Entry information : CroPrx57(CRO_T008816 / cra_locus_18917_iso_2_len_792_ver_3)
Entry ID 11323
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx57(CRO_T008816 / cra_locus_18917_iso_2_len_792_ver_3)
Name CroPrx57(CRO_T008816 / cra_locus_18917_iso_2_len_792_ver_3)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx006]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx57
start..stop
S start..stop
PpePrx26 527 0 27..329 19..321
RcPrx09 525 0 1..329 1..321
VvPrx47 523 0 27..329 22..324
CclPrx45 518 0 1..329 1..322
Literature and cross-references CroPrx57(CRO_T008816 / cra_locus_18917_iso_2_len_792_ver_3)
Protein sequence: CroPrx57(CRO_T008816 / cra_locus_18917_iso_2_len_792_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329
PWM (Da):   %s   35654.16  
PI (pH):   %s   6.66
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEAFPLVALL LQILLLMNYV HIDVIAQGGL KTGFYSSSCP KAESIVRSVV EDHYNKDATI AAGLLRLHFH DCFVQGCDGS VLITGGSAER NALTNGGLRG FEVIDDAKTQ LEASCPGVVS  CADILALAAR DAVDLSGGPS WGVATGRRDG RISLSSEAAN LPSPLDPLSV QRQKFASKGL DDQDLVTLVG AHTIGRTDCL FFRYRLYNFT ATGNADPSIN QAFLTQLQSL CPKNGDPSKR 
VALDKDSEFS FDVSFFKNVR DGNAVLESDQ RLWGDASTRK IVENYAGNIR GLLGFRFNFE FPKAMIKMSN IEVKVGTQGE IRKVCSKVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (5'end is missing). Incorrect prediction
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAT TTCCTTTAGT TGCATTATTA TTACAGATTT TATTACTTAT GAATTATGTT CATATTGATG TAATAGCACA AGGAGGACTC AAAACGGGAT TTTATTCATC ATCTTGTCCA  AAAGCTGAGT CAATTGTTAG GTCAGTTGTG GAAGATCACT ATAACAAAGA TGCTACTATT GCAGCTGGCC TTCTTAGGCT TCATTTCCAT GATTGCTTTG TTCAGGTACC TACTATAATT  ATTGATTTTT TTTTCTTTTT GGGAAAAGTA TAATGACGTC GAGCAGGGTT GTGATGGTTC GGTTCTAATA ACGGGAGGTT CAGCGGAGAG AAATGCATTG ACAAATGGTG GATTAAGAGG  ATTTGAAGTG ATTGATGATG CTAAAACACA ATTAGAAGCT TCTTGCCCTG GTGTTGTTTC TTGTGCTGAC ATACTTGCAT TAGCTGCTCG TGATGCTGTT GACCTGGTAT AATTAATCAT  GCACATTTTA TATTTATGTC CATATTATTA TATTTCTCAT ACTTGTATTA ATGTAATAAC TATAATGAGA TCTAATAATA TATATATAAG ATTATAAACT TAATTAATTA TCTAATGTGA  ATATTATTTT GACGTAAGAA CGAATATACA TCGTAATTAG TTGTTACTAT TATCATAGTA AAAAATGGTG CTTCTGAGTT TGTAAACAAG TGACAGGACT TAATATATAT TTTTCTTACT  AATATCAACT TTACAATATG ATAAGGAGGC CGTTAAGATG GATAAAAACA GAAGTTTTGA ATTCGATTTA TATATTTTTT TTCACATGAA AAAATATCAA CTTTACAATA TGATTTTGCC  TCATGTCATG CACCCTCAAA TTAGTGAGTG CGATTTTTAA GCCTAACCTC ATTTACATTT TCACGCTTAC TATTAGATAA TTTTTTTCAC TTTATTAAAA TAAATATCTT CCAAATAATT  ATAAATATTT AAATTTATAT ACTTATCAAC CCTTCAAATC AACCCAGCGA AAAAAACATA AAATGTATAA TAAAGTAATT CGTTATCTAA TTATAACAAA TATATAATAA GGTAATTCAT  TGTCTAATTA TAATAATAAA GTTGGTGAGG TGTGAATTTT GATATTGTTG TGATGCAGAG TGGGGGTCCG AGTTGGGGAG TGGCTACTGG AAGAAGAGAT GGGAGAATCT CTTTATCCTC  AGAAGCAGCG AACTTGCCTT CACCTTTGGA TCCTCTTTCT GTACAGAGGC AGAAGTTTGC ATCCAAAGGC CTTGATGACC AGGATCTCGT TACCCTAGTT GGTAATTACC ATTTACCCCC  CAGCTAACTC TTCTCAATTT CTTTTTTTAA TTAAGAAGGG TCCTCTTCAG TCCCATTTTT CTCGGAAAAT TCTTAAATCT CGTTAAATAC ATATACACCA AAAAGAACTC AAGTCCATCT  ACTGCATCTT CTATTACATT CTTTAATACA TTTTTTTTAT TACTAACTTT TCTTTAGAAT TTAAAATTTA TATTAATAAA ATTATCATAA AAAATGTATA CAAAACAAAA AAGTATTAGG  TAAGAATCAA CTTTATGTTC TTATGCAAAT TAATCATGGA TCAATCATTT CCCATTCTCT TGAGTAGTTT CGTTTGTTTC AGGGAAAAAA AAAGCGTCTT TTCGTTTGTT AATTATTACT  ACTAATATGA TTCAATAATT TCCTATCCTA AAATAGTGAT GGGATGATGT CCAATAGTTA TAGGCTTAAG AGAAATATTA TAACCAACAT ATGGACCTGT TAGCCCACGA TGTATTTAAA  TAAATGAAGG CCGAAAACGA ACCATAATCC TTCTCCCATG AACCGAGCCT TTAATTAAGG GATAAAAATA AAATTTAGAA TATTCTTTTA TTAATGAATA ATAAATCTTG ATTTTATTGC  ATACTTAAGT AATATAAAAT TAATGTTTTA TTTATTTTGT AATTGAACAT TTTTTTTTTT TTGATAAAAG CTATTATGGA TGAATTTTCA AGAAGTTATG AGATATAAAT ATTTTTATTT  TAGAGTATAA AATTTATTTT GCTACAAAAT TTATTTGATA ATTTATTTTA GAGTATGAAA TATTTATTTA TAATACGATT GAAATCCATA AAATATAAAA GTATGACATT TTGACAAATA  ATATAGATAT TTAGATTTCA GAGTTAAGTT AAAATTTTTT ACTTAAAATC TATAACTATA ATTAATCTTA TATTAAATAA TTAAGTGATT TATAAAATTC TTATCATACA CACTTAAAAT  ATTATCAAAC ACACTTAATT CATTACATTC TTAGCTTATT AATTTTAAGA AATAAAGTAT TTTATCAAAT AGGTCTTAAA GCAAGAATTT TTATAAATAA AAAAAAACCT TTATAATGTT  AAAAGAAGAA TATCAAAAAA TAGTTCTTTT AATCTTCAAA AGTAGATCAG TTTTATTACT TCATCCCATA AACTTTTTCC AACCGTTATG TTCCATAAAC TTGAGAAATA TAAGGACTAT  TTTGATTGCG TAAGTATTCT TCGAGATTAT AATCAGTAAA GAAAAACTTA TCAAATCAAA TGATAAAATT GAAATAACAA TTTTTTCTTA AAAAATGAAG AATTATAAAT AAAATTTTTA  AGTAAGAATG GTAATGGGAC GGATCTAACA GATTACTCAT CTATTCCTTT ACCATTTGTA CTCTTTTAAC CCTAGTTTAA TTGGGGATTC AATTGAGAAA AGAGATAAAT TTTGTATTCA  AATTTGAGGA TGTGATAGGG ACGGGAATTA TGTTCTCTTC ACTCCTACTT GCCCCATCCA TCCTGGGACT AGATTTTATC CCATCCCCAA TTCATTGAGT ATAAATTGAG AATGAAGATT  AATTAAGGAA AGTCGGATTA AGAATGAAGA TAATTTTCAT ACCCAAGCAT ACGAATAGTA TAAGAATATA TTGGAAATGA GAACAAAGTA GAGAAGCGGA AATAGTAGAG AAGTGGAAAT  GGGGTTTGGA GATGGGATCC TCGTCCCCAC CGCCCCATTG CCATTCCTTT TCCTTACTCA TTTTTTTCTT GTAATTTGTA CAGGAGCTCA CACCATCGGG CGGACAGACT GTTTATTCTT  TAGATACAGA CTATACAATT TCACAGCAAC AGGAAATGCA GATCCCAGCA TAAATCAAGC ATTCTTAACA CAACTTCAGT CTCTGTGTCC CAAAAATGGC GACCCTTCGA AACGGGTTGC  TTTAGACAAA GACAGTGAGT TTTCGTTCGA TGTGAGCTTC TTCAAGAATG TGAGGGATGG AAATGCAGTT CTTGAATCTG ATCAGAGGCT TTGGGGAGAC GCTTCCACAC GTAAAATTGT  TGAGAATTAT GCTGGAAATA TTAGAGGTTT ATTGGGTTTT AGATTTAATT TTGAGTTTCC AAAAGCTATG ATTAAAATGA GTAACATTGA AGTCAAAGTT GGAACTCAAG GAGAGATTAG 
AAAGGTTTGC TCTAAGGTAA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAT TTCCTTTAGT TGCATTATTA TTACAGATTT TATTACTTAT GAATTATGTT CATATTGATG TAATAGCACA AGGAGGACTC AAAACGGGAT TTTATTCATC ATCTTGTCCA  AAAGCTGAGT CAATTGTTAG GTCAGTTGTG GAAGATCACT ATAACAAAGA TGCTACTATT GCAGCTGGCC TTCTTAGGCT TCATTTCCAT GATTGCTTTG TTCAGGGTTG TGATGGTTCG  GTTCTAATAA CGGGAGGTTC AGCGGAGAGA AATGCATTGA CAAATGGTGG ATTAAGAGGA TTTGAAGTGA TTGATGATGC TAAAACACAA TTAGAAGCTT CTTGCCCTGG TGTTGTTTCT  TGTGCTGACA TACTTGCATT AGCTGCTCGT GATGCTGTTG ACCTGAGTGG GGGTCCGAGT TGGGGAGTGG CTACTGGAAG AAGAGATGGG AGAATCTCTT TATCCTCAGA AGCAGCGAAC  TTGCCTTCAC CTTTGGATCC TCTTTCTGTA CAGAGGCAGA AGTTTGCATC CAAAGGCCTT GATGACCAGG ATCTCGTTAC CCTAGTTGGA GCTCACACCA TCGGGCGGAC AGACTGTTTA  TTCTTTAGAT ACAGACTATA CAATTTCACA GCAACAGGAA ATGCAGATCC CAGCATAAAT CAAGCATTCT TAACACAACT TCAGTCTCTG TGTCCCAAAA ATGGCGACCC TTCGAAACGG  GTTGCTTTAG ACAAAGACAG TGAGTTTTCG TTCGATGTGA GCTTCTTCAA GAATGTGAGG GATGGAAATG CAGTTCTTGA ATCTGATCAG AGGCTTTGGG GAGACGCTTC CACACGTAAA  ATTGTTGAGA ATTATGCTGG AAATATTAGA GGTTTATTGG GTTTTAGATT TAATTTTGAG TTTCCAAAAG CTATGATTAA AATGAGTAAC ATTGAAGTCA AAGTTGGAAC TCAAGGAGAG 
ATTAGAAAGG TTTGCTCTAA GGTAAATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGGCAT TTCCTTTAGT TGCATTATTA TTACAGATTT TATTACTTAT GAATTATGTT CATATTGATG TAATAGCACA AGGAGGACTC AAAACGGGAT TTTATTCATC ATCTTGTCCA  AAAGCTGAGT CAATTGTTAG GTCAGTTGTG GAAGATCACT ATAACAAAGA TGCTACTATT GCAGCTGGCC TTCTTAGGCT TCATTTCCAT GATTGCTTTG TTCAGGGTTG TGATGGTTCG  GTTCTAATAA CGGGAGGTTC AGCGGAGAGA AATGCATTGA CAAATGGTGG ATTAAGAGGA TTTGAAGTGA TTGATGATGC TAAAACACAA TTAGAAGCTT CTTGCCCTGG TGTTGTTTCT  TGTGCTGACA TACTTGCATT AGCTGCTCGT GATGCTGTTG ACCTGAGTGG GGGTCCGAGT TGGGGAGTGG CTACTGGAAG AAGAGATGGG AGAATCTCTT TATCCTCAGA AGCAGCGAAC  TTGCCTTCAC CTTTGGATCC TCTTTCTGTA CAGAGGCAGA AGTTTGCATC CAAAGGCCTT GATGACCAGG ATCTCGTTAC CCTAGTTGGA GCTCACACCA TCGGGCGGAC AGACTGTTTA  TTCTTTAGAT ACAGACTATA CAATTTCACA GCAACAGGAA ATGCAGATCC CAGCATAAAT CAAGCATTCT TAACACAACT TCAGTCTCTG TGTCCCAAAA ATGGCGACCC TTCGAAACGG  GTTGCTTTAG ACAAAGACAG TGAGTTTTCG TTCGATGTGA GCTTCTTCAA GAATGTGAGG GATGGAAATG CAGTTCTTGA ATCTGATCAG AGGCTTTGGG GAGACGCTTC CACACGTAAA  ATTGTTGAGA ATTATGCTGG AAATATTAGA GGTTTATTGG GTTTTAGATT TAATTTTGAG TTTCCAAAAG CTATGATTAA AATGAGTAAC ATTGAAGTCA AAGTTGGAAC TCAAGGAGAG 
ATTAGAAAGG TTTGCTCTAA GGTAAATTAA TCAAACGCTT AAATGAAAAT GTAAAAAGAC AG 

Retrieve as FASTA