Entry information : EguGPx[P]11
Entry ID 11588
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-05-19 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2020-02-13 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: EguGPx[P]11
Name EguGPx[P]11
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguGPx[P]11
start..stop
S start..stop
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EguGPx04 77 4e-20 1..48 105..152
Literature and cross-references EguGPx[P]11
DNA ref. Phytozome 12:   Chr4 (224001..223798)
Protein sequence: EguGPx[P]11
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   66
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PI (pH):   %s   10.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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IEVNEEKAAL LYKFPKSGKW GIFKDEIQRN LARFLVDKNR VIIDRYYPHN ISSYH*GTV* LLKDRVHF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (5 end is missing, PS is missing).
DNA
Send to BLAST
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ACTGCGAGCT TAAACGCTGC TAATACCAAC CTTCCAGCTC CAACTCTCAA TCTCAGTGCC CTTATCACCT CTTTCTCTAA CAAGGGCTTC ACTGCTAAAG AAATGGTGGC ACTCTCAGGA  TCTCACACAA TAGGCCAGGC TAGGTGTGTG ACGTTCCGGA ACCGACTCTA CAATGAGAAT GACATAAGCT CGTCGTTCGC CAnATCTTTA AAGGCCCAGT GCCCnAGCTC GGGAGGTGAC  AACAAnCTCT CTCCTCTCGA CATCACGAGC CCGACnTCCT TCGACAGTGC CTACTTCAGC AACTTGGTGA GCCAAAAGGG CTTGCTTCAT TCGGACCAAC AGTTGTTCAG TGGGGGCTCG  ACGAAnGCTC AAGTGACTAC nTACAGCAAG AACTTGGATT TGTTCAAGAA CGATTTTGCC AAGGCCATGG TnAAGATGGG AGGCCTTAGC CCTCTCACnG GnTCTGCTGG TCAGATCAGG  ACGAATTGTA AAAGAGTCAA TTGATTTTAA TCTTGGTnnT TTTTTTTTTC TTTTCATGAT GTAATAACTT GGnGCTCTTG GGCGCTATGT AACTTTGTTT CTTGTCAATn TCACTAAGCG  TGATGATATT GnCAATGnTA TAAGATATGG TTAATTTTTT ATCATATGAT GGATTACATT CTTTCTTGAA AGAAACTGGG GCTCATCAAT TGAATAAGGA AAATTGTCCA AAAAnTCCTA  AACATATTAC ACTTTTGTCA ATTTAATCCT AAATCTTTCA ATTTTATCAA TTGAGTTCTA AACCTTTTTA CTTTTTGCCA ATTAAATCCA TCAGGCCAAT TGTGGCTGGA ATTTGCTAAT  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TGGGTGGCCT TAGCCCTCTC ACCGGGTCCA CTnGTCAAAT CAGGnCGAAT TGTAGAAGAG nCAATTGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACTGCGAGCT TAAACGCTGC TAATACCAAC CTTCCAGCTC CAACTCTCAA TCTCAGTGCC CTTATCACCT CTTTCTCTAA CAAGGGCTTC ACTGCTAAAG AAATGGTGGC ACTCTCAGGA  TCTCACACAA TAGGCCCTCT TGACGTCACC AGCCCAATGT CCTTCGACAA TGCCTACTTC ACCAACTTGG TGAGCCAAAA GGGTTTGCTT CATTCGGACC AnCAATTGTT CAGTGGAGGT 
TCAACGAATG CTCAATTTGC CAAGGCCATG GTCAAGATGG GTGGCCTTAG CCCTCTCACC GGGTCCACTn GTCAAATCAG GnCGAATTGT AGAAGAGnCA ATTGA 

Retrieve as FASTA