Entry information : CroPrx51(CRO_T017175 / cra_locus_21299_iso_1_len_962_ver_3)
Entry ID 11316
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx51(CRO_T017175 / cra_locus_21299_iso_1_len_962_ver_3)
Name CroPrx51(CRO_T017175 / cra_locus_21299_iso_1_len_962_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx034]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx51
start..stop
S start..stop
RcPrx49 554 0 12..351 17..352
CsPrx13 550 0 13..352 17..355
CppPrx08 548 0 24..352 29..354
VvPrx53 547 0 36..352 33..346
Literature and cross-references CroPrx51(CRO_T017175 / cra_locus_21299_iso_1_len_962_ver_3)
Protein sequence: CroPrx51(CRO_T017175 / cra_locus_21299_iso_1_len_962_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   352
PWM (Da):   %s   38481.78  
PI (pH):   %s   9.2
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSFSSTFLSA IIFVVAFLAL LPSNSHCFVN VKSTTNNATR SHRPPRQLSV SYYAKSCPQV DQLVASVTSE RFKEAPVSAP ATIRLFFHDC FVDGCDASIL ISTKPGSKIL AEKDAEDNKD  LAMEAFDSIN KAKALVESKC PGVVSCSDIL AIAARDFVHL AGGPYYQVKK GRWDGKLSMA SRVHYNIPRA NSTVDELIRL FNSKGLTVND LVVLSGAHTI GFAHCKHFVD RLYDYKGTKQ 
PDPAIDPRLL KALKMPCPHF GGNVDIVVPF DVTTPFAFDN AYYGNLESKM GLLASDQALA LDPRTKPLVQ ALSKDKQKFF QEFAVAIDKM GSIGVKRGPK HGEKRKVCSM HV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST. Short PS s missing., Frame shift in 3' end. Based on orthologs probably contains C-term extention.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTCT CTTCTACATT CCTCTCAGCT ATTATTTTTG TGGTGGCTTT CCTTGCCTTA CTTCCTTCTA ATTCGCACTG CTTTGTTAAT GTTAAATCCA CCACAAACAA TGCCACCCGC  AGCCATAGGC CGCCACGGCA ACTCTCTGTC AGCTACTATG CAAAGTCCTG TCCTCAGGTT GACCAGTTGG TGGCTTCCGT TACCTCTGAA CGGTTCAAAG AGGCTCCTGT CTCTGCTCCG  GCCACCATTC GCCTCTTTTT CCATGACTGC TTTGTTGATG TAATTCTAAA TTCTGTGCTC TATTACTTGG TTGCTGGCTT ATATTGATAT ACATTATGAT CAGTCTTACC AAATTCACTT  CTTGTGGGTG GATTATTCTA TTCTACAATG TGAATTGTGT TTCTGCTGGG AAAATAATGA GTGCCTTCGC TGATTGGGCT GATTTCTTAG CTTTGTTTAT GAAAGTTCTC TTGGAGATAG  TGTTCATAAT TACTTGCTTT TCATGTAATC TTTTAGTTAT CAGCTGTGCT TCTATCATTT TGTGAGAGAT TACTAAGCAA GTAATCAAAT TCGCATGTCG ATTTGTTGTG TTTGTGTATT  TGAGTTAAAT TTTGATCATC TCAAAATTTG TGGTTCTTAA GGGCTGTGAT GCATCAATAC TGATATCGAC AAAACCAGGA AGTAAAATAT TGGCTGAAAA GGATGCTGAG GACAACAAGG  ACCTCGCGAT GGAGGCGTTT GATAGTATAA ATAAGGCAAA GGCATTGGTG GAGAGCAAGT GTCCTGGTGT TGTATCTTGT TCAGACATTC TAGCAATTGC AGCCAGGGAT TTTGTCCACC  TGGTTAGTCT TCTCTTGCTG TTTATTAAAA AAGGTCGTTT TCTGGGGAAT TTTTGTTTTG ATGCTTGCCA CTGTATTGAC CTCATGTGCC TGATCATGAA GTTCTCCTTC TCATGCCCCA  TATTTTACAG TAAAGCAAAT ATAGCTTTTC CTTTTCATAT GCAGAAAATA TGGAAAAAAA AACAAAACTA ATCCTCTGAA TCCGGTGCTA GTTATAAGTC CCATCAAATT CCGTTATACT  TCTGCTGTAT ATTGCAAAAT TATTAAATAA AGAGGCGTCA AGAATCCAAT TTGCAGATGG TTGACTCACA TTCCAGCTTC TTTATTGGAA GAAAGCAAGA AACATTGGCC TAATGAGACA  TATAGTCTCT TTATTTAGTC TTCTACCGTT GTCGGATTGT GTTTTAAAGG ACCTAGTTAG GCAGGTTTAG GGACATTTTG TCTTGCTTTA GTTATGAATA ATACTGTTTA GCTGTGATTG  AAATGATTCC CAGGTATGGT ACAAATAGAG AAGAAGAGTC CAAATCTGAG CCAATTTTAT CAACATATAA AATGTGCAAA CAGCTGTTTA ACTTTTGTCC CTTTAACAAA CTATACAAGT  AGTGAAAACT ATATTTGCAC TTTGTCAACC ATTAGTTATC TATGTGAATA TGATCCAAAT CTATTGGTGT ATCTGAAAAG AAATGATTTG TCACTATGCC TGTTGTCACA GACCCTTCTA  CTACTGGGCT CCAAATGTAA AAATCACATG GACCTTATTT GCTCTGTTTT AAAGATTGCT TAGCGGCTGC AAAACAATGT TCACAAACTT TCTGGACTTA TTCAAAAATT TTCAAGCAAC  CTGCACTGAA GCTGCACTAG TTATGCATTC TAGCAGGTTA AACATGAAAG CATGTGAAAA TCAAACACGA GTGACACGTA TCATTTTGTA CCCTTCCTGG TTTTCGGCTC CACTTATTTA  CACTCCTCCC CCCATTCTGT TTCCCTCCAG AAGTTGCCAT GGTTCTGCCC CCTGTCCCCA AACTATGAGT GGAACACTCG ACTATTAAGC TATTACCAAG CGACTCCTTA TTTAAATGGT  TGGTGTCTAG AAAACATAAC CATATGCATA TAATAAAATA TATTTTCAAG TTGTATAGTC GAATAACTTG TTGGTTGAAA TCTAGATACC CTTGTGTGAA AAATGACTTT GGATTGACAT  TACTTTTGTT ATTGGTTGTG GTGTAAAGGC AGGAGGACCA TATTATCAAG TTAAGAAAGG GAGATGGGAC GGGAAGCTTT CCATGGCTTC GCGGGTACAT TACAACATCC CTCGAGCCAA  TTCAACAGTG GATGAGCTTA TAAGACTCTT CAATTCAAAA GGGCTAACAG TGAATGACTT AGTTGTCCTT TCTGGTGCAC ACACAATAGG TTTTGCACAT TGTAAGCACT TTGTGGATAG  ATTATATGAC TACAAGGGCA CAAAACAACC TGACCCTGCC ATTGATCCAA GACTCCTCAA AGCCCTTAAA ATGCCATGCC CACATTTTGG AGGAAATGTT GATATTGTAG TCCCTTTTGA  TGTTACAACT CCATTTGCAT TTGACAATGC TTATTATGGG AATTTGGAGT CCAAGATGGG ATTGTTGGCC TCTGATCAAG CTCTGGCTTT GGATCCAAGA ACAAAGCCAT TGGTTCAAGC  TCTTTCAAAG GATAAACAAA AATTCTTCCA AGAATTTGCA GTGGCGATCG ATAAAATGGG ATCCATAGGT GTGAAGAGGG GACCAAAACA TGGAGAAAAA AGAAAAGTCT GCAGTATGCA 
TGTGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTTTCT CTTCTACATT CCTCTCAGCT ATTATTTTTG TGGTGGCTTT CCTTGCCTTA CTTCCTTCTA ATTCGCACTG CTTTGTTAAT GTTAAATCCA CCACAAACAA TGCCACCCGC  AGCCATAGGC CGCCACGGCA ACTCTCTGTC AGCTACTATG CAAAGTCCTG TCCTCAGGTT GACCAGTTGG TGGCTTCCGT TACCTCTGAA CGGTTCAAAG AGGCTCCTGT CTCTGCTCCG  GCCACCATTC GCCTCTTTTT CCATGACTGC TTTGTTGATG GCTGTGATGC ATCAATACTG ATATCGACAA AACCAGGAAG TAAAATATTG GCTGAAAAGG ATGCTGAGGA CAACAAGGAC  CTCGCGATGG AGGCGTTTGA TAGTATAAAT AAGGCAAAGG CATTGGTGGA GAGCAAGTGT CCTGGTGTTG TATCTTGTTC AGACATTCTA GCAATTGCAG CCAGGGATTT TGTCCACCTG  GCAGGAGGAC CATATTATCA AGTTAAGAAA GGGAGATGGG ACGGGAAGCT TTCCATGGCT TCGCGGGTAC ATTACAACAT CCCTCGAGCC AATTCAACAG TGGATGAGCT TATAAGACTC  TTCAATTCAA AAGGGCTAAC AGTGAATGAC TTAGTTGTCC TTTCTGGTGC ACACACAATA GGTTTTGCAC ATTGTAAGCA CTTTGTGGAT AGATTATATG ACTACAAGGG CACAAAACAA  CCTGACCCTG CCATTGATCC AAGACTCCTC AAAGCCCTTA AAATGCCATG CCCACATTTT GGAGGAAATG TTGATATTGT AGTCCCTTTT GATGTTACAA CTCCATTTGC ATTTGACAAT  GCTTATTATG GGAATTTGGA GTCCAAGATG GGATTGTTGG CCTCTGATCA AGCTCTGGCT TTGGATCCAA GAACAAAGCC ATTGGTTCAA GCTCTTTCAA AGGATAAACA AAAATTCTTC 
CAAGAATTTG CAGTGGCGAT CGATAAAATG GGATCCATAG GTGTGAAGAG GGGACCAAAA CATGGAGAAA AAAGAAAAGT CTGCAGTATG CATGTGTGA 

Retrieve as FASTA