Entry information : CroPrx15(CRO_T000492 / cra_locus_18060_iso_1_len_1064_ver_3)
Entry ID 11273
Creation 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx15(CRO_T000492 / cra_locus_18060_iso_1_len_1064_ver_3)
Name CroPrx15(CRO_T000492 / cra_locus_18060_iso_1_len_1064_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx009]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx15
start..stop
S start..stop
LePrx15 546 0 1..329 1..328
LePrx105 542 0 1..329 1..328
StPrx21 539 0 1..329 17..347
StPrx49 525 0 1..329 1..326
Literature and cross-references CroPrx15(CRO_T000492 / cra_locus_18060_iso_1_len_1064_ver_3)
Protein sequence: CroPrx15(CRO_T000492 / cra_locus_18060_iso_1_len_1064_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (305)
PWM (Da):   %s   35964.43 (33206.0) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   9.12 (9.07) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKNFGYFCVV ILIFLGLIIS CAKADLQMNF YAKNCPKAEK IVQDYVQKHI PNAPSLAAAL IRMHFHDCFV RGCDASVLLN FTSSSGNQTE KVAVPNQTVR GFGFIDGIKS LLEAECPGVV  SCADIIALAA RDAIVFTGGP FWRVPTGRRD GRISNATEAL NNIPPPSSNL SSLQTFFSSK GLDLKDLVVL SGAHTIGVSH CPSFTTRLYN FSGIIGNQDP SLDTEYAANL KSNKCKTRND 
TKTIVEMDPG SFRTFDLSYY KLLLKRRGLF QSDASLTTSS TTLSIINQIL KGSLKNFYAE FALSMEKMGR IQVKTGSAGE IRKQCAFVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from EST. Incorrect prediction from MPGR (two ORF encoding two Prxs).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAAATT TTGGCTACTT TTGTGTTGTA ATTTTGATCT TTTTAGGTCT TATTATTTCT TGTGCTAAAG CTGATTTACA AATGAATTTT TATGCAAAAA ATTGTCCTAA AGCTGAGAAG  ATTGTTCAAG ATTATGTCCA AAAGCACATT CCAAATGCTC CTTCTCTTGC TGCTGCTTTG ATCAGAATGC ATTTCCATGA TTGCTTTGTC AGAGTAAGTA TCAAATAATC TTCATAGTGA  AAAATTACAT TTTCTTGTGT GTATAAGATC TCGAGTTTGA GCTTTGTATG TAGAAAAAGT ACAACTAATT AGAGCAATCA AATTAATCGT GATACATAAA ACGGGAAAGA GAAAAATATA  TATATATATA TTATACTAGT TTCTTAGAAA AAAAATATTC ATATGGATTC TCAAAGTTTG GTCAATTTTA TCACTTAATC CCTACACATT TTTTAGTTAT TTCCCTACCA GTTTAGTTAC  ATATATATGT TCTTTAAGAA TTATAATGAG CGGAAAAAAA ATTTATGAGA TCGAATGATA AAATTGGTTT AATTTAAAGG CCAAAATAGT CATTTTTGTT AAAATTTTAG GCTTGGTTTT  AATTCATTTC AAAAATATCT CGAAAAGAGG AGAACTGTCT AAAATTATAA AGAGTTCATG TATCTCGACA TATCCTTTTG CGTCTTGTAT TGATTATCTG GATTGGAGTG TGAAATTATA  CAAGCATAAA CATTTGTAGA TACCAGATTA AAATTCTTGG CTCGGGCCTA ACTATTTTCA CTTTTTTTTT ACCTCTTCTC AATTTGTAAA CCATATCAAA ATTTATGAGA TCGAAATGAT  AAAATTGGTC TAATTTAAAG GCCAAAATAG TCATTTTTGT TAAAATTTTA GACTTGGTCT TAGCTCATTT CAAAAGTATT TCGAAAGAAG GATGATTGTT TAAGTTTATA AGGGGTTCAT  TTATTCTTTA ATTACTCAAT CTGAATTTCT CGGACTGATC ATCTGGACTG GAATATGAAA TTATACAAAA TTAAACATCT GGCTCGGACC TAACCATTTT CACTTTTTTT TTTTTACCTT  TTCTCAACAT TTTTTTAAAA TTATTTTTTT ATGACAGGGT TGTGATGCAT CTGTTCTTTT GAACTTCACA TCAAGTTCAG GCAACCAAAC AGAGAAAGTT GCTGTTCCAA ATCAAACCGT  GAGAGGCTTT GGTTTCATTG ATGGAATAAA AAGCTTGCTA GAAGCTGAAT GCCCTGGTGT TGTTTCTTGT GCAGATACCA TAGCTCTTGC CGCCAGGGAT GCCATAGTTT TCACAGTAAG  TAAACTCAAA ATTTTGCACA ATGCAAGTAG GGTTTCAAGG GTTTTTTTTA AACAGGTTTT GATCAAATCA AATCGTTTAA TATATCTTCT AAAATATTTA CGTGCTTTAA TTACTTTTAT  AATATCTCAT AATTGAAATT TAAAATTTAT TTTTTAGTTT ATAATATTTA TTTATAAATT TTATAAACAA TATCACAAAA AAGTATATTA CAAGATGTAT GACCTCTGTA CCGTCTTTCC  TAGCTGTTTA ATTTGGAAAA AAATGAATTT TTTTATTGGA AGTCGTAAAA GATACTTAAT CCATCTCACA AAAAGATACT CTCCTTTATT TTTAACACAA ATTAAGAAAA TTAATTCGAT  GTTTAAATTT TATTTTGATT TCTATTATTA TACCCTACTT TAATTAATAT TAAATGACTT TGAATTTTTA TCTTTAAACT TTATAAATAT AGGCATAATT TTTTTTTTAT AAATATAGTG  TATCTTTTAT TGATATAAAA TTTATTTTAT TAATATATCT TAGGAAGTGA AGAAAAATAA ATAAGGCTCG ATATTTTTTA GTTTTTTTAT TTTCTCACTC TCAATCTCAC CTCTTTTATC  ACACGAAATT TAACTTTTAT GAACTCAAAA TATATATATA TCTATCCAAA TAGAGCCTAA GATTTATAAT AATGAAGGGC GACATAAAAG GAAATGAAAC TATCTTTTGA GACGGGGAGA  GATTATTTAT GAAAATGTAC GGGGAATTCA AAGTAAAAAA AATAAAAATA AAAATAATTT CAAATTTAAA TTGAATTTCA TTTCTTGGAA TAATATTATT GCAGGGAGGT CCATTTTGGA  GAGTGCCGAC TGGCAGAAGA GATGGGCGGA TATCGAATGC TACTGAGGCC TTGAACAATA TTCCACCTCC TTCCTCCAAT TTATCTTCTC TTCAAACATT TTTTTCCAAC AAGGGTCTTG  ATCTCAAGGA TTTAGTTGTA TTATCAGGTG ACTTAAACGC CATTTCATTA CCAAAATCAA TATTTCATAA TTTTTTTTTG GCCTAAAAAT AAATTTTCAT TAAATTTTTA CTAAAAGAAT  ATTTTACTTG TACAGTAAGT GTGAAGGGTA TTTTTGTCAA TAAGAACGAT TACACCATGC ATGTAACGTG CATTTTACGT CAAAGAAACA GTCAGATTCC GCGGTGTAGT GAATATATAT  ATACCCAACT CATTTTAAGA TCTCGATTGG CCACTTGCTC TAAGCTACTC CCTCCGGGGT TTTTTTTTTA AACTTGTTAT ATTATGATTC CAAAACAATA TTTAATGAAC TTTTTCCTAT  TATACCCTTC CATTAATAAC AAATTCAACA TCTTTTTATT CTTCTATTAT GAAAGATAGA AGAAATAATA ATGAGAGAAA GAGATAGAAA ATTCTGAAGA TCCTTCTAGT CTACATTAGA  AAGAAAACAT CTAAAATTTT GTATTTTTTT TAAACAGTAT AATGCCTAAA ACGTGACGAG TAAAAAAGAA AACAAAGGGA GTAACTTAAT TTGTTTTTTT TTTTTTTTCT CTTTGATTTn  TTTTTTTTTT TTTTTTCTCT TTGATTTCTA TTTTTTTTTT TCAAAGTGCT AACTTTTCTT GACATTTACA AACCTTACTA GGTGCACATA CCATTGGAGT TTCACATTGT CCATCATTCA  CAACTCGTTT ATACAACTTT TCTGGAATTA TTGGGAACCA AGATCCATCT CTAGACACTG AATATGCAGC AAATCTTAAA TCAAACAAAT GCAAAACAAG AAACGACACG AAAACCATAG  TAGAAATGGA TCCAGGAAGC TTTAGAACAT TTGATCTAAG CTATTACAAG CTTTTGCTCA AGAGAAGAGG TCTTTTTCAA TCTGATGCAT CATTAACAAC AAGTTCAACA ACATTGTCAA  TTATTAACCG AATTCTTAAA GGTTCTTTGA AGAATTTTTA CGCCGAATTC GCCTTGTCTA TGGAGAAAAT GGGGAGAATT CAAGTGAAAA CAGGATCTGC AGGTGAAATT AGGAAACAAT 
GTGCTTTTGT TAATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGAAATT TTGGCTACTT TTGTGTTGTA ATTTTGATCT TTTTAGGTCT TATTATTTCT TGTGCTAAAG CTGATTTACA AATGAATTTC TATGCAAAAA ATTGTCCTAA AGCTGAGAAG  ATTGTTCAAG ATTATGTCCA AAAGCACATT CCAAATGCTC CTTCTCTTGC TGCTGCTTTG ATCAGAATGC ATTTCCATGA TTGCTTTGTA AGAGGTTGTG ATGCATCTGT TCTTTTGAAC  TTCACATCAA GCTCAGGCAA CCAAACAGAG AAAGTTGCTG TTCCAAATCA AACCGTGAGA GGCTTTGGTT TCATTGATGG AATAAAAAGC TTGCTAGAAG CTGAATGCCC TGGTGTTGTT  TCTTGTGCAG ATATCATAGC TCTTGCAGCC AGGGATGCCA TAGTTTTCAC AGGAGGTCCA TTCTGGAGAG TGCCGACTGG CAGAAGAGAT GGGCGGATAT CGAATGCTAC TGAGGCCTTG  AACAATATTC CACCTCCTTC CTCCAATTTA TCTTCTCTTC AAACATTTTT TTCCAGCAAG GGTCTTGATC TCAAGGATTT AGTTGTATTA TCAGGTGCTC ATACCATTGG AGTTTCACAT  TGTCCATCAT TCACAACTCG TTTATACAAC TTTTCTGGAA TTATTGGGAA CCAAGATCCA TCTCTAGACA CTGAATATGC AGCAAATCTT AAATCAAACA AATGCAAAAC AAGAAACGAC  ACGAAAACCA TAGTAGAAAT GGATCCAGGA AGCTTTAGAA CATTTGATCT AAGCTATTAC AAGCTTTTGC TCAAGAGAAG AGGTCTTTTT CAATCTGATG CATCATTAAC AACAAGTTCA  ACAACATTGT CAATTATTAA CCAAATTCTT AAAGGTTCTT TGAAGAATTT TTACGCCGAA TTCGCCTTGT CTATGGAGAA AATGGGGAGA ATTCAAGTGA AAACAGGATC TGCAGGTGAA 
ATTAGGAAAC AATGTGCTTT TGTTAATTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTCTTAAAC AAAACCCCCC AAAAAATGAG AAATTTTGGC TACTTTTGTG TTGTAATTTT GATCTTTTTA GGTCTTATTA TTTCTTGTGC TAAAGCTGAT TTACAAATGA ATTTCTATGC  AAAAAATTGT CCTAAAGCTG AGAAGATTGT TCAAGATTAT GTCCAAAAGC ACATTCCAAA TGCTCCTTCT CTTGCTGCTG CTTTGATCAG AATGCATTTC CATGATTGCT TTGTAAGAGG  TTGTGATGCA TCTGTTCTTT TGAACTTCAC ATCAAGCTCA GGCAACCAAA CAGAGAAAGT TGCTGTTCCA AATCAAACCG TGAGAGGCTT TGGTTTCATT GATGGAATAA AAAGCTTGCT  AGAAGCTGAA TGCCCTGGTG TTGTTTCTTG TGCAGATATC ATAGCTCTTG CAGCCAGGGA TGCCATAGTT TTCACAGGAG GTCCATTCTG GAGAGTGCCG ACTGGCAGAA GAGATGGGCG  GATATCGAAT GCTACTGAGG CCTTGAACAA TATTCCACCT CCTTCCTCCA ATTTATCTTC TCTTCAAACA TTTTTTTCCA GCAAGGGTCT TGATCTCAAG GATTTAGTTG TATTATCAGG  TGCTCATACC ATTGGAGTTT CACATTGTCC ATCATTCACA ACTCGTTTAT ACAACTTTTC TGGAATTATT GGGAACCAAG ATCCATCTCT AGACACTGAA TATGCAGCAA ATCTTAAATC  AAACAAATGC AAAACAAGAA ACGACACGAA AACCATAGTA GAAATGGATC CAGGAAGCTT TAGAACATTT GATCTAAGCT ATTACAAGCT TTTGCTCAAG AGAAGAGGTC TTTTTCAATC  TGATGCATCA TTAACAACAA GTTCAACAAC ATTGTCAATT ATTAACCAAA TTCTTAAAGG TTCTTTGAAG AATTTTTACG CCGAATTCGC CTTGTCTATG GAGAAAATGG GGAGAATTCA 
AGTGAAAACA GGATCTGCAG GTGAAATTAG GAAACAATGT GCTTTTGTTA ATTAGGGGCA AGAAGAAGGT TATTTGTTTT AGCTATCTAC TTATGTTATA ATTT 

Retrieve as FASTA