Entry information : EguGPx[P]11
Entry ID 11588
Creation 2012-12-05 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-05-19 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-05-19 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: EguGPx[P]11
Name EguGPx[P]11
Class Plant glutathione peroxidase    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus
Organism Eucalyptus gunnii    [TaxId: 3933 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value EguGPx[P]11
start..stop
S start..stop
EglGPx[P]11 134 8e-44 1..68 1..68
EcamGPx[P]11 130 1e-42 1..68 1..68
EcamGPx04 76 3e-20 1..48 61..108
EguGPx04 77 4e-20 1..48 105..152
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 31463..31597 135 N° 2 60199..60318 120 N° 3 60361..60450 90  
join(31463..31597,60199..60318,60361..60450)


exon

Literature and cross-references EguGPx[P]11
DNA ref. Phytozome 11:   Chr4 (224001..223798)
Protein sequence: EguGPx[P]11
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   66
PWM (Da):   %s   7739.18  
PI (pH):   %s   10.07
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TASLNAANTNLPAPTLNLSALITSFSNKGFTAKEMVALSGSHTIGPLDVTSPMSFDNAYFTNLVSQKGLLHSDXQLFSGGSTNAQFAKAMVKMGGLSPLTGSTXQIRXNCRRXN*

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic (5 end is missing, PS is missing).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ACTGCGAGCTTAAACGCTGCTAATACCAACCTTCCAGCTCCAACTCTCAATCTCAGTGCCCTTATCACCTCTTTCTCTAACAAGGGCTTCACTGCTAAAGAAATGGTGGCACTCTCAGGA
TCTCACACAATAGGC
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GTTGATCAAGCCTTGGCCTCCATTTGGAGAGAATACCGTTGTGAGATTAGGTGAGTTTTGGCCCATGATGGATTAGTTAGCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC
TCTCTCTNTNTNTNNNNNTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATGTTTATATATATGTTTATTACTCAACAGTGAATTTTCTATTAAGTATCCATACTA
AATCAATGTCGACATTTTTACCCTTTGTTGGCCANTGTTATCACCTTAATATGGAGATAATGAGGAATATTATCTTTAATTTTATGTTTTGGATAATAATTCTGGTCTTTGGTAAAACAN
AGCTTCATATACAACCTCTTTAACCTTGATTTTATAAGATATTATACCCACAATCAGTACTTTATTCGGACATGGCATTATAACGCAAGGGTTCCCATTTGTTAAGATATTATATTCTTT
AAGAGTTTAAACTTTTAAAATAAACAGTGTTTTGTTCAATTTTAAACTATCGTCTTAATATATATATATTACCAAATTCATAGTAAGGTTCGAGTAAGATTATCTAAACATCTTTCTCGA
GTGTATCAGAAATAAAATATAAACACCATTTGTTTCTTGTAATTTAAACTTTCAAATAGATAGATGTGCACTCATCCTGCCTCATTTATATTGGTCTAGTAAAGAAATGAAATTCTTGGA
ATGAACACTTATTGTTTTTATTTTTAAGAGCTATGTACGCATGAATCTGTTTGGTAAAAATTATTTCTGTTCTCAAGAACAAAAATTTATGTTCTTTTGTTTCGAGGAAAAAAAAAAAGA
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TCCTAGGAACAATTCCTAGAATCAAATTTTCTCTCTCTTCTATTTTCTTCTCTTTTCTCTTCCTCTCTTTTCTTTCATTCTTCTTCCTTTTGGCCAGTCGTCGGCCTTGGCCATGGTCCG
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ATCAAACGCGTTCTTATATTCAGAAATTGTTCCCAGGAATAGAAATAAAAAAAAAATCATTTTTCATTAAAAATTGTTTCTTGGAATATAATTGTTACCAAACGCACCTTAAGGCACACA
AATGGAGGTTCGAGAGGAAGTAGGTNTCGGAAAAGAGTACCTCTCCATGATGATGATACCTTNTACACATGGCCGACCACTTCATGCTCAAGATCCCCACATTGGTATATCCTCGGCTAT
TGTACCAAGAAGTTTTCTAATTACTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCAATTGGTGATTCTTTAATNTGTTCTTTTTTTTATACAAAAAATAATGTCATGGAAGTCAATCGG
GAATTGCCCAGTTGGGCAATGTCTCAGTTGATGTCGCGGAAACAAGTCTATGATTAACCGAAGTTGACTTTTTCTTTTGTTTGGGGTTCATCGGACATTGGAAAGGACAGAAGACAAGNT
TTGTTCGACGTGCTTGACACGACTATGATTCAAAGCTTTATAGAAGAACCGCCCTTGAATAACTAAGCCGTCGCAGACCGAGCACGTTTTGTTTTGGTTACANCCGGTCACTGTAGATTA
ATCATTAATGTGAGAAAACACATCATATACTGATCATATTTCCGACATATCAATCGACAAAGTGATTGTGCTTCATGACAAATCATGGTACATATTTTTCAGTGTTGAATTATTTCGATC
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GAATTATTTTTCTTTCTAAGAAATGCTATGAATGAATTTAAGANGTTAGCTAAAAGAATAATGCTTAGAGATATGAGATAGGTGGATTTGGAAATAATTAACTAAACTTTTCAATAGTTA
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CACTTGGAGTAACTTTGACAGACGCTCGGCATGTGGATCGTTGGTCCATTGNCTTACGTATTGGTGGGTATGAATTGAGTCAATGTTTCGAAATGGTTATATTGTAAAAGATAACATGGA
TGGATCATCGCAATCTTATGTNATTTTCCTTTTGAGACATGAGAAGGTGTCACTCCTTGAAAGTAATGGTGCTGCCTCCACCACTAGTTTTCTCAAGGGAACGATCCCTTGAGAGATCTG
TGGATCCCATTTGCTGGGTCCCACCGAGTGAAANTCAATAAATAAAAACAATAAATCAAATAAAAAATCTNGAAAAANGTACTTATTAGAAACATCATCANTATAAAATATCTTTACTTA
GAATTTAGAAAGAAGGGNTTAAGCATCTTTATTATAAGACAAAATAAATGTNGGATATCTATTAACATAGCTCTATGATTAAATATCTTTCACACTTGCAGTCTTGAATGAAATTATTCA
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GATAATCTCGTACCTAACTCTAAATAAATTTTATATTAAAAATTTAAGTATATTGGATTTGTTCAATTAATTTTTTTTACCTCAATGCTTTTTTCTTTTATACAACCCCACTTTATTACC
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GCTTCCTTTTCGTTGTTTGCGTGATCACGTCGAGATCTGCCTCGGCACAGTTGTCTAACCAAAATTACTACGAGAAAGGGTGCCCGAAAGCACTCCAGACCATTGGATCTGCCGTGAAAT
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TCCATTTTCATTCTTTTGTGCATGTGTTGCATGTTCTTTTATGTGCGAGCTTTTACTTCATTCCCGATCCATACATGGATTATTCCTTTATGTGTATTTTCGATTGATCATCCATTCCTG
CTTCGCTAAAAACAATTTTNACGTCCGATGTTAGAAGAGTTGCAAAACAACATTGTTTTTTTTTCCTTCATCTTTTTCCATTTTATTATCTTGCGTTGGTTATATAATTCCACGCATGTC
ACACACATCAGTGAGTACAACCCGTTTAGTAGGAAAAGATGTGACCAACATTTTGGAAATTCGAATTTTTAAGGAATACTGCAACAACTGAGATACAAGGGCCAACGATTCCATTAAATT
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TTTTTTTACAGGGTTGTGATGGATCAATTCTACTAGATGACACCGCGAACTTTACTGGGGAGAAGACGGCGTTTCCCAACTTGAACTCCTTGAGGGGATTCGATGTGGTTGACACCATCA
AGTCAGAAGTGGAAAAACTGTGCCCTGGCGTCGTCTCGTGCGCTGACATCTTAGCCATTGTTGCGAGAGATTCCGTNGTCGAAGTAAGCACCCAACTCTTGAGATTTCTTAGAANGTAAT
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AGAAATGGTAACCCTCTCAGGATCTCACACCATAGGCCAATCCAGGTGCGTGACNTTCCGGGCCCGTCTTTACAACGAAAGCAACATAGACTCGTCGTTCGCCACAACTTTAAAAGCCAA
TTGCCCTAGCTCGGGAGGTGACAACAANCTCTCCCCTCTTGACGTCACCAGCCCGACGTCCTTCGACAATGCCTACTTCACCAACTTGGTGNGCCAAAANGGTTTGCTTCATTCGGACCA
GCAATTGTTNAGTGGAGGTTCGACGAATGCTCAAGTGACTGCCTACAGCAAGAACTTTGGCTCGTTCCANAATGATTTTGCCAAGGCCATGGTCAAGATGGGTGGCCTTAGCCCTCTCAC
CGGGTCCACTGGTCAAATCAGGACGAATTGTAGAAGAGTCAATTGATTTTAATCCTGGATATTGTTCTTTTGGAGACGTTTTTCTTTATTTAATCTTGTAACCTTTCAAGATGATTGAGA
ATTATGTGTAATAACTTGGTGCTCTTGGGTGTAATGATAACTTTGTTTTAGTCAATTTCATGGGGCGTCAATTGAATATGATGATATCAATATCCAATGCTAGATAATGATTAATCGTAT
GGCATCTAAGCTCTTGGAAATGCCAGACTTGACATGTGTGATTCTATGCATTTGCATCATGAATGGAGAGTAATATTTTTGAAGTCCATAACAGTTGCTCCTCAGGAATCTAATNATCAT
CATGAAGAGGTCAATGCTCTTGTTACCTTTCCGGCATTCAAGAGTTCANATTTCCTCANAGTCTTAAAGTGCTTCAANGACTTCAAAGCTCCGAGTCCAGATAGTTTTAACAGTCTATTC
TAGAAATGTGCTTAGCCCATCATAGGGTANGACATTGAGGAAGATGTCATGGACTTCATCTCATCAAAAAGAATATTTAAATCTATAAATTTCACATTGAATATTTAAATCTATAAATTC
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GTGCTTCCGTCGATCATTGACCTCAACNAAACTGCTTTCATCACNTTGTGACAGATCTTGGAGANCATCCTATTGTGCCAAGATCTATTATGCAACCACTGTAAGGGAGACAAAGGTAAA
CAAGTAGCCATAAAGATTGATCTCATGAAAGCTTATGACATGGTAAAATGGGATGTAGTTCTTGGGATGCTCAAAGCTATAAATACACCTCAATACTTGGTTGATTCGGTAACTGAATGC
ATCACTACACCAAGGCTTTTAGTGACCTTCAATGGCGAATAGGCCAGCTGTTTTAATAGTACTAATGGGTTAAGACTAGGTGATACTNTTTCTCCATACCTCTTAATTTTAGTTATGGAG
CTTCTTAATAGAATTATCAGTGTGAAAGTTGCTCCTATTGCTTTCAAGTATCACTGTCACTGCGAAATGCAATGGATTACCCACTTATGCTTTGTCAACGATTTGTTTTTATTTGCTTAT
GGAGATGTAGATTCTGTCCTTTCCCTTGTTGATGCCTTTAAATATTTTTATCTGGGTTAACNAAGATTGGAAGCTCCTTACACTGGATCACTCGCCTTTTTCCACANGTGCCCTCCCTAT
CAAACACCTGGGTGTTCCCCTTTAGAAGACTCACTCACATAGATTGTAAAAGTCTTATTAACAAGACTTTTAAGAAAATTGAAAGCTTGGACATGAAGCATATNAGTTATGCAGGGTGTC
TCAGTTAGCAAAATCAGTCATCATCTCCATTTGCACTTCTTGGATGCAAATGTTCTTACTTCCAAGGCAAACCATATACGAGGAAAAGAAGAGGATCCATCAATCTTTTTNGGCAGGTAA
TGCAATAAACCATGGACCGCACAAGGTGGCATGGCAAGTAGTTTGCTTAACTAAAAGAGAAGGAGGATTAGGATTGCTCGATTTGAACTTGTAGAACAAAGTATTGTTAGGCCGCATGTT
ATGGAACCTCATTAATCGTCCATTCCCTTCGAAGTATATGGGTTCACAACACCAAATGTAGAGGCACTCCAATTATTGTGATCAACATTNGGGCAAGTATGGCTTGGAGTTGATGATGTC
TCCTTAAATTGTCACCTATTCTAACGTTGATAATCCATAGTTCAGGGTATTGTTGCCAAGAAATTTATGATGAACTCAAATATTTGGGACTNGTTGTGGAGTGGTATAACCTAATTGGTT
CACNGGAATTAGCAAACACAATTTTATTANCTAGCTCGTTTGCAAAAACAAACCATTGATAGTAGAGATCATCGACCAATGGATGANTTTTGTCGATATCCAATGTAACTTTTGTAAGGN
TGGTACCGAAGAAAAAACTCGTTTATTTTTCCAATGTGGGTGGACAAGTAGCATTTTTCGCATTATCCTTGCACAACATGGGATTAGGTGTCCTCTGGGAGGATAGAATNAGAAACTTCA
ATGGATGATTAGANCAACAAAGAGTAAAGACTTGGCAGCAAAACTCCTCAAAGCATCCTTTCTAGCAACCCTATATGGCTTTTGGATGGAGTGCAACCGTAGAAGGTATCAAAACCAGTC
AACTAAGATTTATATTATTTTGGCTAATATACATAAAAATGGAAGAGATAGAGTAAAGAATGAGACCTTCCTAGACAAATGTTATTTTGGCTACTATGTCGAGACTTCCCACCTCCATCT
TTTCAAATTATTAGCTCTATTTGTAATGCTAGGGAATGCATTTAAGCTGTTGTTCTTAATCTGCTTTATAATATTGACATTTTACACAAAAGAAAAAGGGAATTTATATTCAATGCCGAA
GGCAAAAATATCTTCTATGCTTTCATGTNGACTGTTAGAGATGANTAGGGAGTTCTATAGAATATTTTCCTATGTTAGAGATAACGATGGTNTTTATGCTAGTTATCTATCTTGTTTAAG
AGTGCACATATATTGCATGCATTATTTCCTTTAATTGTGCATATCATGATTGAGATATTATCTTGGAATAATTATCTAATGAAGCCTATAAATGGGTAAGTGTATTCTTCATTAATATAT
ATACATATATGTATATATATCAAATTTTACAAAATTCTCTAATTTTATTTTTTGCATTATTCTTATCTTTGTCATTGTGATTATTCATTTAATAAATTACATAATGGTAGAAAAGAACTA
ATCTTGTGCAATGCACATTAATCGAGGGTGTTGTCGAAATAAATTTCGATGGCTTAGGCTGGATGGATCAACTTGGNACTTCCGTACTAGATGAACATTGAATATTCTTTCCAGTTTATG
TCGCTTTTGTATCTGAGCTTCTTTACGGTATCGGATTAATCTCATGATCATCNAGTCAAGACAATTCTCTTATGCGCTGCAACAAGGAAATTAGAGGTAGAGGTGATCTTGCCCAAGGCG
GCTTGACAGACATGCACATCGATCTTCTGAGCGGGTTCGGGTGATGTATTTCGCTCCGATGGGCAGTCTGGGGTCAGCTCCGAAAGTAGTTTCTATTTTTGGACCAATGAGATTAAAGAC
GTTCTATGAATCCTTGTTGGGCCCNACTCGTCCAAAACCGTTAAGTGTTTCAAAGAACACTTTAGTGTCGAGAGTAAGCAATATTCTATGCCTGTTCACATGTCCAATCNAAGTTGGTCA
TTGAAAAGGGCGTAATTATAAATCCNAGGCCTCTGAAGATGNCTGGAAAGTAAGTTAAAAAAAAATTAACGTCNTAAACCTGTAATGCCAATTTTATCNCTAAACAAAATATAAGATAAT
TCTCTAGGAGGCTACGAGTTAAGCATATTATCCAAATGCTACACTATGCCCACATGAGCAAGCATATCACTAGACCAATTGCCTTCCTGAAAAATGCGATGAATTTTGAANTCAAAATGA
GCTCTATAGCCTTATGATATCCTTAAATAATGTTGGATCAATGTTATTCACTACTCTCTCNGGGTTAAGAAATTCAGTAATTATTTTGGAGTCCATCACAATCAATATCCACTACCCACT
TGGTTATCTCCTTATTAGGGATTCTTAGATGTACTTAACATGTCATATAGAGCATCAACTTTATCGAGTGACTTCTTGTTGTCTTGACTTAGAAGTATTAGATCGTTCACTTCACAACCC
TTAGGCCCTCCTCTCTGTCTACCATTGAAGATTCATTTTCATGCCCAAGCCCAATTTTACCATAGGTCTTTAGTTGGGAGAGGCCGCCATTAAGATTTNAGTGTCTTCAGGANGTTCAAC
TCACCTCTTAAGAGATGACTTTAATTAAGCCTTTGGCAAAAAGTGGCGCAAATTATTTTAGAATAGATATGATCATAGGTTTAGCAAGTGACTCGCTATACCTTAATGCACTATCCAAGA
GTGTAAATATAAAGTGCTTTGAGAAATCATTATACTAAAAAATTTGAATAGCCCAAGTTGCCTATCGACGCTCATCCAATTAAACTTGAAAAAACAAGCGTAGACTGGTTCAGGTTGGTT
ATCATGACATTTGAGCAAGGTGAGGAATAAATTCCGCTCNCTCTTTGAAGTAGACTGGTTCAAGTTAGGTTACCTTGTTTACTCCNTCGGGTTTATTCATCTTCTGCAAAGATGTAATAA
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AACCCAAACCCTCGTTTGGAAAGTNACTGAAATTTCCTTATTTTGTTTTAATCAGCTGGCTCAGTAGAATATCCAATTAAGCACACAACATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
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TGGGTGGCCTTAGCCCTCTCACCGGGTCCACTNGTCAAATCAGGNCGAATTGTAGAAGAGNCAATTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ACTGCGAGCTTAAACGCTGCTAATACCAACCTTCCAGCTCCAACTCTCAATCTCAGTGCCCTTATCACCTCTTTCTCTAACAAGGGCTTCACTGCTAAAGAAATGGTGGCACTCTCAGGA
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TTTGCCAAGGCCATGGTCAAGATGGGTGGCCTTAGCCCTCTCACCGGGTCCACTNGTCAAATCAGGNCGAATTGTAGAAGAGNCAATTGA

Retrieve as FASTA