Entry information : CduCcP01
Entry ID 11826
Creation 2013-05-03 (Angela Cardinali)
Last sequence changes 2013-05-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2013-05-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CduCcP01
Name CduCcP01
Class Cytochrome C peroxidase    [Orthogroup: CcP003]
Taxonomy Eukaryota Fungi Ascomycota Saccharomycetes Candida
Organism Candida dubliniensis    [TaxId: 42374 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Callus
Inducer Abscission
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CduCcP01
start..stop
S start..stop
CalCcP02 683 0 1..365 1..366
CtCcP01 554 0 1..364 1..358
CtCcP02 553 0 1..364 1..358
CtanzCcP01 457 3e-162 1..365 1..356
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 582085..583182 1098  
complement(join(582085..583182))


exon

Literature and cross-references CduCcP01
Protein ref. UniProtKB:   B9WDL5
DNA ref. GenBank:   FM992690.1 (582085..583182)
Protein sequence: CduCcP01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   366
PWM (Da):   %s   40757.08  
PI (pH):   %s   6.7
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MATFAPNISK ITKTSAKFNY GRIAKTFLGV AGSAAIATYF YNNGNPFNNN NNNNNNGNSK NVAKALFGVG TGANIKTAKV PEGKTANDYQ KVYNDIATKI SENLEFDENS GYYGQLLRLA  WHTSGTYDKS DNSGGSYGGT MIFAPEEFDP ENAGLQVGRE FLMEFLVKYP WISRGDLWTL GGVAAVQESG GPKIEWRPGR VDDNTASKVP PNGRLPDASR DGKYVKDLFA RMGFNERETV  ALLGAHVLGR CHKHNSGYDG PWGPSFNQFT NVFYTTLLGD WHIKKWNGKK QYEDDETGEF MMLPTDMALK EELYFLKYVK MYAEDQDLFF KDFAKAFSKL ISNGIKYPAD SKPILFKTLD 
EQDEE* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, no intron).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTACTT TTGCTCCCAA TATCAGTAAG ATTACAAAAA CTTCAGCCAA ATTCAATTAT GGTAGAATTG CAAAGACATT TCTTGGGGTA GCTGGTTCTG CCGCTATTGC CACTTATTTC  TATAACAATG GAAATCCATT CAACAACAAC AACAATAATA ACAACAACGG AAATTCTAAA AATGTAGCTA AGGCATTATT TGGAGTTGGT ACTGGAGCCA ATATCAAAAC AGCCAAAGTT  CCAGAAGGGA AAACTGCTAA TGATTATCAA AAAGTTTATA ATGATATTGC TACCAAGATT TCTGAAAATT TAGAATTTGA TGAAAATTCT GGTTATTATG GTCAATTGTT AAGATTAGCA  TGGCATACTT CTGGTACTTA TGATAAATCA GATAATTCTG GTGGTTCATA TGGTGGTACG ATGATTTTTG CTCCAGAAGA ATTTGATCCA GAAAATGCTG GTTTACAAGT TGGTCGTGAA  TTTTTAATGG AATTTTTAGT GAAATATCCA TGGATTTCAA GAGGTGATTT ATGGACTTTA GGAGGGGTTG CTGCTGTACA AGAATCGGGT GGTCCAAAAA TTGAATGGAG ACCAGGTAGA  GTTGATGATA ATACTGCATC TAAGGTACCA CCAAATGGTA GATTACCCGA TGCTTCAAGA GATGGTAAAT ATGTAAAAGA TTTATTTGCT AGAATGGGAT TTAATGAAAG AGAAACTGTT  GCTTTACTTG GTGCTCATGT TTTAGGTAGA TGTCATAAAC ATAATTCTGG ATATGATGGT CCATGGGGTC CATCATTTAA CCAATTTACT AATGTCTTTT ACACGACCTT ATTGGGTGAT  TGGCACATTA AGAAATGGAA TGGTAAAAAA CAATATGAAG ATGATGAAAC TGGTGAATTT ATGATGTTAC CAACAGATAT GGCTTTGAAA GAAGAACTGT ATTTCTTGAA ATATGTCAAG  ATGTATGCTG AAGATCAAGA TTTGTTTTTC AAAGATTTTG CTAAAGCATT TTCTAAATTG ATTTCAAATG GTATTAAATA TCCTGCTGAT AGTAAACCAA TATTATTCAA AACATTAGAT 
GAACAAGACG AAGAATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTACTT TTGCTCCCAA TATCAGTAAG ATTACAAAAA CTTCAGCCAA ATTCAATTAT GGTAGAATTG CAAAGACATT TCTTGGGGTA GCTGGTTCTG CCGCTATTGC CACTTATTTC  TATAACAATG GAAATCCATT CAACAACAAC AACAATAATA ACAACAACGG AAATTCTAAA AATGTAGCTA AGGCATTATT TGGAGTTGGT ACTGGAGCCA ATATCAAAAC AGCCAAAGTT  CCAGAAGGGA AAACTGCTAA TGATTATCAA AAAGTTTATA ATGATATTGC TACCAAGATT TCTGAAAATT TAGAATTTGA TGAAAATTCT GGTTATTATG GTCAATTGTT AAGATTAGCA  TGGCATACTT CTGGTACTTA TGATAAATCA GATAATTCTG GTGGTTCATA TGGTGGTACG ATGATTTTTG CTCCAGAAGA ATTTGATCCA GAAAATGCTG GTTTACAAGT TGGTCGTGAA  TTTTTAATGG AATTTTTAGT GAAATATCCA TGGATTTCAA GAGGTGATTT ATGGACTTTA GGAGGGGTTG CTGCTGTACA AGAATCGGGT GGTCCAAAAA TTGAATGGAG ACCAGGTAGA  GTTGATGATA ATACTGCATC TAAGGTACCA CCAAATGGTA GATTACCCGA TGCTTCAAGA GATGGTAAAT ATGTAAAAGA TTTATTTGCT AGAATGGGAT TTAATGAAAG AGAAACTGTT  GCTTTACTTG GTGCTCATGT TTTAGGTAGA TGTCATAAAC ATAATTCTGG ATATGATGGT CCATGGGGTC CATCATTTAA CCAATTTACT AATGTCTTTT ACACGACCTT ATTGGGTGAT  TGGCACATTA AGAAATGGAA TGGTAAAAAA CAATATGAAG ATGATGAAAC TGGTGAATTT ATGATGTTAC CAACAGATAT GGCTTTGAAA GAAGAACTGT ATTTCTTGAA ATATGTCAAG  ATGTATGCTG AAGATCAAGA TTTGTTTTTC AAAGATTTTG CTAAAGCATT TTCTAAATTG ATTTCAAATG GTATTAAATA TCCTGCTGAT AGTAAACCAA TATTATTCAA AACATTAGAT 
GAACAAGACG AAGAATAA 

Retrieve as FASTA