Entry information : CroPrx25(CRO_T009288/ cra_locus_9019_iso_1_len_1537_ver_3)
Entry ID 11283
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx25(CRO_T009288/ cra_locus_9019_iso_1_len_1537_ver_3)
Name CroPrx25(CRO_T009288/ cra_locus_9019_iso_1_len_1537_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx25
start..stop
S start..stop
EgrPrx134 552 0 4..333 1..329
VvPrx04 550 0 13..333 1..321
EglPrx134 550 0 4..333 1..329
EguPrx134 549 0 4..333 1..329
Literature and cross-references CroPrx25(CRO_T009288/ cra_locus_9019_iso_1_len_1537_ver_3)
Protein sequence: CroPrx25(CRO_T009288/ cra_locus_9019_iso_1_len_1537_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (304)
PWM (Da):   %s   36281.14 (32882.4) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.48 (8.39) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKMARFDLL LTMLTLCLSV NFFPQLVSAQ LRQNYYANIC PNVENIVRGV VAQKFQQTFT TVPATLRMFF HDCFVQGCDA SVIIGSTPNN KAEKDHPDNL SLAGDGFDTV IKAKAAVDAV  PSCNNKVSCA DILAMATRDV IALSGGPSYA VELGRLDGLS STAASVEGKL PKPTFNLDQL NALFAANGLN QMDMIALSGA HTLGFSHCDK VSPRIYNFSR QNPIDPTLNP QYAQQLQGAC 
PKNVDPRVAI NMDPTTPRTF DNVYFQNLQQ GKGLFTSDQV LFTDPRSKPT VNTWAMNSQA FQTAFINAMT KLGRVGVKTG RNGNIRRDCG SFN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAAA TGGCTCGTTT TAATCTTTTA TTAACTATGT TAACACTTTG TTTAAGTGTT AATTTCTTTC CTCAATTGGT ATCAGCTCAA TTAAGACAGA ATTATTATGC AAATATTTGT  CCAAATGTTG AAAATATTGT TAGAGGTGTT GTTGCCCAGA AATTCCAACA AACATTTACT ACTGTCCCTG CCACTCTTCG TATGTTCTTT CATGATTGTT TCGTTCAGGT AAAGTTTTGA  TTTTGAAAAA TTACAGCTTA GTTGGTTATA TGCCCGACAA ACATTTACAA TTGTCCCTAC CATTCTTGGC ATGTTTTTTT CGTGATTGAG AGTTTGATTT TGAAATTTTT TACTGAAATT  TTTGCAATGG ATTTGAAACG AACGAACAGG GATGTGATGC TTCTGTAATA ATAGGATCAA CTCCAAATAA TAAGGCGGAA AAAGATCATC CGGATAATTT GTCCCTGGCT GGAGATGGAT  TTGATACTGT AATTAAAGCT AAAGCTGCAG TTGATGCTGT ACCAAGTTGT AATAATAAGG TTTCTTGCGC TGACATTCTT GCCATGGCTA CCCGGGATGT CATTGCTCTG GTTAGTACCG  TCTTCTTCTT TACTTAAAAA TACTTATTTT AAGTTATAAA AAGTTTCGGG TCAATTTAAA AAATTTCTTG ATATTTATAG TTAAGTGTCA ATTAAGTATC TAAACTTTTA AAATTGACGA  TTAGATACCT ATTTTAGGTT TACTTAAGCC ATTGGGGTCC ACATGACAGA TAATAAATGA TAACGATTAG TAATTATCTT TTAAACTACC ATTTTTTGTA CTCAAAAnAA AAAAAAAAAA  AATTCTTGTC TTGAGGATCT CGACTAGCCC CATTTGGGCA CGAATAAATC AGGTATACGG CAACCTACAA GAAACTACTT CTAAAAGAAG TAAAATCTCC ACATTACGAC CGTCTAGACT  CAAATCTTGT ACTCCAAAAC TAATCAAGCT ATGCCCTAAA AGCATTTAAA TCACTATTCT TCGTACTTGA CCAACAAAGT TTAGTTAATC AAGTTGGTAT ACTCGTTCGG CAACTGATCC  GACTCGACCA ACTCAATCCA ACTCGCGTAT TAAAAATTTA CCCAATTATT TTTTTATTAG GCTTGTTCTG ATGAGTCATA TCGCGTATTT TAATTCTACA GAGTGGAGGA CCTTCATATG  CAGTTGAATT GGGAAGATTA GATGGGCTGA GTTCAACAGC AGCAAGTGTA GAAGGAAAGT TGCCAAAGCC AACATTCAAT TTGGATCAGC TTAATGCGAT GTTTGCTTCT AATGGACTAA  ACCAGATGGA TATGATCGCT CTCTCAGGTA ATGCCACGTG GAATTTCCTT TTTTGCTAAA TGTCTATTTA TTTGCTGACA AAATGTGCAT GTCCTAATAA TAAGTGCCAA ATTCAGACCG  TCTTTTTTTT TAATTACAAT TCCATTGGTC TGATCATGCG TGAAAGAAAA AAAAAAGAAA AAAAAGGCAA AGAAGATAAC TTTTTTTAAA GAATATTAAG GTGGCCAGCT GGATGTAATG  TGACCATTTT CTTAGTCAGA ATAGTTTAAA AGAAAAAAAT AAATACTTAA AAATAACTCT CCCACAACAA TTTTTTTTTG TCGCACGAAA TAATAACTCA GTTATAAAAA TACATTTTAT  AAGACTAAAT ATATAATATT TGAATTATAT TTTTTCTCGA TATTTATAAT AAAAATTATT TAATTACTTT ATAAGAATTG ATCAGTTTTT CAAAAGAAAG AAAAAAGTGA TTGTGTAAAT  AATGTGACTA AGATTAGTTT GATCACGTAA ACAAATTTCG TAATATTAAT ATATTTATTT TTTTCTAGAA ATTTTTTTTC TATGTGACGT AAATGTTTTC ACGAGATAAT ATGTATATGA  TTTGATAAGT TTTTCCGGTA AAAATGTTTT AAAAAAAATT GAGAAAAAGT AAAATTTTTA ATTAATCAAG TTCATATTAG TTTGAGAATA TAGGATTATT TTAAAAATAT ATATGATTTA  ATATTAAGAA ATGTTATTTA TTAACCCAAG ATGATTTGAT CCTATGTAGG GGCTCATACC TTAGGGTTCT CACATTGTGA CAAGGTTTCA CCAAGAATAT ACAATTTCAG CCGTCAAAAC  CCGATAGATC CGACGTTAAA CCCGCAATAT GCACAGCAAT TACAAGGAGC ATGCCCGAAG AATGTTGACC CGAGGGTAGC CATAAATATG GACCCCACCA CACCTCGTAC CTTCGATAAT  GTCTATTTTC AGAATTTACA GCAAGGTAAA GGTTTATTTA CCTCGGATCA AGTCCTTTTT ACTGATTCCA GATCAAAGCC TACTGTTAAT ACTTGGGCAA CGAACTCGCA AGCTTTTCAA 
ACCGCTTTTA TTAATGCGAT GACTAAACTC GGACGCGTTG GTGTTAAAAC CGGAAGAAAC GGTAATATTC GTCGCGATTG CGGAGCCTTT AATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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ATGACGAAAA TGGCTCGTTT TGATCTTTTA TTAACTATGT TAACACTTTG TTTAAGTGTT AATTTCTTTC CTCAATTGGT ATCAGCTCAA TTAAGACAGA ATTATTATGC AAATATTTGT  CCAAATGTTG AAAATATTGT TAGAGGTGTT GTTGCCCAGA AATTCCAACA AACATTTACT ACTGTCCCTG CCACTCTTCG TATGTTCTTT CATGATTGTT TCGTTCAGGG ATGTGATGCT  TCGGTAATAA TAGGATCAAC TCCAAATAAT AAGGCGGAAA AAGATCATCC GGATAATTTG TCCCTGGCTG GAGATGGATT TGATACTGTA ATTAAAGCTA AAGCTGCAGT TGATGCTGTA  CCAAGTTGTA ATAATAAGGT TTCTTGCGCT GACATTCTTG CCATGGCTAC CCGGGATGTC ATTGCTCTGA GTGGAGGACC TTCATATGCA GTTGAATTGG GAAGATTAGA TGGGCTGAGT  TCAACAGCAG CAAGTGTAGA AGGAAAGTTG CCAAAGCCAA CATTCAATTT GGACCAGCTT AATGCGTTGT TTGCTGCTAA TGGACTAAAC CAGATGGATA TGATTGCTCT CTCAGGGGCT  CATACCTTAG GGTTCTCACA TTGTGACAAG GTTTCACCGA GAATATACAA TTTCAGCCGT CAAAACCCGA TAGATCCGAC GTTAAACCCG CAATATGCAC AGCAATTACA AGGAGCATGC  CCGAAGAATG TTGACCCGAG GGTAGCCATA AATATGGACC CCACCACACC TCGTACCTTC GATAATGTCT ATTTCCAGAA TTTACAGCAA GGTAAAGGTT TATTTACTTC AGATCAAGTC  CTTTTTACTG ATCCCAGATC AAAGCCTACT GTTAATACTT GGGCAATGAA CTCGCAAGCT TTTCAAACTG CTTTTATTAA TGCGATGACT AAACTCGGAC GCGTTGGTGT TAAAACCGGA 
AGAAACGGTA ATATTCGTCG CGATTGCGGA TCCTTTAATT AA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGCCGGGGA TGAAGAAGTA AACCCAAAAA AAAGAAAACA AAAAAGACAG TCCGATATGA ACATGCCAAC ATCAATCTCA CCACAGTCCC TTTCTTTCCT TCTTTTTAAA TCCAACTTTC  ACTCATAACC CTCTCTCCCC ACCTCCATTA GAAAGATTCT AAAGCTCCAA CTTGCCATTA GAATTCGTCT TCTTCTTCTC TGTTTCCTCT GTATATAAAT TCTTCCCACA TTTTCTTCAT  TTTCATAAAA GAAAGATGAC GAAAATGGCT CGTTTTGATC TTTTATTAAC TATGTTAACA CTTTGTTTAA GTGTTAATTT CTTTCCTCAA TTGGTATCAG CTCAATTAAG ACAGAATTAT  TATGCAAATA TTTGTCCAAA TGTTGAAAAT ATTGTTAGAG GTGTTGTTGC CCAGAAATTC CAACAAACAT TTACTACTGT CCCTGCCACT CTTCGTATGT TCTTTCATGA TTGTTTCGTT  CAGGGATGTG ATGCTTCGGT AATAATAGGA TCAACTCCAA ATAATAAGGC GGAAAAAGAT CATCCGGATA ATTTGTCCCT GGCTGGAGAT GGATTTGATA CTGTAATTAA AGCTAAAGCT  GCAGTTGATG CTGTACCAAG TTGTAATAAT AAGGTTTCTT GCGCTGACAT TCTTGCCATG GCTACCCGGG ATGTCATTGC TCTGAGTGGA GGACCTTCAT ATGCAGTTGA ATTGGGAAGA  TTAGATGGGC TGAGTTCAAC AGCAGCAAGT GTAGAAGGAA AGTTGCCAAA GCCAACATTC AATTTGGACC AGCTTAATGC GTTGTTTGCT GCTAATGGAC TAAACCAGAT GGATATGATT  GCTCTCTCAG GGGCTCATAC CTTAGGGTTC TCACATTGTG ACAAGGTTTC ACCGAGAATA TACAATTTCA GCCGTCAAAA CCCGATAGAT CCGACGTTAA ACCCGCAATA TGCACAGCAA  TTACAAGGAG CATGCCCGAA GAATGTTGAC CCGAGGGTAG CCATAAATAT GGACCCCACC ACACCTCGTA CCTTCGATAA TGTCTATTTC CAGAATTTAC AGCAAGGTAA AGGTTTATTT  ACTTCAGATC AAGTCCTTTT TACTGATCCC AGATCAAAGC CTACTGTTAA TACTTGGGCA ATGAACTCGC AAGCTTTTCA AACTGCTTTT ATTAATGCGA TGACTAAACT CGGACGCGTT  GGTGTTAAAA CCGGAAGAAA CGGTAATATT CGTCGCGATT GCGGATCCTT TAATTAAAAA AGAAAAAAAA AGAAAGAGAG ATTGTGGTTT TGTATATGAA TAATGAATGA TGGCAAAATT  AAGCCTCAAA TTACGGTGTT GTGAATTTTT AAAAAATTTG TGTACGTCAA CCGGTTAAAA ATAAGGTTCA TTTCTTATTT CTGGAAAAAA AAAAGAAACT GTAAAGTCAG AGAGTTACTT 
TACGAGTAAT CTTTTGTAAT GGTGATTTGT TTATTTCAAA TTGAATGAAG GAAATAGAAG TTAAAGGAAA ATATATATTT ATTTTTTTGT TCCGAAG 

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