTG CTGAGGTTAT CAAAGCCCTC  GAGGGTGTTC AGCAGCACTT CAACTCTTCC AGCCAGGGTG GCAAGCAGAT CTCGATCGCC GACCTTATCG TCCTTGGCGG TAACGCCGCT CTCGAGAAAG CTTCCGGTCT TGCGGTCCCC  TTCACTCCTG GCCGCACCGA TGCCTTGCAG GAGGAGACCG AGAGCGAGAC TTTCCAGTGG CTCCGACCTA CCGCCGATGG TTTCCGCAAC TACGGCCAAT CGAGCGAGCA TGTTCGGGCT  GAGCAGTACC TTGTTGACAA GGCCAACCTG CTGACCCTAA CCCCACCCGA GCTCACCGTC CTCATCGGTG GTCTCCGTGC TCTCGGCATG AACTGGGACG GCTCGTCGCA CGGTGTCCTC  ACTCACCGAC GTGGTCAGCT CACCAACGAC TTTTTTGTCA ACTTGCTCGA CATGAGCACC GAGTGGAAGG TCGCCGACGG TGGCAAAGCC GAGCTCTTCG ACGGTGTTGA TCGCAAGTCG  GGTCAGAACA AGTGGACCGC TACCCGAGCT GATCTCATCT TTGGTGCACA GGCCGAGCTT CGTGCTCTTG CTGAGCACTA CGCTCAGCCT GACAACGGCG AGAAGTTTGC CAAGGACTTT 
GTTGCCGCTT GGAACAAGGT GATGAACTTG GACCGTTTCG ACGTCAAGAC GAACAAGATT GGCCTTGCCA AGTTCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGAGCAG AGTGCCCAGT TGCTCACGCC GGCAACATCG ACCGCAAGCG TGTCCCCGCT GCCGGCTTCG GTACCAAGAA CAGCGATTGG TGGCCTAACG AGCTCAGGCT CAACATCCTT  CGCCAGCACC AGGCCAACTC GGATCCTTTC CGCGCCCATT TCGATTACGC TGCCGCCTTC AACAGCCTCG ACTATGACGC CCTCAAGAAG GATCTCCACA ACTTGATGAC CGACTCCCAG  GACTGGTGGC CAGCCGACTA TGGCCACTAC GGCGGTTTCT TCATCCGTCT CGCATGGCAC GCCGCCGGCA CCTATCGTGT TCAGGACGGC CGTGGCGGTG GAGGTGAGGG TCAGCAGCGA  TTCGCTCCTC TCAACTCCTG GCCAGACAAC GGTAACCTCG ACAAGGGACG TCGTCTCTTG TGGCCCCTCA AGCAGAAGTA CGGTAACAAG ATCTCTTGGG CCGACCTCTT GCTTCTCTCC  GGCAACGTTG CGCTCGAGTC GATGGGATTC AAGACTTTCG GTTTCGCCGG TGGTCGCGCA GACACCTGGG AGGCCGACGA GTCCACTTAC TGGGGTGGCG AGACCACCTG GCTCGGCAAC  GATGTTCGTT ACGAGCAGAG CAACCCCAAG GACCTCAAGA ACCGTAACCT TGACGGTGCC CTTGCTGCCT CGCACATGGG TCTCATCTAC GTCAACCCTG AGGGTCCCAA CGGCCTGCCT  GACCCGGCCG CCGCTGCCAA CGACATCCGA ACCACGTTCG GCCGTATGGC GATGAACGAT TACGAGACCG TTGCTCTTAT CGCTGGTGGT CACACTTTCG GTAAGACCCA CGGTGCTGGT  GACCCTGGCC TTGTCGGTCC CGAGCCCAAC GCTGCTCCTA TCGAGGCTCA GGGTCTCGGA TGGGCTAGCA AGTACAAGTC TGGTAAGGGC CCTCACGCCA TCACTTCGGG CACCGAGGTC  ATTTGGACCA GCAAGCCTAC CGAGTGGACC AACCTCTATC TCGAGTACCT CTTCAAGTTC GACTGGGAGC TCACCAAGTC GCCCGCTGGT GCCAACCAGT GGGTTGCCAA GGACTCAGAT  GCCATCATCC CCGAACCCTT CGACCCTACC AAGAAGCGCC GCCCAACCAT GCTGACCACG GATCTGTCGC TTCGCTATGA CCCCGAGTAC GAGAAGATCT CGCGTCACTT TCTCAACAAC  TTTGACGAGT TTGCTGATGC CTTTGCTCGT GCTTGGTTCA AGCTTCTTCA CCGTGACATG GGTCCTCGTT CTCGATGGCT CGGTCCCGAG ATCCCCAAGG AGACGCTTAT CTGGGAGGAC  CCCGTTCCGC CTGTCAAGCA CGCTCTCGTT GACAACCGCG ACCTTGCTGG TTTGAAGCAG GCCATTCTTG CCGCCGGTGT CGAGCCCACC AAGTTGCTCA ACGTTGCTTG GTCTTCGGCT  GCCAGCTACC GTGACTCGGA CAAGCGTGGT GGCGCCAATG GTGCCCGCGT CCGTCTTGCT CCCTTGAAGG ACTGGGAGGT CAACAACCCT GCTGAGGTTG CTGAGGTTAT CAAAGCCCTC  GAGGGTGTTC AGCAGCACTT CAACTCTTCC AGCCAGGGTG GCAAGCAGAT CTCGATCGCC GACCTTATCG TCCTTGGCGG TAACGCCGCT CTCGAGAAAG CTTCCGGTCT TGCGGTCCCC  TTCACTCCTG GCCGCACCGA TGCCTTGCAG GAGGAGACCG AGAGCGAGAC TTTCCAGTGG CTCCGACCTA CCGCCGATGG TTTCCGCAAC TACGGCCAAT CGAGCGAGCA TGTTCGGGCT  GAGCAGTACC TTGTTGACAA GGCCAACCTG CTGACCCTAA CCCCACCCGA GCTCACCGTC CTCATCGGTG GTCTCCGTGC TCTCGGCATG AACTGGGACG GCTCGTCGCA CGGTGTCCTC  ACTCACCGAC GTGGTCAGCT CACCAACGAC TTTTTTGTCA ACTTGCTCGA CATGAGCACC GAGTGGAAGG TCGCCGACGG TGGCAAAGCC GAGCTCTTCG ACGGTGTTGA TCGCAAGTCG  GGTCAGAACA AGTGGACCGC TACCCGAGCT GATCTCATCT TTGGTGCACA GGCCGAGCTT CGTGCTCTTG CTGAGCACTA CGCTCAGCCT GACAACGGCG AGAAGTTTGC CAAGGACTTT 
GTTGCCGCTT GGAACAAGGT GATGAACTTG GACCGTTTCG ACGTCAAGAC GAACAAGATT GGCCTTGCCA AGTTCTAA 

Retrieve as FASTA