Entry information : EguKat[P]06
Entry ID 11407
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2013-03-13 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-03-25 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguKat[P]06
Name EguKat[P]06
Class Catalase     [Orthogroup: Kat001]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguKat[P]06
start..stop
S start..stop
EguKat[P]08 767 0 1..402 1..398
EgrKat[P]06 723 0 1..402 1..422
EgrKat[P]08 718 0 1..402 1..420
EglKat[P]08-2 672 0 1..402 1..411
Literature and cross-references EguKat[P]06
Protein sequence: EguKat[P]06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   400
PWM (Da):   %s   43863.58  
PI (pH):   %s   7.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASEVTSPLA SRQLSFRVKA YWSFLAFHPY TSFCCWCVAI SMCIGRNCSS VVHARGACAK GFFEVTHDIS HLTHADFLQA PGVQTPVTVR FSILIHERGG PETLRDPRGS xVNFYTRxEG  NFDLVGNNFP IFFIRxGMKF PDMVRALRPN PKSRVQENWR ILDFFFHHPE SLRLFTFLFD DxxSAQDYRH MQGSGVNTYT LINQLAGQEL AGGRGN*SRG IQSQPCNSGF xDSIAAGNYP  EWKLFVQIVN PDHEDNFDFG PLDGAKTWPE DILPLMPVGR LVLNRNIDNF FAENEQLALH FxPSIVVPGV YDSDxDxKLL QPxPxSPPNT RKCAHHNNHP EGFTNFMHRD EEINYFPSRx 
xPVCHGERYP IPPAMLTGKH EKTIIEKENN FKQLGERCRS *

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (3' end is missing, Stops in frame). Scaffold_6_22058 (122..2288).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC AGTCGTCAGC TATCATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTAT ACATCATTCT GTTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTGCTCGGTG AACTACTCTG AGTCAAGGCA TAAACTAACC AAATTCATCA AGACACAGTA GAACCTAATT TTAGAGTAAC GCTAAACGTG GAATATGCTT  ATGGCAAACT ATCATCTACG TCATAGGTCC AATTCTTCTT GACGATTATC ACCTCnTGGA GAAACTTGCC AACTTTGATA GGGAGAGGAT TCCATAGAGT GTTGTCCATG CCAGGGGAGC  CTGCGCAAAG GGATTCTTTG AGGTCACTCA TGACATTTCT CACCTTACCC ATGCCGATTT CCTTCAGGCA CCAGGAGTTC AAACACCTGT GACTGTCCGT TTCTCCATCC TCATCCACGA  AAGGGGCGGC CCTGAAACCC TGAGGGACCC CCGGGGTTCT CnTGTGAACT TCTACACnAG AnAGGTGAGG GTCGTTTTGG TAGTAGACAT GAATGTGCAG TATGGACGGG CATGAGTATG  ATGCTCCCTG TGATGAATCC TTTCACGGGT GGCCTAAACT CGACCnATGC ATATGGCAGT TCTCTTGTCC ACATTGCATA CATTTGTTTT GnTGCACTTT GCTATGTGAT CTTACCTTTT  CTGTnACTGC AGGGTAACTT TGATCTGGTA GGAAACAATT TCCCTATCTT CTTTATCCGC nATGGGATGA AATTCCCGGA TATGGTTCGT GCACTTAGAC CAAACCCCAA ATCCCGCGTC  CAGGAGAACT GGAGGATCCT TGACTTTTTC TTCCACCATC CCGAGAGCTT GCGCTTGTTC ACCTTCCTCT TTGATGATAT nnnnAGTGCA CAAGATTACA GGCACATGCA GGGCTCTGGA  GTTAACACCT ACACTTTGAT CAACAAGGCC AGAAAAGCGC ATCATGTGAA GTTTCACTGG AAACCAACTT GCGGGTCAAG AGCTTGCTGG AGGAAGAGGC AATTAGAGTC GGGGGATCCA  ATCACAGCCA TGCAACTCAG GATTTTnTGA TTCCATTGCT GCTGGAAACT ATCCTGAATG GAAACTTTTC GTTCAGATTG TCAATCCTGA TCATGAAGAC AACTTCGACT TTGGCCCACT  TGATGGGGCT AAGACCTGGC CCGAGGACAT ATTGCCCCTA ATGCCAGTTG GCCGCTTGGT CTTGAATAGG AACATTGATA ACTTCTTTGC TGAGAATGAA CAGCTTGCAT TGCATTTTGC  nCCTTCAATT GTAGTTCCCG GCGTCTACGA TTCGGATnnn GATnnnAAGC TGCTCCAAAC TCGTCATCTC ATATTCTGAT ACTCGGAGGC ACTGTCTTGG ACCAAAATAT CATCAACTCC  CACCCCCCCC nnnCCCnCCT CCCCCCCCAA TACTCGTAAA TGCGCTCATC ACAACAATCA CCCTGAAGGT TTCACGAATT TCATGCATAG GGATGAAGAG GTAAGAATCG TCTTAGAATA  CTTCAGCAGC GATGCTCTGG GCAGCAnCTC TTGTGGATTT TTTGTTGATG TAACTnGACA TCGTGCTTTC CTATAAGCAT GTAGGCGTTG TnATGCAATC TGACATnTCA AnTGCGGATC  CTAAAGTGGC AGTGCGAATG TCCTCCCTCC TTTTGAnGAA GATTACTTTC TTAATTTTGC AAATGCACTA TGnACCTGAA ACATnCATAC ATGTTTACAT ATGTAGGAAA TGCCTnTCTG  CTATTATGTA AAATGATTAT CTGTTGAGCA AATGCTTAAT TTCCCTnTTG CAnATAAACT ATTTTCCATC AAGGTAnnAT CCCGTTTGTC ATGGAGAGAG GTATCCCATT CCACCTGCTA  TGCTGACTGG AAAGCATGAA AAGGTGTGTT TTTAGTTAGG ATCTCTTTTA CGTAAACAGA GATTGATTGT CTTGAGGTGC TTTCATGGCG ATGTCCATGG GATAGACTCA GCTTGTCCTA  GATGATCAAT TGAATTGCAG TGAGTAGTGC GACTGATGTA TGTGTTTGGA TTTTnTTTAC TTTTGTTGCT CCAAACAGAC CATCATTGAG AAAGAGAACA ACTTCAAGCA GCTCGGAGAG 
AGATGCCGAT CATAGACA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAGTG AGGTCACCTC ACCTCTGGCC AGTCGTCAGC TATCATTCCG AGTCAAGGCA TATTGGAGTT TTCTGGCTTT TCATCCTTAT ACATCATTCT GTTGTTGGTG TGTAGCCATT  AGCATGTGCA TAGGAAGAAA TTGCTCGAGT GTTGTCCATG CCAGGGGAGC CTGCGCAAAG GGATTCTTTG AGGTCACTCA TGACATTTCT CACCTTACCC ATGCCGATTT CCTTCAGGCA  CCAGGAGTTC AAACACCTGT GACTGTCCGT TTCTCCATCC TCATCCACGA AAGGGGCGGC CCTGAAACCC TGAGGGACCC CCGGGGTTCT CnTGTGAACT TCTACACnAG AnAGGAGGGT  AACTTTGATC TGGTAGGAAA CAATTTCCCT ATCTTCTTTA TCCGCnATGG GATGAAATTC CCGGATATGG TTCGTGCACT TAGACCAAAC CCCAAATCCC GCGTCCAGGA GAACTGGAGG  ATCCTTGACT TTTTCTTCCA CCATCCCGAG AGCTTGCGCT TGTTCACCTT CCTCTTTGAT GATATnnnnA GTGCACAAGA TTACAGGCAC ATGCAGGGCT CTGGAGTTAA CACCTACACT  TTGATCAACC AACTTGCGGG TCAAGAGCTT GCTGGAGGAA GAGGCAATTA GAGTCGGGGG ATCCAATCAC AGCCATGCAA CTCAGGATTT TnTGATTCCA TTGCTGCTGG AAACTATCCT  GAATGGAAAC TTTTCGTTCA GATTGTCAAT CCTGATCATG AAGACAACTT CGACTTTGGC CCACTTGATG GGGCTAAGAC CTGGCCCGAG GACATATTGC CCCTAATGCC AGTTGGCCGC  TTGGTCTTGA ATAGGAACAT TGATAACTTC TTTGCTGAGA ATGAACAGCT TGCATTGCAT TTTGCnCCTT CAATTGTAGT TCCCGGCGTC TACGATTCGG ATnnnGATnn nAAGCTGCTC  CAACCCnnnC CCnCCTCCCC CCCCAATACT CGTAAATGCG CTCATCACAA CAATCACCCT GAAGGTTTCA CGAATTTCAT GCATAGGGAT GAAGAGATAA ACTATTTTCC ATCAAGGTAn  nATCCCGTTT GTCATGGAGA GAGGTATCCC ATTCCACCTG CTATGCTGAC TGGAAAGCAT GAAAAGACCA TCATTGAGAA AGAGAACAAC TTCAAGCAGC TCGGAGAGAG ATGCCGATCA 
TAGACA 

Retrieve as FASTA