Entry information : EguPrx155
Entry ID 11463
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-12-13 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguPrx155
Name EguPrx155
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguPrx155
start..stop
S start..stop
EgrPrx155 682 0 1..339 1..339
PpePrx18 484 5e-174 33..339 21..326
CclPrx36 480 2e-172 33..339 22..327
GhPrx27 474 6e-170 5..339 3..326
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1782..2798 1017  
complement(join(1782..2798))


exon

Literature and cross-references EguPrx155
Protein sequence: EguPrx155
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (304)
PWM (Da):   %s   36598.6 (33171.7)  
PI (pH):   %s   8.9 (8.70) Peptide Signal:   %s   cut: 36 range:36-339
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSPPPSPPPR CPALLRIAPL LLAVLLASSA APAASRLTAD YYAKSCPRFH QIVQDTVTSK QISTPTTAAA TLRVLFHDCF GTGCDGSILL SAAPLAPPPE RDADINLSLP GDAFDLVVRA  KTALELACPG TVSCSDILVV ATRDLVTMLG GPYYDVFLGR RDTRISRASL VAGLLPRPNM TMSELLSLFG ARGFSAQEMV ALAGAHTVGF SHCKEFSSGI YGFSKSSSYD PTYNPRFAQG 
LQKACASYGK DPTLSVFNDV MTPNKFDNMY YQNLPKGLGL LASDRGLYGD PRTRPFVEMY ARDQDRFLKD FARAMQKLSL YGVQTGRRGE IRRRCDAVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (no intron).
scaffold_10_34837 (2798..1782)
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGCCGC CGCCGTCGCC GCCGCCGCGC TGCCCGGCTC TCCTCCGCAT CGCGCCGCTC CTCCTCGCCG TCCTCCTCGC CTCCTCCGCC GCGCCCGCCG CCTCCCGCCT CACCGCCGAC  TACTACGCCA AGTCCTGCCC GCGCTTCCAC CAGATCGTCC AGGACACCGT CACCTCCAAG CAGATCTCCA CCCCCACCAC CGCCGCCGCC ACCCTCCGCG TCCTCTTCCA CGACTGCTTC  GGCACAGGCT GCGACGGCTC CATCCTCCTC TCCGCCGCGC CCCTCGCCCC GCCCCCGGAG CGCGACGCCG ACATCAACCT CTCCCTCCCC GGCGACGCCT TCGACCTCGT CGTCCGCGCC  AAGACCGCCC TCGAGCTCGC CTGCCCCGGC ACCGTCTCCT GCTCCGACAT CCTCGTCGTC GCCACGCGGG ACCTCGTCAC CATGCTCGGC GGCCCCTACT ACGACGTCTT CCTCGGCCGC  CGCGACACCC GGATCTCCCG CGCCTCCCTC GTCGCCGGGC TCCTCCCGCG GCCCAACATG ACCATGTCGG AACTCCTCTC CCTCTTCGGC GCCCGCGGGT TCTCCGCCCA GGAGATGGTG  GCCCTCGCCG GCGCCCACAC CGTGGGGTTC TCCCACTGCA AGGAGTTCAG CTCCGGGATC TACGGCTTCA GCAAGTCCTC CTCCTACGAC CCGACCTACA ACCCGCGGTT CGCGCAGGGG  CTGCAGAAGG CCTGCGCCTC CTACGGCAAG GACCCGACGC TCTCGGTGTT CAACGACGTG ATGACCCCCA ACAAGTTCGA CAACATGTAC TACCAGAACC TGCCCAAGGG GCTGGGCCTG  CTGGCGTCGG ATCGGGGGCT GTACGGCGAC CCCAGGACGA GGCCGTTCGT GGAGATGTAC GCCAGGGATC AGGACCGGTT CTTAAAAGAC TTCGCGAGGG CGATGCAGAA GCTGAGCCTC 
TACGGGGTCC AGACCGGGAG GAGGGGCGAG ATCAGGCGAA GGTGCGATGC CGTCAAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGCCGC CGCCGTCGCC GCCGCCGCGC TGCCCGGCTC TCCTCCGCAT CGCGCCGCTC CTCCTCGCCG TCCTCCTCGC CTCCTCCGCC GCGCCCGCCG CCTCCCGCCT CACCGCCGAC  TACTACGCCA AGTCCTGCCC GCGCTTCCAC CAGATCGTCC AGGACACCGT CACCTCCAAG CAGATCTCCA CCCCCACCAC CGCCGCCGCC ACCCTCCGCG TCCTCTTCCA CGACTGCTTC  GGCACAGGCT GCGACGGCTC CATCCTCCTC TCCGCCGCGC CCCTCGCCCC GCCCCCGGAG CGCGACGCCG ACATCAACCT CTCCCTCCCC GGCGACGCCT TCGACCTCGT CGTCCGCGCC  AAGACCGCCC TCGAGCTCGC CTGCCCCGGC ACCGTCTCCT GCTCCGACAT CCTCGTCGTC GCCACGCGGG ACCTCGTCAC CATGCTCGGC GGCCCCTACT ACGACGTCTT CCTCGGCCGC  CGCGACACCC GGATCTCCCG CGCCTCCCTC GTCGCCGGGC TCCTCCCGCG GCCCAACATG ACCATGTCGG AACTCCTCTC CCTCTTCGGC GCCCGCGGGT TCTCCGCCCA GGAGATGGTG  GCCCTCGCCG GCGCCCACAC CGTGGGGTTC TCCCACTGCA AGGAGTTCAG CTCCGGGATC TACGGCTTCA GCAAGTCCTC CTCCTACGAC CCGACCTACA ACCCGCGGTT CGCGCAGGGG  CTGCAGAAGG CCTGCGCCTC CTACGGCAAG GACCCGACGC TCTCGGTGTT CAACGACGTG ATGACCCCCA ACAAGTTCGA CAACATGTAC TACCAGAACC TGCCCAAGGG GCTGGGCCTG  CTGGCGTCGG ATCGGGGGCT GTACGGCGAC CCCAGGACGA GGCCGTTCGT GGAGATGTAC GCCAGGGATC AGGACCGGTT CTTAAAAGAC TTCGCGAGGG CGATGCAGAA GCTGAGCCTC 
TACGGGGTCC AGACCGGGAG GAGGGGCGAG ATCAGGCGAA GGTGCGATGC CGTCAAT 

Retrieve as FASTA