Entry information : CroPrx12 (cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Entry ID 11270
Creation 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx12 (cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Name (synonym) CroPrx12 (cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx024]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx12
start..stop
S start..stop
NtPrx36-1A 509 0 2..326 6..327
NtPrx36-1B 497 3e-179 2..326 6..328
LePrx37 490 5e-176 5..326 10..328
LePrx31 484 5e-174 5..328 10..329
Literature and cross-references CroPrx12 (cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Protein sequence: CroPrx12 (cra_locus_3279_iso_4_len_1147_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (311)
PWM (Da):   %s   35796.91 (33806.8)  
PI (pH):   %s   5.14 (5.14) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TFLFFAIFFC IILFVAPDPF PYNAQLDYHF YDTSCPNLAL IVRWGVWAAV KSDSRMGASL LRLYFHDCFV NGCDGSVLLD DTVNFKGEKN AFPNRNSARG YEVIDSIKAD VEKACPSVVS  CVDILALAAR EAVIIAGGPY YPVYLGRRDG LTASEKAANE QLPSPIEPLD NITTKFVSKG LDLKDVVVLS GAHTIGFAQC FTFKRRLYNF KGSGNPDPTL DSSLVSNLQS TCPNVDGSNN 
KLAPLDVQST LIFDNAYYVN LMNNSGLLES DQALMGDPRT ADLVKSYSMY PYLYFRDFAA SMVKLGNVGI LTGDSGEIRK KCGSVNSY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Short PS is missing.
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACTTTCTTGT TCTTCGCGAT TTTCTTCTGC ATTATCCTCT TCGTAGCGCC TGACCCCTTT CCTTATAATG CCCAATTAGA TTACCATTTC TATGATACAT CATGCCCTAA TTTGGCTCTA  ATAGTTAGAT GGGGTGTTTG GGCAGCTGTT AAAAGTGATA GCAGAATGGG TGCATCCCTT CTCCGTTTAT ACTTTCATGA TTGCTTCGTA AATGGTTGTG ATGGTTCTGT GCTTCTTGAT  GACACAGTAA ACTTCAAGGG CGAGAAGAAT GCTTTTCCAA ACCGCAATTC AGCCAGAGGA TATGAGGTGA TTGATAGCAT AAAAGCCGAT GTTGAAAAAG CTTGCCCATC CGTAGTATCA  TGTGTGGACA TCTTAGCTCT TGCAGCTAGA GAAGCAGTGA TTATAGCAGG AGGGCCTTAT TATCCTGTTT ATTTAGGCCG GCGAGATGGA TTAACTGCAA GTGAGAAAGC AGCAAATGAG  CAACTACCAT CACCTATTGA GCCTTTGGAT AACATTACTA CCAAGTTTGT ATCAAAAGGT CTTGACTTGA AGGATGTGGT AGTCCTCTCA GGAGCTCATA CCATTGGTTT TGCTCAGTGT  TTTACATTCA AGAGGAGACT CTATAATTTC AAAGGATCAG GAAATCCAGA CCCTACTCTT GATTCATCTC TAGTTTCGAA CTTGCAAAGT ACTTGTCCAA ATGTAGATGG ATCAAACAAC  AAATTAGCTC CTCTTGATGT TCAATCTACT CTTATATTCG ACAATGCATA TTATGTTAAC TTGATGAACA ATTCGGGCTT GCTTGAATCT GATCAAGCAT TGATGGGGGA TCCCAGAACA  GCAGATTTGG TGAAGTCTTA TAGTATGTAT CCATATCTGT ATTTCAGAGA TTTTGCAGCA TCAATGGTGA AGCTTGGAAA TGTTGGGATT TTGACTGGTG ATTCTGGCGA AATTCGCAAG 
AAATGTGGCT CTGTAAACTC TTACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACTTTCTTG TTCTTCGCGA TTTTCTTCTG CATTATCCTC TTCGTAGCGC CTGACCCCTT TCCTTATAAT GCCCAATTAG ATTACCATTT CTATGATACA TCATGCCCTA ATTTGGCTCT  AATAGTTAGA TGGGGTGTTT GGGCAGCTGT TAAAAGTGAT AGCAGAATGG GTGCATCCCT TCTCCGTTTA TACTTTCATG ATTGCTTCGT AAATGGTTGT GATGGTTCTG TGCTTCTTGA  TGACACAGTA AACTTCAAGG GCGAGAAGAA TGCTTTTCCA AACCGCAATT CAGCCAGAGG ATATGAGGTG ATTGATAGCA TAAAAGCCGA TGTTGAAAAA GCTTGCCCAT CCGTAGTATC  ATGTGTGGAC ATCTTAGCTC TTGCAGCTAG AGAAGCAGTG ATTATAGCAG GAGGGCCTTA TTATCCTGTT TATTTAGGCC GGCGAGATGG ATTAACTGCA AGTGAGAAAG CAGCAAATGA  GCAACTACCA TCACCTATTG AGCCTTTGGA TAACATTACT ACCAAGTTTG TATCAAAAGG TCTTGACTTG AAGGATGTGG TAGTCCTCTC AGGAGCTCAT ACCATTGGTT TTGCTCAGTG  TTTTACATTC AAGAGGAGAC TCTATAATTT CAAAGGATCA GGAAATCCAG ACCCTACTCT TGATTCATCT CTAGTTTCGA ACTTGCAAAG TACTTGTCCA AATGTAGATG GATCAAACAA  CAAATTAGCT CCTCTTGATG TTCAATCTAC TCTTATATTC GACAATGCAT ATTATGTTAA CTTGATGAAC AATTCGGGCT TGCTTGAATC TGATCAAGCA TTGATGGGGG ATCCCAGAAC  AGCAGATTTG GTGAAGTCTT ATAGTATGTA TCCATATCTG TATTTCAGAG ATTTTGCAGC ATCAATGGTG AAGCTTGGAA ATGTTGGGAT TTTGACTGGT GATTCTGGCG AAATTCGCAA  GAAATGTGGC TCTGTAAACT CTTACTGATT ATGTTATATA ATGAATGCTA TTAGGGAAAG GGAAACAAAG TCTTGTTGTA AATTAGTCAT TATATGAAGT CAAGTGCTAC TTACTTGGTA 
GTGAATGGAA CATTGTATCA TAGGTTTGCA TCAATAAAAC TGCTGAAAAA ATTCCATAAT TCGTCAA 

Retrieve as FASTA