Entry information : CroDiOx01 (cra_locus_15741_iso_1_len_1903_ver_3)
Entry ID 11320
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroDiOx01 (cra_locus_15741_iso_1_len_1903_ver_3)
Name (synonym) CroDiOx01 (cra_locus_15741_iso_1_len_1903_ver_3)
Class Alpha-dioxygenase     [Orthogroup: DiOx001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroDiOx01
start..stop
S start..stop
LeDiOx02 1004 0 1..600 29..627
CsDiOx01 999 0 1..600 29..628
PtDiOx02 998 0 1..600 29..627
CclDiOx01 998 0 1..600 29..628
Literature and cross-references CroDiOx01 (cra_locus_15741_iso_1_len_1903_ver_3)
Protein sequence: CroDiOx01 (cra_locus_15741_iso_1_len_1903_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   600
PWM (Da):   %s   68709.91  
PI (pH):   %s   7.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
LFCVVHFVDK FWAWHRLPVL LGLAYLGIRR QLHQRYNLLH VGRTVGRKYD TEKCWYRTAD GTCNHPNDDK VGSQGTFFGR NMPLSTSSYG LLDPHPTTVA TKLLERKEFK ECGDQLNMIA  CSWIQFMIHD WVDHMEDTKQ VELRAPDEVS EGCPLKSFKF FKNKKVPTGS SGTRFGFLNT RTPWWDGSVI YGNNTEGMVR VRTFTDGKLK ISNNGLLEHD SNGVPISGDV RNGWAGFSLL  QALFIKEHNA VCDMLKENYP DLDDEKLYHH ARLVTSAVIA KIHTIDWTVQ LLKTDTLLAG MRINWYGFLG KKVKDLFGPK FGPILSGLVG LRRPLDHGTP YSLTEEFVSV YRMHSLLPEN  FLLRDLKTSS SSADKCPPVQ EEVPMKALVG KEGERRLSSI GMERMLVSLG HQASGALTLW NYPSWMRNLI AHDTNGEDRP DPVDMAALEI YRDRERGVAR YNEFRRNLLM IPISRWEDLT  DDEKVIEALR EIYDDDVEKL DLQIGLHAEK PIKGFAISET AFFIFLLIAS RRLEADRFFT TNFNAKTYTE KGLEWVNKTE SLKEVIDRHF PDMTKKWMRC ESAFSVWSSS PTPKHHLPLY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from EST. Short 5' end is missing. Found in two contigs: cra_locus_15741_iso_2_len_1280_ver_3
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATTCTGTG TAGTACATTT TGTAGACAAG TTTTGGGCAT GGCATAGATT ACCAGTTCTA TTGGGGTTAG CTTACCTAGG AATTAGAAGG CAATTGCACC AAAGATACAA TCTTTTGCAT  GTTGGGAGAA CTGTTGGCCG GAAATATGAT ACTGAAAAAT GCTGGTACCG GACCGCCGAT GGTACCTGCA ATCATCCTAA CGATGATAAA GTTGGCAGTC AAGGAACATT TTTTGGCCGG  AATATGCCTC TATCTACTTC TTCTTATGGG TTATTGGATC CTCATCCAAC AACAGTAGCC ACGAAGCTAT TGGAAAGAAA AGAATTTAAA GAATGTGGTG ATCAATTAAA CATGATCGCG  TGCTCGTGGA TACAGTTTAT GATCCATGAT TGGGTTGATC ATATGGAGGA TACGAAACAG GTCGAACTGA GAGCTCCTGA TGAAGTTTCA GAAGGGTGTC CATTGAAGTC ATTTAAGTTC  TTCAAGAATA AAAAAGTTCC CACAGGTTCA TCTGGTACAA GATTTGGATT TCTAAATACA AGAACCCCAT GGTGGGATGG GAGTGTCATA TATGGCAATA ACACAGAGGG CATGGTTAGG  GTGAGAACAT TTACAGATGG AAAATTGAAG ATCTCCAATA ATGGACTTCT TGAACATGAT AGTAATGGTG TTCCTATCTC GGGAGATGTA CGAAATGGTT GGGCAGGCTT CTCACTCTTG  CAAGCCTTGT TTATCAAAGA ACATAACGCC GTCTGTGATA TGCTAAAAGA AAACTATCCC GACCTTGATG ATGAGAAGCT CTATCATCAT GCAAGATTAG TAACTTCAGC AGTTATTGCA  AAAATTCATA CTATTGATTG GACAGTTCAA CTCCTGAAGA CTGATACATT GTTAGCAGGG ATGAGGATCA ACTGGTATGG TTTTCTAGGA AAGAAAGTGA AGGATTTATT CGGACCCAAG  TTTGGACCAA TACTAAGTGG ATTGGTTGGT CTTAGAAGGC CTTTGGATCA TGGAACGCCT TACTCGTTAA CTGAAGAGTT TGTCAGTGTC TACAGAATGC ATTCACTTCT CCCTGAAAAT  TTTCTTCTGA GGGATTTGAA GACATCATCA TCTTCAGCAG ATAAATGCCC GCCAGTTCAA GAAGAGGTTC CTATGAAGGC ACTGGTGGGG AAAGAAGGAG AGAGAAGACT GTCAAGCATT  GGCATGGAAC GGATGCTGGT TTCATTAGGT CATCAAGCGA GTGGAGCTCT CACGCTATGG AATTATCCAT CATGGATGAG GAATCTCATT GCTCACGATA CTAACGGAGA AGACAGGCCG  GATCCTGTTG ACATGGCTGC ACTCGAAATT TATAGAGACA GAGAAAGAGG AGTTGCTCGA TACAATGAAT TCCGAAGAAA CTTGCTGATG ATACCAATTA GCCGGTGGGA AGATTTAACA  GACGATGAAA AAGTAATCGA AGCACTCAGA GAAATCTACG ATGATGATGT TGAGAAACTT GATCTCCAGA TTGGATTACA TGCTGAGAAA CCAATCAAAG GCTTTGCTAT TAGTGAAACT  GCATTCTTCA TATTTCTACT CATTGCATCA AGGAGGCTTG AAGCTGATAG ATTCTTTACG ACAAACTTTA ACGCGAAAAC TTATACAGAG AAAGGATTAG AGTGGGTTAA CAAAACGGAG  TCATTGAAAG AAGTTATCGA TAGACATTTT CCAGATATGA CAAAGAAATG GATGAGATGT GAAAGTGCAT TTTCTGTTTG GAGTTCATCA CCAACACCTA AACATCATTT ACCACTCTAT 
TAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTATTCTGTG TAGTACATTT TGTAGACAAG TTTTGGGCAT GGCATAGATT ACCAGTTCTA TTGGGGTTAG CTTACCTAGG AATTAGAAGG CAATTGCACC AAAGATACAA TCTTTTGCAT  GTTGGGAGAA CTGTTGGCCG GAAATATGAT ACTGAAAAAT GCTGGTACCG GACCGCCGAT GGTACCTGCA ATCATCCTAA CGATGATAAA GTTGGCAGTC AAGGAACATT TTTTGGCCGG  AATATGCCTC TATCTACTTC TTCTTATGGG TTATTGGATC CTCATCCAAC AACAGTAGCC ACGAAGCTAT TGGAAAGAAA AGAATTTAAA GAATGTGGTG ATCAATTAAA CATGATCGCG  TGCTCGTGGA TACAGTTTAT GATCCATGAT TGGGTTGATC ATATGGAGGA TACGAAACAG GTCGAACTGA GAGCTCCTGA TGAAGTTTCA GAAGGGTGTC CATTGAAGTC ATTTAAGTTC  TTCAAGAATA AAAAAGTTCC CACAGGTTCA TCTGGTACAA GATTTGGATT TCTAAATACA AGAACCCCAT GGTGGGATGG GAGTGTCATA TATGGCAATA ACACAGAGGG CATGGTTAGG  GTGAGAACAT TTACAGATGG AAAATTGAAG ATCTCCAATA ATGGACTTCT TGAACATGAT AGTAATGGTG TTCCTATCTC GGGAGATGTA CGAAATGGTT GGGCAGGCTT CTCACTCTTG  CAAGCCTTGT TTATCAAAGA ACATAACGCC GTCTGTGATA TGCTAAAAGA AAACTATCCC GACCTTGATG ATGAGAAGCT CTATCATCAT GCAAGATTAG TAACTTCAGC AGTTATTGCA  AAAATTCATA CTATTGATTG GACAGTTCAA CTCCTGAAGA CTGATACATT GTTAGCAGGG ATGAGGATCA ACTGGTATGG TTTTCTAGGA AAGAAAGTGA AGGATTTATT CGGACCCAAG  TTTGGACCAA TACTAAGTGG ATTGGTTGGT CTTAGAAGGC CTTTGGATCA TGGAACGCCT TACTCGTTAA CTGAAGAGTT TGTCAGTGTC TACAGAATGC ATTCACTTCT CCCTGAAAAT  TTTCTTCTGA GGGATTTGAA GACATCATCA TCTTCAGCAG ATAAATGCCC GCCAGTTCAA GAAGAGGTTC CTATGAAGGC ACTGGTGGGG AAAGAAGGAG AGAGAAGACT GTCAAGCATT  GGCATGGAAC GGATGCTGGT TTCATTAGGT CATCAAGCGA GTGGAGCTCT CACGCTATGG AATTATCCAT CATGGATGAG GAATCTCATT GCTCACGATA CTAACGGAGA AGACAGGCCG  GATCCTGTTG ACATGGCTGC ACTCGAAATT TATAGAGACA GAGAAAGAGG AGTTGCTCGA TACAATGAAT TCCGAAGAAA CTTGCTGATG ATACCAATTA GCCGGTGGGA AGATTTAACA  GACGATGAAA AAGTAATCGA AGCACTCAGA GAAATCTACG ATGATGATGT TGAGAAACTT GATCTCCAGA TTGGATTACA TGCTGAGAAA CCAATCAAAG GCTTTGCTAT TAGTGAAACT  GCATTCTTCA TATTTCTACT CATTGCATCA AGGAGGCTTG AAGCTGATAG ATTCTTTACG ACAAACTTTA ACGCGAAAAC TTATACAGAG AAAGGATTAG AGTGGGTTAA CAAAACGGAG  TCATTGAAAG AAGTTATCGA TAGACATTTT CCAGATATGA CAAAGAAATG GATGAGATGT GAAAGTGCAT TTTCTGTTTG GAGTTCATCA CCAACACCTA AACATCATTT ACCACTCTAT 
TAGATATGAT TTCTGTATTC TCTGTTCAAC TTTGTATTTT TCAATCACTG TCTTGTCTTG TAACATAATA ACATCCAAAT AAATCAATCT TTGACCGGAA A 

Retrieve as FASTA