Entry information : EguAPx-R[P]
Entry ID 11379
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-01-22 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-05-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguAPx-R[P]
Name EguAPx-R[P]
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguAPx-R[P]
start..stop
S start..stop
EguAPx-R 158 7e-50 1..78 113..190
EgrAPx-R 158 8e-50 1..78 113..190
EglAPx-R 158 8e-50 1..78 113..190
EcamAPx-R 156 3e-49 1..78 112..189
Literature and cross-references EguAPx-R[P]
Protein sequence: EguAPx-R[P]
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   78
PWM (Da):   %s   8405.5  
PI (pH):   %s   10.06
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2

MIKEEVRKVV SKVKAAGVLR LVFHDAGTFE MGENSGGMNG SIVYELERPE NAGLKKPVKV LEKAKGEVDA KRPVSWAD 

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Remarks Pseudogene from genomic (Short PS).
scaffold_3_8466 (8565..12009)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATAAAGG AAGAGGTCAG AAAGGTAGTT TCCAAGGTGA AGGCTGCTGG TGTGCTTCGT TTGGTATTTC ATGATGCTGG AACCTTTGAA ATGGGTGAAA ATTCAGGGAT TTTACATGGA  CAGAAAGTTA AAGTACTACA AATAATGATA CTCGACATCA GTAACTGTGC TCCATATCTC TGGCTACAAT TTTTGAATGC CTACTAATCG ATCCAAATTG TTTTATCCTC TTTTCCCCAT  AATTGAACTT TTGAGCTGAA GCTAAGATGA TGCATATATT GATTTCATCT GAATTAGGGG GGTATAGCTC TCATTTGCCA AAAAAGTTAG ATAATCCCTG TAAATGGGCA TAACTTTTTT  TTTATCATGG TGGTTAACTA AATGAGCAAG GGCGAGTAAT TCTATGACTG TTAAAGCAAC TACAGACTCT AATGGACCTT ATAAGTGAAT GATCGATCAT AGAGAGCAGT ATCATTCATA  CTACCTGTAT TTGTGAACGG TCATGTCCGA TTCTTTTAAT GCATGCACAT ACTTCTTTTG AGTTGAAATT TTTCTGCGTC ATGTCCTTTT GTCTGAGTAT GGATTTCAAT CCTCACATTG  TAATTCTAAT ATGTTTTTGT GTCAATATCC AGGTGGTATG AATGGTTCCA TAGTTTATGA ACTTGAAAGG CCTGAAAATG CTGGGCTAAA AAAGCCTGTG AAGGTATGTT TTCTTTTATT  GTTACATCCT CAAGTTTAGC ATCCATTCTG GAGATGCAAC ATTTCATTTC AACTAGTGTA CTCCCTCATG TATTTCTAGG CTGCTAGAAG TTCCTGTATA TTATATCTGG AACAGTCAAC  TCGGGTTCAT CTTCAGGCTA ACTCGTCAGT CATTGTGTTA TTGTTTAGAT ACTAGAGAAA GCAAAGGGTG AGGTGGATGC AAAAAGACCA GGTGATTTTT TTTAGTGTTA TATTCTATAT  GCTGATAGTA TGATTGTGGT GATATAGATG GAACTTTCCT CTCTCAGTAT CCTGGGCGGA CATAACTATA TGTCTCATAA CTCTCGTGAG TGTCATAACT TCTTCTTTTT TCGATCAGTT  GAGTGTCATA ATTTTTAATA AATGTTTATT ACAAGTGCTA TGTTGCATCA AATTTTCAAC ATTTAGGTAT TTGAAATTAC GATACTCATG TGGTTGAAGA AAATGTTATA GCATTCAATT  GAGCGTTGTA GAAAAATTAA ATTTATCACA AAAGTACTAA TTTAGAGTTT TTGATTGTCA AAATATTAAT TTAAGATAGA TTTGTCATnT ATGTACTAAT TTGAGATTTT TTGTGATATT  AACTCTTTTT TCACGGGAGA TGTTATGCTG AATTTAGTCC AACATGAATT GAGTTATTTA AGTnGTCnGG TACGATGGCA AACATGGGGG CAACTTACCC AATGATACCC AGAGAACTCA  TCTGCTTCCA CATATAAAAn GTTCTTGACC ACTTCTTGAA AGTCATCTCC AGGAATCCCA TAATGCTTCA nTCAAAACCC TCAGTCAACA TAACATTACA TTTTTACATT ACCTTATGAC  TAAAGCGTAA TAGCATGACC ATCCAACTnC CCTTCGGCAA TTTGCATAAA AAACCCAAAG CCAAATCAGA TTTTTGAAGA AAACCAAATC nAATCAAACC ATATTGACAT CCCTATTCCA  ACAATGTGAT TGCTTTATGA CAAATCCGAC AAAGCAAACC TAACGTGCCA CTGAGATTTG CCCAGAATTC ATATTTTTAT GCTAAAGATG GCGAGTGTTT TCAACCCCCA TCGTCCACAA  GAAATCTTAG CCAGCTCTTC TGTGAACATC TGACTTTGAC CCATCAATTG GGTGATAACT TAGGGAGACG ACATGTAAAG TTCATCCTCA CGAGCCATAA TATATGACAT CACAGACTTn  TTTGTTTACT TTAGTCACAT TTCTTTCTAn GAAAATTTCA AATAAAAGGA AAATATTTTT CATGAAAATC ATTTAAATAG TGnTTTCCAT TTTTTTTGTA ATTTAAGAAA AGTnGTTTCA  TTCTCATTAG AAAGGAAATn ATTTTCCTCC AATTTAAACT CATTGTTTTC TATGTATATA AAAnGTTATT TTGTAAAGCA ATCAATTTTC CGTTATCAAA ACATTGGAAA ATTGGAAAAC  AATTTCCTnn AAACAGTTTT CCTTCACGAA AAATAAACGA TTTGGAAAAT nTTTTTTTGA AAAnTAATAG TTTATAGTGC TCATAAAAAT GTTAAACGAA AAGTnTCTTT ATGGTCCACA  AAAACATATG GACGTAAATT ATTATTGATA ATGAAnTTTT TTTTTATTAA TTAATTATTT CAAGTGATAT CTTTTAAGAA ATTATTTTAT AAATCATTCA TTTTTGTGAA ATAAACAnAC  TCTTTTCATT ATTTCTTAGA GATTGTGACT TTTGGTAAAA GGGTCCGACG ACAATTTAAG AAATTCTGGC ATAGCCCAAC ATATCCTTTT ATTGAGTCAA GGATGCCACG CGCATCATTG  ATCGCCTCTC CTCATTTCAA ATnCACCGAT GTTGACTCAT TACCTGATCG TGAGGCATCG ATAGGGTTTT TCCTCTCGnT CAAGGGGACA TCCCTAATTG CCACCTGGGG TCACTTTCAT  CACATGCAAC TAGTTGACTT TTGAAAGTGT CACTTCATCC ACTATTTCCA AGTAGCGAGA ACAACGTAAG GCTGCATTTG ATTnTGTTTT GAAAATTGAT TTTGAAAAAT TATAAATGCT  TGAAAAAATG CATATTGTGT TTGGTAAAAA TTCCTTAACA AAGTAACTTT AGGTTAAGTA GTATTTGGCA AAACAATTTA CAAAGAGCTT TGGCTGTAAT TTTTCTATTG AAGAACAAAT  TAAATCGTTT GCTAACTCCn GnAAAGGGTT TAGCCCACTG TTGAGTTAGG TCTGGCGTGG GCnGCTGAGG TnGCATGACC TCAAnGGCCA TCGCTTAAGG TAACCGACAA GCCCAAGCTG  CnACTAGTGT TGCGCTACCT ATGGTGATCG CTGATGGCAC GTGnCCCCnG TCAACACTTG GGCTTGCnGG CGACCAACCT CAATATGTCC TTAACGAGGG TAAAGGGGGA ATACAAGAAA  GCTAGTGAGG GTAGAATGGG AAGAAAAAAA nTCATTAAAA TCTCTCnAGA TAGCnTTTTG AAAATGCTAA AAACCTAAGG CAAGCGGGnA CCTACCTTAT GCTTTCATCC TnCTAAGGCT  AACTTTCAAC CCCAAAACTT TTTAAGAATA GTTGCnAAAC AGCTCAAATT TTCCCTAAAG GGCTAGGCAC TCAAGGATTT TTAAAATGCT GAACCAAAnA CACCTTATGA TTTTTCATAT 
AATGAGAAAA CCTACCTTAA ATAGGTAAAT TnCGGGCCCC TAATATGCCC TAGGTATCTA TTAATTTCAT GGACnAGGTA AGGCA 

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