Entry information : CroPrx58(CRO_T010016 / cra_locus_26014_iso_1_len_448_ver_3)
Entry ID 11324
Creation 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2012-09-17 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CroPrx58(CRO_T010016 / cra_locus_26014_iso_1_len_448_ver_3)
Name CroPrx58(CRO_T010016 / cra_locus_26014_iso_1_len_448_ver_3)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Apocynaceae Catharanthus
Organism Catharanthus roseus    [TaxId: 4058 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CroPrx58
start..stop
S start..stop
LePrx80 402 3e-141 60..359 26..324
RcPrx24 395 3e-138 29..359 23..348
HaPrx14 390 2e-136 59..359 23..324
HaPrx03 392 3e-136 60..359 86..388
Literature and cross-references CroPrx58(CRO_T010016 / cra_locus_26014_iso_1_len_448_ver_3)
Protein sequence: CroPrx58(CRO_T010016 / cra_locus_26014_iso_1_len_448_ver_3)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   359
PWM (Da):   %s   39155.72  
PI (pH):   %s   7.17
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRKLVFSLIF LAIFLRTSGI CNAGHGGPSE GRDQGRGWND HGGRGRGRGG DQGHVGQFGL TMNYYRMSCR SDVEAIVRDI VWRNVSANPS LPAKLLRLHY HDCFVRGCDA SILLDSTPGN  QAEKDAGPNR SVTGYELIDF IKETLEKLCP GIVSCADIIA LAARDAVSFQ FQRPMWPVFT GREDGRISQS ADAVAGLPSA SADFATLLAN FNSNGLDIVD LVTLSGAHTI GITHCSLVSR  RLYNFTGNGD TDPTLNPEYV KTLKKICPLP IISSTLVEMD PQSSTNFDNH YYVALKQNEG IFQSDAALLT DPKSVALVQL FQNPSLFFES FARSMIKMGE VGVLINGQGE IRKNCRVVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and EST (3' end is misisng). Also found in CRO_T021489 (only 3' end) and CRO_T012251 (only exon 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAT TGGTTTTTTC ACTTATTTTT CTTGCAATAT TTCTTCGCAC TTCAGGAATT TGCAATGCAG GTCATGGAGG CCCTAGTGAA GGTCGTGATC AAGGTCGTGG CTGGAATGAT  CATGGAGGTC GTGGTCGCGG TCGAGGCGGT GATCAAGGGC ATGTAGGTCA ATTTGGACTT ACCATGAATT ACTACCGTAT GAGCTGCCGA TCAGATGTGG AAGCTATTGT GAGGGACATT  GTTTGGAGAA ATGTCTCTGC TAATCCCAGT TTGCCTGCAA AGTTGCTCAG GCTACATTAC CATGATTGCT TTGTTAGGGT ATTGCAATTG TTACCTTCTC AATTATTTAA AATAAATTAT  TTTTAATTTT TGTTTTTGTA GTTAAAAAAT CCTAGCAATT AAGAACATGA TCATCTGCTT ATTATATCTT TTTTACTTAG AAAACAAAAG AAAATTATAT TTTTTTAATT AAAAAAGTTA  CCATGAAAAT AATTATTGAT ACAGTTAAAA TGAAGGTTTT ATGTTAAGCT TGTTTTATAT AACTTTTCAC AAAAGTTATT TCTTCAGAAG GTCAAGAAAT GTCTTAATTA TGACTAACTC  TCTTTCACAA TGTAGTTTTC TATTGATTTT TTGTTGGAAT TAACGGGTGA GCTTTGGATG GAGTTTATTT TGAAAATTCT TCTTTTTTCA CTTTGGGATT GATCTCTTAT AAACAATTCA  GTTATTACGG ACTTTAAAAT AAAAATCACA AAATAAACTC TAATCCAAGC TATAACTATT TTTATGTAAT TTTTGTTCCA AATTTTTTTT CTTCAAACAT GTTTGATCGT ATAAGTCAAT  GATCTAGGGA AAAATCGACA ATTTCTTTTC TTTTAGACTA TTTTATGCTA AGCTGAATTA ATATTATTAA TTTCAGGGTT GTGATGCATC AATTCTTCTG GATTCAACCC CAGGAAATCA  AGCTGAAAAA GATGCTGGTC CCAATCGATC TGTAACAGGC TATGAATTAA TTGATTTCAT CAAAGAAACA CTCGAAAAAT TATGTCCTGG AATTGTCTCT TGTGCTGATA TTATTGCTTT  GGCAGCTCGA GATGCAGTTT CATTTCAAGT AAGCTTCTAA TGTAATCTTA CCACACTCCA TTGCTATGCA TGTAGCTAAG TTTGTAACAA CCGTCGCAAA AATGATAACA ATTGTAAATG  TGAGGTTTCT AAAAGATATT ACTGTGGATT TACTCCGATA TTTTTTAGAC TTCTTGAGAC AGATGATAGA TATATAAATA GATGTTTCCT ATTGTAGTAA TTTCTATTGG TACTTATCGA  CAATCCCATT TTTTGGTATC ACACCTTTTT GCAGTTCCAA AGGCCAATGT GGnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTATGCATG TAGCTAAGTT  TGTAACAACC GTCGCAAAAA TGATAACAAT TGTAAATGTG AGGTTTCTAA AAAATATTAC TATGGATTTA TTCCGATATT TTTTAGACTT CTTGAGACAG ATGATAGATA TATAGATAGA  TGTTTCCTAT TGTAGTAATT TCTATTGGTA CTTATCGACA ATCCCATTTT TTGGTATCAT ACTTTTTTTG CAGTTCCAAA GGCCAATGTG GCCAGTCTTC ACCGGTAGAG AAGATGGAAG  GATTTCGCAA TCGGCCGATG CAGTAGCAGG CTTGCCATCA GCATCCGCAG ATTTTGCAAC CCTCTTGGCT AATTTTAATA GTAATGGTTT AGACATTGTG GACCTTGTGA CTTTGTCAGG  TAATTATATA TCTCTCTTAT CAAAGTAAAT TACTATTATT TCTCTTAATA AGATAGTAAT TTAATGCAAA AAATATTCTC TCAGTTCACA TTTTATACTG TGATATATGA AAAAATACAT  ATTATCCCAA GAGAATTCCT TATATATTGT CCAATGACGG GCCAAAAAGG GCCATCAATT TCTTTGAAAA TCTTTTATGT AATAAGTAAT ATATTTATTT TATATTAAAA ATTAGTAATT  TACCTAATCA CTATACAAAT ATTTTAAAAA GATGAACGTA ATAAATTTTG TGCACTAGTT TTTCTTATTC CATGATGTTT TAATACCTTA GTAGAATAGT GTAAATATAC TTACATTTAT  TTTGGCTAAA AAAAATGATA TATAACTTTT TTTCATATGA ATTTTTGATT CATAGACTTA CCTGTTTGAT TTCGCCCTGA TCCGATAGTA GATTCTCTTT TTTCTTTTAA TATACATGAG  ACTAGAGATA TATAAACTAT ATATAACTAA TAAGTTTTAT GAATTATTTG TAGGGGCACA TACAATTGGA ATAACACATT GTTCATTGGT ATCAAGAAGA CTCTATAATT TCACAGGAAA  TGGAGACACA GATCCTACTC TTAACCCTGA ATATGTTAAA ACCTTAAAGA AAATATGTCC GCTTCCTATT ATTTCGTCCA CCCTAGTGGA AATGGACCCT CAAAGTTCCA CAAATTTTGA  CAACCATTAT TATGTGGCTT TGAAACAAAA TGAAGGAATT TTTCAATCGG ATGCTGCCTT ATTAACAGAT CCTAAATCTG TTGCTCTTGT ACAACTCTTC CAAAACCCTA GTTTATTCTT 
CGAAAGTTTT GCTCGTTCAA TGATTAAAAT GGGAGAAGTT GGTGTTCTTA TCAATGGGCA AGGTGAGATA AGAAAGAATT GCAGAGTTGT TAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAT TGGTTTTTTC ACTTATTTTT CTTGCAATAT TTCTTCGCAC TTCAGGAATT TGCAATGCAG GTCATGGAGG CCCTAGTGAA GGTCGTGATC AAGGTCGTGG CTGGAATGAT  CATGGAGGTC GTGGTCGCGG TCGAGGCGGT GATCAAGGGC ATGTAGGTCA ATTTGGACTT ACCATGAATT ACTACCGTAT GAGCTGCCGA TCAGATGTGG AAGCTATTGT GAGGGACATT  GTTTGGAGAA ATGTCTCTGC TAATCCCAGT TTGCCTGCAA AGTTGCTCAG GCTACATTAC CATGATTGCT TTGTTAGGGG TTGTGATGCA TCAATTCTTC TGGATTCAAC CCCAGGAAAT  CAAGCTGAAA AAGATGCTGG TCCCAATCGA TCTGTAACAG GCTATGAATT AATTGATTTC ATCAAAGAAA CACTCGAAAA ATTATGTCCT GGAATTGTCT CTTGTGCTGA TATTATTGCT  TTGGCAGCTC GAGATGCAGT TTCATTTCAA TTCCAAAGGC CAATGTGGCC AGTCTTCACC GGTAGAGAAG ATGGAAGGAT TTCGCAATCG GCCGATGCAG TAGCAGGCTT GCCATCAGCA  TCCGCAGATT TTGCAACCCT CTTGGCTAAT TTTAATAGTA ATGGTTTAGA CATTGTGGAC CTTGTGACTT TGTCAGGGGC ACATACAATT GGAATAACAC ATTGTTCATT GGTATCAAGA  AGACTCTATA ATTTCACAGG AAATGGAGAC ACAGATCCTA CTCTTAACCC TGAATATGTT AAAACCTTAA AGAAAATATG TCCGCTTCCT ATTATTTCGT CCACCCTAGT GGAAATGGAC  CCTCAAAGTT CCACAAATTT TGACAACCAT TATTATGTGG CTTTGAAACA AAATGAAGGA ATTTTTCAAT CGGATGCTGC CTTATTAACA GATCCTAAAT CTGTTGCTCT TGTACAACTC  TTCCAAAACC CTAGTTTATT CTTCGAAAGT TTTGCTCGTT CAATGATTAA AATGGGAGAA GTTGGTGTTC TTATCAATGG GCAAGGTGAG ATAAGAAAGA ATTGCAGAGT TGTTAATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAAAT TGGTTTTTTC ACTTATTTTT CTTGCAATAT TTCTTCGCAC TTCAGGAATT TGCAATGCAG GTCATGGAGG CCCTAGTGAA GGTCGTGATC AAGGTCGTGG CTGGAATGAT  CATGGAGGTC GTGGTCGCGG TCGAGGCGGT GATCAAGGGC ATGTAGGTCA ATTTGGACTT ACCATGAATT ACTACCGTAT GAGCTGCCGA TCAGATGTGG AAGCTATTGT GAGGGACATT  GTTTGGAGAA ATGTCTCTGC TAATCCCAGT TTGCCTGCAA AGTTGCTCAG GCTACATTAC CATGATTGCT TTGTTAGGGG TTGTGATGCA TCAATTCTTC TGGATTCAAC CCCAGGAAAT  CAAGCTGAAA AAGATGCTGG TCCCAATCGA TCTGTAACAG GCTATGAATT AATTGATTTC ATCAAAGAAA CACTCGAAAA ATTATGTCCT GGAATTGTCT CTTGTGCTGA TATTATTGCT  TTGGCAGCTC GAGATGCAGT TTCATTTCAA TTCCAAAGGC CAATGTGGCC AGTCTTCACC GGTAGAGAAG ATGGAAGGAT TTCGCAATCG GCCGATGCAG TAGCAGGCTT GCCATCAGCA  TCCGCAGATT TTGCAACCCT CTTGGCTAAT TTTAATAGTA ATGGTTTAGA CATTGTGGAC CTTGTGACTT TGTCAGGGGC ACATACAATT GGAATAACAC ATTGTTCATT GGTATCAAGA  AGACTCTATA ATTTCACAGG AAATGGAGAC ACAGATCCTA CTCTTAACCC TGAATATGTT AAAACCTTAA AGAAAATATG TCCGCTTCCT ATTATTTCGT CCACCCTAGT GGAAATGGAC  CCTCAAAGTT CCACAAATTT TGACAACCAT TATTATGTGG CTTTGAAACA AAATGAAGGA ATTTTTCAAT CGGATGCTGC CTTATTAACA GATCCTAAAT CTGTTGCTCT TGTACAACTC  TTCCAAAACC CTAGTTTATT CTTCGAAAGT TTTGCTCGTT CAATGATTAA AATGGGAGAA GTTGGTGTTC TTATCAATGG GCAAGGTGAG ATAAGAAAGA ATTGCAGAGT TGTTAATTAA 

Retrieve as FASTA