Entry information : CroPrx26(CRO_T011974 / cra_locus_1478_iso_4_len_1500_ver_3)
Entry ID 11284
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-07 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx26(CRO_T011974 / cra_locus_1478_iso_4_len_1500_ver_3)
Name CroPrx26(CRO_T011974 / cra_locus_1478_iso_4_len_1500_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx020]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx26
start..stop
S start..stop
EgrPrx68 516 0 8..328 6..325
EglPrx68 516 0 8..328 6..325
EgrPrx67 513 0 8..328 6..325
MePrx133 511 0 24..328 21..324
Literature and cross-references CroPrx26(CRO_T011974 / cra_locus_1478_iso_4_len_1500_ver_3)
Protein sequence: CroPrx26(CRO_T011974 / cra_locus_1478_iso_4_len_1500_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (304)
PWM (Da):   %s   36046.23 (33355.0) Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   9.15 (9.31) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSSSCFLS HFLVFFFFIS TTFGQLRPNF YSSTCPNVET LVRNAVQAKF RQTFVTAPAT LRLFFHDCFV RGCDASILIA SPNNNAEKDH PDNLSLAGDG FDTVVKAKAA VDSDPRCTNK  VSCADILALA TRDVVSLAGG PFYQVELGRR DGRISTKASV QRRLPTPDDK LDKLTALFAS HGLDQTDLIA LSGAHTIGFS HCSRVSKRIY NFSPPRTRID PTLNLQYAFQ LRQMCPIKVD 
PRIAINMDPN TPNTFDNVYY QNLQQGKGLF TSDQTLFTDN RSKATVNLFA SNPIAFGQAF ANAMTKLGRV GVLTGNQGEI RRDCTRPN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTTCTTCTTG TTTTCTGTCT CATTTTCTTG TTTTTTTCTT CTTCATAAGT ACAACTTTTG GTCAATTGAG GCCAAATTTC TACAGCAGCA CATGTCCTAA TGTTGAAACT  CTTGTAAGAA ATGCAGTTCA AGCTAAATTC AGACAGACAT TTGTCACTGC TCCTGCTACT CTTAGACTCT TCTTCCATGA TTGCTTTGTC CGGGTACGTA CCTACTTTTT TTTTCAGCTG  AATAGTGGGA AAAATGTAAT TAACCATACT CCTTGTATTT TTTTTTTTTT TTTTTTTnGG GGAGGACAGG GTTGTGATGC ATCAATATTG ATAGCTTCGC CTAACAATAA TGCTGAGAAG  GATCATCCTG ATAATCTTTC ACTTGCTGGA GATGGATTCG ACACAGTAGT TAAGGCCAAA GCAGCTGTGG ATAGTGATCC TCGTTGTACA AATAAGGTTT CATGTGCTGA CATCTTAGCC  TTGGCTACAA GAGATGTCGT CTCTTTGGTA AGGATTTTAC ACGCCAATGC CAAATTTCTG TTTGTGTTTG TGACCTGAAG ACACTTATTT TAGAGTGTAT TATTTTTTTA TATAATTTGT  GGGGTGGGTG GGTGCAGGCA GGAGGGCCAT TTTATCAAGT GGAATTGGGA AGGCGAGATG GAAGAATTTC GACAAAGGCA AGCGTACAAC GTAGGCTTCC AACTCCAGAT GATAAATTGG  ACAAGCTTAC TGCCTTGTTT GCTTCCCATG GCCTCGACCA AACTGATTTG ATTGCTTTAT CTGGTAATTA ATTAATTAAT TAATTAATTA CCTCTCAATC AATCTTTGCT TCCCATCCCC  ACCATGAATG AGTTATGTAA AGGTTACCTT AGCTTAGCTA GTCATTTATT TATATTAATG GTTCATATTA ATAATTCTTT GTTGCAGGAG CACACACAAT TGGATTCTCT CATTGTAGCC  GAGTCTCAAA ACGTATATAC AATTTCAGTC CTCCTCGTAC CAGAATAGAT CCAACATTAA ACTTACAATA TGCATTTCAA CTGAGACAAA TGTGTCCAAT AAAAGTTGAT CCAAGAATTG  CAATTAATAT GGATCCAAAC ACACCAAACA CATTTGATAA TGTTTATTAT CAAAATCTTC AACAAGGAAA AGGTTTATTT ACTTCTGATC AAACCTTGTT TACTGATAAT CGTTCTAAGG  CTACCGTCAA TTTGTTTGCA TCAAATCCAA TTGCTTTCGG ACAAGCTTTT GCTAATGCTA TGACTAAACT TGGTCGTGTT GGTGTTTTGA CTGGAAATCA AGGTGAAATT AGAAGGGATT 
GTACTAGACC AAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT CTTCTTCTTG TTTTCTGTCT CATTTTCTTG TTTTTTTCTT CTTCATAAGT ACAACTTTTG GTCAATTGAG GCCAAATTTC TACAGCAGCA CATGTCCTAA TGTTGAAACT  CTTGTAAGAA ATGCAGTTCA AGCTAAATTC AGACAGACAT TTGTCACTGC TCCTGCTACT CTTAGACTCT TCTTCCATGA TTGCTTTGTC CGGGGTTGTG ATGCATCAAT ATTGATAGCT  TCGCCTAACA ATAATGCTGA GAAGGATCAT CCTGATAATC TTTCACTTGC TGGAGATGGA TTCGACACAG TAGTTAAGGC CAAAGCAGCT GTGGATAGTG ATCCTCGTTG TACAAATAAG  GTTTCATGTG CTGACATCTT AGCCTTGGCT ACAAGAGATG TCGTCTCTTT GGCAGGAGGG CCATTTTATC AAGTGGAATT GGGAAGGCGA GATGGAAGAA TTTCGACAAA GGCAAGCGTA  CAACGTAGGC TTCCAACTCC AGATGATAAA TTGGACAAGC TTACTGCCTT GTTTGCTTCC CATGGCCTCG ACCAAACTGA TTTGATTGCT TTATCTGGAG CACACACAAT TGGATTCTCT  CATTGTAGCC GAGTCTCAAA ACGTATATAC AATTTCAGTC CTCCTCGTAC CAGAATAGAT CCAACATTAA ACTTACAATA TGCATTTCAA CTGAGACAAA TGTGTCCAAT AAAAGTTGAT  CCAAGAATTG CAATTAATAT GGATCCAAAC ACACCAAACA CATTTGATAA TGTTTATTAT CAAAATCTTC AACAAGGAAA AGGTTTATTT ACTTCTGATC AAACCTTGTT TACTGATAAT  CGTTCTAAGG CTACCGTCAA TTTGTTTGCA TCAAATCCAA TTGCTTTCGG ACAAGCTTTT GCTAATGCTA TGACTAAACT TGGTCGTGTT GGTGTTTTGA CTGGAAATCA AGGTGAAATT 
AGAAGGGATT GTACTAGACC AAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TACATGTTGT TGAATCCCCC ATTGGAGATT TTTTTTATTT TTTTTAGGAC TATACAAGAA CTAATATACA GTGACTACAA AAAGTTTGTT GTTGTTTTTT TTTTCTTTGG GTATATTTTT  TTTTTCTGAA TAAATTTTTT TCTTCCTTTG GTTTATTGGA GAAGAGACCT GGAAAAGATA TTGACAAGGT AAGAAGAAGA AAAATTAAGG CTGAGAAATG ATCTAATAAG CAACAGTGGA  AGCAACAGTA TGAGCCCACC ATTTGAGGCT ATCTTTCATG TCTATCTCAT TACTTGTATT TGGAACTCTC CACTTCATCA ATGGCTTCTT CTTCTTCTTG TTTTCTGTCT CATTTTCTTG  TTTTTTTCTT CTTCATAAGT ACAACTTTTG GTCAATTGAG GCCAAATTTC TACAGCAGCA CATGTCCTAA TGTTGAAACT CTTGTAAGAA ATGCAGTTCA AGCTAAATTC AGACAGACAT  TTGTCACTGC TCCTGCTACT CTTAGACTCT TCTTCCATGA TTGCTTTGTC CGGGGTTGTG ATGCATCAAT ATTGATAGCT TCGCCTAACA ATAATGCTGA GAAGGATCAT CCTGATAATC  TTTCACTTGC TGGAGATGGA TTCGACACAG TAGTTAAGGC CAAAGCAGCT GTGGATAGTG ATCCTCGTTG TACAAATAAG GTTTCATGTG CTGACATCTT AGCCTTGGCT ACAAGAGATG  TCGTCTCTTT GGCAGGAGGG CCATTTTATC AAGTGGAATT GGGAAGGCGA GATGGAAGAA TTTCGACAAA GGCAAGCGTA CAACGTAGGC TTCCAACTCC AGATGATAAA TTGGACAAGC  TTACTGCCTT GTTTGCTTCC CATGGCCTCG ACCAAACTGA TTTGATTGCT TTATCTGGAG CACACACAAT TGGATTCTCT CATTGTAGCC GAGTCTCAAA ACGTATATAC AATTTCAGTC  CTCCTCGTAC CAGAATAGAT CCAACATTAA ACTTACAATA TGCATTTCAA CTGAGACAAA TGTGTCCAAT AAAAGTTGAT CCAAGAATTG CAATTAATAT GGATCCAAAC ACACCAAACA  CATTTGATAA TGTTTATTAT CAAAATCTTC AACAAGGAAA AGGTTTATTT ACTTCTGATC AAACCTTGTT TACTGATAAT CGTTCTAAGG CTACCGTCAA TTTGTTTGCA TCAAATCCAA  TTGCTTTCGG ACAAGCTTTT GCTAATGCTA TGACTAAACT TGGTCGTGTT GGTGTTTTGA CTGGAAATCA AGGTGAAATT AGAAGGGATT GTACTAGACC AAATTGAAGG AAAATATGAA  AGAGGATATG ATATGTAATT TGTTGTAATA AGAAGAATAA ATTTCTTTAT TCAAATATTT TGTAAATTGG TTTCATTTGT ATTATTATTA TTTTGTTTCT TGGAGAGCTG CTAATTATGT 
TTGTAATAAG ATCCTTAAAT TATGAAATGA TGTAAAGAGT CTCTTTAAAC TATATTTGGA 

Retrieve as FASTA