Entry information : CroPrx27(CRO_T021121 / cra_locus_8549_iso_1_len_1406_ver_3)
Entry ID 11285
Creation 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-08-22 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx27(CRO_T021121 / cra_locus_8549_iso_1_len_1406_ver_3)
Name CroPrx27(CRO_T021121 / cra_locus_8549_iso_1_len_1406_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx028]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx27
start..stop
S start..stop
VvPrx65 499 5e-180 11..333 3..323
MePrx64 493 2e-177 13..333 7..324
CclPrx43 488 2e-175 12..332 8..324
NtPrx44-1A 487 5e-175 25..333 20..325
Literature and cross-references CroPrx27(CRO_T021121 / cra_locus_8549_iso_1_len_1406_ver_3)
Protein sequence: CroPrx27(CRO_T021121 / cra_locus_8549_iso_1_len_1406_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (306)
PWM (Da):   %s   35569.66 (32736.2) Transmb domain:   %s   i12-31o
PI (pH):   %s   4.68 (4.50) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKVMVIRSCS SWLLLLMVAM VVTGGGAQVL VENFYSSSCP NVELIVQQSV ASKMQATQTF TPIPATLRLF FHDCFVEGCD GSVLIASPNG DAEKDAPDNL SLAGDGFDTV IKAKQAVEAQ  CPGIVSCADV LAIAARDVIV MAGGPSFSVE LGRKDGLVSK ASRVAGNLPE PSDDLNKLIA LFTKNNLSTM DLIALSGAHS IGFSHCSRFA NRLYSFSPSS PIDPSLDPNY AQQLIQMCPQ 
NVDPSIAVNI DPTTPTTFDN VYYQNLVGGK GLFTSDQELF TDPRTQSTVT DFANNPLNFN AAFVTAMRNL GRVGVKTNNQ QGEIRRDCTT FNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGGTGA TGGTGATCAG AAGCTGCAGC AGCTGGCTTC TCTTGTTGAT GGTAGCAATG GTAGTGACAG GAGGAGGAGC ACAAGTACTA GTGGAGAACT TTTACAGTTC AAGCTGTCCG  AACGTGGAAT TAATTGTGCA GCAGTCAGTG GCTTCCAAAA TGCAGGCGAC TCAAACATTC ACTCCAATTC CTGCCACGCT ACGTCTCTTT TTCCATGACT GCTTTGTTGA GGTACAGTCA  AACTTTCTGC GAACAATTTG TGAAAAGTTC GATCAAAGTT GATATGAATT CGACATTGAT CGAATAAGAG TTGATTCAAG TCAAGTATAT TATTAAACGT GTCGAGTTCA AAATTAACGA  AATTTAGCTC AAAATTCGTT AAGAGTTCGA TTTGAATATT CAATTTCTGA GTTCGAATTC AAGTTCGAAA TTATATATAA TCATAATTAT ATTAAATATG TATGATTACT AAATAAAATG  TACAAAAACG TCACTCTTCC GTTATTTATA TTAAAAGATT TGTATAATTG TATATCATTA CATAATTATT ATATCATAAA AATATCAGTG ATGTTTAAAA TATTTTAATT AGTTTTAATA  ACTTATTAAT ATTAAATTAA AATATTTCAT GTAGATGATT ATATGACATA CACAAACGAA ATCGATAATA TTTTTTACGT TATTAGTAGA GTAAATAATA ACACTCACGA TTGTCTAATA  CATCTTCTAA TATACAATAT ATAGTACATT TCCTTCAACA ATAACTTTTT CGTTAGGATT TATAGTTTAT CTTTTAGAGT TTAGAATTTA TTTTATATTG CGTATGATTA TATTAAAAAA  ACTATAAAAA GAATGTATTA GGGAGTGAAT TAGAAAATAT AATAGATGAT TCTTTTCTTA AATAATACTT CTACAAAATA AGATATATTA TCTATACACT TATGTAATTT TTTTCAAATA  ACAATATAAA AGCTCCATAT TTGAATATAT GTTAATTATT TATGTAATTA AATAAAAACT ACAATACATA AAAAAATAAA AATAAAATTT TAAAAATTAA GTTTTGGAAT ATCAAACTTA  AGTTCGGACT CGAGCTTGGA AAATTCAAGT TGTATTCGAG CTCGAGCTCT TTTAAAATTC TATCGAGCCG AGCTCGATAA GCTAAAGCTC GACTCGATTC GATTCCTTTA CAATCCTACG  CACTACTCAC GCATTACATC TCTTTGTTAA TATTTTTAAA TTTATTTTAA AGTATACCCT ATTCTTTGAC TTATATTATG TAAGTTAAAT AAATTAAAAA CATATTATTA TTTTTTTATC  TTAACTAGAT CATATATTAA CATAAAACTT ATAAAGTTAA AGTACAAAAA TGTCTTCCGC ATATGGGAAA TCACAAAATC TTTTCAAACT TACAAGTAGA TGTTTTTTTA AACTTGTTAC  TATTTTATTT TTTATGTGCT GGGAGAGAGA AATGTGTTTC CAACAGGACA TATTCCACTA AATATTACTT CCACCGCTGA TTAATACCTT ACTACTTAAA CAATTTAAAA TTATAATGAA  AATATTGTAT TAAAATATGG GTCAATTACA TTATCTCCCT TGATGTTTTT TAAAATTACA ATATTTTATT TTTTATTTTA CATAAATTAC AAATTTATCC TTATCATTTA TAATATATAT  ATATATATGA GATTTAGCTA TTTATATATA TATATGTATA TGTATGAGAT TTAGCTATAT GTCTATATAT ATATATATAT GAGATTTAGC TATTATAGCA TAAACGACTA TTTTTAATTT  TTTTTTATAT GCATAAACTT TGATTTTACG TTTTCTAAAT ATGAACTATT TTGCTTTTTT CTTTATAGGC ATAAACTTTG ATTTTATCTT TTTCTAGCCA TAAACTATTT TTATTTTTAT  TTTTATTTTT ATTTTTGTAG CCATGAACTA TTTTTGAAAC CTCAAATATT GCCATGAACT ATATTTAATA TATTGCTATA TTTGAAAGGT GAAAAATAGG TCATGATTAT AAAGAGAAAA  ACAAAAATAG TTCATGACTA AAAAACGATA AATCAAAATT TCTAGCTATA AAGAGAAAAA CAAAATAATT TATGGCTAAA AATTGATAAA AGCAAAGTTT ATGGCTACAT AAAGAGAAAA  GTAAAAACAG TTTATAACTA TAAATAGTTA ATATCTCTTT AAATATTCGT AAATAATTAA TCTCTACCAT TAACTTCAGT AAAAATTATC AAAAAAATAA TAATTTTGTG ACAAAAAGTT  TAAAATTTTT TTTAAATATG ATTCTTGTGC CTAATCACCA TATATTTAAG ACAATGATAT AATTTTTAAA ATTTGTTTTA TGAGTTTAAT TCCTGTAATG AATCATACGC GTGTATGTAT  ATATATATAG ATATGTAATT TTAGAAAACA ATAGTTTTGT AACAAAAAGC TAAGAATTTT TCTAATAGAA CATTGGTAAA TCTCCTCTTT CTGGTTTACA GGGGTGTGAT GGATCTGTTC  TTATCGCTTC ACCAAATGGA GATGCAGAAA AAGACGCTCC AGATAATCTT TCTCTAGCTG GAGATGGCTT CGACACTGTC ATCAAGGCAA AACAAGCCGT GGAGGCGCAA TGCCCTGGCA  TTGTCTCATG TGCCGACGTT TTAGCTATTG CTGCAAGAGA TGTGATAGTC ATGGTAATGT ACCCGCCTCC ATCATATTGA TTTCATTACA CAAATTAGCT ATATATACTA CTGTTTATCT  ACGACCTTAG AGTTATCTTA TGACAGATTG TACAATTTTC AACGTGCTTT AATCATGTTT TTGTACACAA ACTCCTAAGT AAATCATATT ATGCAACTAA AAATAAAATT AAAAAACACA  TTCATCGGGT ACAATTTTCT ATCATCTTTC AATAGATATC ATCTAGAACT TTTCTTCTAT TTTTTTTTTT ACAATTCACC ATTTTAAAAA TCAAAATGCA TTTAATAAAG AATTCACGTA  CATAACGCAT GCTTAAAATG TGGCGGAAAC TACCAAATTT AATATAATTT GTTATACAAT ATTGTAAAAT AGTTCATGAG AATAAAAGTT AAAAAAAAAA AAAGTTTTTA AGTAGGTATA  AAAAAATAAC GATAATTTAT ATATATAACC AATTTCTCTA TTTCATAACT ATTTGTGTTT TTTTATTTTT CACGTTATTA AATAATATCA TATTAAATAA AAATTTTTTA TTATATCCTT  CCATAAAAGA GTTTCAACCC TCTCAATTTT TGTCATAGAA AATTATAGAA ATGACAAATA GATGAGATTA ATTTAATGGG TATTTTTGTT CATATGAAAA TTTTTCTAAA ATTCACGTTT  AATTTCTTAA AAGGTATTAT GCTTGAAATG TAACAAGTAA AAAAAAAAAT ATTTGGAAGT ATTTAATGAT ATTTTCGATC AAGATCGTCT AATACATCCA TTAGCACACC CTTTAGTGCA  TATTTAAGAG TGTACTAGAT GGTTTTGTGT GTGATGTTCT GATGCAATAT TGTGTTTCAG GCAGGTGGTC CTTCCTTCAG TGTAGAACTG GGACGTAAAG ACGGTCTAGT TTCTAAGGCA  TCTAGAGTTG CTGGAAACTT GCCTGAACCA TCTGACGATC TAAACAAGCT AATTGCCCTT TTTACAAAGA ACAATCTTAG CACTATGGAT CTAATTGCTC TATCAGGTGC TCATTCTATT  GGTTTTTCTC ACTGCAGTCG TTTTGCCAAT CGTCTCTATT CATTCTCACC TTCATCTCCA ATTGATCCTT CTTTGGATCC AAATTATGCT CAGCAATTGA TACAAATGTG CCCTCAAAAT  GTGGATCCTA GTATTGCTGT AAACATAGAT CCTACCACTC CAACCACTTT TGATAATGTT TATTACCAGA ATCTTGTTGG AGGAAAAGGA TTGTTCACTT CAGATCAAGA GCTTTTCACC  GATCCAAGAA CTCAATCTAC GGTTACCGAT TTTGCAAACA ACCCTTTGAA TTTCAATGCA GCCTTTGTCA CAGCAATGAG AAATCTTGGC AGAGTTGGAG TCAAAACAAA CAACCAGCAG 
GGGGAAATAA GGAGGGACTG CACCACCTTC AATTCGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGGTGA TGGTGATCAG AAGCTGCAGC AGCTGGCTTC TCTTGTTGAT GGTAGCAATG GTAGTGACAG GAGGAGGAGC ACAAGTACTA GTGGAGAACT TTTACAGTTC AAGCTGTCCG  AACGTGGAAT TAATTGTGCA GCAGTCAGTG GCTTCCAAAA TGCAGGCGAC TCAAACATTC ACTCCAATTC CTGCCACGCT ACGTCTCTTT TTCCATGACT GCTTTGTTGA GGGGTGTGAT  GGATCTGTTC TTATCGCTTC ACCAAATGGA GATGCAGAAA AAGACGCTCC AGATAATCTT TCTCTAGCTG GAGATGGCTT CGACACTGTC ATCAAGGCAA AACAAGCCGT GGAGGCGCAA  TGCCCTGGCA TTGTCTCATG TGCCGACGTT TTAGCTATTG CTGCAAGAGA TGTGATAGTC ATGGCAGGTG GTCCTTCCTT CAGTGTAGAA CTGGGACGTA AAGACGGTCT AGTTTCTAAG  GCATCTAGAG TTGCTGGAAA CTTGCCTGAA CCATCTGACG ATCTAAACAA GCTAATTGCC CTTTTTACAA AGAACAATCT TAGCACTATG GATCTAATTG CTCTATCAGG TGCTCATTCT  ATTGGTTTTT CTCACTGCAG TCGTTTTGCC AATCGTCTCT ATTCATTCTC ACCTTCATCT CCAATTGATC CTTCTTTGGA TCCAAATTAT GCTCAGCAAT TGATACAAAT GTGCCCTCAA  AATGTGGATC CTAGTATTGC TGTAAACATA GATCCTACCA CTCCAACCAC TTTTGATAAT GTTTATTACC AGAATCTTGT TGGAGGAAAA GGATTGTTCA CTTCAGATCA AGAGCTTTTC  ACCGATCCAA GAACTCAATC TACGGTTACC GATTTTGCAA ACAACCCTTT GAATTTCAAT GCAGCCTTTG TCACAGCAAT GAGAAATCTT GGCAGAGTTG GAGTCAAAAC AAACAACCAG 
CAGGGGGAAA TAAGGAGGGA CTGCACCACC TTCAATTCGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATCCAGG GTTGACAAAA CCTTATATCA GTGGAAATGA AGGTGATGGT GATCAGAAGC TGCAGCAGCT GGCTTCTCTT GTTGATGGTA GCAATGGTAG TGACAGGAGG AGGAGCACAA  GTACTAGTGG AGAACTTTTA CAGTTCAAGC TGTCCGAACG TGGAATTAAT TGTGCAGCAG TCAGTGGCTT CCAAAATGCA GGCGACTCAA ACATTCACTC CAATTCCTGC CACGCTACGT  CTCTTTTTCC ATGACTGCTT TGTTGAGGGG TGTGATGGAT CTGTTCTTAT CGCTTCACCA AATGGAGATG CAGAAAAAGA CGCTCCAGAT AATCTTTCTC TAGCTGGAGA TGGCTTCGAC  ACTGTCATCA AGGCAAAACA AGCCGTGGAG GCGCAATGCC CTGGCATTGT CTCATGTGCC GACGTTTTAG CTATTGCTGC AAGAGATGTG ATAGTCATGG CAGGTGGTCC TTCCTTCAGT  GTAGAACTGG GACGTAAAGA CGGTCTAGTT TCTAAGGCAT CTAGAGTTGC TGGAAACTTG CCTGAACCAT CTGACGATCT AAACAAGCTA ATTGCCCTTT TTACAAAGAA CAATCTTAGC  ACTATGGATC TAATTGCTCT ATCAGGTGCT CATTCTATTG GTTTTTCTCA CTGCAGTCGT TTTGCCAATC GTCTCTATTC ATTCTCACCT TCATCTCCAA TTGATCCTTC TTTGGATCCA  AATTATGCTC AGCAATTGAT ACAAATGTGC CCTCAAAATG TGGATCCTAG TATTGCTGTA AACATAGATC CTACCACTCC AACCACTTTT GATAATGTTT ATTACCAGAA TCTTGTTGGA  GGAAAAGGAT TGTTCACTTC AGATCAAGAG CTTTTCACCG ATCCAAGAAC TCAATCTACG GTTACCGATT TTGCAAACAA CCCTTTGAAT TTCAATGCAG CCTTTGTCAC AGCAATGAGA  AATCTTGGCA GAGTTGGAGT CAAAACAAAC AACCAGCAGG GGGAAATAAG GAGGGACTGC ACCACCTTCA ATTCGTGAAA CCAGTCCAGC AGCAATATGT TTATTCAATA GAGTGTAATT  GACATAATTG GCACCAAACA ATAATAACAT GCAAACGAGG TGGCAGTCCC ATAATGACAC TTCTATCTCC TAGTTACCTT CACCTGACAT GTCAAGTGAG AAGTTTTGAA TTCAAGTAAT  TTTAGACACG GCTTTATACC GAGAACATGT GGAATAAGGA CTCTACTTCA AAGGCTACTT CATTTCTGTA AATAGTTTCC AAAGCTTCAA GTTCAAAGAC TTTCTTCTTT TTTAGGATGA 
GATTCACTTT GTTCTTTCAT CTTTAAGCCA AGTATTTGAA TCTCTATGTA GTGAATAATA GCTCTCTTCC GCTTGAGTAT TGCCCG 

Retrieve as FASTA