Entry information : CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Entry ID 11276
Creation 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Name CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx025]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx18
start..stop
S start..stop
MguPrx88 565 0 1..324 17..341
SaPrx46 551 0 7..324 24..340
EglPrx60 531 0 14..324 30..339
EgrPrx60 531 0 14..324 30..339
Literature and cross-references CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Protein sequence: CroPrx18(CRO_T003213 / cra_locus_19953_iso_1_len_1005_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (310)
PWM (Da):   %s   35705.96 (34306.2)  
PI (pH):   %s   4.82 (4.82) Peptide Signal:   %s   cut: 15 range:15-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
VILVLCIFNG SLGAFDPPLT LDYYKDTCPT VLEIVRKEME CAVLSDPRNA ALILRLHFHD CFVQGCDGSV LLDDTITLQG EKKAPNNVNA LKGFRMMDRI KNRLESECPG TVSCADILTI  AARDAVLLVG GPYWDVPLGR KDSKTAGYEL STTNLPTADE SLVSIISKFL FQGLSVTDMV ALSGAHTIGM ARCVNFRNRI YGDFSITSAM NPISQTYLDN LKGICPPAVG EDNKESAMDY 
VTPNLFDNSY YQILLRGEGL INSDQELYSS VLAIQTRQLV KKYAENPIAF FEQFSESMVK LGNITNPETY VNGEVRKNCR FVNT 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from EST and genomic . Short PS is missing.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATGTGTGAT TTTGGTTTTG TGCATTTTTA ATGGGAGTTT GGGGGCTTTT GATCCACCTT TAACGTTGGA TTACTACAAA GATACGTGCC CAACTGTGCT TGAAATTGTT AGAAAGGAAA  TGGAATGTGC TGTTCTATCT GATCCTCGTA ATGCAGCCTT GATTTTAAGG TTGCATTTTC ATGACTGCTT TGTTCAGGTT AGCACAGCTA CATGATTTTT GCTTCTCCTG TTGTATATGA  TAGTGTGTGG TCAAATGAAT CTCGTCACTT AACTTAAGTA CTTCCACCTG TCATATCAAG TGAGAGATTC TAGACATTCA ATGTGTAGTT TAATACTGTA TACCAGTCTT GTATCCCTAT  TTAAGACTTT GTGCACTATG ATCCTTCTCG GGTTAGCTGA TGATTCTCGA ATACCGAATT ATCTAAAAAA TGTTGAAATA TTAGTCTCAG GTTGTCTAGC TTGTGCGCTT TTGGACAATC  CTCTCCTAAG GTGTTTTTTA AATAGAGTTA AACACAAATT TAATTTTATA ACACGGTATC AGAGTCGGAT ATTATGAGGA ACCATTACCT CGTTTAAAAT TATACTCATT CCGTATTAAA  ATTAATGTAT TTAATTATTT TGATTCCGAA ATCAATTAAA ACTAAGTTAT CAAATACAAA AAATAATAAT CTAATGTTAT TTTCATAAAG TTAAATGACA AATCAAATTT TTCTGTATTT  AAATTAAGGT TATTTTTTTG TTGTTTGGCT CTATGAATGT ATTAAAATTA AGTTATCAAG TATGTAACTA CTAAAAATTC AATTTATTTT GCGAGAGTTA AATAATATAT TAAATTTTTA  TATTTAAGTT TTGACTATGT AACATAAACA TTCAACTTTC GTCTTTCTAA TTCATTATTA TGTCCAATTC TGAACTTGGA GGTGAGTCTG TCGAGAATTA TTTTATATGA CTAATTATAA  TTTGTGAGAA AATTTACTCT TTATAACTAC CACTAAGACG TTGGTTGAGA AAGATTGAAA TTGTTAAAAT GTTCATCTTT TATGATTATG AATGCATAAA TACATATATA TATATATATA  TATGTATGTA TAGGGATGTG ATGGATCAGT GCTGTTGGAT GATACAATCA CATTGCAAGG AGAAAAGAAA GCACCCAACA ACGTTAATGC ACTCAAAGGA TTTAGGATGA TGGACAGGAT  CAAGAATAGG CTCGAATCTG AATGTCCTGG AACTGTTTCT TGTGCTGATA TTCTCACCAT TGCCGCTAGA GATGCTGTTC TTCTGGTATT AAACTCAATT TGAAAAAAAA AAAAAAAAAA  ACTCATAACA CAATTTTTAG TTTTTGTACA ATTTCTATTT TGTTTATTGA TGAGTTTTTT TTGTGTTTTG GTTTTTTGTT GAGGTTGGTG GGCCTTATTG GGATGTTCCT TTGGGCAGAA  AAGACTCAAA AACAGCAGGT TATGAACTCT CAACAACAAA TCTTCCAACT GCTGATGAAA GCCTTGTCTC CATCATTTCC AAGTTCCTTT TTCAGGGGCT CTCAGTTACT GACATGGTAG  CTCTTTCTGG TAAGCATGCA AACAAATAAA TATAAAATTT ATAAAGATTT TTTACAAATA TTAAAGAACG ACACTATCTT CACTTTGCCG CTTGTCCCTT TCATTCCATC CTTGATTTTC  ATGCAAGCTA TATTTCTACT TTAGTAAAAT TATAACAACA GAGGTGATAT AAAACTTGAC CTTTCATCCT CAGGTTTCTG ATTATGCCAT TGACTGCAGG TGCCCACACA ATTGGCATGG  CAAGGTGTGT AAACTTCAGG AACAGAATCT ATGGAGACTT TTCAATAACT TCAGCAATGA ATCCAATTTC TCAAACATAT TTGGACAATT TGAAAGGTAT ATGCCCTCCT GCTGTTGGAG  AAGACAACAA AGAATCAGCA ATGGATTATG TAACACCAAA TTTATTTGAT AATTCTTATT ACCAAATACT ATTGAGAGGA GAAGGACTCA TCAATTCAGA TCAAGAATTA TATTCAAGTG  TTCTTGCAAT TCAAACAAGA CAACTTGTCA AGAAATATGC TGAAAATCCA ATTGCTTTCT TTGAGCAATT CTCAGAATCA ATGGTGAAAT TGGGGAACAT TACAAATCCA GAAACTTATG 
TCAATGGAGA AGTCAGGAAG AATTGCAGAT TTGTGAATAC ATAAAAAAGC TTTATTAATT ATATGAAAGT TGTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGATTTTGG TTTTGTGCAT TTTTAATGGG AGTTTGGGGG CTTTTGATCC ACCTTTAACG TTGGATTACT ACAAAGATAC GTGCCCAACT GTGCTTGAAA TTGTTAGAAA GGAAATGGAA  TGTGCTGTTC TATCTGATCC TCGTAATGCA GCCTTGATTT TAAGGTTGCA TTTTCATGAC TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGATCAGTG CTGTTGGATG ATACAATCAC ATTGCAAGGA  GAAAAGAAAG CACCCAACAA CGTTAATGCA CTCAAAGGAT TTAGGATGAT GGACAGGATC AAGAATAGGC TCGAATCTGA ATGTCCTGGA ACTGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCACCATT  GCCGCTAGAG ATGCTGTTCT TCTGGTTGGT GGGCCTTATT GGGATGTTCC TTTGGGCAGA AAAGACTCAA AAACAGCAGG TTATGAACTC TCAACAACAA ATCTTCCAAC TGCTGATGAA  AGCCTTGTCT CCATCATTTC CAAGTTCCTT TTTCAGGGGC TCTCAGTTAC TGACATGGTA GCTCTTTCTG GTGCCCACAC AATTGGCATG GCAAGGTGTG TAAACTTCAG GAACAGAATC  TATGGAGACT TTTCAATAAC TTCAGCAATG AATCCAATTT CTCAAACATA TTTGGACAAT TTGAAAGGTA TATGCCCTCC TGCTGTTGGA GAAGACAACA AAGAATCAGC AATGGATTAT  GTAACACCAA ATTTATTTGA TAATTCTTAT TACCAAATAC TATTGAGAGG AGAAGGACTC ATCAATTCAG ATCAAGAATT ATATTCAAGT GTTCTTGCAA TTCAAACAAG ACAACTTGTC  AAGAAATATG CTGAAAATCC AATTGCTTTC TTTGAGCAAT TCTCAGAATC AATGGTGAAA TTGGGGAACA TTACAAATCC AGAAACTTAT GTCAATGGAG AAGTCAGGAA GAATTGCAGA 
TTTGTGAATA CATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGATTTTGG TTTTGTGCAT TTTTAATGGG AGTTTGGGGG CTTTTGATCC ACCTTTAACG TTGGATTACT ACAAAGATAC GTGCCCAACT GTGCTTGAAA TTGTTAGAAA GGAAATGGAA  TGTGCTGTTC TATCTGATCC TCGTAATGCA GCCTTGATTT TAAGGTTGCA TTTTCATGAC TGCTTTGTTC AGGGATGTGA TGGATCAGTG CTGTTGGATG ATACAATCAC ATTGCAAGGA  GAAAAGAAAG CACCCAACAA CGTTAATGCA CTCAAAGGAT TTAGGATGAT GGACAGGATC AAGAATAGGC TCGAATCTGA ATGTCCTGGA ACTGTTTCTT GTGCTGATAT TCTCACCATT  GCCGCTAGAG ATGCTGTTCT TCTGGTTGGT GGGCCTTATT GGGATGTTCC TTTGGGCAGA AAAGACTCAA AAACAGCAGG TTATGAACTC TCAACAACAA ATCTTCCAAC TGCTGATGAA  AGCCTTGTCT CCATCATTTC CAAGTTCCTT TTTCAGGGGC TCTCAGTTAC TGACATGGTA GCTCTTTCTG GTGCCCACAC AATTGGCATG GCAAGGTGTG TAAACTTCAG GAACAGAATC  TATGGAGACT TTTCAATAAC TTCAGCAATG AATCCAATTT CTCAAACATA TTTGGACAAT TTGAAAGGTA TATGCCCTCC TGCTGTTGGA GAAGACAACA AAGAATCAGC AATGGATTAT  GTAACACCAA ATTTATTTGA TAATTCTTAT TACCAAATAC TATTGAGAGG AGAAGGACTC ATCAATTCAG ATCAAGAATT ATATTCAAGT GTTCTTGCAA TTCAAACAAG ACAACTTGTC  AAGAAATATG CTGAAAATCC AATTGCTTTC TTTGAGCAAT TCTCAGAATC AATGGTGAAA TTGGGGAACA TTACAAATCC AGAAACTTAT GTCAATGGAG AAGTCAGGAA GAATTGCAGA 
TTTGTGAATA CATAAAAAAG CTTTATTAAT TATATGAAAG TTGTT 

Retrieve as FASTA