Entry information : CroPrx54(CRO_T006549 / cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3)
Entry ID 11319
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx54(CRO_T006549 / cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3)
Name CroPrx54(CRO_T006549 / cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx022]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx54
start..stop
S start..stop
LePrx57 365 1e-126 5..341 8..352
CsPrx17 359 9e-124 25..341 30..376
CclPrx98 348 3e-119 28..332 48..381
GmPrx270 347 6e-119 29..341 58..384
Literature and cross-references CroPrx54(CRO_T006549 / cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3)
Protein sequence: CroPrx54(CRO_T006549 / cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   342
PWM (Da):   %s   37672.73  
PI (pH):   %s   4.72
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAMKILGLLL FLAIAAISGL GAEGSDDNIS DSSLFRYDFY EKTCPDVEKI IYYAMQKIIS QNKNAPAQLL RLLFHDCFIE GCDASILLND MNGTETVERK AGPNLTLKGF QFIDMIKEEV  EKECPGVVSC SDILVLAARY GVLLSGGPYY PLFTGRRDGN ESFFHKAEIE MPGPDEDITD TLRLFSLRGF SERETVALLG AHNIGQVSCE FIKPRLGNFR NTGFPDSTIT TNFLAEMSFK 
CQESSASVSN SYPSQATSFS PPESPFGTHY YQNLVQGRGL LHADQQLTAD DETAKVVEEY AYDGKAFRND FARMLIKLSN LGVRTGLQGQ VRLNCSIALN SV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs (2 contigs without overlap: 5': cra_locus_45564_iso_1_len_486_ver_3 and 3': cra_locus_15695_iso_1_len_694_ver_3. Incorrect prediction of intron 1
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTAACA ACAATTTAAA AAACGTATTT CATGTACGAA AGTATTCGAA TCGATAACAA TTTTACAAAG TGTTGCAATG TATCATCTTT CTCTTACTCA CTAATTTTCA CTTGTGATGA  AATTCATAAA TTGAGAGTTT ATTGAGTCAT TGTGATAACT AATATTTATA TCATAATTGT TGTCACGGTC AAAATCTATG TTATAAATAA ATTATAAGTT TAATGCATTC ACTTTAGGCA  ATGACATAAA ATCAATTTGT TGGCCAGTAT CATTTTCATC AATGTCTTAA TTCCCATTTA GTCTCAAGAA GATGTGAGAC TAATTTAATA AAATGTTCAA AAATATCTTT TTCCATATTA  CTACTGTAGC AGCATATTTG AGATATGATA AAAGATAGAA TATTTCCTCT ATCATCACTA ATAATATTTT CTCTGTAAAT TTTAATTGAG GAGAAATCCT AAATATAATA GAAATATGCT  ATTGATAAAT GTAAAACTTT TAGGAAACAA AATTACGAAA TATGCCTTAA GAGTAGAGAC TTGTAAAGTA ATCTTAATAA AATGATGGGC TATTCCGATG AATATATAAA AAAATAATGT  CAGAAGAATT TATACAAACA AAAAAAAAAA GTGAGAAGTT GAGCTCCAAG TTTCGAAAGG TTATCAGCTT AAATATAGAG ACATGTTTTA GCCTCCGCTG TTATGCGTAT ACATCATTGT  ACGAGTTGCT TCCTGAGTTG TACCTACAGG GGGGTACGAA CAAGTCTGTT TGGTTCCCGG GGGTGCTATG CTGTTACTCT TCTGGGACTT CTCCTTACGC TTCCTCGTCT TCTTCAGTAT  ATCTACTCGG ATTTTTTCTA ATACATTTTT CGTCTAAAGC TCTTCCGGGA ATCCCTTCAG AAACGTACCG GGAAGTTGCA GAAATGGCAA TGAAAATTCT GGGTCTGTTG TTGTTCTTGG  CTATCGCTGC CATTTCAGGT CTTGGGGCTG AAGGATCAGA CGATAACATC AGCGATTCTT CGCTTTTCCG ATACGATTTC TATGAAAAGA CTTGCCCTGA CGTTGAGAAA ATCATTTATT  ACGCCATGCA AAAGATTATC TCCCAGAACA AGAACGCCCC TGCTCAGCTG CTTCGCCTCC TTTTCCATGA TTGCTTCATT GAGGTAATTC CCTAATCACA GTTAGTTTCT TACTTGATCT  GTATTTTTTT TAGTTTTAAC GGTAATGGAT TCCTCTTATT TCTACCGTCT ACCAAGTTAT TTTCATAATG TCGACTTTGT CTCTGTGATT CCTAGTTAAA TTGCATTTCT TGGAGGACGC  GAGGGTTATT GCATTTCTTT TTCTTTTATT TGTAGTGTTT ACTTATTCTT TCTTATAAAT GCGAATCTGA TCTTGAATTA TTTCTGTTAG GTATGGATTT CTGGATTTGA CTTTGGTTTC  TTAGTGTGAT TATACTGTCT CTGTTCTTTT AATATTCTGG GTTTCTCACA TTAACTGTAA TCTTTACCAT TTTGCTTTGT AGTACCAGTT TGTTTTCAGG TGTAATTTGT GGATTTCTTA  TGCTTGATTG TTGATTCTTG ATTCTTGCTA TTGAGAGTTT TAATTTAAGT TTTCTTAAAC TGCATATGTT TTCTTAAACT GCATAGGCGA TGGTGGAAGG CATATTGCAG GTTTTTTATG  TTTAATCATT TTTGGATTTT GTGATTTACA GAATTGGAAT GTATCATTAA TTTTGTATAT ATATGAACAT TCGACTTGGA GTTGGCTTAT AGAGTGATCC AGTGTTTAAT CATCTGGGTT  CTGTTGCTCT TTAGAGTTTT TATCCCCAGT ATAGTGCTGG TTTTCACTTT AAAGTTATTA GTGTTCGGTA TGATGTGGGG AGTATAAGTC ACGTTTGATT CTCTTCCAGT GACCTCAAAT  AGACAAACAC GCACACAAGA CAGTTCTAAC TGTTTATCAG ATCATTTGTC CATTTGTGAA TAGCTAAATG ATTTGATAGT TTTTGGGATT TGGACTAAAA TCATTGTCTG TGGCTGAAAG  AAAAGAAAAC AGAAAATGCA GTGATTGAGT TTGATGTTTT AGGTCTTATG ATGTAGAGTC TTTTCCAGGT TTTCATTAGG TTAATGTTAG GGTTAAAGGA AAAGACAATC TGAATCCTGT  CCGGCCCCGC AATGTTTATC ATCTGAAATG AGTGAGCGAG GAGAATATGG AAGCAAGGAG TAGATATTGT TTCATTTCAT ATCCGCAACA TTTATCATTG AAAATAAGCT GATCTTCTAA  GCAGCTTGAT TTATTGCTTT ACTTGGATTA GGAGACCATT GAGAATAATC GTCGGTATTG TCCCCTTGCA ATTAGTCAGA TAGTAAGCAT GCTTGCTTAA TGCTTCAAAG AAATGCTTAC  TTCCATAAGT TTTAGATCTT CTTTGTGCAA TATTTCGACT AAAATTGGCT CAATTAATCA ATGAAGCGAG GGTTCAGTGG TTCTAGGGAT TGACTAAATC AATTTTGTAA TAAGAAATTG  AAGCAAGAAA ATGAAACTTG AACATGTAAT AGGAATAAAT TTACTGAATT ACTCTTGTTT CATGGCATAA AAGTAACTCT TTGATGTTTT TACAATCTTG AAACTGATTC TTGTTGATTG  GTGTATAATA CACAGATAAT TCATTTCAGA CTATTGTTAT TTTGAACATC GAGTACTTAG CATCATTGAC TGTTTTAGTT CTCATTCTGG CATGCTTAAG AAGTTGTTTA GATTTCAAGT  AGTGTCATTT AGGGTTATCC TGTTCTGCTT TAGTTGCTCC TTTTCCAAAG GTTACCTCTA ATTTACTTAA TTTCTTTTGT TCTCTTCATT GTAAGTACAT TGTTTTGGAT CCTTTGAATT  AGTTCAAAAA CTTCTAGGTA TATCATTTGT ATGTTTCTTT CTCATTGTCT CTCCAATTAT TGTATAGTAA CTTTTGTCAT ATTCTATCTT TGTGTGTCCT GTAGGGCTGT GATGCATCTA  TCCTGTTAAA TGACATGAAT GGAACTGAAA CAGTAGAGCG CAAAGCAGGT CCAAACCTGA CATTGAAAGG GTTTCAGTTC ATTGATATGA TAAAGGAAGA GGTTGAGAAA GAATGCCCAG  GGGTTGTATC ATGTTCTGAC ATACTTGTTC TGGCAGCTCG ATACGGTGTC CTCCTGGTAA GTCTTGATAT CCATACTTGT CTTCTTTTTC ATTACTTCTG TTTCCCCACT TCCTTTTGAG  GATCATTTTT TTTATCATCC TCGAAACTTC TTCCTCTAGA ATGACTAACC AGCTTGAAGC ATTATTCTCT TTCTGTCCAC AAGTTGATGG ATTTAACATT TTGAATCTAT CATTTAATTG  GAGAGGAAAA TGATTGATCA TGTAAACATC TCCGATGGCC ATCTCTTTTT TCCAAGCATT TCGAAGTTAT TTCTTAAATT ACAACTTGCC GAAAGTCAGT ACCTCGCATG AGAATAACCT  TTTGAATTTG TTTTCTCCTA TATCCAATTT TCACTCTGGT ACCATTTTAT ATCAATCACA TACTAAAATT TTACCTGATG TATTCTTTTT CCTTGTATTC TGTCAAATAC ATGTTGTACT  TCATTTCTTG TGGACGAATT GGATTTCCAT ATGTATTAGA TATACTGCAT TTTTTTCTTA CCGACAGACA TAGATGGCTT ACTGATTCAT GTATCTTTCT GTAGTCTGGT GGTCCATATT  ATCCTCTATT TACGGGCAGA AGAGATGGTA ATGAATCTTT CTTTCACAAA GCCGAAATTG AGATGCCAGG GCCAGATGAA GATATCACAG ATACACTGCG GTTGTTTTCC CTGAGGGGAT  TCAGTGAAAG GGAAACTGTA GCACTTCTTG GTAAAAATTC AGTCCACTTG TTTAACTTTC TGAAGCATAA GCATACTTGA AAGGTAGAAA GTAATTCCTA CTTAATATTG AAATTCTACT  TTAATCTGTT TAAAATGCAG GAGCCCACAA TATTGGTCAA GTTAGTTGTG AATTTATTAA ACCAAGGCTT GGTAACTTCA GGAACACAGG ATTTCCTGAT TCAACCATCA CTACGAATTT  CCTTGCAGAG ATGAGCTTTA AGTGCCAGGA AAGCAGCGCT AGTGTCAGTA ACAGCTATCC TTCTCAAGCA ACATCATTTT CTCCACCTGA ATCTCCCTTT GGCACTCATT ACTATCAAAA  CCTAGTCCAG GGTAGAGGTC TCCTTCATGC TGATCAGCAA TTAACTGCCG ATGATGAGAC AGCGAAAGTT GTAGAGGAAT ATGCTTATGA TGGAAAGGCA TTTAGAAACG ATTTTGCTCG  CATGTTGATT AAACTATCAA ACCTTGGTGT GAGGACTGGT TTGCAGGGAC AAGTACGACT CAATTGCTCT ATTGCTCTCA ATTCAGTTTA ATTCTGTAGA TCCGATATAA ACACAATTAT  TAAGAAAAGC AGCTCCACTC GATTTTATTG TATACTTGAC ATATAATTAG GCCTCCTCTC AGCTCAAGCT TCCAGAATCA TCGTAGCCAG CCAGCCACGT TCTTTCATGG ACAGGTCCGA 
ACTCATTATT CTGAAGGCTC TACAAGTAGC AGGCAAATTT TCTGGAAATC TGGTAAGAAG ACAACATGGT AATGTAGCTT GTAACACAGT TGTTTCATTA ACAAGGAGGG TAGT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAATGA AAATTCTGGG TCTGTTGTTG TTCTTGGCTA TCGCTGCCAT TTCAGGTCTT GGGGCTGAAG GATCAGACGA TAACATCAGC GATTCTTCGC TTTTCCGATA CGATTTCTAT  GAAAAGACTT GCCCTGACGT TGAGAAAATC ATTTATTACG CCATGCAAAA GATTATCTCC CAGAACAAGA ACGCCCCTGC TCAGCTGCTT CGCCTCCTTT TCCATGATTG CTTCATTGAG  GGCTGTGATG CATCTATCCT GTTAAATGAC ATGAATGGAA CTGAAACAGT AGAGCGCAAA GCAGGTCCAA ACCTGACATT GAAAGGGTTT CAGTTCATTG ATATGATAAA GGAAGAGGTT  GAGAAAGAAT GCCCAGGGGT TGTATCATGT TCTGACATAC TTGTTCTGGC AGCTCGATAC GGTGTCCTCC TGTCTGGTGG TCCATATTAT CCTCTATTTA CGGGCAGAAG AGATGGTAAT  GAATCTTTCT TTCACAAAGC CGAAATTGAG ATGCCAGGGC CAGATGAAGA TATCACAGAT ACACTGCGGT TGTTTTCCCT GAGGGGATTC AGTGAAAGGG AAACTGTAGC ACTTCTTGGA  GCCCACAATA TTGGTCAAGT TAGTTGTGAA TTTATTAAAC CAAGGCTTGG TAACTTCAGG AACACAGGAT TTCCTGATTC AACCATCACT ACGAATTTCC TTGCAGAGAT GAGCTTTAAG  TGCCAGGAAA GCAGCGCTAG TGTCAGTAAC AGCTATCCTT CTCAAGCAAC ATCATTTTCT CCACCTGAAT CTCCCTTTGG CACTCATTAC TATCAAAACC TAGTCCAGGG TAGAGGTCTC  CTTCATGCTG ATCAGCAATT AACTGCCGAT GATGAGACAG CGAAAGTTGT AGAGGAATAT GCTTATGATG GAAAGGCATT TAGAAACGAT TTTGCTCGCA TGTTGATTAA ACTATCAAAC 
CTTGGTGTGA GGACTGGTTT GCAGGGACAA GTACGACTCA ATTGCTCTAT TGCTCTCAAT TCAGTTTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAATGA AAATTCTGGG TCTGTTGTTG TTCTTGGCTA TCGCTGCCAT TTCAGGTCTT GGGGCTGAAG GATCAGACGA TAACATCAGC GATTCTTCGC TTTTCCGATA CGATTTCTAT  GAAAAGACTT GCCCTGACGT TGAGAAAATC ATTTATTACG CCATGCAAAA GATTATCTCC CAGAACAAGA ACGCCCCTGC TCAGCTGCTT CGCCTCCTTT TCCATGATTG CTTCATTGAG  GGCTGTGATG CATCTATCCT GTTAAATGAC ATGAATGGAA CTGAAACAGT AGAGCGCAAA GCAGGTCCAA ACCTGACATT GAAAGGGTTT CAGTTCATTG ATATGATAAA GGAAGAGGTT  GAGAAAGAAT GCCCAGGGGT TGTATCATGT TCTGACATAC TTGTTCTGGC AGCTCGATAC GGTGTCCTCC TGTCTGGTGG TCCATATTAT CCTCTATTTA CGGGCAGAAG AGATGGTAAT  GAATCTTTCT TTCACAAAGC CGAAATTGAG ATGCCAGGGC CAGATGAAGA TATCACAGAT ACACTGCGGT TGTTTTCCCT GAGGGGATTC AGTGAAAGGG AAACTGTAGC ACTTCTTGGA  GCCCACAATA TTGGTCAAGT TAGTTGTGAA TTTATTAAAC CAAGGCTTGG TAACTTCAGG AACACAGGAT TTCCTGATTC AACCATCACT ACGAATTTCC TTGCAGAGAT GAGCTTTAAG  TGCCAGGAAA GCAGCGCTAG TGTCAGTAAC AGCTATCCTT CTCAAGCAAC ATCATTTTCT CCACCTGAAT CTCCCTTTGG CACTCATTAC TATCAAAACC TAGTCCAGGG TAGAGGTCTC  CTTCATGCTG ATCAGCAATT AACTGCCGAT GATGAGACAG CGAAAGTTGT AGAGGAATAT GCTTATGATG GAAAGGCATT TAGAAACGAT TTTGCTCGCA TGTTGATTAA ACTATCAAAC  CTTGGTGTGA GGACTGGTTT GCAGGGACAA GTACGACTCA ATTGCTCTAT TGCTCTCAAT TCAGTTTAAT TCTGTAGATC CGATATAAAC ACAATTATTA AGAAAAGCAG CTCCACTCGA  TTTTATTGTA TACTTGACAT ATAATTAGGC CTCCTCTCAG CTCAAGCTTC CAGAATCATC GTAGCCAGCC AGCCACGTTC TTTCATGGAC AGGTCCGAAC TCATTATTCT GAAGGCTCTA 
CAAGTAGCAG GCAAATTTTC TGGAAATCTG GTAAGAAGAC AACATGGTAA TGTAGCTTGT AACACAGTTG TTTCATTAAC AAGGAGGGTA GT 

Retrieve as FASTA