Entry information : EguKat[P]05
Entry ID 11402
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguKat[P]05
Name EguKat[P]05
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguKat[P]05
start..stop
S start..stop
EgrKat[P]05 619 0 1..321 1..321
EglKat[P]05 575 0 1..321 1..310
EcamKat03 541 0 1..321 137..466
VvKat02 526 0 1..321 141..470
Literature and cross-references EguKat[P]05
Protein sequence: EguKat[P]05
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321
PWM (Da):   %s   35934.16  
PI (pH):   %s   8.65
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
PVFFIRDGKP NPKSHVQENW RILDVLAYHP ESLGMFTLLF DDTGIPQDYR NMKGSGVNTY ALINKARKAH YVKFHWKRTC GVKSLLEEEA IRVGGSNHSL ATRDLFDSIA AGNYLEWKLF  VQIMDTDYKx KFDFDPLDVA KTWPEDILxP LMxVGRLVLx KNIDNFFAEN EQLAFCPSxV VPGVYYSxDK LxQIRIFSYS DAQRDRLAPN YLQLPSNAPK CAHHNSHHEG FMNCLISLLQ 
INYFPSxYxP VRHAERYPIP TAMLTGKREK GMIEKENNFK QPGERYRSRA PDRQxRFICR WIDALSEPRM THExHSIWIS Y 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene sequence from genomic (Both 5' end and 3' end are missing). Scaffold_6_22057 (72..1598)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCGTCTTCT TTATCCGTGA TGGGAAACCA AACCCCAAAT CCCACGTCCA GGAGAACTGG AGGATCCTTG ACGTTCTCGC CTACCATCCC GAGAGCTTGG GCATGTTCAC CCTCCTCTTT  GATGATACTG GTATTCCACA AGATTACAGG AACATGAAGG GCTCTGGAGT TAACACCTAC GCTTTGATCA ACAAGGCCAG AAAAGCGCAT TATGTGAAGT TTCACTGGAA ACGAACTTGC  GGGGTCAAGA GCTTACTGGA GGAAGAGGCG ATTAGAGTCG GGGGATCCAA TCACAGCCTT GCGACTCGGG ATCTTTTTGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCTTGAATG GAAACTTTTC  GTTCAGATCA TGGATACTGA TTATAAAnAC AAATTTGACT TTGACCCGCT TGATGTGGCT AAGACCTGGC CCGAAGACAT ATTGCnnCCC CTAATGCnAG TTGGnCGCTT GGTCTTGAnT  AAGAACATTG ATAACTTCTT TGCTGAGAAT GAACAGCTTG CATTTTGCCC TTCAAnTGTG GTTCCTGGCG TCTACTACTC AGAnGATAAG CTGCnCCAAA TTCGTATTTT CTCATATTCT  GATGCTCAGA GGGACCGCCT TGCACCAAAT TATCTTCAAC TCCCTTCTAA TGCTCCTAAA TGCGCTCATC ACAACAGTCA CCATGAAGGT TTCATGAATT GCCATGCATA GGATGAAGAG  GTAAGAATTT TCTTTGAATC CTTCCTnAGC AATACTCTGG CAGCATCTCT TGTGnATTTT TTGTTGATGT AACCAAGTTA GACATCACGC TCTCCTATAA GTATGAAGGC CTAGTGATGC  ATTCTGACAT GTCAATTGTG GATCCCAAAG TGGCGGTGCG AACCCTCCTT TTGTTnGAGG ATTACTTTCT TGATTTTTCT ACTGCCCTTT GTGCCTGAAA CATGCATGTT TACATATGTA  GGAAATACCT TTCTGCTATC ATGTAAAATG ATTATCTGTT GAGCAAATGT TTAATTTCCC TTTTGCAGAT AAACTATTTT CCTTCAAGnT ATnATCCnGT TCGTCATGCn GAGAGATATC  CCATTCCAAC TGCTATGCTG ACTGGAAAGC GTGAAAAAGG TATGTTTTGT AGGATCTCTT TTACTTGGAT AGAGATTGAT TGTCCTGAGG TGCTTTCATG GTGATATCCA TGGGATATAC  TCAACTTGTC CTAGATGATC AATTGAATTG CAGnGAGTGG TATGACTGAT GTATGTGTGT TTGGATCTTG TTATCTTTTG TTTCTCCTGG CAGACCAACA TTGAGAAAGA GAACAACTTC  AAGCAGCCTG GAGAGAGATA CCGATCAAGG GCGCCTGACA GGTATTCTTC AGTTGTGCAT CTCCTGAAAA TGGTTTGATT GTCTCATGTT TCTCAATAAT CTGTCTCTAT CTTTCTTTTC 
TCAGGCAAGA nCGGTTCATC TGCCGATGGA TCGATGCTTT GTCTGAACCA CGTATGACTC ATGAGnTCCA CAGCATCTGG ATTTCATAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCGTCTTCT TTATCCGTGA TGGGAAACCA AACCCCAAAT CCCACGTCCA GGAGAACTGG AGGATCCTTG ACGTTCTCGC CTACCATCCC GAGAGCTTGG GCATGTTCAC CCTCCTCTTT  GATGATACTG GTATTCCACA AGATTACAGG AACATGAAGG GCTCTGGAGT TAACACCTAC GCTTTGATCA ACAAGGCCAG AAAAGCGCAT TATGTGAAGT TTCACTGGAA ACGAACTTGC  GGGGTCAAGA GCTTACTGGA GGAAGAGGCG ATTAGAGTCG GGGGATCCAA TCACAGCCTT GCGACTCGGG ATCTTTTTGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCTTGAATG GAAACTTTTC  GTTCAGATCA TGGATACTGA TTATAAAnAC AAATTTGACT TTGACCCGCT TGATGTGGCT AAGACCTGGC CCGAAGACAT ATTGCnnCCC CTAATGCnAG TTGGnCGCTT GGTCTTGAnT  AAGAACATTG ATAACTTCTT TGCTGAGAAT GAACAGCTTG CATTTTGCCC TTCAAnTGTG GTTCCTGGCG TCTACTACTC AGAnGATAAG CTGCnCCAAA TTCGTATTTT CTCATATTCT  GATGCTCAGA GGGACCGCCT TGCACCAAAT TATCTTCAAC TCCCTTCTAA TGCTCCTAAA TGCGCTCATC ACAACAGTCA CCATGAAGGT TTCATGAATT GTTTAATTTC CCTTTTGCAG  ATAAACTATT TTCCTTCAAG nTATnATCCn GTTCGTCATG CnGAGAGATA TCCCATTCCA ACTGCTATGC TGACTGGAAA GCGTGAAAAA GGTATGATTG AGAAAGAGAA CAACTTCAAG  CAGCCTGGAG AGAGATACCG ATCAAGGGCG CCTGACAGGC AAGAnCGGTT CATCTGCCGA TGGATCGATG CTTTGTCTGA ACCACGTATG ACTCATGAGn TCCACAGCAT CTGGATTTCA 
TAT 

Retrieve as FASTA