Entry information : CroPrx24(CRO_T004893 / cra_locus_7767_iso_1_len_1157_ver_3)
Entry ID 11282
Creation 2012-08-21 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-21 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-05 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx24(CRO_T004893 / cra_locus_7767_iso_1_len_1157_ver_3)
Name CroPrx24(CRO_T004893 / cra_locus_7767_iso_1_len_1157_ver_3)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx028]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx24
start..stop
S start..stop
VvPrx19 454 7e-162 52..346 40..333
RcPrx48 453 2e-161 7..346 1..337
InPrx02 451 2e-160 14..346 5..334
MguPrx10 450 4e-160 23..346 7..332
Literature and cross-references CroPrx24(CRO_T004893 / cra_locus_7767_iso_1_len_1157_ver_3)
Protein sequence: CroPrx24(CRO_T004893 / cra_locus_7767_iso_1_len_1157_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (320)
PWM (Da):   %s   37286.48 (34375.0)  
PI (pH):   %s   4.23 (4.23) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-337
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MANTILMYNI IFGFCLSLAI SINAFASGSS SSSEEVACID GGATFLLSFG LYKDSCPEAE LIIFSWVEKA VIEDPRMAAS LLRLHFHDCF VNGCDASILL DDRADFIGEK TAAPNLNSLR  GFEVIDAVKN DLESICPQIV SCADILAIAA RDSVVLSGGP DWEVQMGRKD SVIASKTAAE NNIPGPNSDL LTLVNKFQNV GLTLDDMVTL SGAHTLGKAR CSTFSSRLNG FTNGNVGPDV 
NLEYIQSLQQ LCTQSNSSTT LADLDLVSPT TFDNQYYVNL LSGEGLLASD LALVSGDDRV RQIVQTFVEE PMAFFEEFKK SMRMGGLVPA ISGENGEVRR NCRIPN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (Very short PS is missing). incorrect prediction of splicing exon 1.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAATA CAATATTAAT GTACAATATT ATTTTTGGTT TTTGCTTATC ATTGGCCATC TCCATTAATG CATTTGCTTC TGGAAGCAGC AGTTCAAGTG AAGAAGTTGC ATGCATTGAT  GGTGGTGCCA CTTTTCTATT GAGTTTTGGG TTGTACAAGG ATAGTTGTCC AGAAGCTGAA CTTATTATAT TTTCATGGGT TGAAAAGGCT GTTATTGAAG ACCCTAGAAT GGCTGCTTCT  TTGCTTCGTC TCCATTTCCA TGACTGCTTC GTTAATGCAA GTACCTCCTT TTACTTTCTT ATCGGTTTAT GATTCATCCC ACTCTATTTT ACTAATTAAA CAAACTTCTT TCATATCCAT  ACCTATTTTA CATATCATGA TTAATCTTTT AACTATTCTA CTACTCTCTA ACCATTTTCT TCATCGCTAT ATCTATTTTT TACAATCCAT GATTAATTAA TCCAACTACT TTTATTGTCT  TATAGAGTTT TACTTCTAGT ACTGAGTTTT TCGAGCTTTG AAATTTCACT TTCCTATTAG TATATATTTT ACGATTCAAC AGAATTTTTT TCACCTAATT TCCTTATGCA TTGATAGTGA  AGAATTTTTT TCGTGAGAAA ATTTTTACTA ATTAATCATA ATGGATTATT AATTATTTGT GTAATTAATG TCTAAATATA TTTAATTTAT TAATTACAGG GATGCGATGC AAGTATTTTA  CTGGATGATA GAGCAGATTT TATTGGAGAA AAAACAGCAG CTCCAAATTT GAACTCCCTA AGAGGGTTTG AAGTGATTGA TGCCGTTAAA AATGATCTTG AATCTATTTG TCCACAAATT  GTTTCTTGTG CTGATATTCT AGCCATTGCA GCTCGTGATT CTGTTGTTCT TGTAAGAATC TTCAATTTTT ATTAACCTAA AAAAAAGGAA TTAATTTATT AAATTAATTA TTTTAATGTT  GCAGTCTGGA GGGCCAGATT GGGAAGTGCA GATGGGAAGA AAAGATAGCG TAATAGCCAG TAAGACAGCA GCCGAAAATA ACATTCCTGG TCCCAATTCA GACCTTCTAA CACTTGTTAA  CAAGTTTCAG AATGTTGGCC TTACCTTAGA TGACATGGTT ACCCTCTCAG GTAATTAATT ACTCACTCTG GATATGATAT GATATGATAC TCCCTAATAT TTTCTTTTTT GATATCCTTA  ATTAATAAAA ATATTATACT CACTCCATCT CATAAATATA AGCTTGCTTT TATTTTTCTT CTCTACTAAA TTATAAGTCT ATTTCATTTT TATGAACATA AATAAACTTG TTAATTTTCT  TGAATATCCC TTATTATTAT ACATCTTAAT TAGTTAAACA TGTATATTTT TAAAAAATAT ATTAATGAAA CCAACCAATC TTACCGTTTT AATAACTCCA TGCCTAAAAT TTTAAGATGG  AAAATCAATT AGTATTAATG AAGTGTATAA TATATATAAT CTAACTAAAA CTTATTACTT TAACAGATTT TTTAAGTTAT ATTCAAATTG AAATAGATTT ATTTTTGTAG GACGAAGAGA  GTAACAGGAA AGAGAATTAT AGGATATGAT CTCAGACAAA ATAAGGAAAT AGTATTAATA TTATAAAAAT AGTGTTATAG TTCCCAATTT TAGAAAAATA AATACTATTA CGCGATCTTA  ATTTCAAACG AAAAGAAATA TTATAACATG ATTCCAATTT TAGACCCAAA AAAAATAGTA TTGATATTAT AGAAATAGTA TTATAAAATT TCGATTTCAA ACAAAAAAAA ATAGTGTTAA  TATTATAACT TATAAAAAAG TATTACATAA AAAAAATAGC GTTATGGAAA ATATTATGGA GAGTCTACAA CATATTATAA TTGCTAAAAG TTTTAAAAGC CATTAATTAT TGTCTCTTCC  TAATTTCAAA CAGGTGCGCA TACATTGGGA AAAGCTCGTT GCTCAACATT TAGCTCTCGG CTCAACGGTT TCACCAACGG AAATGTTGGC CCAGACGTTA ACTTAGAGTA TATTCAGTCT  CTACAGCAGC TCTGCACTCA ATCCAACTCA AGTACAACCT TAGCAGATCT TGATCTTGTT TCTCCAACAA CGTTTGATAA CCAATACTAC GTTAATCTTC TTTCTGGAGA AGGTTTGCTC  GCATCTGACT TAGCTCTCGT GTCTGGAGAC GATCGAGTTC GTCAGATAGT TCAGACCTTT GTTGAAGAAC CTATGGCGTT TTTCGAAGAA TTCAAGAAAT CTATGGTTAG AATGGGTGGT 
TTGGTGCCCG CTATTAGTGG AGAAAATGGT GAAGTTCGCA GGAATTGTAG AATTCCTAAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAATA CAATATTAAT GTACAATATT ATTTTTGGTT TTTGCTTATC ATTGGCCATC TCCATTAATG CATTTGCTTC TGGAAGCAGC AGTTCAAGTG AAGAAGTTGC ATGCATTGAT  GGTGGTGCCA CTTTTCTATT GAGTTTTGGG TTGTACAAGG ATAGTTGTCC AGAAGCTGAA CTTATTATAT TTTCATGGGT TGAAAAGGCT GTTATTGAAG ACCCTAGAAT GGCTGCTTCT  TTGCTTCGTC TCCATTTCCA TGACTGCTTC GTTAATGGAT GCGATGCAAG TATTTTACTG GATGATAGAG CAGATTTTAT TGGAGAAAAA ACAGCAGCTC CAAATTTGAA CTCCCTAAGA  GGGTTTGAAG TGATTGATGC CGTTAAAAAT GATCTTGAAT CTATTTGTCC ACAAATTGTT TCTTGTGCTG ATATTCTAGC CATTGCAGCT CGTGATTCTG TTGTTCTTTC TGGAGGGCCA  GATTGGGAAG TGCAGATGGG AAGAAAAGAT AGCGTAATAG CCAGTAAGAC AGCAGCCGAA AATAACATTC CTGGTCCCAA TTCAGACCTT CTAACACTTG TTAACAAGTT TCAGAATGTT  GGCCTTACCT TAGATGACAT GGTTACCCTC TCAGGTGCGC ATACATTGGG AAAAGCTCGT TGCTCAACAT TTAGCTCTCG GCTCAACGGT TTCACCAACG GAAATGTTGG CCCAGACGTT  AACTTAGAGT ATATTCAGTC TCTACAGCAG CTCTGCACTC AATCCAACTC AAGTACAACC TTAGCAGATC TTGATCTTGT TTCTCCAACA ACGTTTGATA ACCAATACTA CGTTAATCTT  CTTTCTGGAG AAGGTTTGCT CGCATCTGAC TTAGCTCTCG TGTCTGGAGA CGATCGAGTT CGTCAGATAG TTCAGACCTT TGTTGAAGAA CCTATGGCGT TTTTCGAAGA ATTCAAGAAA 
TCTATGAGAA TGGGTGGTTT GGTGCCCGCT ATTAGTGGAG AAAATGGTGA AGTTCGCAGG AATTGTAGAA TTCCTAATTA A 

Retrieve as FASTA